MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_021487	TCGT	2	8	1505424	1505431	0 %	50 %	25 %	25 %	512551306
29002	NC_021487	GAT	2	6	1505446	1505451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551307
29003	NC_021487	TGG	2	6	1505486	1505491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551307
29004	NC_021487	AGGA	2	8	1505508	1505515	50 %	0 %	50 %	0 %	512551307
29005	NC_021487	AG	3	6	1505554	1505559	50 %	0 %	50 %	0 %	512551307
29006	NC_021487	TCTAC	2	10	1505593	1505602	20 %	40 %	0 %	40 %	512551307
29007	NC_021487	ACAG	2	8	1505618	1505625	50 %	0 %	25 %	25 %	512551307
29008	NC_021487	CAA	2	6	1505630	1505635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551307
29009	NC_021487	GCG	2	6	1505638	1505643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551307
29010	NC_021487	TCC	2	6	1505644	1505649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551307
29011	NC_021487	ATC	2	6	1505823	1505828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551307
29012	NC_021487	GCG	2	6	1505860	1505865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551307
29013	NC_021487	GCT	2	6	1505936	1505941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551307
29014	NC_021487	GCT	2	6	1505957	1505962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551307
29015	NC_021487	AGG	2	6	1505972	1505977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551307
29016	NC_021487	GTT	2	6	1506027	1506032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551307
29017	NC_021487	GATA	2	8	1506056	1506063	50 %	25 %	25 %	0 %	512551307
29018	NC_021487	TTC	2	6	1506083	1506088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29019	NC_021487	T	6	6	1506096	1506101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29020	NC_021487	CGA	2	6	1506201	1506206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29021	NC_021487	GT	3	6	1506223	1506228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29022	NC_021487	CTC	3	9	1506269	1506277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551308
29023	NC_021487	TGC	2	6	1506288	1506293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551308
29024	NC_021487	TAA	2	6	1506313	1506318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551308
29025	NC_021487	CAA	2	6	1506371	1506376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551308
29026	NC_021487	CCT	2	6	1506465	1506470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551308
29027	NC_021487	CT	3	6	1506474	1506479	0 %	50 %	0 %	50 %	512551308
29028	NC_021487	GTGG	2	8	1506543	1506550	0 %	25 %	75 %	0 %	512551308
29029	NC_021487	GGC	2	6	1506659	1506664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551308
29030	NC_021487	ATG	2	6	1506672	1506677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551308
29031	NC_021487	GC	3	6	1506723	1506728	0 %	0 %	50 %	50 %	512551308
29032	NC_021487	CCAAC	2	10	1506750	1506759	40 %	0 %	0 %	60 %	512551308
29033	NC_021487	CGGC	2	8	1506763	1506770	0 %	0 %	50 %	50 %	512551308
29034	NC_021487	AGC	2	6	1506938	1506943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551308
29035	NC_021487	GGA	2	6	1506970	1506975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551308
29036	NC_021487	CTA	2	6	1507105	1507110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551308
29037	NC_021487	ACC	2	6	1507123	1507128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551308
29038	NC_021487	CT	3	6	1507146	1507151	0 %	50 %	0 %	50 %	512551308
29039	NC_021487	CTC	2	6	1507244	1507249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551308
29040	NC_021487	TCAG	2	8	1507317	1507324	25 %	25 %	25 %	25 %	512551308
29041	NC_021487	ACGCTG	2	12	1507328	1507339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512551308
29042	NC_021487	ACC	2	6	1507353	1507358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551308
29043	NC_021487	GGC	2	6	1507387	1507392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551308
29044	NC_021487	GGC	2	6	1507412	1507417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551308
29045	NC_021487	CGG	2	6	1507438	1507443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551308
29046	NC_021487	GAT	2	6	1507474	1507479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551308
29047	NC_021487	GTT	2	6	1507481	1507486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551308
29048	NC_021487	TCTA	2	8	1507487	1507494	25 %	50 %	0 %	25 %	512551308
29049	NC_021487	CG	3	6	1507573	1507578	0 %	0 %	50 %	50 %	512551308
29050	NC_021487	ACC	2	6	1507622	1507627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29051	NC_021487	AAG	2	6	1507783	1507788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29052	NC_021487	TGAA	2	8	1507792	1507799	50 %	25 %	25 %	0 %	512551309
29053	NC_021487	CTA	2	6	1507828	1507833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551309
29054	NC_021487	CGC	2	6	1507842	1507847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551309
29055	NC_021487	GGT	2	6	1507920	1507925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551309
29056	NC_021487	CT	3	6	1507967	1507972	0 %	50 %	0 %	50 %	512551309
29057	NC_021487	CTG	2	6	1508062	1508067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551309
29058	NC_021487	CG	3	6	1508112	1508117	0 %	0 %	50 %	50 %	512551309
29059	NC_021487	GCT	2	6	1508127	1508132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551309
29060	NC_021487	GCT	2	6	1508136	1508141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551309
