MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_021487	TAA	2	6	2071073	2071078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40002	NC_021487	T	6	6	2071095	2071100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40003	NC_021487	TAA	2	6	2071157	2071162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40004	NC_021487	TCT	2	6	2071175	2071180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40005	NC_021487	GGAG	2	8	2071214	2071221	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40006	NC_021487	CCT	2	6	2071261	2071266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551762
40007	NC_021487	A	6	6	2071308	2071313	100 %	0 %	0 %	0 %	512551762
40008	NC_021487	CCG	2	6	2071319	2071324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551762
40009	NC_021487	TCT	2	6	2071398	2071403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551762
40010	NC_021487	CTA	2	6	2071429	2071434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551762
40011	NC_021487	CTA	2	6	2071652	2071657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551762
40012	NC_021487	GCT	3	9	2071681	2071689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551762
40013	NC_021487	GCG	2	6	2071692	2071697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551762
40014	NC_021487	CAG	2	6	2071784	2071789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551762
40015	NC_021487	CTT	2	6	2071834	2071839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551762
40016	NC_021487	CAG	3	9	2071841	2071849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551762
40017	NC_021487	CAA	2	6	2071853	2071858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551762
40018	NC_021487	AGG	2	6	2071890	2071895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551762
40019	NC_021487	TCA	2	6	2071942	2071947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551762
40020	NC_021487	CT	3	6	2072088	2072093	0 %	50 %	0 %	50 %	512551762
40021	NC_021487	CCAAC	2	10	2072095	2072104	40 %	0 %	0 %	60 %	512551762
40022	NC_021487	GCG	2	6	2072120	2072125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551762
40023	NC_021487	CAG	2	6	2072144	2072149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551762
40024	NC_021487	GCC	2	6	2072173	2072178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551762
40025	NC_021487	AAGC	2	8	2072234	2072241	50 %	0 %	25 %	25 %	512551762
40026	NC_021487	AGC	2	6	2072307	2072312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551762
40027	NC_021487	GC	4	8	2072311	2072318	0 %	0 %	50 %	50 %	512551762
40028	NC_021487	TTG	2	6	2072330	2072335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551762
40029	NC_021487	GAC	2	6	2072369	2072374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551762
40030	NC_021487	CAACAG	2	12	2072387	2072398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512551762
40031	NC_021487	ACCT	2	8	2072475	2072482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40032	NC_021487	CCT	2	6	2072556	2072561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40033	NC_021487	AAG	2	6	2072577	2072582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40034	NC_021487	GCT	2	6	2072734	2072739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551763
40035	NC_021487	CGGC	2	8	2072868	2072875	0 %	0 %	50 %	50 %	512551763
40036	NC_021487	CGG	2	6	2072884	2072889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551763
40037	NC_021487	CAA	2	6	2072959	2072964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551763
40038	NC_021487	CATC	2	8	2072965	2072972	25 %	25 %	0 %	50 %	512551763
40039	NC_021487	TGG	2	6	2072985	2072990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551763
40040	NC_021487	A	6	6	2073002	2073007	100 %	0 %	0 %	0 %	512551763
40041	NC_021487	AATC	2	8	2073022	2073029	50 %	25 %	0 %	25 %	512551763
40042	NC_021487	CGC	2	6	2073045	2073050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551763
40043	NC_021487	CCT	3	9	2073097	2073105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551763
40044	NC_021487	GATA	2	8	2073124	2073131	50 %	25 %	25 %	0 %	512551763
40045	NC_021487	CTCG	2	8	2073181	2073188	0 %	25 %	25 %	50 %	512551763
40046	NC_021487	CTT	2	6	2073232	2073237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551763
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40048	NC_021487	GGC	2	6	2073266	2073271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551763
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40051	NC_021487	GGC	2	6	2073491	2073496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551763
40052	NC_021487	TCGA	2	8	2073519	2073526	25 %	25 %	25 %	25 %	512551763
40053	NC_021487	GCG	2	6	2073588	2073593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551763
40054	NC_021487	ATC	2	6	2073617	2073622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551763
