MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_021487	ATCG	2	8	2119485	2119492	25 %	25 %	25 %	25 %	512551798
41003	NC_021487	CT	3	6	2119504	2119509	0 %	50 %	0 %	50 %	512551798
41004	NC_021487	CCG	2	6	2119513	2119518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551798
41005	NC_021487	GCCC	2	8	2119573	2119580	0 %	0 %	25 %	75 %	512551798
41006	NC_021487	TCA	2	6	2119687	2119692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551798
41007	NC_021487	CCT	2	6	2119696	2119701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551798
41008	NC_021487	TGG	3	9	2119732	2119740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551798
41009	NC_021487	TGA	2	6	2119762	2119767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551798
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41012	NC_021487	CT	3	6	2119903	2119908	0 %	50 %	0 %	50 %	512551798
41013	NC_021487	GAG	2	6	2120013	2120018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551798
41014	NC_021487	GGC	2	6	2120084	2120089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551798
41015	NC_021487	TGG	2	6	2120122	2120127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551798
41016	NC_021487	GAG	2	6	2120307	2120312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551798
41017	NC_021487	ACT	2	6	2120335	2120340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551798
41018	NC_021487	GC	3	6	2120426	2120431	0 %	0 %	50 %	50 %	512551798
41019	NC_021487	TGC	2	6	2120443	2120448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551798
41020	NC_021487	GCT	2	6	2120474	2120479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551798
41021	NC_021487	TG	4	8	2120528	2120535	0 %	50 %	50 %	0 %	512551798
41022	NC_021487	GATG	2	8	2120552	2120559	25 %	25 %	50 %	0 %	512551798
41023	NC_021487	TCG	2	6	2120780	2120785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551798
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41025	NC_021487	GGC	2	6	2120916	2120921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551798
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41027	NC_021487	ATC	2	6	2120937	2120942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551798
41028	NC_021487	AGAT	2	8	2120959	2120966	50 %	25 %	25 %	0 %	512551798
41029	NC_021487	TAT	2	6	2120990	2120995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512551798
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41032	NC_021487	TTG	2	6	2121046	2121051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551798
41033	NC_021487	CG	3	6	2121091	2121096	0 %	0 %	50 %	50 %	512551798
41034	NC_021487	AAGG	2	8	2121135	2121142	50 %	0 %	50 %	0 %	512551798
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41039	NC_021487	GAG	2	6	2121349	2121354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551798
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41083	NC_021487	ATGG	2	8	2123509	2123516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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41087	NC_021487	AGG	2	6	2123723	2123728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551802
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41090	NC_021487	GGC	2	6	2123821	2123826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551802
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41094	NC_021487	CACTG	2	10	2124003	2124012	20 %	20 %	20 %	40 %	512551802
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41099	NC_021487	CTTT	2	8	2124386	2124393	0 %	75 %	0 %	25 %	512551802
41100	NC_021487	GTG	2	6	2124403	2124408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551802
41101	NC_021487	TCT	2	6	2124441	2124446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41102	NC_021487	AGCC	2	8	2124465	2124472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41103	NC_021487	CG	3	6	2124487	2124492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41104	NC_021487	GCG	2	6	2124541	2124546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41105	NC_021487	TGC	2	6	2124614	2124619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41106	NC_021487	CAA	2	6	2124667	2124672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41107	NC_021487	TAC	2	6	2124680	2124685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41108	NC_021487	GC	3	6	2124723	2124728	0 %	0 %	50 %	50 %	512551803
41109	NC_021487	GCA	2	6	2124814	2124819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551803
41110	NC_021487	ACG	2	6	2124836	2124841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551803
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41112	NC_021487	GAA	2	6	2124895	2124900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551803
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41114	NC_021487	GGC	2	6	2125049	2125054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551803
41115	NC_021487	CAG	2	6	2125112	2125117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551803
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41118	NC_021487	GGT	2	6	2125184	2125189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551803
41119	NC_021487	GC	3	6	2125290	2125295	0 %	0 %	50 %	50 %	512551803
41120	NC_021487	GGC	2	6	2125316	2125321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551803
41121	NC_021487	AGC	2	6	2125344	2125349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551803
41122	NC_021487	GGC	2	6	2125403	2125408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551803
41123	NC_021487	GCC	2	6	2125449	2125454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551803
41124	NC_021487	CCT	2	6	2125482	2125487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551803
41125	NC_021487	GCT	2	6	2125627	2125632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551803
41126	NC_021487	CA	3	6	2125656	2125661	50 %	0 %	0 %	50 %	512551803
41127	NC_021487	TCC	2	6	2125720	2125725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551803
41128	NC_021487	CT	3	6	2125734	2125739	0 %	50 %	0 %	50 %	512551803
41129	NC_021487	CAA	2	6	2125837	2125842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551804
41130	NC_021487	GCA	2	6	2125939	2125944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551804
41131	NC_021487	G	6	6	2126098	2126103	0 %	0 %	100 %	0 %	512551804
41132	NC_021487	GAC	2	6	2126158	2126163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551804
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41139	NC_021487	AGG	2	6	2126849	2126854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551805
