MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_021487	GCC	2	6	1632490	1632495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551408
31503	NC_021487	AGA	2	6	1632643	1632648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551408
31504	NC_021487	ATG	2	6	1632658	1632663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551408
31505	NC_021487	AGCA	2	8	1632693	1632700	50 %	0 %	25 %	25 %	512551408
31506	NC_021487	AGA	2	6	1632706	1632711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551408
31507	NC_021487	ACC	2	6	1632714	1632719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551408
31508	NC_021487	ACC	2	6	1632735	1632740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551408
31509	NC_021487	AG	3	6	1632759	1632764	50 %	0 %	50 %	0 %	512551408
31510	NC_021487	GCA	2	6	1632769	1632774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551408
31511	NC_021487	CAG	2	6	1632876	1632881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551408
31512	NC_021487	TGA	2	6	1632901	1632906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551408
31513	NC_021487	AAG	2	6	1632925	1632930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551408
31514	NC_021487	TTG	2	6	1632973	1632978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551408
31515	NC_021487	A	7	7	1633101	1633107	100 %	0 %	0 %	0 %	512551408
31516	NC_021487	GGC	2	6	1633110	1633115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551408
31517	NC_021487	AGC	3	9	1633150	1633158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551408
31518	NC_021487	AG	4	8	1633279	1633286	50 %	0 %	50 %	0 %	512551408
31519	NC_021487	ACC	2	6	1633315	1633320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551408
31520	NC_021487	GGC	2	6	1633374	1633379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551408
31521	NC_021487	CAA	2	6	1633400	1633405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551408
31522	NC_021487	CCA	2	6	1633412	1633417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551408
31523	NC_021487	GCC	2	6	1633424	1633429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551408
31524	NC_021487	GAT	2	6	1633445	1633450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551408
31525	NC_021487	AAG	2	6	1633475	1633480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551408
31526	NC_021487	CAGG	2	8	1633483	1633490	25 %	0 %	50 %	25 %	512551408
31527	NC_021487	AG	3	6	1633515	1633520	50 %	0 %	50 %	0 %	512551408
31528	NC_021487	AAG	3	9	1633564	1633572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551408
31529	NC_021487	GCAGAA	2	12	1633574	1633585	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512551408
31530	NC_021487	GCA	2	6	1633835	1633840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551408
31531	NC_021487	CG	3	6	1633861	1633866	0 %	0 %	50 %	50 %	512551408
31532	NC_021487	CT	3	6	1633873	1633878	0 %	50 %	0 %	50 %	512551408
31533	NC_021487	TCC	2	6	1633914	1633919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551408
31534	NC_021487	GAAG	2	8	1633984	1633991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31535	NC_021487	GCC	2	6	1633998	1634003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31536	NC_021487	GAA	2	6	1634045	1634050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31537	NC_021487	A	6	6	1634049	1634054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31538	NC_021487	TCC	3	9	1634147	1634155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551409
31539	NC_021487	CTGGA	2	10	1634253	1634262	20 %	20 %	40 %	20 %	512551409
31540	NC_021487	AGAC	2	8	1634351	1634358	50 %	0 %	25 %	25 %	512551409
31541	NC_021487	AGG	2	6	1634446	1634451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551409
31542	NC_021487	CGG	2	6	1634591	1634596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551409
31543	NC_021487	GTG	2	6	1634646	1634651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551409
31544	NC_021487	GGC	2	6	1634671	1634676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551409
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31546	NC_021487	TGG	2	6	1634821	1634826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551409
31547	NC_021487	TCC	2	6	1634846	1634851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551409
31548	NC_021487	CT	3	6	1634875	1634880	0 %	50 %	0 %	50 %	512551409
31549	NC_021487	GCA	2	6	1634899	1634904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31550	NC_021487	GGC	2	6	1634937	1634942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551409
31551	NC_021487	CCA	2	6	1634962	1634967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551409
31552	NC_021487	CGG	2	6	1635013	1635018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551409
31553	NC_021487	GTT	2	6	1635081	1635086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551409