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40057	NC_021487	GCC	2	6	2073788	2073793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40058	NC_021487	GCG	2	6	2073855	2073860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40059	NC_021487	CGG	2	6	2073871	2073876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40060	NC_021487	TGG	2	6	2073888	2073893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40061	NC_021487	AG	3	6	2073949	2073954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40062	NC_021487	TGC	2	6	2073987	2073992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40063	NC_021487	GTG	2	6	2074010	2074015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40064	NC_021487	CAG	2	6	2074209	2074214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40065	NC_021487	GC	3	6	2074222	2074227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40066	NC_021487	CTG	2	6	2074324	2074329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40069	NC_021487	GGGGC	2	10	2074517	2074526	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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40071	NC_021487	GCA	2	6	2074726	2074731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40072	NC_021487	CTG	2	6	2074733	2074738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40073	NC_021487	C	6	6	2074832	2074837	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40074	NC_021487	GCT	2	6	2074864	2074869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40075	NC_021487	AAC	3	9	2074881	2074889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40076	NC_021487	CG	3	6	2074945	2074950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40077	NC_021487	TAC	2	6	2075013	2075018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40079	NC_021487	CTTGCA	2	12	2075298	2075309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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40084	NC_021487	TTG	2	6	2075565	2075570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551764
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40088	NC_021487	TCT	2	6	2075711	2075716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551764
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40091	NC_021487	GCA	2	6	2076024	2076029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551764
40092	NC_021487	ACG	2	6	2076094	2076099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551764
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40094	NC_021487	CCAAAC	2	12	2076116	2076127	50 %	0 %	0 %	50 %	512551764
40095	NC_021487	CCGC	2	8	2076141	2076148	0 %	0 %	25 %	75 %	512551764
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40101	NC_021487	T	6	6	2076381	2076386	0 %	100 %	0 %	0 %	512551764
40102	NC_021487	GCAT	2	8	2076397	2076404	25 %	25 %	25 %	25 %	512551764
40103	NC_021487	AAG	2	6	2076444	2076449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551764
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40106	NC_021487	CCG	2	6	2076487	2076492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551764
40107	NC_021487	CTCTC	2	10	2076524	2076533	0 %	40 %	0 %	60 %	512551764
40108	NC_021487	GGT	2	6	2076641	2076646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551764
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40110	NC_021487	CTC	2	6	2076728	2076733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551764
40111	NC_021487	TGA	2	6	2076797	2076802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551764
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40120	NC_021487	CG	3	6	2077235	2077240	0 %	0 %	50 %	50 %	512551765
40121	NC_021487	GCT	2	6	2077256	2077261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551765
40122	NC_021487	GCC	2	6	2077284	2077289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551765
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40125	NC_021487	CGG	2	6	2077355	2077360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551765
40126	NC_021487	TTG	2	6	2077375	2077380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551765
40127	NC_021487	GGGT	2	8	2077436	2077443	0 %	25 %	75 %	0 %	512551765
40128	NC_021487	TGG	2	6	2077492	2077497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551765
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40130	NC_021487	AG	3	6	2077574	2077579	50 %	0 %	50 %	0 %	512551765
40131	NC_021487	CGA	2	6	2077601	2077606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551765
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40133	NC_021487	GGT	2	6	2077718	2077723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551765
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40136	NC_021487	AGG	2	6	2077994	2077999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551765
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40142	NC_021487	AAAG	2	8	2078341	2078348	75 %	0 %	25 %	0 %	512551765
40143	NC_021487	CA	3	6	2078417	2078422	50 %	0 %	0 %	50 %	512551766
40144	NC_021487	CAC	2	6	2078434	2078439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551766
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40151	NC_021487	GCC	2	6	2078871	2078876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551766
40152	NC_021487	CGC	2	6	2078888	2078893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551766
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40155	NC_021487	GC	3	6	2079005	2079010	0 %	0 %	50 %	50 %	512551766
40156	NC_021487	GAG	2	6	2079057	2079062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551766
