MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_021487	AGCAA	2	10	1938244	1938253	60 %	0 %	20 %	20 %	512551653
37503	NC_021487	A	6	6	1938252	1938257	100 %	0 %	0 %	0 %	512551653
37504	NC_021487	CT	3	6	1938296	1938301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37505	NC_021487	ATC	2	6	1938338	1938343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37506	NC_021487	T	6	6	1938369	1938374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37507	NC_021487	AAC	2	6	1938381	1938386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37508	NC_021487	T	6	6	1938425	1938430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37509	NC_021487	CAG	2	6	1938527	1938532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551654
37510	NC_021487	TTGGAA	2	12	1938586	1938597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551654
37511	NC_021487	CTC	2	6	1938649	1938654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37512	NC_021487	CTG	2	6	1938777	1938782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37513	NC_021487	ACC	2	6	1938812	1938817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37514	NC_021487	ACAGCA	2	12	1938918	1938929	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512551655
37515	NC_021487	AGA	2	6	1938957	1938962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551655
37516	NC_021487	CTC	2	6	1938993	1938998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551655
37517	NC_021487	TGC	2	6	1939034	1939039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551655
37518	NC_021487	CTT	2	6	1939074	1939079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551655
37519	NC_021487	ACG	2	6	1939247	1939252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551655
37520	NC_021487	GACCA	2	10	1939261	1939270	40 %	0 %	20 %	40 %	512551655
37521	NC_021487	CTA	2	6	1939281	1939286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551655
37522	NC_021487	ATG	2	6	1939420	1939425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551655
37523	NC_021487	GCA	2	6	1939461	1939466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551655
37524	NC_021487	CAT	2	6	1939557	1939562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551655
37525	NC_021487	CTT	2	6	1939680	1939685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551655
37526	NC_021487	CT	3	6	1939758	1939763	0 %	50 %	0 %	50 %	512551655
37527	NC_021487	CAC	2	6	1939782	1939787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551655
37528	NC_021487	CGG	2	6	1939798	1939803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551655
37529	NC_021487	TGCG	2	8	1939864	1939871	0 %	25 %	50 %	25 %	512551655
37530	NC_021487	CGC	2	6	1939956	1939961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551655
37531	NC_021487	ATG	3	9	1939963	1939971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551655
37532	NC_021487	GGA	2	6	1940046	1940051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551655
37533	NC_021487	GGA	3	9	1940106	1940114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551655
37534	NC_021487	TAC	2	6	1940239	1940244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551655
37535	NC_021487	CT	3	6	1940280	1940285	0 %	50 %	0 %	50 %	512551656
37536	NC_021487	CT	3	6	1940297	1940302	0 %	50 %	0 %	50 %	512551656
37537	NC_021487	A	8	8	1940329	1940336	100 %	0 %	0 %	0 %	512551656
37538	NC_021487	A	6	6	1940354	1940359	100 %	0 %	0 %	0 %	512551656
37539	NC_021487	GTA	2	6	1940395	1940400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37540	NC_021487	CT	3	6	1940479	1940484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37541	NC_021487	GTT	2	6	1940532	1940537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37542	NC_021487	CAC	3	9	1940777	1940785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37543	NC_021487	AGG	2	6	1940801	1940806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37544	NC_021487	TCC	2	6	1940836	1940841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551657
37545	NC_021487	CAA	2	6	1940843	1940848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551657
37546	NC_021487	CA	3	6	1940850	1940855	50 %	0 %	0 %	50 %	512551657
37547	NC_021487	CTA	2	6	1941024	1941029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551657
37548	NC_021487	CG	3	6	1941039	1941044	0 %	0 %	50 %	50 %	512551657
37549	NC_021487	CAC	3	9	1941069	1941077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551657
37550	NC_021487	GA	3	6	1941083	1941088	50 %	0 %	50 %	0 %	512551657
37551	NC_021487	CTGAGC	2	12	1941139	1941150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512551657
37552	NC_021487	TAC	2	6	1941216	1941221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551657
37553	NC_021487	CAG	2	6	1941286	1941291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551657
37554	NC_021487	ACG	2	6	1941395	1941400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551657
37555	NC_021487	C	6	6	1941467	1941472	0 %	0 %	0 %	100 %	512551657
37556	NC_021487	GGA	2	6	1941496	1941501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551657
37557	NC_021487	CGA	2	6	1941528	1941533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551657
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37559	NC_021487	CT	3	6	1941562	1941567	0 %	50 %	0 %	50 %	512551657
37560	NC_021487	ACT	2	6	1941779	1941784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551657
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37565	NC_021487	GGA	2	6	1942123	1942128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37566	NC_021487	TATC	2	8	1942149	1942156	25 %	50 %	0 %	25 %	512551658
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37598	NC_021487	GCCG	2	8	1943870	1943877	0 %	0 %	50 %	50 %	512551658
37599	NC_021487	A	6	6	1943955	1943960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37600	NC_021487	AGA	2	6	1944021	1944026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551659
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37604	NC_021487	GGTT	2	8	1944127	1944134	0 %	50 %	50 %	0 %	512551659
37605	NC_021487	GACA	2	8	1944186	1944193	50 %	0 %	25 %	25 %	512551659
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37608	NC_021487	GAC	2	6	1944247	1944252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551660
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37613	NC_021487	TCC	2	6	1944619	1944624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37614	NC_021487	TTG	2	6	1944638	1944643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37615	NC_021487	ACT	2	6	1944703	1944708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37736	NC_021487	ACC	2	6	1950195	1950200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551664
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37754	NC_021487	CTG	2	6	1951129	1951134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37755	NC_021487	GCC	2	6	1951148	1951153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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37759	NC_021487	TG	3	6	1951316	1951321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37760	NC_021487	GC	3	6	1951334	1951339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37761	NC_021487	GAG	2	6	1951399	1951404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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37974	NC_021487	GGGTGC	2	12	1962912	1962923	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512551674
37975	NC_021487	GAT	3	9	1962936	1962944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551674
37976	NC_021487	AGT	2	6	1962962	1962967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551674
37977	NC_021487	GAT	2	6	1963140	1963145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551674
37978	NC_021487	GTG	2	6	1963223	1963228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551674
37979	NC_021487	CGG	2	6	1963300	1963305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551674
37980	NC_021487	AGT	2	6	1963335	1963340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551674
37981	NC_021487	CGGT	2	8	1963354	1963361	0 %	25 %	50 %	25 %	512551674
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37991	NC_021487	GTC	2	6	1963738	1963743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551674
37992	NC_021487	GCGG	2	8	1963759	1963766	0 %	0 %	75 %	25 %	512551674
37993	NC_021487	GCC	2	6	1963826	1963831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551674
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37996	NC_021487	CAT	3	9	1963930	1963938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551674
37997	NC_021487	GAGG	2	8	1963944	1963951	25 %	0 %	75 %	0 %	512551674
37998	NC_021487	CG	4	8	1964081	1964088	0 %	0 %	50 %	50 %	512551674
37999	NC_021487	TGG	2	6	1964181	1964186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551674
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