31554	NC_021487	CAT	2	6	1635149	1635154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551409
31555	NC_021487	GAG	2	6	1635222	1635227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551409
31556	NC_021487	CT	3	6	1635246	1635251	0 %	50 %	0 %	50 %	512551409
31557	NC_021487	TGG	2	6	1635354	1635359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551409
31558	NC_021487	AAACCG	2	12	1635361	1635372	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512551409
31559	NC_021487	CAC	3	9	1635404	1635412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551409
31560	NC_021487	GTG	2	6	1635459	1635464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551409
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31562	NC_021487	TGC	2	6	1635535	1635540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31563	NC_021487	CGA	3	9	1635554	1635562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31564	NC_021487	CCGG	2	8	1635595	1635602	0 %	0 %	50 %	50 %	512551409
31565	NC_021487	GCT	2	6	1635650	1635655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31566	NC_021487	GAC	2	6	1635666	1635671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31567	NC_021487	CTG	2	6	1635675	1635680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31568	NC_021487	GGCC	2	8	1635683	1635690	0 %	0 %	50 %	50 %	512551409
31569	NC_021487	CCA	2	6	1635700	1635705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551409
31570	NC_021487	CGG	2	6	1635736	1635741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551409
31571	NC_021487	AGC	2	6	1635749	1635754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31572	NC_021487	CAA	2	6	1635816	1635821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551409
31573	NC_021487	CTC	2	6	1635826	1635831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551409
31574	NC_021487	GCA	2	6	1635843	1635848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31575	NC_021487	CCGAC	2	10	1635905	1635914	20 %	0 %	20 %	60 %	512551409
31576	NC_021487	CCG	2	6	1635928	1635933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551409
31577	NC_021487	GCG	2	6	1635965	1635970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551409
31578	NC_021487	ACG	2	6	1636011	1636016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551409
31579	NC_021487	GAG	2	6	1636158	1636163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31580	NC_021487	TCG	2	6	1636183	1636188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551410
31581	NC_021487	GCG	2	6	1636194	1636199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551410
31582	NC_021487	AAC	2	6	1636300	1636305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551410
31583	NC_021487	GAG	2	6	1636348	1636353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551410
31584	NC_021487	GTC	2	6	1636358	1636363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551410
31585	NC_021487	CAAG	2	8	1636425	1636432	50 %	0 %	25 %	25 %	512551410
31586	NC_021487	GC	3	6	1636524	1636529	0 %	0 %	50 %	50 %	512551410
31587	NC_021487	CAT	2	6	1636536	1636541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551410
31588	NC_021487	GAG	2	6	1636645	1636650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551410
31589	NC_021487	CATGG	2	10	1636721	1636730	20 %	20 %	40 %	20 %	512551410
31590	NC_021487	AGG	2	6	1636770	1636775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551410
31591	NC_021487	GC	3	6	1636831	1636836	0 %	0 %	50 %	50 %	512551410
31592	NC_021487	TGC	2	6	1636838	1636843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551410
31593	NC_021487	AGCT	2	8	1636859	1636866	25 %	25 %	25 %	25 %	512551410
31594	NC_021487	GCCGAT	2	12	1636885	1636896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512551410
31595	NC_021487	CCG	2	6	1636907	1636912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551410
31596	NC_021487	TC	3	6	1636952	1636957	0 %	50 %	0 %	50 %	512551410
31597	NC_021487	ATC	2	6	1636973	1636978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551410
31598	NC_021487	GCC	2	6	1637028	1637033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551410
31599	NC_021487	ACTC	2	8	1637061	1637068	25 %	25 %	0 %	50 %	512551410
31600	NC_021487	GGT	2	6	1637094	1637099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551410
31601	NC_021487	AGG	2	6	1637208	1637213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551410
31602	NC_021487	G	6	6	1637249	1637254	0 %	0 %	100 %	0 %	512551410
31603	NC_021487	CGG	3	9	1637294	1637302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551410
31604	NC_021487	GGCG	2	8	1637355	1637362	0 %	0 %	75 %	25 %	512551410
31605	NC_021487	GTT	2	6	1637385	1637390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551410
31606	NC_021487	TC	3	6	1637396	1637401	0 %	50 %	0 %	50 %	512551410
