MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_021487	TGCT	2	8	1578909	1578916	0 %	50 %	25 %	25 %	512551367
30503	NC_021487	GT	3	6	1578987	1578992	0 %	50 %	50 %	0 %	512551367
30504	NC_021487	ACCG	2	8	1579007	1579014	25 %	0 %	25 %	50 %	512551367
30505	NC_021487	GCG	2	6	1579028	1579033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551367
30506	NC_021487	GT	3	6	1579047	1579052	0 %	50 %	50 %	0 %	512551367
30507	NC_021487	GGC	2	6	1579064	1579069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551367
30508	NC_021487	TCC	2	6	1579123	1579128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551367
30509	NC_021487	ATGGT	2	10	1579182	1579191	20 %	40 %	40 %	0 %	512551367
30510	NC_021487	GCG	2	6	1579242	1579247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551367
30511	NC_021487	GTG	2	6	1579342	1579347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551367
30512	NC_021487	GAT	2	6	1579349	1579354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551367
30513	NC_021487	TAC	2	6	1579379	1579384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551367
30514	NC_021487	ATG	2	6	1579581	1579586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551367
30515	NC_021487	GAG	2	6	1579604	1579609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551367
30516	NC_021487	AAG	2	6	1579667	1579672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551367
30517	NC_021487	AC	3	6	1579709	1579714	50 %	0 %	0 %	50 %	512551367
30518	NC_021487	TC	3	6	1579796	1579801	0 %	50 %	0 %	50 %	512551367
30519	NC_021487	AG	3	6	1579844	1579849	50 %	0 %	50 %	0 %	512551367
30520	NC_021487	ATT	2	6	1579859	1579864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30521	NC_021487	CCT	2	6	1579883	1579888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551368
30522	NC_021487	CTC	2	6	1579929	1579934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551368
30523	NC_021487	TC	3	6	1579955	1579960	0 %	50 %	0 %	50 %	512551368
30524	NC_021487	CAT	2	6	1579974	1579979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551368
30525	NC_021487	GCG	2	6	1579980	1579985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551368
30526	NC_021487	CATCG	2	10	1580031	1580040	20 %	20 %	20 %	40 %	512551368
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30528	NC_021487	CCA	2	6	1580101	1580106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551368
30529	NC_021487	CCA	2	6	1580138	1580143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551368
30530	NC_021487	CCA	2	6	1580147	1580152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551368
30531	NC_021487	CCT	2	6	1580300	1580305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30532	NC_021487	CTCTA	2	10	1580326	1580335	20 %	40 %	0 %	40 %	512551369
30533	NC_021487	CT	4	8	1580459	1580466	0 %	50 %	0 %	50 %	512551369
30534	NC_021487	CGG	2	6	1580507	1580512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551369
30535	NC_021487	GCA	2	6	1580650	1580655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551369
30536	NC_021487	AGC	2	6	1580677	1580682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551369
30537	NC_021487	GCGA	2	8	1580703	1580710	25 %	0 %	50 %	25 %	512551369
30538	NC_021487	GAC	2	6	1580721	1580726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551369
30539	NC_021487	CCT	2	6	1580780	1580785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551369
30540	NC_021487	CT	5	10	1580793	1580802	0 %	50 %	0 %	50 %	512551369
30541	NC_021487	AGA	2	6	1580824	1580829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551369
30542	NC_021487	GA	3	6	1580828	1580833	50 %	0 %	50 %	0 %	512551369
30543	NC_021487	CTG	3	9	1580868	1580876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551369
30544	NC_021487	AAC	2	6	1580932	1580937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551369
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30546	NC_021487	TGA	2	6	1581080	1581085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551369
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30548	NC_021487	GCT	2	6	1581134	1581139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551369
30549	NC_021487	CTG	2	6	1581162	1581167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551369
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30551	NC_021487	GC	3	6	1581364	1581369	0 %	0 %	50 %	50 %	512551369
30552	NC_021487	TGC	2	6	1581394	1581399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551369
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30554	NC_021487	GGC	2	6	1581512	1581517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551369
30555	NC_021487	CATC	2	8	1581744	1581751	25 %	25 %	0 %	50 %	512551369
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30560	NC_021487	GCT	2	6	1581851	1581856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551369
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30562	NC_021487	CGAG	2	8	1581929	1581936	25 %	0 %	50 %	25 %	512551369
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30583	NC_021487	TGGCC	2	10	1583126	1583135	0 %	20 %	40 %	40 %	512551369
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30585	NC_021487	CTG	2	6	1583181	1583186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551369
30586	NC_021487	AGC	2	6	1583281	1583286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551369
30587	NC_021487	GCAA	2	8	1583323	1583330	50 %	0 %	25 %	25 %	512551369
