MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_021487	TCT	2	6	909861	909866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550835
17502	NC_021487	TC	3	6	909876	909881	0 %	50 %	0 %	50 %	512550835
17503	NC_021487	CTTC	2	8	909938	909945	0 %	50 %	0 %	50 %	512550835
17504	NC_021487	GC	4	8	909967	909974	0 %	0 %	50 %	50 %	512550835
17505	NC_021487	CCGG	2	8	910030	910037	0 %	0 %	50 %	50 %	512550835
17506	NC_021487	TTC	2	6	910091	910096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550835
17507	NC_021487	GCT	2	6	910174	910179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550835
17508	NC_021487	ACT	2	6	910251	910256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550835
17509	NC_021487	GTC	2	6	910309	910314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550835
17510	NC_021487	CCA	2	6	910364	910369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550835
17511	NC_021487	GAT	2	6	910446	910451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550836
17512	NC_021487	A	6	6	910454	910459	100 %	0 %	0 %	0 %	512550836
17513	NC_021487	GGA	2	6	910491	910496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550836
17514	NC_021487	CTT	2	6	910529	910534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550836
17515	NC_021487	TCG	2	6	910606	910611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550836
17516	NC_021487	A	6	6	910692	910697	100 %	0 %	0 %	0 %	512550836
17517	NC_021487	GGT	2	6	910706	910711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550836
17518	NC_021487	CTA	2	6	910756	910761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550836
17519	NC_021487	ACT	2	6	910834	910839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550836
17520	NC_021487	AGA	2	6	910880	910885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550836
17521	NC_021487	AAGC	2	8	910903	910910	50 %	0 %	25 %	25 %	512550836
17522	NC_021487	ACCA	2	8	910924	910931	50 %	0 %	0 %	50 %	512550836
17523	NC_021487	TGGA	2	8	910981	910988	25 %	25 %	50 %	0 %	512550836
17524	NC_021487	TCA	2	6	911006	911011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550836
17525	NC_021487	CAT	2	6	911045	911050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550836
17526	NC_021487	GTG	2	6	911079	911084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550836
17527	NC_021487	GCC	2	6	911097	911102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550836
17528	NC_021487	CG	3	6	911236	911241	0 %	0 %	50 %	50 %	512550836
17529	NC_021487	CA	3	6	911279	911284	50 %	0 %	0 %	50 %	512550836
17530	NC_021487	ATC	2	6	911388	911393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550836
17531	NC_021487	AGAT	2	8	911416	911423	50 %	25 %	25 %	0 %	512550836
17532	NC_021487	CCAG	2	8	911425	911432	25 %	0 %	25 %	50 %	512550836
17533	NC_021487	GGT	2	6	911537	911542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550837
17534	NC_021487	CAA	2	6	911584	911589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550837
17535	NC_021487	GCC	2	6	911633	911638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550837
17536	NC_021487	GTA	2	6	911681	911686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550837
17537	NC_021487	CCG	2	6	911721	911726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550837
17538	NC_021487	GCC	2	6	911765	911770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550837
17539	NC_021487	AAC	2	6	911806	911811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550837
17540	NC_021487	TCT	2	6	911832	911837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550837
17541	NC_021487	ACC	2	6	911843	911848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550837
17542	NC_021487	CAA	2	6	911875	911880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550837
17543	NC_021487	CA	3	6	911936	911941	50 %	0 %	0 %	50 %	512550837
17544	NC_021487	CTAT	2	8	911946	911953	25 %	50 %	0 %	25 %	512550837
17545	NC_021487	GCCTG	2	10	911962	911971	0 %	20 %	40 %	40 %	512550837
17546	NC_021487	GGT	2	6	911996	912001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550837
17547	NC_021487	TCT	2	6	912006	912011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550837
17548	NC_021487	CCGA	2	8	912051	912058	25 %	0 %	25 %	50 %	512550837
17549	NC_021487	CGC	2	6	912110	912115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550837
17550	NC_021487	AT	3	6	912130	912135	50 %	50 %	0 %	0 %	512550837
17551	NC_021487	CTG	2	6	912140	912145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550837
17552	NC_021487	CGGTG	2	10	912154	912163	0 %	20 %	60 %	20 %	512550837
17553	NC_021487	TC	4	8	912201	912208	0 %	50 %	0 %	50 %	512550837
17554	NC_021487	ACCTTT	2	12	912218	912229	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512550837
17555	NC_021487	CCA	2	6	912345	912350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550837
17556	NC_021487	TAC	2	6	912356	912361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550837
17557	NC_021487	GTG	2	6	912365	912370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550837
17558	NC_021487	CAT	2	6	912394	912399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550837
17559	NC_021487	CTT	2	6	912458	912463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550837
17560	NC_021487	GATG	2	8	912505	912512	25 %	25 %	50 %	0 %	512550837
17561	NC_021487	AAG	2	6	912693	912698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550837
17562	NC_021487	CGC	2	6	912778	912783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550837
17563	NC_021487	GCG	2	6	912850	912855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550837
17564	NC_021487	CAA	3	9	912865	912873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550837
17565	NC_021487	GCCC	2	8	912882	912889	0 %	0 %	25 %	75 %	512550837
17566	NC_021487	TGC	2	6	912916	912921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550837
17567	NC_021487	ATGC	2	8	912940	912947	25 %	25 %	25 %	25 %	512550837
17568	NC_021487	GCG	2	6	913062	913067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550837
17569	NC_021487	CGT	2	6	913222	913227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550837
17570	NC_021487	TCCT	2	8	913264	913271	0 %	50 %	0 %	50 %	512550837
17571	NC_021487	TACC	2	8	913332	913339	25 %	25 %	0 %	50 %	512550837
17572	NC_021487	TTC	2	6	913392	913397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550837
17573	NC_021487	GTC	2	6	913412	913417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550837
17574	NC_021487	AAG	2	6	913428	913433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550837