31607	NC_021487	AGG	2	6	1637424	1637429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551410
31608	NC_021487	ACC	2	6	1637431	1637436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551410
31609	NC_021487	AAAG	2	8	1637573	1637580	75 %	0 %	25 %	0 %	512551410
31610	NC_021487	C	6	6	1637608	1637613	0 %	0 %	0 %	100 %	512551411
31611	NC_021487	TCA	2	6	1637667	1637672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551411
31612	NC_021487	A	6	6	1637712	1637717	100 %	0 %	0 %	0 %	512551411
31613	NC_021487	CAG	2	6	1637771	1637776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551411
31614	NC_021487	TCC	2	6	1637802	1637807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551411
31615	NC_021487	CCT	2	6	1637824	1637829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551411
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31735	NC_021487	GCT	2	6	1644683	1644688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551417
31736	NC_021487	CTA	2	6	1644876	1644881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551418
31737	NC_021487	CGGTGG	2	12	1644897	1644908	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512551418
31738	NC_021487	ACGGC	2	10	1644932	1644941	20 %	0 %	40 %	40 %	512551418
31739	NC_021487	TTG	2	6	1644974	1644979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551418
31740	NC_021487	TTG	2	6	1645010	1645015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551418
31741	NC_021487	GAG	2	6	1645016	1645021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551418
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31745	NC_021487	CTGG	2	8	1645322	1645329	0 %	25 %	50 %	25 %	512551418
31746	NC_021487	AAAG	2	8	1645339	1645346	75 %	0 %	25 %	0 %	512551418
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31753	NC_021487	TTG	2	6	1645822	1645827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551418
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31800	NC_021487	CCT	2	6	1648118	1648123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31827	NC_021487	CAA	2	6	1649887	1649892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31829	NC_021487	ACAG	2	8	1650004	1650011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31830	NC_021487	GCT	2	6	1650067	1650072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551423
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31843	NC_021487	CCG	2	6	1650829	1650834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551423
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31845	NC_021487	T	6	6	1650857	1650862	0 %	100 %	0 %	0 %	512551423
31846	NC_021487	TACG	2	8	1650895	1650902	25 %	25 %	25 %	25 %	512551423
31847	NC_021487	GGC	2	6	1650915	1650920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551423
31848	NC_021487	CTC	2	6	1650932	1650937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551424
31849	NC_021487	TGG	2	6	1651007	1651012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551424
31850	NC_021487	CCGAT	2	10	1651102	1651111	20 %	20 %	20 %	40 %	512551424
31851	NC_021487	GCTT	2	8	1651144	1651151	0 %	50 %	25 %	25 %	512551424
31852	NC_021487	TTG	2	6	1651195	1651200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551424
31853	NC_021487	CCCA	2	8	1651435	1651442	25 %	0 %	0 %	75 %	512551424
31854	NC_021487	TGG	2	6	1651457	1651462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551424
31855	NC_021487	TGC	2	6	1651481	1651486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551424
31856	NC_021487	TACC	2	8	1651499	1651506	25 %	25 %	0 %	50 %	512551424
31857	NC_021487	CTG	2	6	1651530	1651535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551424
31858	NC_021487	TGG	2	6	1651646	1651651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551424
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31870	NC_021487	TCA	2	6	1652120	1652125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551424
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31882	NC_021487	TAG	2	6	1652645	1652650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551424
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31925	NC_021487	TACCC	2	10	1655321	1655330	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31926	NC_021487	GGAATA	2	12	1655519	1655530	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512551427
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31931	NC_021487	GC	3	6	1655836	1655841	0 %	0 %	50 %	50 %	512551427
31932	NC_021487	CGGG	2	8	1655900	1655907	0 %	0 %	75 %	25 %	512551427
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31939	NC_021487	TC	3	6	1656183	1656188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31940	NC_021487	AG	3	6	1656238	1656243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31941	NC_021487	T	6	6	1656286	1656291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31942	NC_021487	AG	3	6	1656312	1656317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31943	NC_021487	CCG	2	6	1656327	1656332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31944	NC_021487	GGAATT	2	12	1656368	1656379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551428