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41148	NC_021487	CCT	2	6	2127278	2127283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551806
41149	NC_021487	GAT	2	6	2127366	2127371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551806
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41152	NC_021487	CCT	2	6	2127473	2127478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551806
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41154	NC_021487	AGAGA	2	10	2127558	2127567	60 %	0 %	40 %	0 %	512551806
41155	NC_021487	AGA	2	6	2127577	2127582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551806
41156	NC_021487	GGC	2	6	2127642	2127647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551806
41157	NC_021487	TC	3	6	2127672	2127677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41158	NC_021487	CAC	2	6	2127688	2127693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41159	NC_021487	AG	3	6	2127737	2127742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41160	NC_021487	GCA	2	6	2127751	2127756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41161	NC_021487	GGC	2	6	2127771	2127776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41162	NC_021487	GTG	2	6	2127823	2127828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41163	NC_021487	CAT	2	6	2127871	2127876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551807
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41166	NC_021487	GCC	2	6	2127913	2127918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551807
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41173	NC_021487	TC	3	6	2128081	2128086	0 %	50 %	0 %	50 %	512551807
41174	NC_021487	GCA	2	6	2128090	2128095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551807
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41180	NC_021487	AG	3	6	2128333	2128338	50 %	0 %	50 %	0 %	512551807
41181	NC_021487	GAG	2	6	2128340	2128345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551807
41182	NC_021487	GAG	2	6	2128376	2128381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551807
41183	NC_021487	GGC	2	6	2128384	2128389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551807
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41196	NC_021487	CGC	2	6	2128859	2128864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551808
41197	NC_021487	GCA	2	6	2128899	2128904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551808
41198	NC_021487	CA	3	6	2128911	2128916	50 %	0 %	0 %	50 %	512551808
41199	NC_021487	GCT	2	6	2129049	2129054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551808
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41201	NC_021487	GC	3	6	2129178	2129183	0 %	0 %	50 %	50 %	512551808
41202	NC_021487	CCA	2	6	2129222	2129227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551808
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41205	NC_021487	GA	4	8	2129392	2129399	50 %	0 %	50 %	0 %	512551808
41206	NC_021487	CCA	2	6	2129469	2129474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551808
41207	NC_021487	GTG	2	6	2129479	2129484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551808
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41212	NC_021487	GTG	2	6	2129611	2129616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551808
41213	NC_021487	GCT	2	6	2129619	2129624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551808
41214	NC_021487	TTG	2	6	2129656	2129661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551808
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41216	NC_021487	GAATCC	2	12	2129845	2129856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512551809
41217	NC_021487	CA	3	6	2129974	2129979	50 %	0 %	0 %	50 %	512551809
41218	NC_021487	GGC	2	6	2130013	2130018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551809
41219	NC_021487	CGG	2	6	2130039	2130044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551809
41220	NC_021487	CGC	2	6	2130213	2130218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551809
41221	NC_021487	TG	3	6	2130226	2130231	0 %	50 %	50 %	0 %	512551809
41222	NC_021487	AGAT	2	8	2130394	2130401	50 %	25 %	25 %	0 %	512551809
41223	NC_021487	AGC	2	6	2130482	2130487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551809
41224	NC_021487	CCT	2	6	2130521	2130526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41225	NC_021487	CA	3	6	2130547	2130552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41226	NC_021487	GGAA	2	8	2130562	2130569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41227	NC_021487	AAC	2	6	2130578	2130583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41228	NC_021487	TCT	2	6	2130643	2130648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551810
41229	NC_021487	TTG	2	6	2130663	2130668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551810
41230	NC_021487	TGG	2	6	2130742	2130747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551810
41231	NC_021487	CTG	2	6	2130818	2130823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551810
41232	NC_021487	ACCT	2	8	2130947	2130954	25 %	25 %	0 %	50 %	512551810
41233	NC_021487	GCT	2	6	2130991	2130996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551810
41234	NC_021487	ACCC	2	8	2131021	2131028	25 %	0 %	0 %	75 %	512551810
41235	NC_021487	AAC	2	6	2131041	2131046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551810
41236	NC_021487	GGGC	2	8	2131083	2131090	0 %	0 %	75 %	25 %	512551810
41237	NC_021487	CAA	2	6	2131177	2131182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551810
41238	NC_021487	G	7	7	2131336	2131342	0 %	0 %	100 %	0 %	512551810
41239	NC_021487	CAGA	2	8	2131358	2131365	50 %	0 %	25 %	25 %	512551810
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41241	NC_021487	TGT	2	6	2131425	2131430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551810
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41244	NC_021487	TAG	2	6	2131710	2131715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41337	NC_021487	ATA	2	6	2136313	2136318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41338	NC_021487	T	6	6	2136333	2136338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41339	NC_021487	GA	4	8	2136488	2136495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41340	NC_021487	CTC	2	6	2136578	2136583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41341	NC_021487	CGAA	2	8	2136615	2136622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41342	NC_021487	ACG	2	6	2136630	2136635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41343	NC_021487	GCT	2	6	2136704	2136709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551816