30588	NC_021487	AAC	2	6	1583355	1583360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551369
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30591	NC_021487	CGCT	2	8	1583573	1583580	0 %	25 %	25 %	50 %	512551369
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30593	NC_021487	AAGCG	2	10	1583726	1583735	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30594	NC_021487	AAG	2	6	1583784	1583789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30595	NC_021487	TAT	2	6	1583803	1583808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30596	NC_021487	T	6	6	1583861	1583866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30597	NC_021487	CTT	2	6	1583907	1583912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30598	NC_021487	GA	3	6	1583920	1583925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30599	NC_021487	CCG	2	6	1584031	1584036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551370
30600	NC_021487	GA	3	6	1584067	1584072	50 %	0 %	50 %	0 %	512551370
30601	NC_021487	AG	3	6	1584089	1584094	50 %	0 %	50 %	0 %	512551370
30602	NC_021487	CAT	2	6	1584116	1584121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551370
30603	NC_021487	CCG	2	6	1584135	1584140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551370
30604	NC_021487	GCT	2	6	1584161	1584166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551370
30605	NC_021487	GCC	2	6	1584168	1584173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551370
30606	NC_021487	CGC	2	6	1584186	1584191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551370
30607	NC_021487	CTA	2	6	1584224	1584229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551370
30608	NC_021487	A	6	6	1584247	1584252	100 %	0 %	0 %	0 %	512551370
30609	NC_021487	TCG	2	6	1584286	1584291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551370
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30611	NC_021487	ACT	2	6	1584412	1584417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551370
30612	NC_021487	A	7	7	1584482	1584488	100 %	0 %	0 %	0 %	512551370
30613	NC_021487	CACC	2	8	1584569	1584576	25 %	0 %	0 %	75 %	512551370
30614	NC_021487	ACA	2	6	1584592	1584597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551370
30615	NC_021487	CAT	2	6	1584605	1584610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551370
30616	NC_021487	ACC	2	6	1584627	1584632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551370
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30618	NC_021487	GGC	2	6	1584698	1584703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551370
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30847	NC_021487	CGCC	2	8	1596602	1596609	0 %	0 %	25 %	75 %	512551382
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30973	NC_021487	GC	3	6	1605219	1605224	0 %	0 %	50 %	50 %	512551388
30974	NC_021487	CCACAT	2	12	1605308	1605319	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512551388
30975	NC_021487	ACC	2	6	1605352	1605357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551388
30976	NC_021487	TTGGC	2	10	1605394	1605403	0 %	40 %	40 %	20 %	512551388
30977	NC_021487	TTG	2	6	1605421	1605426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551388
30978	NC_021487	GGC	2	6	1605507	1605512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551388
30979	NC_021487	CTG	2	6	1605522	1605527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551388
30980	NC_021487	AGC	2	6	1605528	1605533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551388
30981	NC_021487	GGC	2	6	1605549	1605554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551388
30982	NC_021487	CGG	2	6	1605560	1605565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551388
30983	NC_021487	GCT	2	6	1605592	1605597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551388
30984	NC_021487	CCT	2	6	1605686	1605691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551388
30985	NC_021487	TTG	2	6	1605733	1605738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551388
30986	NC_021487	CCT	2	6	1605896	1605901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551388
30987	NC_021487	CAC	2	6	1605903	1605908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551388
30988	NC_021487	TGT	3	9	1605913	1605921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551388
30989	NC_021487	CTG	2	6	1606008	1606013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551388
30990	NC_021487	CG	3	6	1606132	1606137	0 %	0 %	50 %	50 %	512551388
30991	NC_021487	TGGC	2	8	1606169	1606176	0 %	25 %	50 %	25 %	512551388
30992	NC_021487	CCCT	2	8	1606185	1606192	0 %	25 %	0 %	75 %	512551388
30993	NC_021487	CTG	2	6	1606245	1606250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551388
30994	NC_021487	CACC	2	8	1606295	1606302	25 %	0 %	0 %	75 %	512551388
30995	NC_021487	AAT	2	6	1606317	1606322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551388
30996	NC_021487	CAA	2	6	1606328	1606333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551388
30997	NC_021487	GAT	2	6	1606344	1606349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551388
30998	NC_021487	CAT	3	9	1606364	1606372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551388
30999	NC_021487	GAC	2	6	1606399	1606404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551388
31000	NC_021487	ATG	2	6	1606411	1606416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551388

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