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31948	NC_021487	CCG	2	6	1656638	1656643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31949	NC_021487	TCCTT	2	10	1656679	1656688	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31950	NC_021487	CGGT	2	8	1656699	1656706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31951	NC_021487	GAA	2	6	1656707	1656712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31953	NC_021487	GC	3	6	1656805	1656810	0 %	0 %	50 %	50 %	512551429
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31957	NC_021487	TCT	2	6	1657017	1657022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551429
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31959	NC_021487	GTG	2	6	1657157	1657162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551430
31960	NC_021487	GCTG	2	8	1657222	1657229	0 %	25 %	50 %	25 %	512551430
31961	NC_021487	CCA	2	6	1657230	1657235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551430
31962	NC_021487	GC	3	6	1657265	1657270	0 %	0 %	50 %	50 %	512551430
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31965	NC_021487	TCGC	2	8	1657428	1657435	0 %	25 %	25 %	50 %	512551431
31966	NC_021487	TC	3	6	1657628	1657633	0 %	50 %	0 %	50 %	512551431
31967	NC_021487	CCT	2	6	1657638	1657643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31968	NC_021487	AAGC	2	8	1657676	1657683	50 %	0 %	25 %	25 %	512551432
31969	NC_021487	CATGTC	2	12	1657758	1657769	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512551432
31970	NC_021487	AGT	2	6	1657901	1657906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551432
31971	NC_021487	GC	3	6	1657987	1657992	0 %	0 %	50 %	50 %	512551432
31972	NC_021487	CAC	2	6	1658010	1658015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551432
31973	NC_021487	CAC	2	6	1658028	1658033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551432
31974	NC_021487	TCA	2	6	1658066	1658071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551432
31975	NC_021487	GCG	2	6	1658080	1658085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551432
31976	NC_021487	GGT	2	6	1658115	1658120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551432
31977	NC_021487	GCT	2	6	1658139	1658144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551432
31978	NC_021487	TCCT	2	8	1658145	1658152	0 %	50 %	0 %	50 %	512551432
31979	NC_021487	GAT	2	6	1658153	1658158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551432
31980	NC_021487	GAA	2	6	1658166	1658171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551432
31981	NC_021487	CAT	2	6	1658180	1658185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551432
31982	NC_021487	CCCGAA	2	12	1658264	1658275	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512551432
31983	NC_021487	ATCA	2	8	1658316	1658323	50 %	25 %	0 %	25 %	512551432
31984	NC_021487	TCT	2	6	1658365	1658370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551432
31985	NC_021487	GTC	2	6	1658455	1658460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551432
31986	NC_021487	GTT	2	6	1658517	1658522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551432
31987	NC_021487	TCCA	2	8	1658604	1658611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31988	NC_021487	CAA	2	6	1658615	1658620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31989	NC_021487	GA	3	6	1658633	1658638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31990	NC_021487	AATGCG	2	12	1658663	1658674	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512551433
31991	NC_021487	CGT	2	6	1658677	1658682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551433
31992	NC_021487	TCC	2	6	1658688	1658693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551433
31993	NC_021487	CCA	2	6	1658710	1658715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551433
31994	NC_021487	TGG	2	6	1658737	1658742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551433
31995	NC_021487	GTC	2	6	1658748	1658753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551433
31996	NC_021487	TCG	2	6	1658763	1658768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551433
31997	NC_021487	TCT	2	6	1658836	1658841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551433
31998	NC_021487	TCC	2	6	1658870	1658875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551433
31999	NC_021487	CGG	2	6	1658917	1658922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551433
32000	NC_021487	CCA	3	9	1658974	1658982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551433

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