MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_021487	CGG	2	6	1402492	1402497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551222
27003	NC_021487	GGC	2	6	1402533	1402538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551222
27004	NC_021487	CCGG	2	8	1402622	1402629	0 %	0 %	50 %	50 %	512551222
27005	NC_021487	GGTTTG	2	12	1402654	1402665	0 %	50 %	50 %	0 %	512551222
27006	NC_021487	AATC	2	8	1402803	1402810	50 %	25 %	0 %	25 %	512551222
27007	NC_021487	TCC	2	6	1402874	1402879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551222
27008	NC_021487	GGA	2	6	1402895	1402900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551222
27009	NC_021487	GGCA	2	8	1403086	1403093	25 %	0 %	50 %	25 %	512551222
27010	NC_021487	GTC	2	6	1403152	1403157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551222
27011	NC_021487	AGG	2	6	1403224	1403229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551222
27012	NC_021487	GCA	2	6	1403304	1403309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551222
27013	NC_021487	AGAA	2	8	1403341	1403348	75 %	0 %	25 %	0 %	512551222
27014	NC_021487	CCA	2	6	1403373	1403378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551222
27015	NC_021487	CAAG	2	8	1403447	1403454	50 %	0 %	25 %	25 %	512551222
27016	NC_021487	CCA	2	6	1403520	1403525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27017	NC_021487	CTT	2	6	1403566	1403571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27018	NC_021487	ACCGC	2	10	1403580	1403589	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27019	NC_021487	GAGG	2	8	1403819	1403826	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27020	NC_021487	AGG	2	6	1403869	1403874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27021	NC_021487	GCT	2	6	1403951	1403956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551223
27022	NC_021487	CAA	2	6	1404000	1404005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551223
27023	NC_021487	TAA	2	6	1404056	1404061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551223
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27025	NC_021487	GTA	2	6	1404154	1404159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551223
27026	NC_021487	T	7	7	1404169	1404175	0 %	100 %	0 %	0 %	512551223
27027	NC_021487	AGTCC	2	10	1404192	1404201	20 %	20 %	20 %	40 %	512551223
27028	NC_021487	AGA	2	6	1404302	1404307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551223
27029	NC_021487	TGTCG	2	10	1404355	1404364	0 %	40 %	40 %	20 %	512551223
27030	NC_021487	GATCAG	2	12	1404368	1404379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512551223
27031	NC_021487	GTG	2	6	1404398	1404403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551223
27032	NC_021487	GTT	2	6	1404411	1404416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551223
27033	NC_021487	TG	3	6	1404500	1404505	0 %	50 %	50 %	0 %	512551223
27034	NC_021487	AGA	2	6	1404521	1404526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551223
27035	NC_021487	TGCC	2	8	1404597	1404604	0 %	25 %	25 %	50 %	512551223
27036	NC_021487	TGG	2	6	1404702	1404707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551223
27037	NC_021487	CCTCAT	2	12	1404716	1404727	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512551223
27038	NC_021487	TCG	3	9	1404770	1404778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551223
27039	NC_021487	AAG	2	6	1404858	1404863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551223
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27041	NC_021487	TG	3	6	1404894	1404899	0 %	50 %	50 %	0 %	512551223
27042	NC_021487	GCT	2	6	1404930	1404935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551223
27043	NC_021487	CCT	2	6	1404952	1404957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27044	NC_021487	GCA	2	6	1405111	1405116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551224
27045	NC_021487	GTCCA	2	10	1405210	1405219	20 %	20 %	20 %	40 %	512551224
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27047	NC_021487	TAG	2	6	1405315	1405320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551224
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27049	NC_021487	TGC	2	6	1405366	1405371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551224
27050	NC_021487	GTT	2	6	1405458	1405463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551224
27051	NC_021487	ATA	2	6	1405556	1405561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551224
27052	NC_021487	AAT	2	6	1405701	1405706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551224
27053	NC_021487	ACA	2	6	1405714	1405719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551224
27054	NC_021487	GAC	2	6	1405835	1405840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27055	NC_021487	T	7	7	1405848	1405854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27056	NC_021487	GAA	2	6	1405924	1405929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551225
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27058	NC_021487	CTG	2	6	1406112	1406117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551225
27059	NC_021487	CTC	2	6	1406161	1406166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551225
27060	NC_021487	AGAT	2	8	1406195	1406202	50 %	25 %	25 %	0 %	512551225
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27063	NC_021487	GGAT	2	8	1406453	1406460	25 %	25 %	50 %	0 %	512551225
27064	NC_021487	ACAGA	2	10	1406506	1406515	60 %	0 %	20 %	20 %	512551225
27065	NC_021487	A	6	6	1406560	1406565	100 %	0 %	0 %	0 %	512551225
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27068	NC_021487	GATA	2	8	1406838	1406845	50 %	25 %	25 %	0 %	512551225
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27070	NC_021487	GTT	2	6	1406929	1406934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27071	NC_021487	CCG	2	6	1407045	1407050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551226
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27083	NC_021487	CGC	2	6	1407844	1407849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551226
27084	NC_021487	GCG	2	6	1407968	1407973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551226
