MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021487	TCA	2	6	886031	886036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550819
17002	NC_021487	GCTG	2	8	886049	886056	0 %	25 %	50 %	25 %	512550819
17003	NC_021487	GAG	2	6	886152	886157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550819
17004	NC_021487	CTTT	2	8	886199	886206	0 %	75 %	0 %	25 %	512550819
17005	NC_021487	ACA	2	6	886240	886245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550819
17006	NC_021487	GTG	2	6	886260	886265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550819
17007	NC_021487	ACG	2	6	886330	886335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550819
17008	NC_021487	GGC	2	6	886410	886415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550819
17009	NC_021487	TCC	2	6	886432	886437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550819
17010	NC_021487	TC	3	6	886441	886446	0 %	50 %	0 %	50 %	512550819
17011	NC_021487	TCGGCA	2	12	886471	886482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512550819
17012	NC_021487	AGG	2	6	886526	886531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550819
17013	NC_021487	CA	3	6	886732	886737	50 %	0 %	0 %	50 %	512550819
17014	NC_021487	GGC	2	6	886740	886745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550819
17015	NC_021487	CTT	2	6	886805	886810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550819
17016	NC_021487	TCC	2	6	886874	886879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550819
17017	NC_021487	GAC	2	6	887052	887057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550819
17018	NC_021487	TTCT	2	8	887128	887135	0 %	75 %	0 %	25 %	512550819
17019	NC_021487	GCC	2	6	887190	887195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550819
17020	NC_021487	ACC	2	6	887274	887279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550819
17021	NC_021487	ACC	2	6	887394	887399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550819
17022	NC_021487	GGC	2	6	887445	887450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550819
17023	NC_021487	GGT	2	6	887504	887509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550819
17024	NC_021487	CAA	2	6	887552	887557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550819
17025	NC_021487	TCC	2	6	887677	887682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550819
17026	NC_021487	CTC	2	6	887714	887719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550819
17027	NC_021487	TCA	2	6	887774	887779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17028	NC_021487	CGT	2	6	887882	887887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17029	NC_021487	CTA	2	6	887949	887954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17030	NC_021487	AAC	2	6	887955	887960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_021487	CCT	2	6	887974	887979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17032	NC_021487	CGG	2	6	888042	888047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550820
17033	NC_021487	GCGAAG	2	12	888058	888069	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512550820
17034	NC_021487	ACC	2	6	888110	888115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550820
17035	NC_021487	ACC	2	6	888207	888212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550820
17036	NC_021487	AGCA	2	8	888250	888257	50 %	0 %	25 %	25 %	512550820
17037	NC_021487	ACC	2	6	888326	888331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550820
17038	NC_021487	TCG	2	6	888410	888415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550820
17039	NC_021487	CCA	2	6	888426	888431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550820
17040	NC_021487	CGA	2	6	888535	888540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550820
17041	NC_021487	ACC	2	6	888567	888572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550820
17042	NC_021487	TCCCT	2	10	888583	888592	0 %	40 %	0 %	60 %	512550820
17043	NC_021487	TCGA	2	8	888664	888671	25 %	25 %	25 %	25 %	512550820
17044	NC_021487	TCC	2	6	888703	888708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550820
17045	NC_021487	CCA	2	6	888715	888720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550820
17046	NC_021487	GTC	2	6	888742	888747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550820
17047	NC_021487	GA	3	6	888818	888823	50 %	0 %	50 %	0 %	512550820
17048	NC_021487	ACA	2	6	888849	888854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550820
17049	NC_021487	AAC	2	6	888929	888934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550820
17050	NC_021487	AAAG	2	8	888949	888956	75 %	0 %	25 %	0 %	512550820
17051	NC_021487	CGC	2	6	888987	888992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550820
17052	NC_021487	CAT	2	6	889000	889005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550820
17053	NC_021487	AGC	2	6	889097	889102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550820
17054	NC_021487	CGG	2	6	889117	889122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550820
17055	NC_021487	CTC	2	6	889135	889140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550820
17056	NC_021487	CCG	2	6	889149	889154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550820
17057	NC_021487	GCT	2	6	889158	889163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550820
17058	NC_021487	TGCCA	2	10	889185	889194	20 %	20 %	20 %	40 %	512550820
