MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_021487	CGG	2	6	1859860	1859865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551592
36002	NC_021487	CTC	2	6	1860000	1860005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551592
36003	NC_021487	GC	3	6	1860045	1860050	0 %	0 %	50 %	50 %	512551592
36004	NC_021487	CAT	2	6	1860085	1860090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551592
36005	NC_021487	A	6	6	1860103	1860108	100 %	0 %	0 %	0 %	512551592
36006	NC_021487	GCCA	2	8	1860117	1860124	25 %	0 %	25 %	50 %	512551592
36007	NC_021487	GCA	2	6	1860142	1860147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551592
36008	NC_021487	GCA	2	6	1860150	1860155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551592
36009	NC_021487	GTG	2	6	1860206	1860211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551592
36010	NC_021487	GCA	2	6	1860249	1860254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551592
36011	NC_021487	CCT	2	6	1860330	1860335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36012	NC_021487	GGAGGG	2	12	1860417	1860428	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
36013	NC_021487	GAC	2	6	1860594	1860599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551593
36014	NC_021487	CGT	2	6	1860651	1860656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551593
36015	NC_021487	GCC	2	6	1860699	1860704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551593
36016	NC_021487	TCGT	2	8	1860884	1860891	0 %	50 %	25 %	25 %	512551593
36017	NC_021487	AGG	2	6	1860893	1860898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551593
36018	NC_021487	GA	3	6	1860923	1860928	50 %	0 %	50 %	0 %	512551593
36019	NC_021487	CAC	2	6	1860962	1860967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551593
36020	NC_021487	CAC	2	6	1861039	1861044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551593
36021	NC_021487	GGCCGG	2	12	1861068	1861079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551593
36022	NC_021487	ATG	2	6	1861109	1861114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551593
36023	NC_021487	CTA	2	6	1861115	1861120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551593
36024	NC_021487	CAG	2	6	1861160	1861165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551593
36025	NC_021487	CG	3	6	1861236	1861241	0 %	0 %	50 %	50 %	512551593
36026	NC_021487	GGC	2	6	1861477	1861482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551593
36027	NC_021487	TGGT	2	8	1861508	1861515	0 %	50 %	50 %	0 %	512551593
36028	NC_021487	TCA	2	6	1861556	1861561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551593
36029	NC_021487	CCT	2	6	1861620	1861625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551593
36030	NC_021487	CGG	2	6	1861681	1861686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551593
36031	NC_021487	C	6	6	1861709	1861714	0 %	0 %	0 %	100 %	512551593
36032	NC_021487	CGC	2	6	1861740	1861745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551593
36033	NC_021487	GC	3	6	1861744	1861749	0 %	0 %	50 %	50 %	512551593
36034	NC_021487	GAGAAA	2	12	1861891	1861902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551593
36035	NC_021487	CAG	2	6	1862038	1862043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551593
36036	NC_021487	CAC	2	6	1862052	1862057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551593
36037	NC_021487	AGC	3	9	1862105	1862113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551593
36038	NC_021487	AGC	2	6	1862144	1862149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551593
36039	NC_021487	CTT	2	6	1862191	1862196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551593
36040	NC_021487	CACC	2	8	1862253	1862260	25 %	0 %	0 %	75 %	512551593
36041	NC_021487	AGG	2	6	1862300	1862305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551593
36042	NC_021487	CGG	2	6	1862452	1862457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551593
36043	NC_021487	GCC	2	6	1862480	1862485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551593
36044	NC_021487	AG	3	6	1862509	1862514	50 %	0 %	50 %	0 %	512551593
36045	NC_021487	CAG	2	6	1862518	1862523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551593
36046	NC_021487	TCGT	2	8	1862553	1862560	0 %	50 %	25 %	25 %	512551593
36047	NC_021487	ACATCT	2	12	1862568	1862579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551593
36048	NC_021487	CCT	2	6	1862580	1862585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36049	NC_021487	T	7	7	1862608	1862614	0 %	100 %	0 %	0 %	512551594
36050	NC_021487	GCTC	2	8	1862700	1862707	0 %	25 %	25 %	50 %	512551594
36051	NC_021487	GC	3	6	1862717	1862722	0 %	0 %	50 %	50 %	512551594
36052	NC_021487	GTT	2	6	1862774	1862779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551594
36053	NC_021487	CAT	2	6	1862803	1862808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551594
36054	NC_021487	CCA	2	6	1862829	1862834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551594
36055	NC_021487	CAA	2	6	1862881	1862886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551594
36056	NC_021487	GTA	2	6	1862944	1862949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551594
36057	NC_021487	GTC	2	6	1862954	1862959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551594
