MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_021487	CG	3	6	1659052	1659057	0 %	0 %	50 %	50 %	512551433
32003	NC_021487	TGC	2	6	1659068	1659073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551433
32004	NC_021487	CT	3	6	1659107	1659112	0 %	50 %	0 %	50 %	512551434
32005	NC_021487	TC	3	6	1659115	1659120	0 %	50 %	0 %	50 %	512551434
32006	NC_021487	CCT	2	6	1659146	1659151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551434
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32008	NC_021487	GC	3	6	1659380	1659385	0 %	0 %	50 %	50 %	512551434
32009	NC_021487	CCT	2	6	1659449	1659454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551434
32010	NC_021487	GTC	2	6	1659583	1659588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551434
32011	NC_021487	CAA	2	6	1659615	1659620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551434
32012	NC_021487	CCT	2	6	1659623	1659628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551434
32013	NC_021487	GCT	2	6	1659650	1659655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551434
32014	NC_021487	CTC	2	6	1659663	1659668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551434
32015	NC_021487	CCT	2	6	1659683	1659688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551434
32016	NC_021487	CGC	2	6	1659694	1659699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551434
32017	NC_021487	GA	3	6	1659706	1659711	50 %	0 %	50 %	0 %	512551434
32018	NC_021487	ATCC	2	8	1659771	1659778	25 %	25 %	0 %	50 %	512551434
32019	NC_021487	GC	3	6	1659791	1659796	0 %	0 %	50 %	50 %	512551434
32020	NC_021487	CCT	2	6	1659818	1659823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551434
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32022	NC_021487	CG	4	8	1659887	1659894	0 %	0 %	50 %	50 %	512551434
32023	NC_021487	CTG	2	6	1659897	1659902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551434
32024	NC_021487	GCT	3	9	1659905	1659913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551434
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32031	NC_021487	GCA	2	6	1660301	1660306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551434
32032	NC_021487	TCC	2	6	1660374	1660379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551434
32033	NC_021487	CCA	2	6	1660382	1660387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551434
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32039	NC_021487	A	6	6	1660710	1660715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32040	NC_021487	CTTC	2	8	1660790	1660797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32041	NC_021487	TCG	2	6	1660817	1660822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32042	NC_021487	GCG	2	6	1660857	1660862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32043	NC_021487	AG	3	6	1660887	1660892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32044	NC_021487	AGC	2	6	1660930	1660935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32045	NC_021487	AG	3	6	1660961	1660966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32046	NC_021487	TGA	2	6	1660999	1661004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32047	NC_021487	GTTCT	2	10	1661114	1661123	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32048	NC_021487	AGG	2	6	1661151	1661156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32049	NC_021487	TTGGCG	2	12	1661225	1661236	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512551435
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32052	NC_021487	A	7	7	1661566	1661572	100 %	0 %	0 %	0 %	512551435
32053	NC_021487	CAA	2	6	1661586	1661591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551435
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32055	NC_021487	TTCTC	2	10	1661755	1661764	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32056	NC_021487	TTA	2	6	1661791	1661796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32057	NC_021487	GTC	2	6	1661807	1661812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32058	NC_021487	CAA	2	6	1661840	1661845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551436
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32062	NC_021487	CTTT	2	8	1661916	1661923	0 %	75 %	0 %	25 %	512551436
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32065	NC_021487	CAA	2	6	1662029	1662034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551436
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32068	NC_021487	CTG	2	6	1662132	1662137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551436
32069	NC_021487	G	7	7	1662144	1662150	0 %	0 %	100 %	0 %	512551436
32070	NC_021487	TCG	2	6	1662199	1662204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32072	NC_021487	CTG	2	6	1662436	1662441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551437
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32091	NC_021487	ACCGT	2	10	1663311	1663320	20 %	20 %	20 %	40 %	512551437
32092	NC_021487	AG	3	6	1663389	1663394	50 %	0 %	50 %	0 %	512551437
32093	NC_021487	AGC	2	6	1663397	1663402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551437
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32097	NC_021487	TCA	2	6	1663614	1663619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551437
32098	NC_021487	TC	3	6	1663632	1663637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32099	NC_021487	CCG	2	6	1663643	1663648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32100	NC_021487	CCTC	2	8	1663701	1663708	0 %	25 %	0 %	75 %	512551438