17059	NC_021487	TTC	2	6	889274	889279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550820
17060	NC_021487	GTC	2	6	889306	889311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550820
17061	NC_021487	C	6	6	889342	889347	0 %	0 %	0 %	100 %	512550820
17062	NC_021487	CAC	2	6	889357	889362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550820
17063	NC_021487	TCA	2	6	889365	889370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550820
17064	NC_021487	A	6	6	889384	889389	100 %	0 %	0 %	0 %	512550820
17065	NC_021487	TC	3	6	889405	889410	0 %	50 %	0 %	50 %	512550820
17066	NC_021487	ATT	2	6	889429	889434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550820
17067	NC_021487	GC	3	6	889441	889446	0 %	0 %	50 %	50 %	512550820
17068	NC_021487	TGA	2	6	889536	889541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550820
17069	NC_021487	TG	4	8	889545	889552	0 %	50 %	50 %	0 %	512550820
17070	NC_021487	ACG	2	6	889627	889632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550820
17071	NC_021487	GGT	2	6	889688	889693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550820
17072	NC_021487	TAG	2	6	889709	889714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550820
17073	NC_021487	CTC	2	6	889771	889776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550820
17074	NC_021487	CAAA	2	8	889822	889829	75 %	0 %	0 %	25 %	512550820
17075	NC_021487	CTC	2	6	890128	890133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550820
17076	NC_021487	TGC	2	6	890158	890163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550820
17077	NC_021487	CCAC	2	8	890201	890208	25 %	0 %	0 %	75 %	512550820
17078	NC_021487	TTG	2	6	890262	890267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_021487	AAGC	2	8	890284	890291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17080	NC_021487	CT	3	6	890299	890304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17081	NC_021487	CTC	2	6	890328	890333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17082	NC_021487	AG	3	6	890358	890363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_021487	CTT	2	6	890394	890399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17084	NC_021487	ACC	2	6	890521	890526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17085	NC_021487	TGGCA	2	10	890766	890775	20 %	20 %	40 %	20 %	512550821
17086	NC_021487	CTT	2	6	890808	890813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550821
17087	NC_021487	TATC	2	8	890850	890857	25 %	50 %	0 %	25 %	512550821
17088	NC_021487	GTT	2	6	890959	890964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550821
17089	NC_021487	GCCC	2	8	890995	891002	0 %	0 %	25 %	75 %	512550821
17090	NC_021487	AGA	2	6	891003	891008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550821
17091	NC_021487	GAG	2	6	891025	891030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550821
17092	NC_021487	GGC	2	6	891087	891092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550821
17093	NC_021487	CGC	2	6	891171	891176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550821
17094	NC_021487	CCG	2	6	891177	891182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550821
17095	NC_021487	TTG	2	6	891230	891235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550821
17096	NC_021487	CAAGAG	2	12	891277	891288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512550821
17097	NC_021487	GCATC	2	10	891306	891315	20 %	20 %	20 %	40 %	512550821
17098	NC_021487	ACA	2	6	891321	891326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550821
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17100	NC_021487	CG	3	6	891396	891401	0 %	0 %	50 %	50 %	512550821
17101	NC_021487	ACC	2	6	891407	891412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550821
17102	NC_021487	GC	3	6	891468	891473	0 %	0 %	50 %	50 %	512550821
17103	NC_021487	CGC	2	6	891477	891482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550821
17104	NC_021487	AG	3	6	891573	891578	50 %	0 %	50 %	0 %	512550821
17105	NC_021487	CG	3	6	891579	891584	0 %	0 %	50 %	50 %	512550821
17106	NC_021487	ACG	2	6	891708	891713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550821
17107	NC_021487	GCC	2	6	891731	891736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550821
17108	NC_021487	CTG	2	6	891796	891801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550821
17109	NC_021487	AAG	2	6	891803	891808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550821
17110	NC_021487	AGC	2	6	891824	891829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550821
17111	NC_021487	GAG	2	6	891841	891846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550821
17112	NC_021487	AGA	2	6	891880	891885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550821
17113	NC_021487	CAA	2	6	891931	891936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550821
17114	NC_021487	AGC	2	6	891981	891986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550821
17115	NC_021487	CT	3	6	892018	892023	0 %	50 %	0 %	50 %	512550821
17116	NC_021487	TAT	2	6	892060	892065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550821
17117	NC_021487	CGGG	2	8	892093	892100	0 %	0 %	75 %	25 %	512550821
17118	NC_021487	CCT	2	6	892134	892139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550821
17119	NC_021487	GTA	2	6	892184	892189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550821
17120	NC_021487	AGA	2	6	892218	892223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550821