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41346	NC_021487	GC	3	6	2136780	2136785	0 %	0 %	50 %	50 %	512551816
41347	NC_021487	TAC	2	6	2136876	2136881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551816
41348	NC_021487	CT	3	6	2136961	2136966	0 %	50 %	0 %	50 %	512551816
41349	NC_021487	GAA	2	6	2136977	2136982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551816
41350	NC_021487	GGACA	2	10	2137009	2137018	40 %	0 %	40 %	20 %	512551816
41351	NC_021487	GCT	2	6	2137019	2137024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551816
41352	NC_021487	CCT	2	6	2137132	2137137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551816
41353	NC_021487	CTG	2	6	2137156	2137161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551816
41354	NC_021487	CTA	2	6	2137187	2137192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551816
41355	NC_021487	CGG	2	6	2137208	2137213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551816
41356	NC_021487	TGG	2	6	2137225	2137230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551816
41357	NC_021487	GCA	2	6	2137479	2137484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41358	NC_021487	GGA	2	6	2137494	2137499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41359	NC_021487	CTC	2	6	2137557	2137562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551817
41360	NC_021487	TTG	2	6	2137587	2137592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551817
41361	NC_021487	TCT	2	6	2137609	2137614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551817
41362	NC_021487	CAG	2	6	2137620	2137625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551817
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41366	NC_021487	AGA	2	6	2137966	2137971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551818
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41368	NC_021487	CCT	2	6	2138070	2138075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41369	NC_021487	CAG	2	6	2138090	2138095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41370	NC_021487	CAT	2	6	2138160	2138165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41372	NC_021487	AGC	2	6	2138254	2138259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41373	NC_021487	CTG	3	9	2138260	2138268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41374	NC_021487	ACC	2	6	2138315	2138320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41377	NC_021487	TGT	2	6	2138589	2138594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551819
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41393	NC_021487	TGGG	2	8	2139218	2139225	0 %	25 %	75 %	0 %	512551820
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41416	NC_021487	CCT	2	6	2140162	2140167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41419	NC_021487	A	6	6	2140228	2140233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41420	NC_021487	CCTT	2	8	2140253	2140260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41421	NC_021487	CTT	2	6	2140279	2140284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41422	NC_021487	T	7	7	2140283	2140289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41423	NC_021487	CCTTT	2	10	2140291	2140300	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41424	NC_021487	TCCT	2	8	2140360	2140367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41425	NC_021487	N	6	6	2140377	2140382	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41428	NC_021487	GTCC	2	8	2140476	2140483	0 %	25 %	25 %	50 %	512551822
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41434	NC_021487	GA	3	6	2140780	2140785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41435	NC_021487	TAC	2	6	2140786	2140791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41439	NC_021487	CTCC	2	8	2140925	2140932	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41440	NC_021487	TTGG	2	8	2140940	2140947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41441	NC_021487	TAA	2	6	2140963	2140968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41442	NC_021487	TCC	2	6	2140982	2140987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41443	NC_021487	CTG	2	6	2141019	2141024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41444	NC_021487	N	1717	1717	2141032	2142748	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41445	NC_021487	ATG	2	6	2142770	2142775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41447	NC_021487	GGT	2	6	2142884	2142889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41462	NC_021487	GA	3	6	2143838	2143843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41463	NC_021487	TGCC	2	8	2143876	2143883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41464	NC_021487	GAT	2	6	2143891	2143896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551824
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41475	NC_021487	GCC	2	6	2144230	2144235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551824
41476	NC_021487	CTC	2	6	2144295	2144300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551824
41477	NC_021487	GCA	2	6	2144314	2144319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41478	NC_021487	CCGT	2	8	2144407	2144414	0 %	25 %	25 %	50 %	512551824
41479	NC_021487	TGA	2	6	2144446	2144451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551824
41480	NC_021487	CGA	2	6	2144464	2144469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41481	NC_021487	GCT	2	6	2144478	2144483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41482	NC_021487	GCC	3	9	2144487	2144495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551824
41483	NC_021487	CCT	2	6	2144549	2144554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551824
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41488	NC_021487	CGT	2	6	2144790	2144795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
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41491	NC_021487	CGT	2	6	2144837	2144842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41492	NC_021487	ACC	3	9	2144878	2144886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551824
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41495	NC_021487	CGT	2	6	2144981	2144986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
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41499	NC_021487	CGC	2	6	2145123	2145128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551824
41500	NC_021487	CCG	2	6	2145188	2145193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551824

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