MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_021487	GCT	2	6	1431196	1431201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551243
27502	NC_021487	CGT	2	6	1431212	1431217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551243
27503	NC_021487	AAGCGA	2	12	1431230	1431241	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512551243
27504	NC_021487	TCCT	2	8	1431289	1431296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27505	NC_021487	GCT	2	6	1431321	1431326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27506	NC_021487	GGC	2	6	1431387	1431392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27507	NC_021487	GT	3	6	1431455	1431460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27508	NC_021487	T	6	6	1431470	1431475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27509	NC_021487	GCTC	2	8	1431478	1431485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27510	NC_021487	GTT	2	6	1431557	1431562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551244
27511	NC_021487	ACCTGA	2	12	1431568	1431579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512551244
27512	NC_021487	ACG	2	6	1431760	1431765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551244
27513	NC_021487	CGG	2	6	1431777	1431782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551244
27514	NC_021487	ACC	2	6	1431823	1431828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551244
27515	NC_021487	CCAAG	2	10	1431832	1431841	40 %	0 %	20 %	40 %	512551244
27516	NC_021487	CTC	2	6	1431870	1431875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551244
27517	NC_021487	CCA	2	6	1431974	1431979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551244
27518	NC_021487	GCA	2	6	1432009	1432014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551244
27519	NC_021487	TCG	2	6	1432048	1432053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551244
27520	NC_021487	CA	3	6	1432131	1432136	50 %	0 %	0 %	50 %	512551244
27521	NC_021487	GGT	2	6	1432221	1432226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551244
27522	NC_021487	CCA	2	6	1432238	1432243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551244
27523	NC_021487	TAA	2	6	1432349	1432354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551244
27524	NC_021487	GCTCT	2	10	1432377	1432386	0 %	40 %	20 %	40 %	512551244
27525	NC_021487	CAT	2	6	1432404	1432409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551244
27526	NC_021487	TCG	2	6	1432411	1432416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551244
27527	NC_021487	GCG	2	6	1432508	1432513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551244
27528	NC_021487	GA	4	8	1432536	1432543	50 %	0 %	50 %	0 %	512551244
27529	NC_021487	C	6	6	1432552	1432557	0 %	0 %	0 %	100 %	512551244
27530	NC_021487	ATGTG	2	10	1432586	1432595	20 %	40 %	40 %	0 %	512551244
27531	NC_021487	CAG	2	6	1432641	1432646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551244
27532	NC_021487	TGT	2	6	1432714	1432719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551245
27533	NC_021487	GTCCG	2	10	1432729	1432738	0 %	20 %	40 %	40 %	512551245
27534	NC_021487	TGT	2	6	1432739	1432744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551245
27535	NC_021487	A	7	7	1432778	1432784	100 %	0 %	0 %	0 %	512551245
27536	NC_021487	GGC	2	6	1432810	1432815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551245
27537	NC_021487	TGA	2	6	1432899	1432904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551245
27538	NC_021487	AGAT	2	8	1432925	1432932	50 %	25 %	25 %	0 %	512551245
27539	NC_021487	CGA	2	6	1432943	1432948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551245
27540	NC_021487	GTA	2	6	1433037	1433042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551245
27541	NC_021487	CAA	2	6	1433053	1433058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551245
27542	NC_021487	ATG	2	6	1433161	1433166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27543	NC_021487	CTT	2	6	1433268	1433273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551246
27544	NC_021487	AG	3	6	1433281	1433286	50 %	0 %	50 %	0 %	512551246
27545	NC_021487	AGG	2	6	1433357	1433362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551246
27546	NC_021487	CG	3	6	1433385	1433390	0 %	0 %	50 %	50 %	512551246
27547	NC_021487	CCT	2	6	1433580	1433585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551246
27548	NC_021487	CT	4	8	1433596	1433603	0 %	50 %	0 %	50 %	512551246
27549	NC_021487	GAA	2	6	1433619	1433624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551246
27550	NC_021487	GCC	2	6	1433663	1433668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551246
27551	NC_021487	TCC	2	6	1433719	1433724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551246
