MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34003	NC_021487	CAA	2	6	1756908	1756913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551516
34004	NC_021487	CCT	2	6	1756950	1756955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551516
34005	NC_021487	GGGA	2	8	1757019	1757026	25 %	0 %	75 %	0 %	512551516
34006	NC_021487	GTGC	2	8	1757045	1757052	0 %	25 %	50 %	25 %	512551516
34007	NC_021487	GAT	2	6	1757071	1757076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551516
34008	NC_021487	GC	3	6	1757121	1757126	0 %	0 %	50 %	50 %	512551516
34009	NC_021487	GC	3	6	1757174	1757179	0 %	0 %	50 %	50 %	512551516
34010	NC_021487	GCC	2	6	1757204	1757209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551516
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34034	NC_021487	CTG	2	6	1758423	1758428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551517
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34039	NC_021487	GC	3	6	1758557	1758562	0 %	0 %	50 %	50 %	512551518
34040	NC_021487	CAA	2	6	1758625	1758630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551518
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34042	NC_021487	AGC	2	6	1758680	1758685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551518
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34044	NC_021487	GAAG	2	8	1758735	1758742	50 %	0 %	50 %	0 %	512551518
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34052	NC_021487	ATCG	2	8	1759029	1759036	25 %	25 %	25 %	25 %	512551518
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34074	NC_021487	GAT	2	6	1759964	1759969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551519
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34093	NC_021487	CCCA	2	8	1761091	1761098	25 %	0 %	0 %	75 %	512551520
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34100	NC_021487	GAA	2	6	1761297	1761302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551520
34101	NC_021487	AGA	2	6	1761411	1761416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551520
34102	NC_021487	AAT	2	6	1761428	1761433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551520
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34104	NC_021487	AGC	2	6	1761608	1761613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34105	NC_021487	CTT	2	6	1761620	1761625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34106	NC_021487	GC	3	6	1761687	1761692	0 %	0 %	50 %	50 %	512551521
34107	NC_021487	CCT	2	6	1761723	1761728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551521
34108	NC_021487	CG	3	6	1761753	1761758	0 %	0 %	50 %	50 %	512551521
34109	NC_021487	CGG	2	6	1761831	1761836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551521
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34118	NC_021487	CAC	2	6	1762255	1762260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551521
34119	NC_021487	CG	3	6	1762275	1762280	0 %	0 %	50 %	50 %	512551521
34120	NC_021487	TGC	2	6	1762401	1762406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551521
34121	NC_021487	CCA	2	6	1762458	1762463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551521
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34139	NC_021487	GCA	2	6	1763327	1763332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551522
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34144	NC_021487	AAG	2	6	1763605	1763610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34145	NC_021487	TAT	2	6	1763677	1763682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34146	NC_021487	GAAA	2	8	1763720	1763727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34147	NC_021487	GAG	2	6	1763771	1763776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34151	NC_021487	TGT	2	6	1763929	1763934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551523
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34164	NC_021487	ATG	2	6	1764846	1764851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551523
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34166	NC_021487	TCCC	2	8	1764957	1764964	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34167	NC_021487	CTA	2	6	1765040	1765045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34169	NC_021487	CGCC	2	8	1765063	1765070	0 %	0 %	25 %	75 %	512551524
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34198	NC_021487	CCCT	2	8	1766469	1766476	0 %	25 %	0 %	75 %	512551524
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34207	NC_021487	CA	3	6	1766861	1766866	50 %	0 %	0 %	50 %	512551524
34208	NC_021487	ATTAA	2	10	1766935	1766944	60 %	40 %	0 %	0 %	512551524
34209	NC_021487	AAG	2	6	1766997	1767002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34210	NC_021487	GTC	2	6	1767033	1767038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34211	NC_021487	AAG	2	6	1767045	1767050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34212	NC_021487	GGAT	2	8	1767051	1767058	25 %	25 %	50 %	0 %	512551525
34213	NC_021487	TGA	2	6	1767100	1767105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551525
34214	NC_021487	TCA	2	6	1767199	1767204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551525
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34218	NC_021487	CTC	2	6	1767335	1767340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551525
34219	NC_021487	GGTG	2	8	1767346	1767353	0 %	25 %	75 %	0 %	512551525
34220	NC_021487	AAGCC	2	10	1767382	1767391	40 %	0 %	20 %	40 %	512551525
34221	NC_021487	CTGC	2	8	1767430	1767437	0 %	25 %	25 %	50 %	512551525
34222	NC_021487	AAC	2	6	1767468	1767473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551525
34223	NC_021487	CTG	2	6	1767560	1767565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551525
34224	NC_021487	GTG	2	6	1767626	1767631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551525
34225	NC_021487	TTG	2	6	1767665	1767670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551525
34226	NC_021487	ATG	2	6	1767687	1767692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551525
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34230	NC_021487	GC	3	6	1767855	1767860	0 %	0 %	50 %	50 %	512551525
34231	NC_021487	GA	3	6	1767869	1767874	50 %	0 %	50 %	0 %	512551525
34232	NC_021487	A	6	6	1767878	1767883	100 %	0 %	0 %	0 %	512551525
