MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_021487	GAG	2	6	1707672	1707677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33003	NC_021487	GAAA	2	8	1707688	1707695	75 %	0 %	25 %	0 %	512551474
33004	NC_021487	GCC	2	6	1707716	1707721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551474
33005	NC_021487	TCATTG	2	12	1707738	1707749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512551474
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33007	NC_021487	GCA	2	6	1707814	1707819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551474
33008	NC_021487	CCA	2	6	1707886	1707891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551474
33009	NC_021487	CGG	2	6	1707894	1707899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551474
33010	NC_021487	GCAG	2	8	1707934	1707941	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33011	NC_021487	TCA	2	6	1707948	1707953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33012	NC_021487	A	7	7	1707966	1707972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33013	NC_021487	AGG	2	6	1707974	1707979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33014	NC_021487	ATTG	2	8	1708007	1708014	25 %	50 %	25 %	0 %	512551475
33015	NC_021487	GCT	2	6	1708016	1708021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551475
33016	NC_021487	ACG	2	6	1708162	1708167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551475
33017	NC_021487	TCT	2	6	1708195	1708200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551475
33018	NC_021487	GGA	2	6	1708206	1708211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551475
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33020	NC_021487	CCG	2	6	1708234	1708239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551475
33021	NC_021487	GAA	2	6	1708271	1708276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551475
33022	NC_021487	CGA	2	6	1708298	1708303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551475
33023	NC_021487	ACG	2	6	1708318	1708323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551475
33024	NC_021487	GAT	2	6	1708341	1708346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551475
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33026	NC_021487	CCAA	2	8	1708470	1708477	50 %	0 %	0 %	50 %	512551475
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33028	NC_021487	CAT	2	6	1708707	1708712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551475
33029	NC_021487	TGGA	2	8	1708735	1708742	25 %	25 %	50 %	0 %	512551475
33030	NC_021487	TGT	2	6	1708893	1708898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551476
33031	NC_021487	TAT	2	6	1708970	1708975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512551476
33032	NC_021487	AC	3	6	1708989	1708994	50 %	0 %	0 %	50 %	512551476
33033	NC_021487	ATG	2	6	1709008	1709013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551476
33034	NC_021487	CAG	2	6	1709117	1709122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551476
33035	NC_021487	TGA	2	6	1709125	1709130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551476
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33038	NC_021487	TGA	2	6	1709338	1709343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551476
33039	NC_021487	CG	3	6	1709403	1709408	0 %	0 %	50 %	50 %	512551476
33040	NC_021487	ACA	2	6	1709555	1709560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551476
33041	NC_021487	AG	3	6	1709665	1709670	50 %	0 %	50 %	0 %	512551476
33042	NC_021487	TTG	2	6	1709734	1709739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551476
33043	NC_021487	AGC	2	6	1709817	1709822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551476
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33046	NC_021487	CTG	2	6	1710051	1710056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551476
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33048	NC_021487	GAG	3	9	1710212	1710220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33049	NC_021487	GTT	2	6	1710280	1710285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551477
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33051	NC_021487	CT	3	6	1710342	1710347	0 %	50 %	0 %	50 %	512551477
33052	NC_021487	GCA	2	6	1710352	1710357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551477
33053	NC_021487	GAT	2	6	1710393	1710398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551477
33054	NC_021487	GGC	2	6	1710482	1710487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551477
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33059	NC_021487	CAG	2	6	1710747	1710752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551477
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33070	NC_021487	CTG	2	6	1711281	1711286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551477
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33081	NC_021487	GCGCAA	2	12	1711684	1711695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551478
33082	NC_021487	TCCC	2	8	1711866	1711873	0 %	25 %	0 %	75 %	512551478
33083	NC_021487	ATAG	2	8	1711992	1711999	50 %	25 %	25 %	0 %	512551478
33084	NC_021487	TAG	2	6	1712015	1712020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551478
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33086	NC_021487	GAG	2	6	1712571	1712576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551478
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33088	NC_021487	TC	3	6	1712640	1712645	0 %	50 %	0 %	50 %	512551478
33089	NC_021487	GCT	2	6	1712688	1712693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551478
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33091	NC_021487	TGA	2	6	1712874	1712879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551478
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33094	NC_021487	GTTCCA	2	12	1712969	1712980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512551479
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33097	NC_021487	AATGGC	2	12	1713127	1713138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512551479
33098	NC_021487	AGG	2	6	1713228	1713233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33099	NC_021487	TCTA	2	8	1713286	1713293	25 %	50 %	0 %	25 %	512551480
33100	NC_021487	GC	3	6	1713390	1713395	0 %	0 %	50 %	50 %	512551480
33101	NC_021487	CAC	2	6	1713464	1713469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551480
33102	NC_021487	GA	3	6	1713521	1713526	50 %	0 %	50 %	0 %	512551480
33103	NC_021487	GTG	2	6	1713534	1713539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551480
33104	NC_021487	GAT	2	6	1713588	1713593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551480
33105	NC_021487	CCA	2	6	1713602	1713607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551480
33106	NC_021487	GGC	2	6	1713633	1713638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551480
33107	NC_021487	AGC	2	6	1713644	1713649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551480
33108	NC_021487	CTCA	2	8	1713690	1713697	25 %	25 %	0 %	50 %	512551480
33109	NC_021487	TGG	2	6	1713710	1713715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551480