27552	NC_021487	GCC	2	6	1433750	1433755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551246
27553	NC_021487	TCGA	2	8	1433851	1433858	25 %	25 %	25 %	25 %	512551246
27554	NC_021487	TAG	2	6	1433927	1433932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551246
27555	NC_021487	GCG	2	6	1433966	1433971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551246
27556	NC_021487	GGC	2	6	1433978	1433983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551246
27557	NC_021487	TGA	3	9	1434047	1434055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551246
27558	NC_021487	GA	3	6	1434068	1434073	50 %	0 %	50 %	0 %	512551246
27559	NC_021487	GAA	2	6	1434079	1434084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551246
27560	NC_021487	GCT	2	6	1434087	1434092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551246
27561	NC_021487	GCA	2	6	1434153	1434158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551246
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27568	NC_021487	TGA	2	6	1434695	1434700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551247
27569	NC_021487	AG	3	6	1434719	1434724	50 %	0 %	50 %	0 %	512551247
27570	NC_021487	TCTT	2	8	1434848	1434855	0 %	75 %	0 %	25 %	512551247
27571	NC_021487	CGC	2	6	1434961	1434966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551247
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27574	NC_021487	GCA	2	6	1435007	1435012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551247
27575	NC_021487	TCC	2	6	1435276	1435281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551247
27576	NC_021487	CTT	2	6	1435327	1435332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551247
27577	NC_021487	ATG	2	6	1435359	1435364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551247
27578	NC_021487	GACA	2	8	1435370	1435377	50 %	0 %	25 %	25 %	512551247
27579	NC_021487	TCT	3	9	1435387	1435395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551247
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27583	NC_021487	ATAC	2	8	1435688	1435695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27584	NC_021487	CTTCT	2	10	1435715	1435724	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27585	NC_021487	CCG	2	6	1435738	1435743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551248
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27588	NC_021487	GCT	2	6	1435963	1435968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551248
27589	NC_021487	GCC	2	6	1436010	1436015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551248
27590	NC_021487	CCT	2	6	1436034	1436039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551248
27591	NC_021487	AACA	2	8	1436048	1436055	75 %	0 %	0 %	25 %	512551248
27592	NC_021487	CTGCT	2	10	1436060	1436069	0 %	40 %	20 %	40 %	512551248
27593	NC_021487	GC	3	6	1436168	1436173	0 %	0 %	50 %	50 %	512551248
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27599	NC_021487	GC	3	6	1436532	1436537	0 %	0 %	50 %	50 %	512551248
27600	NC_021487	GGT	2	6	1436582	1436587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551248
27601	NC_021487	GAA	2	6	1436672	1436677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551248
27602	NC_021487	GC	4	8	1436699	1436706	0 %	0 %	50 %	50 %	512551248
27603	NC_021487	CTG	2	6	1436720	1436725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551248
27604	NC_021487	CT	3	6	1436730	1436735	0 %	50 %	0 %	50 %	512551248
27605	NC_021487	CAA	2	6	1436836	1436841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551248
27606	NC_021487	TGC	2	6	1436848	1436853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551248
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27608	NC_021487	GCG	2	6	1436947	1436952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551248
27609	NC_021487	GAC	2	6	1437026	1437031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551248
27610	NC_021487	CTC	2	6	1437032	1437037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551248
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27613	NC_021487	TGC	2	6	1437390	1437395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551249
27614	NC_021487	CT	3	6	1437443	1437448	0 %	50 %	0 %	50 %	512551249
27615	NC_021487	CGT	2	6	1437462	1437467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551249
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27736	NC_021487	CTG	2	6	1442746	1442751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551253
27737	NC_021487	GGCT	2	8	1442766	1442773	0 %	25 %	50 %	25 %	512551253
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27750	NC_021487	G	6	6	1443220	1443225	0 %	0 %	100 %	0 %	512551253
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