36058	NC_021487	TGC	2	6	1863024	1863029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551594
36059	NC_021487	CCA	2	6	1863036	1863041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551594
36060	NC_021487	CAA	2	6	1863049	1863054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551594
36061	NC_021487	TC	3	6	1863118	1863123	0 %	50 %	0 %	50 %	512551594
36062	NC_021487	CACGC	2	10	1863125	1863134	20 %	0 %	20 %	60 %	512551594
36063	NC_021487	TCT	2	6	1863151	1863156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551594
36064	NC_021487	GCC	3	9	1863186	1863194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551594
36065	NC_021487	TCC	2	6	1863195	1863200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551594
36066	NC_021487	GGA	2	6	1863201	1863206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551594
36067	NC_021487	AAATCG	2	12	1863207	1863218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512551594
36068	NC_021487	GAT	2	6	1863245	1863250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551594
36069	NC_021487	TAA	2	6	1863337	1863342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551594
36070	NC_021487	CCAA	2	8	1863478	1863485	50 %	0 %	0 %	50 %	512551594
36071	NC_021487	CGC	2	6	1863605	1863610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551594
36072	NC_021487	TGA	2	6	1863618	1863623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551594
36073	NC_021487	CAT	2	6	1863658	1863663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551594
36074	NC_021487	CTC	2	6	1863782	1863787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551594
36075	NC_021487	GGA	2	6	1863819	1863824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551594
36076	NC_021487	ATA	2	6	1863843	1863848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551594
36077	NC_021487	CTA	2	6	1863906	1863911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36078	NC_021487	TAAA	2	8	1864088	1864095	75 %	25 %	0 %	0 %	512551595
36079	NC_021487	GC	3	6	1864113	1864118	0 %	0 %	50 %	50 %	512551595
36080	NC_021487	GCT	2	6	1864478	1864483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551595
36081	NC_021487	CTC	2	6	1864539	1864544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551595
36082	NC_021487	CCG	2	6	1864685	1864690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551595
36083	NC_021487	TCC	2	6	1864704	1864709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551595
36084	NC_021487	ACC	2	6	1864735	1864740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551595
36085	NC_021487	CTC	2	6	1864746	1864751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551595
36086	NC_021487	CTT	2	6	1864760	1864765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551595
36087	NC_021487	ATCC	2	8	1864784	1864791	25 %	25 %	0 %	50 %	512551595
36088	NC_021487	TC	3	6	1864921	1864926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36089	NC_021487	TGC	2	6	1864935	1864940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36090	NC_021487	TCCTT	2	10	1864956	1864965	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36091	NC_021487	T	6	6	1864998	1865003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36092	NC_021487	AGT	2	6	1865022	1865027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36093	NC_021487	TC	3	6	1865072	1865077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36094	NC_021487	A	6	6	1865095	1865100	100 %	0 %	0 %	0 %	512551596
36095	NC_021487	TGC	2	6	1865101	1865106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551596
36096	NC_021487	CGG	2	6	1865221	1865226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551596
36097	NC_021487	GAC	2	6	1865244	1865249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551596
36098	NC_021487	GGGC	2	8	1865476	1865483	0 %	0 %	75 %	25 %	512551596
36099	NC_021487	CAC	2	6	1865593	1865598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551596
36100	NC_021487	ACC	2	6	1865600	1865605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551596
36101	NC_021487	GCA	2	6	1865612	1865617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551596
36102	NC_021487	TCA	2	6	1865620	1865625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551596
36103	NC_021487	CAA	2	6	1865630	1865635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551596
36104	NC_021487	GTC	2	6	1865725	1865730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551597
36105	NC_021487	CAT	2	6	1865858	1865863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551597
36106	NC_021487	CCCA	2	8	1865878	1865885	25 %	0 %	0 %	75 %	512551597
36107	NC_021487	GCG	2	6	1865953	1865958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551597
36108	NC_021487	TTCT	2	8	1865987	1865994	0 %	75 %	0 %	25 %	512551597
36109	NC_021487	GTTC	2	8	1866029	1866036	0 %	50 %	25 %	25 %	512551597
36110	NC_021487	GCAA	2	8	1866054	1866061	50 %	0 %	25 %	25 %	512551597
36111	NC_021487	CAGA	2	8	1866202	1866209	50 %	0 %	25 %	25 %	512551597
36112	NC_021487	GCC	2	6	1866245	1866250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551597
36113	NC_021487	CTT	2	6	1866530	1866535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551597
36114	NC_021487	CTG	2	6	1866536	1866541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551597
36115	NC_021487	CAG	2	6	1866674	1866679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551597