29061	NC_021487	GC	3	6	1508215	1508220	0 %	0 %	50 %	50 %	512551309
29062	NC_021487	TCA	2	6	1508238	1508243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551309
29063	NC_021487	GCT	2	6	1508253	1508258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551309
29064	NC_021487	CTG	2	6	1508260	1508265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551309
29065	NC_021487	TGG	2	6	1508287	1508292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551309
29066	NC_021487	ACT	2	6	1508343	1508348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551309
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29068	NC_021487	TCAT	2	8	1508480	1508487	25 %	50 %	0 %	25 %	512551309
29069	NC_021487	CA	3	6	1508578	1508583	50 %	0 %	0 %	50 %	512551309
29070	NC_021487	GT	3	6	1508600	1508605	0 %	50 %	50 %	0 %	512551309
29071	NC_021487	TAT	2	6	1508637	1508642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512551309
29072	NC_021487	GC	3	6	1508671	1508676	0 %	0 %	50 %	50 %	512551309
29073	NC_021487	TCT	2	6	1508685	1508690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551309
29074	NC_021487	CCT	2	6	1508700	1508705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551309
29075	NC_021487	GTG	2	6	1508716	1508721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551309
29076	NC_021487	CTG	2	6	1508722	1508727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551309
29077	NC_021487	GCC	3	9	1508731	1508739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551309
29078	NC_021487	TCTA	2	8	1508781	1508788	25 %	50 %	0 %	25 %	512551310
29079	NC_021487	TAT	2	6	1508860	1508865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512551310
29080	NC_021487	T	6	6	1508941	1508946	0 %	100 %	0 %	0 %	512551310
29081	NC_021487	CGG	2	6	1508959	1508964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551310
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29084	NC_021487	GCT	2	6	1509145	1509150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551310
29085	NC_021487	GCT	2	6	1509202	1509207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551310
29086	NC_021487	ACG	2	6	1509214	1509219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551310
29087	NC_021487	AAC	2	6	1509220	1509225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551310
29088	NC_021487	GGA	2	6	1509242	1509247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551310
29089	NC_021487	GCC	2	6	1509248	1509253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551310
29090	NC_021487	GCT	2	6	1509255	1509260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551310
29091	NC_021487	C	6	6	1509262	1509267	0 %	0 %	0 %	100 %	512551310
29092	NC_021487	CATGG	2	10	1509307	1509316	20 %	20 %	40 %	20 %	512551310
29093	NC_021487	TAT	2	6	1509328	1509333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512551310
29094	NC_021487	CTT	2	6	1509334	1509339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551310
29095	NC_021487	GCTT	2	8	1509364	1509371	0 %	50 %	25 %	25 %	512551310
29096	NC_021487	TCA	2	6	1509375	1509380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551310
29097	NC_021487	GAC	2	6	1509383	1509388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551310
29098	NC_021487	TGC	2	6	1509411	1509416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551310
29099	NC_021487	CTT	2	6	1509527	1509532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551310
29100	NC_021487	CTA	2	6	1509562	1509567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551310
29101	NC_021487	GAT	2	6	1509628	1509633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551310
29102	NC_021487	TC	4	8	1509796	1509803	0 %	50 %	0 %	50 %	512551311
29103	NC_021487	TC	3	6	1509840	1509845	0 %	50 %	0 %	50 %	512551311
29104	NC_021487	CAC	2	6	1509861	1509866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551311
29105	NC_021487	AGC	2	6	1509890	1509895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551311
29106	NC_021487	ACC	2	6	1509931	1509936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551311
29107	NC_021487	ACC	2	6	1509964	1509969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551311
29108	NC_021487	TCT	2	6	1509975	1509980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551311
29109	NC_021487	GGT	2	6	1510026	1510031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551311
29110	NC_021487	GA	3	6	1510045	1510050	50 %	0 %	50 %	0 %	512551311
29111	NC_021487	GGA	2	6	1510066	1510071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551311
29112	NC_021487	CGGCG	2	10	1510093	1510102	0 %	0 %	60 %	40 %	512551311
29113	NC_021487	GCA	2	6	1510132	1510137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551311
29114	NC_021487	CAAC	2	8	1510175	1510182	50 %	0 %	0 %	50 %	512551311
29115	NC_021487	ACCT	2	8	1510198	1510205	25 %	25 %	0 %	50 %	512551311
29116	NC_021487	AGG	2	6	1510364	1510369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551311
29117	NC_021487	CAT	2	6	1510389	1510394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551311
29118	NC_021487	ATCGC	2	10	1510432	1510441	20 %	20 %	20 %	40 %	512551311
29119	NC_021487	TTC	2	6	1510535	1510540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551311
29120	NC_021487	GACCTC	2	12	1510579	1510590	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512551311
29121	NC_021487	CGAG	2	8	1510666	1510673	25 %	0 %	50 %	25 %	512551311
29122	NC_021487	GCG	2	6	1510699	1510704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551311
