MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_021487	GGC	2	6	1530424	1530429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551328
29502	NC_021487	CGC	2	6	1530510	1530515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551328
29503	NC_021487	CCG	2	6	1530522	1530527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551328
29504	NC_021487	CTT	2	6	1530528	1530533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551328
29505	NC_021487	AACGG	2	10	1530616	1530625	40 %	0 %	40 %	20 %	512551328
29506	NC_021487	GCT	2	6	1530633	1530638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551328
29507	NC_021487	CCT	2	6	1530682	1530687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551328
29508	NC_021487	CACG	2	8	1530737	1530744	25 %	0 %	25 %	50 %	512551328
29509	NC_021487	CTG	2	6	1530911	1530916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551328
29510	NC_021487	GAG	2	6	1530991	1530996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551328
29511	NC_021487	TCC	2	6	1531022	1531027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551328
29512	NC_021487	ACA	2	6	1531035	1531040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551328
29513	NC_021487	CGGG	2	8	1531067	1531074	0 %	0 %	75 %	25 %	512551328
29514	NC_021487	TTG	2	6	1531133	1531138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551328
29515	NC_021487	GCT	2	6	1531185	1531190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551328
29516	NC_021487	GC	3	6	1531241	1531246	0 %	0 %	50 %	50 %	512551328
29517	NC_021487	AAC	2	6	1531247	1531252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551328
29518	NC_021487	CAC	2	6	1531260	1531265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551328
29519	NC_021487	CGGCAT	2	12	1531269	1531280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512551328
29520	NC_021487	CG	3	6	1531397	1531402	0 %	0 %	50 %	50 %	512551328
29521	NC_021487	GC	4	8	1531452	1531459	0 %	0 %	50 %	50 %	512551328
29522	NC_021487	ACCT	2	8	1531474	1531481	25 %	25 %	0 %	50 %	512551329
29523	NC_021487	ACG	2	6	1531499	1531504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551329
29524	NC_021487	CCT	2	6	1531542	1531547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551329
29525	NC_021487	CAA	2	6	1531582	1531587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551329
29526	NC_021487	TC	3	6	1531605	1531610	0 %	50 %	0 %	50 %	512551329
29527	NC_021487	CAA	2	6	1531665	1531670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551329
29528	NC_021487	AAC	2	6	1531712	1531717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551329
29529	NC_021487	ATC	2	6	1531817	1531822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551329
29530	NC_021487	TGT	2	6	1531836	1531841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551329
29531	NC_021487	CCAA	2	8	1531862	1531869	50 %	0 %	0 %	50 %	512551329
29532	NC_021487	AAT	2	6	1531879	1531884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551329
29533	NC_021487	CTA	2	6	1531896	1531901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551329
29534	NC_021487	CAC	2	6	1532029	1532034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551330
29535	NC_021487	CCT	2	6	1532073	1532078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551330
29536	NC_021487	GCC	2	6	1532108	1532113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551330
29537	NC_021487	TCCC	2	8	1532134	1532141	0 %	25 %	0 %	75 %	512551330
29538	NC_021487	GC	3	6	1532224	1532229	0 %	0 %	50 %	50 %	512551330
29539	NC_021487	AG	3	6	1532235	1532240	50 %	0 %	50 %	0 %	512551330
29540	NC_021487	GCC	2	6	1532284	1532289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551330
29541	NC_021487	TAG	2	6	1532290	1532295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551330
29542	NC_021487	AG	3	6	1532294	1532299	50 %	0 %	50 %	0 %	512551330
29543	NC_021487	GAT	2	6	1532344	1532349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551330
29544	NC_021487	AAGA	2	8	1532416	1532423	75 %	0 %	25 %	0 %	512551330
29545	NC_021487	GGT	2	6	1532434	1532439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551330
29546	NC_021487	CAA	2	6	1532582	1532587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29547	NC_021487	CTA	2	6	1532631	1532636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551331
29548	NC_021487	TGT	2	6	1532654	1532659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551331
29549	NC_021487	ATCT	2	8	1532661	1532668	25 %	50 %	0 %	25 %	512551331
29550	NC_021487	T	7	7	1532668	1532674	0 %	100 %	0 %	0 %	512551331
29551	NC_021487	GAT	2	6	1532675	1532680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551331
29552	NC_021487	GTT	2	6	1532736	1532741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551331
29553	NC_021487	GGC	2	6	1532798	1532803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551331
29554	NC_021487	GC	3	6	1532987	1532992	0 %	0 %	50 %	50 %	512551331
29555	NC_021487	GCA	2	6	1533046	1533051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551331
29556	NC_021487	GAC	2	6	1533107	1533112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551331
29557	NC_021487	CCT	2	6	1533122	1533127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29558	NC_021487	CG	3	6	1533140	1533145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29559	NC_021487	T	6	6	1533178	1533183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29560	NC_021487	GCA	2	6	1533202	1533207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551332
29561	NC_021487	CTC	2	6	1533217	1533222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551332
29562	NC_021487	G	6	6	1533279	1533284	0 %	0 %	100 %	0 %	512551332
29563	NC_021487	TTG	2	6	1533333	1533338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551332
29564	NC_021487	GCGA	2	8	1533349	1533356	25 %	0 %	50 %	25 %	512551332
29565	NC_021487	AGC	2	6	1533387	1533392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551332
29566	NC_021487	TTGT	2	8	1533419	1533426	0 %	75 %	25 %	0 %	512551332
29567	NC_021487	AAT	2	6	1533497	1533502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551332
29568	NC_021487	CCA	2	6	1533513	1533518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551332
29569	NC_021487	GGA	2	6	1533548	1533553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551332
29570	NC_021487	AGC	2	6	1533567	1533572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551332
29571	NC_021487	TAA	2	6	1533691	1533696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551332