36116	NC_021487	TCTTG	2	10	1866680	1866689	0 %	60 %	20 %	20 %	512551597
36117	NC_021487	ATC	2	6	1866815	1866820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551597
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36133	NC_021487	GTAG	2	8	1867732	1867739	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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36229	NC_021487	TGCGA	2	10	1872699	1872708	20 %	20 %	40 %	20 %	512551603
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36231	NC_021487	GC	3	6	1872757	1872762	0 %	0 %	50 %	50 %	512551603
36232	NC_021487	GC	3	6	1872771	1872776	0 %	0 %	50 %	50 %	512551603
36233	NC_021487	TGC	2	6	1872802	1872807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551603
36234	NC_021487	GGC	2	6	1872832	1872837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551603
36235	NC_021487	CCA	2	6	1872855	1872860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551603
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36239	NC_021487	AGG	2	6	1873039	1873044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36312	NC_021487	C	6	6	1876808	1876813	0 %	0 %	0 %	100 %	512551605
36313	NC_021487	CGA	2	6	1876935	1876940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551605
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36336	NC_021487	TA	3	6	1878247	1878252	50 %	50 %	0 %	0 %	512551605
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36339	NC_021487	TCGG	2	8	1878382	1878389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36340	NC_021487	AAC	2	6	1878391	1878396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36341	NC_021487	AGC	2	6	1878468	1878473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551606
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36344	NC_021487	CCT	2	6	1878577	1878582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551606
36345	NC_021487	ATG	2	6	1878583	1878588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551606
36346	NC_021487	AAC	2	6	1878694	1878699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551606
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36348	NC_021487	GTT	2	6	1878881	1878886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36349	NC_021487	CCA	2	6	1878917	1878922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36350	NC_021487	AG	3	6	1878951	1878956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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36470	NC_021487	TCG	2	6	1886050	1886055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551611
36471	NC_021487	GAT	2	6	1886100	1886105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551611
36472	NC_021487	GT	3	6	1886243	1886248	0 %	50 %	50 %	0 %	512551611
36473	NC_021487	GC	3	6	1886272	1886277	0 %	0 %	50 %	50 %	512551611
36474	NC_021487	T	6	6	1886309	1886314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36475	NC_021487	CTC	2	6	1886323	1886328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36476	NC_021487	AG	3	6	1886338	1886343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36477	NC_021487	GTT	2	6	1886392	1886397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36478	NC_021487	CCT	2	6	1886400	1886405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36479	NC_021487	C	6	6	1886451	1886456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36480	NC_021487	GA	3	6	1886501	1886506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36481	NC_021487	CCA	2	6	1886539	1886544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551612
36482	NC_021487	C	7	7	1886565	1886571	0 %	0 %	0 %	100 %	512551612
36483	NC_021487	CTT	2	6	1886622	1886627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551612
36484	NC_021487	TCC	2	6	1886689	1886694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551612
36485	NC_021487	CTC	2	6	1886776	1886781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551612
36486	NC_021487	CCG	2	6	1886788	1886793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551612
36487	NC_021487	CTT	2	6	1886853	1886858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551612
36488	NC_021487	CTT	2	6	1886862	1886867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551612
36489	NC_021487	CTC	2	6	1886889	1886894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551612
36490	NC_021487	CTA	2	6	1886912	1886917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551612
36491	NC_021487	GAG	2	6	1886937	1886942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551612
36492	NC_021487	GAG	2	6	1886967	1886972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551612
36493	NC_021487	CGCC	2	8	1886984	1886991	0 %	0 %	25 %	75 %	512551612
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36495	NC_021487	ATGTTG	2	12	1887093	1887104	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512551612
36496	NC_021487	CTGC	2	8	1887116	1887123	0 %	25 %	25 %	50 %	512551612
36497	NC_021487	TCC	2	6	1887136	1887141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551612
36498	NC_021487	GCT	2	6	1887201	1887206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551613
36499	NC_021487	GAC	2	6	1887271	1887276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551613
36500	NC_021487	A	7	7	1887396	1887402	100 %	0 %	0 %	0 %	512551613

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