29123	NC_021487	AGG	2	6	1510766	1510771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551311
29124	NC_021487	GC	4	8	1510882	1510889	0 %	0 %	50 %	50 %	512551311
29125	NC_021487	GGA	2	6	1510918	1510923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551311
29126	NC_021487	GGCGCT	2	12	1510935	1510946	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512551311
29127	NC_021487	TGC	2	6	1510974	1510979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551311
29128	NC_021487	GCC	2	6	1510981	1510986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551311
29129	NC_021487	A	6	6	1511007	1511012	100 %	0 %	0 %	0 %	512551311
29130	NC_021487	AG	3	6	1511067	1511072	50 %	0 %	50 %	0 %	512551311
29131	NC_021487	A	6	6	1511078	1511083	100 %	0 %	0 %	0 %	512551311
29132	NC_021487	TC	3	6	1511139	1511144	0 %	50 %	0 %	50 %	512551311
29133	NC_021487	TGC	2	6	1511147	1511152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551311
29134	NC_021487	AC	3	6	1511154	1511159	50 %	0 %	0 %	50 %	512551311
29135	NC_021487	AGCA	2	8	1511288	1511295	50 %	0 %	25 %	25 %	512551311
29136	NC_021487	CGA	2	6	1511310	1511315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551311
29137	NC_021487	ACA	2	6	1511375	1511380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551311
29138	NC_021487	TCT	2	6	1511391	1511396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551311
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29140	NC_021487	TGC	2	6	1511435	1511440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551312
29141	NC_021487	CAT	2	6	1511541	1511546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551312
29142	NC_021487	GGC	2	6	1511551	1511556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551312
29143	NC_021487	ACG	2	6	1511574	1511579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551312
29144	NC_021487	TCGT	2	8	1511671	1511678	0 %	50 %	25 %	25 %	512551312
29145	NC_021487	TCT	2	6	1511787	1511792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551312
29146	NC_021487	GTC	2	6	1511839	1511844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551312
29147	NC_021487	CCT	2	6	1511864	1511869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551312
29148	NC_021487	CTT	2	6	1511884	1511889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551312
29149	NC_021487	TGCGG	2	10	1511901	1511910	0 %	20 %	60 %	20 %	512551312
29150	NC_021487	GGCT	2	8	1511914	1511921	0 %	25 %	50 %	25 %	512551312
29151	NC_021487	GC	3	6	1511978	1511983	0 %	0 %	50 %	50 %	512551312
29152	NC_021487	ATG	2	6	1512007	1512012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551312
29153	NC_021487	CTC	2	6	1512015	1512020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551312
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29155	NC_021487	CG	4	8	1512077	1512084	0 %	0 %	50 %	50 %	512551312
29156	NC_021487	TG	3	6	1512090	1512095	0 %	50 %	50 %	0 %	512551312
29157	NC_021487	ACG	2	6	1512145	1512150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551312
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29166	NC_021487	TGGTT	2	10	1512448	1512457	0 %	60 %	40 %	0 %	512551313
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29168	NC_021487	GATGT	2	10	1512762	1512771	20 %	40 %	40 %	0 %	512551313
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29173	NC_021487	GC	4	8	1512960	1512967	0 %	0 %	50 %	50 %	512551313
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29187	NC_021487	TGC	2	6	1513990	1513995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551314
29188	NC_021487	ACG	2	6	1514017	1514022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551314
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29192	NC_021487	GC	3	6	1514137	1514142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29193	NC_021487	GACA	2	8	1514174	1514181	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29194	NC_021487	ACT	2	6	1514288	1514293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29197	NC_021487	TCC	2	6	1514315	1514320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29199	NC_021487	TA	3	6	1514352	1514357	50 %	50 %	0 %	0 %	512551315
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29220	NC_021487	GCC	2	6	1515341	1515346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551315
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29222	NC_021487	CT	3	6	1515477	1515482	0 %	50 %	0 %	50 %	512551315
29223	NC_021487	ACG	2	6	1515488	1515493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551315
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29225	NC_021487	GA	3	6	1515546	1515551	50 %	0 %	50 %	0 %	512551316
29226	NC_021487	GTCT	2	8	1515569	1515576	0 %	50 %	25 %	25 %	512551316
29227	NC_021487	GA	3	6	1515590	1515595	50 %	0 %	50 %	0 %	512551316
29228	NC_021487	GGA	2	6	1515617	1515622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551316
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29233	NC_021487	GCT	2	6	1515885	1515890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551316
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29355	NC_021487	AG	3	6	1522176	1522181	50 %	0 %	50 %	0 %	512551319
29356	NC_021487	ATC	2	6	1522190	1522195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551319
29357	NC_021487	AGG	2	6	1522260	1522265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551319
29358	NC_021487	TCG	2	6	1522274	1522279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551319
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