17121	NC_021487	TTC	2	6	892277	892282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550821
17122	NC_021487	AGGA	2	8	892331	892338	50 %	0 %	50 %	0 %	512550821
17123	NC_021487	CTT	2	6	892399	892404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550821
17124	NC_021487	GTG	2	6	892414	892419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550821
17125	NC_021487	TCG	2	6	892455	892460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550821
17126	NC_021487	GCT	2	6	892500	892505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550821
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17130	NC_021487	GCT	2	6	892650	892655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550821
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17135	NC_021487	AGG	2	6	892787	892792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550821
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17231	NC_021487	ATGA	2	8	897436	897443	50 %	25 %	25 %	0 %	512550825
17232	NC_021487	CACG	2	8	897477	897484	25 %	0 %	25 %	50 %	512550825
17233	NC_021487	CGA	2	6	897555	897560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550825
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17243	NC_021487	CTG	2	6	898099	898104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550825
17244	NC_021487	GGC	2	6	898126	898131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550825
17245	NC_021487	GC	3	6	898148	898153	0 %	0 %	50 %	50 %	512550825
17246	NC_021487	CCCT	2	8	898180	898187	0 %	25 %	0 %	75 %	512550825
17247	NC_021487	GAG	2	6	898192	898197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550825
17248	NC_021487	TGAG	2	8	898226	898233	25 %	25 %	50 %	0 %	512550825
17249	NC_021487	GTCC	2	8	898352	898359	0 %	25 %	25 %	50 %	512550825
17250	NC_021487	CAG	2	6	898368	898373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550825
17251	NC_021487	CGA	2	6	898432	898437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550825
17252	NC_021487	GTA	2	6	898500	898505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550825
17253	NC_021487	GAT	2	6	898593	898598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550825
17254	NC_021487	AG	3	6	898616	898621	50 %	0 %	50 %	0 %	512550825
17255	NC_021487	CAA	2	6	898633	898638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550825
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17258	NC_021487	CAA	2	6	898734	898739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17259	NC_021487	CGTTC	2	10	898780	898789	0 %	40 %	20 %	40 %	512550826
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17280	NC_021487	TTCC	2	8	899562	899569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17281	NC_021487	CCT	2	6	899656	899661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550827
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17288	NC_021487	TCG	2	6	900165	900170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550827
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17335	NC_021487	GTAG	2	8	902324	902331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17336	NC_021487	TTGCA	2	10	902336	902345	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17337	NC_021487	AGA	2	6	902382	902387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17339	NC_021487	CAC	2	6	902438	902443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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17350	NC_021487	GCA	2	6	902858	902863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550828
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17353	NC_021487	CAT	2	6	902967	902972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550828
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17355	NC_021487	TCA	2	6	903033	903038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550829
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17361	NC_021487	CTATC	2	10	903280	903289	20 %	40 %	0 %	40 %	512550829
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17485	NC_021487	GTAG	2	8	909205	909212	25 %	25 %	50 %	0 %	512550834
17486	NC_021487	TTC	2	6	909236	909241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550834
17487	NC_021487	CCT	2	6	909245	909250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550834
17488	NC_021487	CTCC	2	8	909251	909258	0 %	25 %	0 %	75 %	512550834
17489	NC_021487	GTC	2	6	909271	909276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550834
17490	NC_021487	CGG	2	6	909289	909294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550834
17491	NC_021487	ACC	2	6	909315	909320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550834
17492	NC_021487	GAG	2	6	909325	909330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550834
17493	NC_021487	CTT	2	6	909366	909371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17494	NC_021487	CATG	2	8	909462	909469	25 %	25 %	25 %	25 %	512550835
17495	NC_021487	TGG	2	6	909518	909523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550835
17496	NC_021487	AC	3	6	909638	909643	50 %	0 %	0 %	50 %	512550835
17497	NC_021487	CTAT	2	8	909710	909717	25 %	50 %	0 %	25 %	512550835
17498	NC_021487	TCA	2	6	909743	909748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550835
17499	NC_021487	CTA	2	6	909792	909797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550835
17500	NC_021487	TCAGC	2	10	909804	909813	20 %	20 %	20 %	40 %	512550835

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