17575	NC_021487	TGG	2	6	913463	913468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550837
17576	NC_021487	GTA	2	6	913636	913641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17577	NC_021487	GCT	2	6	913663	913668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550838
17578	NC_021487	TCTGA	2	10	913669	913678	20 %	40 %	20 %	20 %	512550838
17579	NC_021487	GGTT	2	8	913760	913767	0 %	50 %	50 %	0 %	512550838
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17581	NC_021487	TGC	2	6	913829	913834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550838
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17583	NC_021487	CCT	2	6	913976	913981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550838
17584	NC_021487	CT	3	6	913995	914000	0 %	50 %	0 %	50 %	512550838
17585	NC_021487	A	6	6	914015	914020	100 %	0 %	0 %	0 %	512550838
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17588	NC_021487	GAG	2	6	914176	914181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550839
17589	NC_021487	GTC	2	6	914278	914283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550839
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17592	NC_021487	CCAC	2	8	914435	914442	25 %	0 %	0 %	75 %	512550839
17593	NC_021487	GCC	2	6	914483	914488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550839
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17595	NC_021487	TCG	2	6	914525	914530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550839
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17597	NC_021487	TGCC	2	8	914608	914615	0 %	25 %	25 %	50 %	512550839
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17600	NC_021487	CTC	2	6	914660	914665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550839
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17602	NC_021487	GAGAA	2	10	914786	914795	60 %	0 %	40 %	0 %	512550839
17603	NC_021487	CAC	2	6	914807	914812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550839
17604	NC_021487	TTG	2	6	914860	914865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550839
17605	NC_021487	CTC	2	6	914885	914890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550839
17606	NC_021487	TC	3	6	914902	914907	0 %	50 %	0 %	50 %	512550839
17607	NC_021487	CCT	2	6	914914	914919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550839
17608	NC_021487	CCA	2	6	914953	914958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550839
17609	NC_021487	CGC	2	6	915014	915019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17610	NC_021487	TC	3	6	915159	915164	0 %	50 %	0 %	50 %	512550840
17611	NC_021487	CGC	2	6	915190	915195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550840
17612	NC_021487	CGTTGG	2	12	915204	915215	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512550840
17613	NC_021487	TATC	2	8	915264	915271	25 %	50 %	0 %	25 %	512550840
17614	NC_021487	CTCG	2	8	915274	915281	0 %	25 %	25 %	50 %	512550840
17615	NC_021487	GGC	2	6	915326	915331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550840
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17619	NC_021487	GTT	2	6	915421	915426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550840
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17865	NC_021487	GAG	2	6	927228	927233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550852
17866	NC_021487	CGG	2	6	927301	927306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550852
17867	NC_021487	TCC	2	6	927330	927335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550852
17868	NC_021487	CTT	2	6	927338	927343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550852
17869	NC_021487	TGA	2	6	927355	927360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550852
17870	NC_021487	CA	3	6	927437	927442	50 %	0 %	0 %	50 %	512550852
17871	NC_021487	GATCTC	2	12	927543	927554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512550852
17872	NC_021487	G	6	6	927585	927590	0 %	0 %	100 %	0 %	512550852
17873	NC_021487	TGC	2	6	927610	927615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550852
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17878	NC_021487	CGC	2	6	927878	927883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550853
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17892	NC_021487	TGG	3	9	928514	928522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550854
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17900	NC_021487	CTG	2	6	928917	928922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550854
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17912	NC_021487	TCCTA	2	10	929501	929510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17913	NC_021487	TACC	2	8	929521	929528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17920	NC_021487	N	2518	2518	929748	932265	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17921	NC_021487	CTT	2	6	932266	932271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17967	NC_021487	CCA	2	6	934832	934837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550858
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17970	NC_021487	TCT	2	6	934932	934937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550858
17971	NC_021487	AGGTA	2	10	934939	934948	40 %	20 %	40 %	0 %	512550858
17972	NC_021487	ATCCC	2	10	934966	934975	20 %	20 %	0 %	60 %	512550858
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17975	NC_021487	GAA	2	6	935201	935206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17976	NC_021487	A	7	7	935320	935326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17977	NC_021487	GTA	2	6	935403	935408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17978	NC_021487	TCTG	2	8	935483	935490	0 %	50 %	25 %	25 %	512550859
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17982	NC_021487	TCG	2	6	935639	935644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550859
17983	NC_021487	CCCGAT	2	12	935818	935829	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512550859
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17986	NC_021487	GCT	2	6	935897	935902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550859
17987	NC_021487	CTG	2	6	935995	936000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550859
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17989	NC_021487	GC	3	6	936216	936221	0 %	0 %	50 %	50 %	512550859
17990	NC_021487	T	6	6	936223	936228	0 %	100 %	0 %	0 %	512550859
17991	NC_021487	CG	3	6	936416	936421	0 %	0 %	50 %	50 %	512550859
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