32101	NC_021487	CTG	2	6	1663742	1663747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551438
32102	NC_021487	GTC	2	6	1663784	1663789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551438
32103	NC_021487	TCC	2	6	1663851	1663856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551438
32104	NC_021487	GGC	2	6	1664039	1664044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551438
32105	NC_021487	CGT	2	6	1664073	1664078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551438
32106	NC_021487	TAG	2	6	1664121	1664126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551438
32107	NC_021487	ACC	2	6	1664157	1664162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551438
32108	NC_021487	GCG	2	6	1664224	1664229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551438
32109	NC_021487	CTC	2	6	1664237	1664242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551438
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32112	NC_021487	CTT	2	6	1664410	1664415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551438
32113	NC_021487	GCA	2	6	1664440	1664445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551438
32114	NC_021487	CCGCC	2	10	1664471	1664480	0 %	0 %	20 %	80 %	512551438
32115	NC_021487	TCC	2	6	1664484	1664489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551438
32116	NC_021487	CAC	3	9	1664510	1664518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551438
32117	NC_021487	CT	4	8	1664574	1664581	0 %	50 %	0 %	50 %	512551438
32118	NC_021487	CTT	2	6	1664599	1664604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551438
32119	NC_021487	TGGC	2	8	1664690	1664697	0 %	25 %	50 %	25 %	512551438
32120	NC_021487	CCGC	2	8	1664710	1664717	0 %	0 %	25 %	75 %	512551438
32121	NC_021487	CTG	2	6	1664738	1664743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551438
32122	NC_021487	AGC	2	6	1664802	1664807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551438
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32141	NC_021487	CTT	2	6	1665640	1665645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32144	NC_021487	CCAAT	2	10	1665726	1665735	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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32146	NC_021487	ACA	2	6	1665794	1665799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551440
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32192	NC_021487	TCC	2	6	1667988	1667993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32193	NC_021487	AGA	2	6	1667998	1668003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32200	NC_021487	CGG	2	6	1668734	1668739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551442
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32203	NC_021487	ACCT	2	8	1668792	1668799	25 %	25 %	0 %	50 %	512551442
32204	NC_021487	CGT	2	6	1668800	1668805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551442
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32207	NC_021487	TGC	2	6	1668949	1668954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551442
32208	NC_021487	CAT	2	6	1668998	1669003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551442
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32211	NC_021487	GC	4	8	1669178	1669185	0 %	0 %	50 %	50 %	512551442
32212	NC_021487	TGC	2	6	1669192	1669197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551442
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32216	NC_021487	ACG	2	6	1669462	1669467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551442
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32218	NC_021487	GC	3	6	1669613	1669618	0 %	0 %	50 %	50 %	512551442
32219	NC_021487	GCC	2	6	1669683	1669688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551442
32220	NC_021487	CCT	2	6	1669756	1669761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551442
32221	NC_021487	CG	3	6	1669768	1669773	0 %	0 %	50 %	50 %	512551442
32222	NC_021487	GCC	2	6	1669789	1669794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551442
32223	NC_021487	CTG	2	6	1669878	1669883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551442
32224	NC_021487	CTCG	2	8	1669960	1669967	0 %	25 %	25 %	50 %	512551442
32225	NC_021487	AGA	2	6	1670045	1670050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551442
32226	NC_021487	ACG	2	6	1670059	1670064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551442
32227	NC_021487	CTA	2	6	1670075	1670080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551442
32228	NC_021487	CGC	2	6	1670106	1670111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551442
32229	NC_021487	CCA	2	6	1670294	1670299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551443
32230	NC_021487	CCG	2	6	1670304	1670309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551443
32231	NC_021487	AAT	2	6	1670487	1670492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551443
32232	NC_021487	GCC	2	6	1670560	1670565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551443
32233	NC_021487	GGT	2	6	1670574	1670579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551443
32234	NC_021487	GCACC	2	10	1670589	1670598	20 %	0 %	20 %	60 %	512551443
32235	NC_021487	GA	3	6	1670624	1670629	50 %	0 %	50 %	0 %	512551443
32236	NC_021487	GCAA	2	8	1670642	1670649	50 %	0 %	25 %	25 %	512551443
32237	NC_021487	GCCC	2	8	1670668	1670675	0 %	0 %	25 %	75 %	512551443
