MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_021487	AGC	2	6	1913063	1913068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551633
37002	NC_021487	AG	3	6	1913097	1913102	50 %	0 %	50 %	0 %	512551633
37003	NC_021487	GCT	2	6	1913169	1913174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551633
37004	NC_021487	GGA	2	6	1913202	1913207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551633
37005	NC_021487	GCCTA	2	10	1913214	1913223	20 %	20 %	20 %	40 %	512551633
37006	NC_021487	GGT	2	6	1913353	1913358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551633
37007	NC_021487	TTG	2	6	1913417	1913422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551633
37008	NC_021487	CGGC	2	8	1913481	1913488	0 %	0 %	50 %	50 %	512551633
37009	NC_021487	ACCT	2	8	1913545	1913552	25 %	25 %	0 %	50 %	512551633
37010	NC_021487	CG	3	6	1913581	1913586	0 %	0 %	50 %	50 %	512551633
37011	NC_021487	ACGAA	2	10	1913610	1913619	60 %	0 %	20 %	20 %	512551633
37012	NC_021487	ATA	2	6	1913746	1913751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37013	NC_021487	CT	3	6	1913769	1913774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37014	NC_021487	C	6	6	1913794	1913799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37015	NC_021487	CCGG	2	8	1913834	1913841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37016	NC_021487	A	7	7	1913843	1913849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37017	NC_021487	ACA	2	6	1913853	1913858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37018	NC_021487	ACT	2	6	1913899	1913904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551634
37019	NC_021487	GCT	2	6	1913936	1913941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551634
37020	NC_021487	TTA	2	6	1913959	1913964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512551634
37021	NC_021487	GGC	2	6	1913973	1913978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551634
37022	NC_021487	GGT	3	9	1913985	1913993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551634
37023	NC_021487	CTC	2	6	1914023	1914028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551634
37024	NC_021487	GGC	2	6	1914042	1914047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551634
37025	NC_021487	CCA	2	6	1914076	1914081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551634
37026	NC_021487	GGTCA	2	10	1914087	1914096	20 %	20 %	40 %	20 %	512551634
37027	NC_021487	GCC	2	6	1914126	1914131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551634
37028	NC_021487	TTG	2	6	1914139	1914144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551634
37029	NC_021487	AACC	2	8	1914146	1914153	50 %	0 %	0 %	50 %	512551634
37030	NC_021487	GCA	2	6	1914160	1914165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551634
37031	NC_021487	CA	3	6	1914212	1914217	50 %	0 %	0 %	50 %	512551634
37032	NC_021487	CTA	2	6	1914242	1914247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551634
37033	NC_021487	CCCCCT	2	12	1914299	1914310	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	512551634
37034	NC_021487	GCC	2	6	1914377	1914382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551634
37035	NC_021487	CTG	2	6	1914415	1914420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37036	NC_021487	T	7	7	1914457	1914463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37037	NC_021487	CCT	2	6	1914473	1914478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37038	NC_021487	GT	3	6	1914528	1914533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37039	NC_021487	T	6	6	1914533	1914538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37040	NC_021487	TA	4	8	1914619	1914626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37041	NC_021487	TTG	2	6	1914702	1914707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551635
37042	NC_021487	TGC	2	6	1914748	1914753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551635
37043	NC_021487	CAG	2	6	1914788	1914793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551635
37044	NC_021487	CTTG	2	8	1914830	1914837	0 %	50 %	25 %	25 %	512551635
37045	NC_021487	ATAG	2	8	1914917	1914924	50 %	25 %	25 %	0 %	512551635
37046	NC_021487	TGGTT	2	10	1914951	1914960	0 %	60 %	40 %	0 %	512551635
37047	NC_021487	CTG	2	6	1915030	1915035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551635
37048	NC_021487	AGG	2	6	1915204	1915209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551635
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37050	NC_021487	CTA	2	6	1915414	1915419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551635
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37052	NC_021487	GGT	2	6	1915504	1915509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551635
37053	NC_021487	ACC	2	6	1915523	1915528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551635
37054	NC_021487	CCG	2	6	1915562	1915567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551635
37055	NC_021487	CG	3	6	1915572	1915577	0 %	0 %	50 %	50 %	512551635
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37060	NC_021487	CG	3	6	1915875	1915880	0 %	0 %	50 %	50 %	512551635
37061	NC_021487	CGG	2	6	1915894	1915899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551635
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37064	NC_021487	CGA	2	6	1916026	1916031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551635
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37068	NC_021487	GAGCC	2	10	1916242	1916251	20 %	0 %	40 %	40 %	512551635
37069	NC_021487	TGG	2	6	1916310	1916315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551635
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37075	NC_021487	ATC	2	6	1916660	1916665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551635
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37078	NC_021487	TGA	2	6	1916752	1916757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551635
37079	NC_021487	GC	3	6	1916759	1916764	0 %	0 %	50 %	50 %	512551635
37080	NC_021487	GGC	2	6	1916766	1916771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551635
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37084	NC_021487	GGA	2	6	1917116	1917121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551635
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37086	NC_021487	TCA	2	6	1917503	1917508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551636
37087	NC_021487	AGT	2	6	1917641	1917646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551636
37088	NC_021487	TGC	2	6	1917739	1917744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551636
37089	NC_021487	GCA	2	6	1917754	1917759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551636
37090	NC_021487	TCGC	2	8	1917781	1917788	0 %	25 %	25 %	50 %	512551636
37091	NC_021487	C	6	6	1917963	1917968	0 %	0 %	0 %	100 %	512551636
37092	NC_021487	TGC	2	6	1918016	1918021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551636
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37095	NC_021487	CT	3	6	1918115	1918120	0 %	50 %	0 %	50 %	512551636
37096	NC_021487	TTCC	2	8	1918156	1918163	0 %	50 %	0 %	50 %	512551636
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37100	NC_021487	TCG	2	6	1918258	1918263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551636
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37103	NC_021487	TCC	2	6	1918370	1918375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551636
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37108	NC_021487	GTC	2	6	1918566	1918571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551636
37109	NC_021487	CGC	2	6	1918610	1918615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551636
37110	NC_021487	CAA	2	6	1918625	1918630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551636
37111	NC_021487	CCA	2	6	1918639	1918644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551636
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37113	NC_021487	GGA	2	6	1918791	1918796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551636
37114	NC_021487	GCATCT	2	12	1918801	1918812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512551636
37115	NC_021487	GCA	2	6	1918864	1918869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551636
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37118	NC_021487	TTGG	2	8	1919056	1919063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37119	NC_021487	TCCC	2	8	1919110	1919117	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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37220	NC_021487	AG	3	6	1924346	1924351	50 %	0 %	50 %	0 %	512551640
37221	NC_021487	GGC	2	6	1924410	1924415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551640
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37223	NC_021487	TC	3	6	1924503	1924508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37224	NC_021487	CT	4	8	1924573	1924580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37225	NC_021487	A	6	6	1924591	1924596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37226	NC_021487	CAC	2	6	1924654	1924659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551641
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37230	NC_021487	CTG	2	6	1924802	1924807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551641
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37232	NC_021487	GCG	2	6	1924998	1925003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551641
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37234	NC_021487	GCC	2	6	1925118	1925123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551641
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