MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36502	NC_021487	TTG	2	6	1887478	1887483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551613
36503	NC_021487	GGC	2	6	1887489	1887494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551613
36504	NC_021487	TCC	2	6	1887507	1887512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551613
36505	NC_021487	CCGT	2	8	1887518	1887525	0 %	25 %	25 %	50 %	512551613
36506	NC_021487	CCT	2	6	1887673	1887678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551613
36507	NC_021487	AAG	2	6	1887806	1887811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551613
36508	NC_021487	AGG	2	6	1887845	1887850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551613
36509	NC_021487	ACC	2	6	1887865	1887870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551613
36510	NC_021487	AGG	2	6	1887884	1887889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36511	NC_021487	ACA	2	6	1887904	1887909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551614
36512	NC_021487	TTG	2	6	1887915	1887920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551614
36513	NC_021487	GTT	2	6	1888046	1888051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551614
36514	NC_021487	GCCA	2	8	1888072	1888079	25 %	0 %	25 %	50 %	512551614
36515	NC_021487	TGG	2	6	1888318	1888323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551615
36516	NC_021487	ATC	2	6	1888378	1888383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551615
36517	NC_021487	TTC	2	6	1888411	1888416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551615
36518	NC_021487	GCA	2	6	1888544	1888549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551615
36519	NC_021487	ACA	2	6	1888586	1888591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551615
36520	NC_021487	GCA	2	6	1888609	1888614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551615
36521	NC_021487	GCC	2	6	1888642	1888647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551615
36522	NC_021487	GCC	2	6	1888656	1888661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551615
36523	NC_021487	GAT	2	6	1888670	1888675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551615
36524	NC_021487	ACG	2	6	1888686	1888691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551615
36525	NC_021487	GA	3	6	1888703	1888708	50 %	0 %	50 %	0 %	512551615
36526	NC_021487	GA	3	6	1888720	1888725	50 %	0 %	50 %	0 %	512551615
36527	NC_021487	TTG	2	6	1888943	1888948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551615
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36530	NC_021487	CCG	2	6	1889058	1889063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36531	NC_021487	GA	3	6	1889104	1889109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36532	NC_021487	CTA	2	6	1889142	1889147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36533	NC_021487	GTT	2	6	1889195	1889200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36534	NC_021487	TC	3	6	1889277	1889282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36535	NC_021487	ACA	2	6	1889331	1889336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36536	NC_021487	GTA	2	6	1889372	1889377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36537	NC_021487	ATCTGG	2	12	1889469	1889480	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36538	NC_021487	CA	3	6	1889517	1889522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36539	NC_021487	CCCG	2	8	1889572	1889579	0 %	0 %	25 %	75 %	512551616
36540	NC_021487	GC	3	6	1889605	1889610	0 %	0 %	50 %	50 %	512551616
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36544	NC_021487	G	6	6	1889768	1889773	0 %	0 %	100 %	0 %	512551616
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36548	NC_021487	A	6	6	1889945	1889950	100 %	0 %	0 %	0 %	512551616
36549	NC_021487	TAC	2	6	1890177	1890182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551616
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36552	NC_021487	GTT	2	6	1890339	1890344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551616
36553	NC_021487	GGC	2	6	1890450	1890455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551616
36554	NC_021487	TCCC	2	8	1890459	1890466	0 %	25 %	0 %	75 %	512551616
36555	NC_021487	TCAC	2	8	1890476	1890483	25 %	25 %	0 %	50 %	512551616
36556	NC_021487	AT	3	6	1890485	1890490	50 %	50 %	0 %	0 %	512551616
36557	NC_021487	CGC	2	6	1890497	1890502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551616
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36560	NC_021487	GAG	2	6	1890586	1890591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551616
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36573	NC_021487	CCTC	2	8	1891277	1891284	0 %	25 %	0 %	75 %	512551616
36574	NC_021487	GTC	2	6	1891295	1891300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551616
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36578	NC_021487	CAC	2	6	1891397	1891402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551616
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36581	NC_021487	CT	3	6	1891607	1891612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36582	NC_021487	TGAG	2	8	1891702	1891709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36583	NC_021487	ATT	2	6	1891712	1891717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36584	NC_021487	TA	3	6	1891828	1891833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36585	NC_021487	TCC	2	6	1891904	1891909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36586	NC_021487	ATCAA	2	10	1892016	1892025	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36587	NC_021487	AG	3	6	1892045	1892050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36588	NC_021487	T	6	6	1892121	1892126	0 %	100 %	0 %	0 %	512551617
36589	NC_021487	GTTAT	2	10	1892128	1892137	20 %	60 %	20 %	0 %	512551617
36590	NC_021487	AAG	2	6	1892142	1892147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551617
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36602	NC_021487	GC	3	6	1892808	1892813	0 %	0 %	50 %	50 %	512551617
36603	NC_021487	TTC	2	6	1892889	1892894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551617
36604	NC_021487	CTG	2	6	1893066	1893071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551617
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36606	NC_021487	GC	3	6	1893159	1893164	0 %	0 %	50 %	50 %	512551617
36607	NC_021487	GTT	2	6	1893214	1893219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551617
36608	NC_021487	GGC	2	6	1893259	1893264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551617
36609	NC_021487	AG	3	6	1893361	1893366	50 %	0 %	50 %	0 %	512551617
36610	NC_021487	CTC	3	9	1893441	1893449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551617
36611	NC_021487	TC	3	6	1893494	1893499	0 %	50 %	0 %	50 %	512551617
36612	NC_021487	TCCC	2	8	1893501	1893508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36613	NC_021487	CCT	2	6	1893525	1893530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36614	NC_021487	TGG	2	6	1893567	1893572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36615	NC_021487	GAG	2	6	1893606	1893611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36619	NC_021487	CGA	2	6	1893908	1893913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551618
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36734	NC_021487	AG	3	6	1899480	1899485	50 %	0 %	50 %	0 %	512551624
36735	NC_021487	T	7	7	1899554	1899560	0 %	100 %	0 %	0 %	512551624
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36738	NC_021487	GAG	2	6	1899672	1899677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551625
36739	NC_021487	CATCG	2	10	1899770	1899779	20 %	20 %	20 %	40 %	512551625
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36847	NC_021487	GTG	2	6	1904704	1904709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551628
36848	NC_021487	CCCCAT	2	12	1904759	1904770	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	512551628
36849	NC_021487	GCC	2	6	1904778	1904783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551628
36850	NC_021487	GCC	2	6	1904796	1904801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551628
36851	NC_021487	GCA	2	6	1904810	1904815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551628
36852	NC_021487	C	7	7	1904870	1904876	0 %	0 %	0 %	100 %	512551628
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