32238	NC_021487	CACC	2	8	1670720	1670727	25 %	0 %	0 %	75 %	512551443
32239	NC_021487	GCC	2	6	1670782	1670787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551443
32240	NC_021487	GCGG	2	8	1670814	1670821	0 %	0 %	75 %	25 %	512551443
32241	NC_021487	CAA	2	6	1670822	1670827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551443
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32245	NC_021487	TCC	2	6	1670918	1670923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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32282	NC_021487	TTA	2	6	1672465	1672470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32283	NC_021487	A	6	6	1672470	1672475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32284	NC_021487	GT	3	6	1672485	1672490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32285	NC_021487	C	6	6	1672510	1672515	0 %	0 %	0 %	100 %	512551445
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32290	NC_021487	TCC	3	9	1672767	1672775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551445
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32318	NC_021487	TCC	2	6	1674006	1674011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32319	NC_021487	TGGTAA	2	12	1674051	1674062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551447
32320	NC_021487	GTA	2	6	1674181	1674186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551447
32321	NC_021487	CTTTA	2	10	1674280	1674289	20 %	60 %	0 %	20 %	512551447
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32324	NC_021487	TCG	2	6	1674422	1674427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551447
32325	NC_021487	GTA	2	6	1674430	1674435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551447
32326	NC_021487	CGT	2	6	1674603	1674608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551447
32327	NC_021487	GCTG	2	8	1674637	1674644	0 %	25 %	50 %	25 %	512551447
32328	NC_021487	CCG	2	6	1674684	1674689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551447
32329	NC_021487	AAT	2	6	1674772	1674777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551447
32330	NC_021487	TGCC	2	8	1674789	1674796	0 %	25 %	25 %	50 %	512551447
32331	NC_021487	ATCT	2	8	1674832	1674839	25 %	50 %	0 %	25 %	512551447
32332	NC_021487	CCG	2	6	1674956	1674961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551447
32333	NC_021487	TCC	2	6	1675044	1675049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551447
32334	NC_021487	CTC	2	6	1675064	1675069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551448
32335	NC_021487	ATC	2	6	1675275	1675280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551448
32336	NC_021487	GCT	2	6	1675351	1675356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551448
32337	NC_021487	GCC	2	6	1675368	1675373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551448
32338	NC_021487	TCC	2	6	1675389	1675394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551448
32339	NC_021487	CGC	2	6	1675421	1675426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551448
32340	NC_021487	GCC	2	6	1675442	1675447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551448
32341	NC_021487	GCA	2	6	1675462	1675467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551448
32342	NC_021487	C	7	7	1675534	1675540	0 %	0 %	0 %	100 %	512551448
32343	NC_021487	ATA	2	6	1675563	1675568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551448
32344	NC_021487	AG	3	6	1675600	1675605	50 %	0 %	50 %	0 %	512551448
32345	NC_021487	CAG	2	6	1675646	1675651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551448
32346	NC_021487	GCC	2	6	1675680	1675685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551448
32347	NC_021487	AAT	2	6	1675709	1675714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551448
32348	NC_021487	CCTC	2	8	1675716	1675723	0 %	25 %	0 %	75 %	512551448
32349	NC_021487	CCG	3	9	1675747	1675755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551448
32350	NC_021487	CGT	2	6	1675789	1675794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551448
32351	NC_021487	TGCG	2	8	1675917	1675924	0 %	25 %	50 %	25 %	512551448
32352	NC_021487	A	6	6	1675986	1675991	100 %	0 %	0 %	0 %	512551448
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32355	NC_021487	GAT	2	6	1676291	1676296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551448
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32357	NC_021487	TTC	2	6	1676408	1676413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32358	NC_021487	GTA	2	6	1676480	1676485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32359	NC_021487	TAA	2	6	1676493	1676498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32360	NC_021487	GTT	2	6	1676513	1676518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32361	NC_021487	TC	3	6	1676568	1676573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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32365	NC_021487	T	6	6	1676706	1676711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32366	NC_021487	GCGACC	2	12	1676815	1676826	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512551449
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32462	NC_021487	GAG	2	6	1681588	1681593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32468	NC_021487	CT	3	6	1681724	1681729	0 %	50 %	0 %	50 %	512551451
32469	NC_021487	GTT	2	6	1681751	1681756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551451
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