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40166	NC_021487	CA	3	6	2079836	2079841	50 %	0 %	0 %	50 %	512551767
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40179	NC_021487	AAC	2	6	2080699	2080704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551767
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40181	NC_021487	TG	3	6	2080758	2080763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40182	NC_021487	CG	4	8	2080913	2080920	0 %	0 %	50 %	50 %	512551768
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40194	NC_021487	CGGG	2	8	2081380	2081387	0 %	0 %	75 %	25 %	512551768
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40202	NC_021487	GAT	2	6	2081718	2081723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551768
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40206	NC_021487	AAGC	2	8	2081909	2081916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40207	NC_021487	CAA	2	6	2081928	2081933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40208	NC_021487	A	6	6	2081943	2081948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40209	NC_021487	CAT	2	6	2081957	2081962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40210	NC_021487	TC	3	6	2082017	2082022	0 %	50 %	0 %	50 %	512551769
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40220	NC_021487	TAAC	2	8	2082529	2082536	50 %	25 %	0 %	25 %	512551769
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40222	NC_021487	CTC	2	6	2082569	2082574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551769
40223	NC_021487	CCT	2	6	2082596	2082601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551769
40224	NC_021487	GGCA	2	8	2082648	2082655	25 %	0 %	50 %	25 %	512551769
40225	NC_021487	GCA	2	6	2082674	2082679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551769
40226	NC_021487	TAT	2	6	2082743	2082748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40227	NC_021487	TGC	2	6	2082816	2082821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40228	NC_021487	TTG	2	6	2082824	2082829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40229	NC_021487	GATA	2	8	2082836	2082843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40230	NC_021487	TTAT	2	8	2082849	2082856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40231	NC_021487	A	6	6	2082903	2082908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40232	NC_021487	GCA	2	6	2082951	2082956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40233	NC_021487	CATA	2	8	2083193	2083200	50 %	25 %	0 %	25 %	512551770
40234	NC_021487	CCA	2	6	2083225	2083230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40235	NC_021487	GGA	2	6	2083409	2083414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551771
40236	NC_021487	CCA	2	6	2083443	2083448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551771
40237	NC_021487	CAG	2	6	2083482	2083487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551771
40238	NC_021487	AGC	2	6	2083508	2083513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551771
40239	NC_021487	CGG	2	6	2083554	2083559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551771
40240	NC_021487	TGG	2	6	2083685	2083690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551771
40241	NC_021487	CA	3	6	2083738	2083743	50 %	0 %	0 %	50 %	512551771
40242	NC_021487	CAT	2	6	2083750	2083755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551771
40243	NC_021487	GAACGG	2	12	2083813	2083824	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512551771
40244	NC_021487	CCA	2	6	2083839	2083844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551771
40245	NC_021487	ACCT	2	8	2083859	2083866	25 %	25 %	0 %	50 %	512551771
40246	NC_021487	TGA	2	6	2083956	2083961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551771
40247	NC_021487	GCG	2	6	2084034	2084039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551771
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40249	NC_021487	GC	3	6	2084114	2084119	0 %	0 %	50 %	50 %	512551771
40250	NC_021487	AC	3	6	2084155	2084160	50 %	0 %	0 %	50 %	512551771
40251	NC_021487	GAAA	2	8	2084202	2084209	75 %	0 %	25 %	0 %	512551771
40252	NC_021487	TTGA	2	8	2084222	2084229	25 %	50 %	25 %	0 %	512551771
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40258	NC_021487	CGT	2	6	2084644	2084649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551772
40259	NC_021487	GA	3	6	2084778	2084783	50 %	0 %	50 %	0 %	512551772
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40264	NC_021487	GCT	2	6	2085012	2085017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551772
40265	NC_021487	GCC	2	6	2085018	2085023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551772
40266	NC_021487	GAC	2	6	2085065	2085070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551772
40267	NC_021487	CG	3	6	2085079	2085084	0 %	0 %	50 %	50 %	512551772
40268	NC_021487	GC	3	6	2085146	2085151	0 %	0 %	50 %	50 %	512551772
40269	NC_021487	CAA	2	6	2085178	2085183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551772
40270	NC_021487	CTC	2	6	2085295	2085300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40271	NC_021487	TTTTA	2	10	2085316	2085325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40272	NC_021487	GCAC	2	8	2085351	2085358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40273	NC_021487	AAG	2	6	2085501	2085506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551773