27085	NC_021487	AGA	2	6	1408063	1408068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551226
27086	NC_021487	GAC	2	6	1408174	1408179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551226
27087	NC_021487	ATAGGC	2	12	1408260	1408271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512551226
27088	NC_021487	CCT	2	6	1408274	1408279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551227
27089	NC_021487	ACC	2	6	1408302	1408307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551227
27090	NC_021487	ATC	2	6	1408342	1408347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551227
27091	NC_021487	ATC	2	6	1408471	1408476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551227
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27094	NC_021487	GGGA	2	8	1408650	1408657	25 %	0 %	75 %	0 %	512551227
27095	NC_021487	CGA	2	6	1408664	1408669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551227
27096	NC_021487	CAG	2	6	1408733	1408738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551227
27097	NC_021487	GT	3	6	1408841	1408846	0 %	50 %	50 %	0 %	512551227
27098	NC_021487	TTGA	2	8	1408863	1408870	25 %	50 %	25 %	0 %	512551227
27099	NC_021487	TGA	2	6	1408919	1408924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551227
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27101	NC_021487	GTG	2	6	1408972	1408977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551227
27102	NC_021487	CG	3	6	1409018	1409023	0 %	0 %	50 %	50 %	512551227
27103	NC_021487	TGG	2	6	1409072	1409077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551227
27104	NC_021487	T	6	6	1409081	1409086	0 %	100 %	0 %	0 %	512551227
27105	NC_021487	GGTC	2	8	1409189	1409196	0 %	25 %	50 %	25 %	512551227
27106	NC_021487	ACA	2	6	1409305	1409310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551227
27107	NC_021487	ACG	2	6	1409356	1409361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551227
27108	NC_021487	C	7	7	1409462	1409468	0 %	0 %	0 %	100 %	512551227
27109	NC_021487	TGGAT	2	10	1409490	1409499	20 %	40 %	40 %	0 %	512551227
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27112	NC_021487	GGT	2	6	1409697	1409702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551228
27113	NC_021487	CAT	2	6	1409745	1409750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551228
27114	NC_021487	AAGG	2	8	1410048	1410055	50 %	0 %	50 %	0 %	512551228
27115	NC_021487	GA	3	6	1410118	1410123	50 %	0 %	50 %	0 %	512551228
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27117	NC_021487	ATG	2	6	1410193	1410198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551228
27118	NC_021487	GGA	2	6	1410215	1410220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551228
27119	NC_021487	GTTT	2	8	1410344	1410351	0 %	75 %	25 %	0 %	512551228
27120	NC_021487	TG	3	6	1410364	1410369	0 %	50 %	50 %	0 %	512551228
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27133	NC_021487	TCTGG	2	10	1411022	1411031	0 %	40 %	40 %	20 %	512551228
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27142	NC_021487	AAT	2	6	1411617	1411622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27144	NC_021487	TA	3	6	1411702	1411707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27145	NC_021487	T	6	6	1411724	1411729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27146	NC_021487	GAC	2	6	1411744	1411749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27174	NC_021487	CT	3	6	1413304	1413309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27175	NC_021487	CT	3	6	1413420	1413425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27176	NC_021487	ACA	2	6	1413457	1413462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27233	NC_021487	CTC	2	6	1416046	1416051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551233
27234	NC_021487	GC	3	6	1416053	1416058	0 %	0 %	50 %	50 %	512551233
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27352	NC_021487	CAC	2	6	1422822	1422827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551235
27353	NC_021487	CTT	2	6	1422858	1422863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551235
27354	NC_021487	CCG	2	6	1423021	1423026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551236
27355	NC_021487	GGT	2	6	1423145	1423150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551236
27356	NC_021487	GCC	2	6	1423160	1423165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551236
27357	NC_021487	ACC	2	6	1423222	1423227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551236
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27359	NC_021487	GATA	2	8	1423475	1423482	50 %	25 %	25 %	0 %	512551236
27360	NC_021487	CCCCAT	2	12	1423522	1423533	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	512551236
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27362	NC_021487	ATG	2	6	1423646	1423651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551236
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27364	NC_021487	GA	3	6	1423873	1423878	50 %	0 %	50 %	0 %	512551236
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27372	NC_021487	CT	3	6	1424139	1424144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27373	NC_021487	GCG	2	6	1424190	1424195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551237
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27376	NC_021487	CGG	2	6	1424262	1424267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551237
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27383	NC_021487	CAG	2	6	1424499	1424504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551237
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27472	NC_021487	GC	3	6	1429554	1429559	0 %	0 %	50 %	50 %	512551241
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27498	NC_021487	ACGAT	2	10	1430973	1430982	40 %	20 %	20 %	20 %	512551243
27499	NC_021487	TCC	2	6	1431063	1431068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551243
27500	NC_021487	GTA	2	6	1431130	1431135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551243

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