34233	NC_021487	GCC	2	6	1767932	1767937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551525
34234	NC_021487	TGC	2	6	1767939	1767944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551525
34235	NC_021487	AGA	2	6	1768000	1768005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551525
34236	NC_021487	GCG	2	6	1768021	1768026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551525
34237	NC_021487	TCC	2	6	1768146	1768151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551525
34238	NC_021487	GCA	2	6	1768154	1768159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551525
34239	NC_021487	CTG	2	6	1768208	1768213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551525
34240	NC_021487	TTA	2	6	1768292	1768297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512551526
34241	NC_021487	CAA	2	6	1768414	1768419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551526
34242	NC_021487	CCCT	2	8	1768480	1768487	0 %	25 %	0 %	75 %	512551526
34243	NC_021487	GGTG	2	8	1768530	1768537	0 %	25 %	75 %	0 %	512551526
34244	NC_021487	ACT	2	6	1768538	1768543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551526
34245	NC_021487	GTG	2	6	1768570	1768575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551526
34246	NC_021487	GGT	2	6	1768593	1768598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551526
34247	NC_021487	TCA	2	6	1768604	1768609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551526
34248	NC_021487	GAT	2	6	1768630	1768635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551526
34249	NC_021487	ATC	2	6	1768676	1768681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551526
34250	NC_021487	CCT	2	6	1768716	1768721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551526
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34252	NC_021487	TCA	2	6	1768790	1768795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551526
34253	NC_021487	CTGT	2	8	1768823	1768830	0 %	50 %	25 %	25 %	512551526
34254	NC_021487	CGT	2	6	1768831	1768836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551526
34255	NC_021487	TGC	2	6	1768841	1768846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551526
34256	NC_021487	CGCTC	2	10	1768893	1768902	0 %	20 %	20 %	60 %	512551526
34257	NC_021487	GGT	2	6	1768932	1768937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551526
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34259	NC_021487	GAG	2	6	1769066	1769071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551526
34260	NC_021487	GCG	2	6	1769075	1769080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551526
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34264	NC_021487	GGA	2	6	1769392	1769397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551527
34265	NC_021487	GCA	2	6	1769408	1769413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551527
34266	NC_021487	G	6	6	1769489	1769494	0 %	0 %	100 %	0 %	512551527
34267	NC_021487	TCG	2	6	1769502	1769507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551527
34268	NC_021487	CT	3	6	1769562	1769567	0 %	50 %	0 %	50 %	512551527
34269	NC_021487	AG	3	6	1769586	1769591	50 %	0 %	50 %	0 %	512551527
34270	NC_021487	CGG	2	6	1769608	1769613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551527
34271	NC_021487	GC	3	6	1769653	1769658	0 %	0 %	50 %	50 %	512551527
34272	NC_021487	GC	3	6	1769672	1769677	0 %	0 %	50 %	50 %	512551527
34273	NC_021487	CAC	2	6	1769702	1769707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551527
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34300	NC_021487	TGA	2	6	1771019	1771024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551529
34301	NC_021487	CTG	2	6	1771111	1771116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551529
34302	NC_021487	AGC	2	6	1771175	1771180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551529
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34305	NC_021487	CTAT	2	8	1771337	1771344	25 %	50 %	0 %	25 %	512551529
34306	NC_021487	CA	3	6	1771400	1771405	50 %	0 %	0 %	50 %	512551529
34307	NC_021487	AGGCC	2	10	1771421	1771430	20 %	0 %	40 %	40 %	512551529
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34310	NC_021487	GGC	2	6	1771512	1771517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34312	NC_021487	CAA	2	6	1771581	1771586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34313	NC_021487	CT	4	8	1771629	1771636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34314	NC_021487	AG	3	6	1771642	1771647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34315	NC_021487	A	6	6	1771697	1771702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34316	NC_021487	GT	3	6	1771765	1771770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34317	NC_021487	CGC	2	6	1771800	1771805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551530
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34332	NC_021487	TGA	2	6	1772378	1772383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551530
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34338	NC_021487	GCC	2	6	1772664	1772669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551530
34339	NC_021487	TCGA	2	8	1772713	1772720	25 %	25 %	25 %	25 %	512551530
34340	NC_021487	GA	3	6	1772732	1772737	50 %	0 %	50 %	0 %	512551530
34341	NC_021487	CTGG	2	8	1772742	1772749	0 %	25 %	50 %	25 %	512551530
34342	NC_021487	CCT	2	6	1772750	1772755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551530
34343	NC_021487	GCC	2	6	1772848	1772853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551530
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34345	NC_021487	TTG	2	6	1772906	1772911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551530
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34349	NC_021487	CGC	2	6	1773015	1773020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551530
34350	NC_021487	GAG	2	6	1773310	1773315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551530
34351	NC_021487	GCT	2	6	1773431	1773436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551530
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34499	NC_021487	CCA	2	6	1780502	1780507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34500	NC_021487	TA	3	6	1780541	1780546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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