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40275	NC_021487	A	7	7	2085525	2085531	100 %	0 %	0 %	0 %	512551773
40276	NC_021487	CGGAAC	2	12	2085533	2085544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551773
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40292	NC_021487	GCA	2	6	2086451	2086456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551773
40293	NC_021487	TCC	2	6	2086496	2086501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551773
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40302	NC_021487	CGA	2	6	2086817	2086822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551773
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40315	NC_021487	AGATC	2	10	2087412	2087421	40 %	20 %	20 %	20 %	512551773
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40317	NC_021487	TCCAG	2	10	2087474	2087483	20 %	20 %	20 %	40 %	512551773
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40320	NC_021487	CCT	2	6	2087593	2087598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40321	NC_021487	GAT	2	6	2087622	2087627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551774
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40341	NC_021487	GCA	2	6	2088503	2088508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551774
40342	NC_021487	TC	3	6	2088521	2088526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40343	NC_021487	CCT	2	6	2088528	2088533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40344	NC_021487	AGG	2	6	2088543	2088548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40345	NC_021487	CTG	2	6	2088590	2088595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551775
40346	NC_021487	G	6	6	2088604	2088609	0 %	0 %	100 %	0 %	512551775
40347	NC_021487	GCC	2	6	2088654	2088659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551775
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40350	NC_021487	GA	3	6	2088820	2088825	50 %	0 %	50 %	0 %	512551775
40351	NC_021487	GTT	2	6	2088849	2088854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551775
40352	NC_021487	CTG	2	6	2088915	2088920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551775
40353	NC_021487	CCA	2	6	2088949	2088954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551775
40354	NC_021487	ATG	2	6	2089035	2089040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551775
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40357	NC_021487	GCTG	2	8	2089119	2089126	0 %	25 %	50 %	25 %	512551775
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40474	NC_021487	GA	3	6	2095212	2095217	50 %	0 %	50 %	0 %	512551778
40475	NC_021487	ATCT	2	8	2095278	2095285	25 %	50 %	0 %	25 %	512551778
40476	NC_021487	GCT	2	6	2095437	2095442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551778
40477	NC_021487	TCC	2	6	2095452	2095457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551778
40478	NC_021487	TGT	2	6	2095463	2095468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551778
40479	NC_021487	TGATCT	2	12	2095499	2095510	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512551778
40480	NC_021487	GCA	2	6	2095606	2095611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551778
40481	NC_021487	GGC	2	6	2095614	2095619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551778
40482	NC_021487	GCTG	2	8	2095660	2095667	0 %	25 %	50 %	25 %	512551778
40483	NC_021487	GGT	2	6	2095675	2095680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551778
40484	NC_021487	GTG	2	6	2095690	2095695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551778
40485	NC_021487	CCA	2	6	2095708	2095713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551778
40486	NC_021487	GC	3	6	2095741	2095746	0 %	0 %	50 %	50 %	512551778
40487	NC_021487	GTG	2	6	2095766	2095771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551778
40488	NC_021487	GCAG	2	8	2095783	2095790	25 %	0 %	50 %	25 %	512551778
40489	NC_021487	GGT	2	6	2095822	2095827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551778
40490	NC_021487	GCC	2	6	2095840	2095845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551778
40491	NC_021487	TGG	2	6	2095851	2095856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551778
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40493	NC_021487	T	6	6	2095932	2095937	0 %	100 %	0 %	0 %	512551778
40494	NC_021487	AAT	2	6	2096038	2096043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40495	NC_021487	A	6	6	2096049	2096054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40496	NC_021487	CTG	2	6	2096056	2096061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40497	NC_021487	G	6	6	2096071	2096076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40498	NC_021487	TTATA	2	10	2096109	2096118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40499	NC_021487	CAA	2	6	2096150	2096155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40500	NC_021487	CCA	2	6	2096200	2096205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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