33110	NC_021487	AAACC	2	10	1713867	1713876	60 %	0 %	0 %	40 %	512551480
33111	NC_021487	GAA	2	6	1713934	1713939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551480
33112	NC_021487	ACC	2	6	1713941	1713946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551480
33113	NC_021487	GAA	2	6	1713960	1713965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551480
33114	NC_021487	TCA	2	6	1713967	1713972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551480
33115	NC_021487	CAT	2	6	1713987	1713992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551480
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33117	NC_021487	CGC	2	6	1714080	1714085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551480
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33122	NC_021487	ATA	2	6	1714456	1714461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33125	NC_021487	AAG	2	6	1714538	1714543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33236	NC_021487	CGG	2	6	1719613	1719618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551485
33237	NC_021487	CAT	2	6	1719622	1719627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551485
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33241	NC_021487	CTA	2	6	1719709	1719714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551485
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33270	NC_021487	A	7	7	1721204	1721210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33271	NC_021487	GCC	2	6	1721219	1721224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551486
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33331	NC_021487	CG	3	6	1723420	1723425	0 %	0 %	50 %	50 %	512551488
33332	NC_021487	CCG	2	6	1723429	1723434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551488
33333	NC_021487	TGGGC	2	10	1723465	1723474	0 %	20 %	60 %	20 %	512551488
33334	NC_021487	CAC	2	6	1723484	1723489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551488
33335	NC_021487	CGG	2	6	1723507	1723512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551488
33336	NC_021487	CAA	2	6	1723514	1723519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551488
33337	NC_021487	GGT	2	6	1723657	1723662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551488
33338	NC_021487	CAT	2	6	1723705	1723710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551488
33339	NC_021487	GGT	2	6	1723729	1723734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551488
33340	NC_021487	CGG	2	6	1723789	1723794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551488
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33342	NC_021487	GCT	2	6	1723819	1723824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551488
33343	NC_021487	GCT	2	6	1723876	1723881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551489
33344	NC_021487	AGC	2	6	1723890	1723895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551489
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33346	NC_021487	GCAA	2	8	1723940	1723947	50 %	0 %	25 %	25 %	512551489
33347	NC_021487	GCC	2	6	1723973	1723978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551489
33348	NC_021487	CAG	2	6	1724027	1724032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551489
33349	NC_021487	CCT	2	6	1724035	1724040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551489
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33351	NC_021487	GC	3	6	1724102	1724107	0 %	0 %	50 %	50 %	512551489
33352	NC_021487	CGG	2	6	1724158	1724163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551489
33353	NC_021487	GC	4	8	1724172	1724179	0 %	0 %	50 %	50 %	512551489
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33356	NC_021487	TCT	2	6	1724307	1724312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551489
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33370	NC_021487	CGA	2	6	1724936	1724941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551491
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33469	NC_021487	GTG	2	6	1729727	1729732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551495
33470	NC_021487	TGA	2	6	1729756	1729761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551495
33471	NC_021487	GCG	2	6	1729789	1729794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551495
33472	NC_021487	ATCC	2	8	1729860	1729867	25 %	25 %	0 %	50 %	512551495
33473	NC_021487	TCG	2	6	1729983	1729988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551495
33474	NC_021487	CCA	2	6	1730018	1730023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551495
33475	NC_021487	CTG	2	6	1730099	1730104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551495
33476	NC_021487	CTG	2	6	1730149	1730154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551495
33477	NC_021487	TG	3	6	1730153	1730158	0 %	50 %	50 %	0 %	512551495
33478	NC_021487	GTG	2	6	1730223	1730228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551495
33479	NC_021487	ACC	2	6	1730261	1730266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33480	NC_021487	TGC	2	6	1730268	1730273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551496
33481	NC_021487	GCT	4	12	1730311	1730322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551496
33482	NC_021487	TTG	2	6	1730364	1730369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551496
33483	NC_021487	ACC	2	6	1730393	1730398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551496
33484	NC_021487	TTC	2	6	1730478	1730483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551496
33485	NC_021487	ACGC	2	8	1730611	1730618	25 %	0 %	25 %	50 %	512551496
33486	NC_021487	CG	3	6	1730691	1730696	0 %	0 %	50 %	50 %	512551496
33487	NC_021487	ACG	2	6	1730703	1730708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551496
33488	NC_021487	GTT	2	6	1730726	1730731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551496
33489	NC_021487	CTC	2	6	1730795	1730800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551496
33490	NC_021487	TGG	2	6	1730817	1730822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551496
33491	NC_021487	GC	4	8	1730823	1730830	0 %	0 %	50 %	50 %	512551496
33492	NC_021487	TCC	2	6	1730965	1730970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551496
33493	NC_021487	GTG	2	6	1730990	1730995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551496
33494	NC_021487	CTG	2	6	1731045	1731050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551496
33495	NC_021487	TGC	2	6	1731081	1731086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551496
33496	NC_021487	CCT	2	6	1731105	1731110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551497
33497	NC_021487	GTT	2	6	1731111	1731116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551497
33498	NC_021487	TCC	2	6	1731122	1731127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551497
33499	NC_021487	GGC	2	6	1731135	1731140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551497
33500	NC_021487	CGC	2	6	1731198	1731203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551497

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