29572	NC_021487	CGG	2	6	1533724	1533729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551332
29573	NC_021487	ACCTT	2	10	1533768	1533777	20 %	40 %	0 %	40 %	512551332
29574	NC_021487	TGAA	2	8	1533831	1533838	50 %	25 %	25 %	0 %	512551332
29575	NC_021487	CGGTAA	2	12	1533934	1533945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512551332
29576	NC_021487	CAA	2	6	1533986	1533991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551332
29577	NC_021487	AG	3	6	1534106	1534111	50 %	0 %	50 %	0 %	512551332
29578	NC_021487	C	6	6	1534181	1534186	0 %	0 %	0 %	100 %	512551332
29579	NC_021487	CCA	2	6	1534233	1534238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551332
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29581	NC_021487	TTAC	2	8	1534332	1534339	25 %	50 %	0 %	25 %	512551332
29582	NC_021487	AGG	2	6	1534343	1534348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551332
29583	NC_021487	CCGTT	2	10	1534360	1534369	0 %	40 %	20 %	40 %	512551332
29584	NC_021487	TGA	2	6	1534423	1534428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551332
29585	NC_021487	AGT	2	6	1534462	1534467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551332
29586	NC_021487	TGG	2	6	1534479	1534484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551332
29587	NC_021487	TCA	2	6	1534533	1534538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551332
29588	NC_021487	TTG	2	6	1534542	1534547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551332
29589	NC_021487	TGG	2	6	1534567	1534572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551332
29590	NC_021487	TCC	2	6	1534614	1534619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551332
29591	NC_021487	GAG	2	6	1534624	1534629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551332
29592	NC_021487	GTTGT	2	10	1534639	1534648	0 %	60 %	40 %	0 %	512551332
29593	NC_021487	CTTC	2	8	1534651	1534658	0 %	50 %	0 %	50 %	512551332
29594	NC_021487	GC	3	6	1534669	1534674	0 %	0 %	50 %	50 %	512551332
29595	NC_021487	CGG	2	6	1534726	1534731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551332
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29598	NC_021487	CAT	2	6	1534951	1534956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551332
29599	NC_021487	CA	3	6	1534996	1535001	50 %	0 %	0 %	50 %	512551332
29600	NC_021487	GA	3	6	1535031	1535036	50 %	0 %	50 %	0 %	512551332
29601	NC_021487	C	6	6	1535080	1535085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29602	NC_021487	CCG	2	6	1535099	1535104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29603	NC_021487	GCG	2	6	1535124	1535129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29604	NC_021487	TTTCCT	2	12	1535176	1535187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29605	NC_021487	A	7	7	1535207	1535213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29606	NC_021487	AGG	2	6	1535285	1535290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29607	NC_021487	CTC	2	6	1535310	1535315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29608	NC_021487	CAC	2	6	1535369	1535374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551333
29609	NC_021487	GCC	2	6	1535379	1535384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551333
29610	NC_021487	GCC	2	6	1535388	1535393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551333
29611	NC_021487	ACC	2	6	1535394	1535399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551333
29612	NC_021487	GCC	2	6	1535412	1535417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551333
29613	NC_021487	GCC	2	6	1535424	1535429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551333
29614	NC_021487	ACC	2	6	1535433	1535438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551333
29615	NC_021487	CCA	2	6	1535443	1535448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551333
29616	NC_021487	GCC	2	6	1535451	1535456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551333
29617	NC_021487	CAT	2	6	1535457	1535462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551333
29618	NC_021487	CCA	2	6	1535464	1535469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551333
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29715	NC_021487	GCC	2	6	1539521	1539526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551337
29716	NC_021487	C	7	7	1539532	1539538	0 %	0 %	0 %	100 %	512551337
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29721	NC_021487	GCG	2	6	1539709	1539714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551337
29722	NC_021487	GCT	2	6	1539787	1539792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551337
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29730	NC_021487	CTG	2	6	1540142	1540147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551337
29731	NC_021487	CTCC	2	8	1540159	1540166	0 %	25 %	0 %	75 %	512551337
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29852	NC_021487	CGTTG	2	10	1546066	1546075	0 %	40 %	40 %	20 %	512551342
29853	NC_021487	AGA	2	6	1546115	1546120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551342
29854	NC_021487	AGA	2	6	1546149	1546154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551342
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29952	NC_021487	ACT	2	6	1550915	1550920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29953	NC_021487	GGA	2	6	1550957	1550962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29954	NC_021487	CG	3	6	1550981	1550986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29955	NC_021487	GCT	2	6	1551029	1551034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29957	NC_021487	CGC	2	6	1551058	1551063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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29962	NC_021487	CGGC	2	8	1551262	1551269	0 %	0 %	50 %	50 %	512551345
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29966	NC_021487	AAAG	2	8	1551383	1551390	75 %	0 %	25 %	0 %	512551345
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29969	NC_021487	TCA	2	6	1551592	1551597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551345
29970	NC_021487	GCA	2	6	1551748	1551753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551345
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29972	NC_021487	CG	3	6	1551891	1551896	0 %	0 %	50 %	50 %	512551345
29973	NC_021487	CAG	2	6	1551911	1551916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551345
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29975	NC_021487	AG	3	6	1552010	1552015	50 %	0 %	50 %	0 %	512551345
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