MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021487	CGC	2	6	858546	858551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550803
16502	NC_021487	AAGG	2	8	858581	858588	50 %	0 %	50 %	0 %	512550803
16503	NC_021487	TCC	3	9	858603	858611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550803
16504	NC_021487	CCT	2	6	858779	858784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550803
16505	NC_021487	CTC	2	6	858789	858794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550803
16506	NC_021487	AGG	2	6	858888	858893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550803
16507	NC_021487	ATC	2	6	858903	858908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550803
16508	NC_021487	GTA	2	6	858992	858997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550803
16509	NC_021487	CTC	2	6	859056	859061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550803
16510	NC_021487	GCGCG	2	10	859149	859158	0 %	0 %	60 %	40 %	512550803
16511	NC_021487	CTCG	2	8	859166	859173	0 %	25 %	25 %	50 %	512550803
16512	NC_021487	ACG	2	6	859216	859221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550803
16513	NC_021487	TCG	2	6	859252	859257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550803
16514	NC_021487	CCA	2	6	859268	859273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550803
16515	NC_021487	CCA	2	6	859286	859291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550803
16516	NC_021487	ACA	2	6	859300	859305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550803
16517	NC_021487	CAC	2	6	859347	859352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550803
16518	NC_021487	CTT	2	6	859440	859445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550803
16519	NC_021487	TGG	2	6	859475	859480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550803
16520	NC_021487	CCG	2	6	859514	859519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550803
16521	NC_021487	GAT	2	6	859726	859731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550804
16522	NC_021487	CTT	2	6	859740	859745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550804
16523	NC_021487	ATGA	2	8	859768	859775	50 %	25 %	25 %	0 %	512550804
16524	NC_021487	TCTCC	2	10	859776	859785	0 %	40 %	0 %	60 %	512550804
16525	NC_021487	TCG	2	6	859814	859819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550804
16526	NC_021487	GTT	2	6	859837	859842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550804
16527	NC_021487	GCT	3	9	859869	859877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550804
16528	NC_021487	TCA	2	6	859964	859969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550804
16529	NC_021487	GAAG	2	8	860024	860031	50 %	0 %	50 %	0 %	512550804
16530	NC_021487	CGT	2	6	860115	860120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550804
16531	NC_021487	CCT	2	6	860156	860161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550804
16532	NC_021487	GA	3	6	860210	860215	50 %	0 %	50 %	0 %	512550804
16533	NC_021487	TCG	2	6	860224	860229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550804
16534	NC_021487	TGT	2	6	860347	860352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_021487	AAACT	2	10	860383	860392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16536	NC_021487	CCG	2	6	860409	860414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16537	NC_021487	GCAC	2	8	860429	860436	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16538	NC_021487	CGA	2	6	860454	860459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16539	NC_021487	ACC	2	6	860589	860594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16540	NC_021487	TAA	2	6	860646	860651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16541	NC_021487	GCA	2	6	860801	860806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16542	NC_021487	GAA	2	6	860854	860859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_021487	ATC	2	6	860891	860896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16544	NC_021487	ATGCC	2	10	860935	860944	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16545	NC_021487	TG	3	6	861021	861026	0 %	50 %	50 %	0 %	512550805
16546	NC_021487	ACG	2	6	861090	861095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550805
16547	NC_021487	GCA	2	6	861131	861136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550805
16548	NC_021487	ATC	2	6	861211	861216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550805
16549	NC_021487	GT	3	6	861223	861228	0 %	50 %	50 %	0 %	512550805
16550	NC_021487	TGGG	2	8	861290	861297	0 %	25 %	75 %	0 %	512550805
16551	NC_021487	TCA	3	9	861308	861316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550805
16552	NC_021487	TGAT	2	8	861340	861347	25 %	50 %	25 %	0 %	512550805
16553	NC_021487	GCA	2	6	861356	861361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550805
16554	NC_021487	AC	3	6	861362	861367	50 %	0 %	0 %	50 %	512550805
16555	NC_021487	TCA	2	6	861422	861427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550805
16556	NC_021487	GGT	2	6	861448	861453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550805
16557	NC_021487	TCC	2	6	861527	861532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16558	NC_021487	CCT	3	9	861645	861653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550806
16559	NC_021487	GC	3	6	861669	861674	0 %	0 %	50 %	50 %	512550806
16560	NC_021487	C	6	6	861701	861706	0 %	0 %	0 %	100 %	512550806
16561	NC_021487	TGT	2	6	861783	861788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550806
16562	NC_021487	T	7	7	861788	861794	0 %	100 %	0 %	0 %	512550806
16563	NC_021487	TGCT	2	8	861853	861860	0 %	50 %	25 %	25 %	512550806
16564	NC_021487	GGC	2	6	861895	861900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550806
16565	NC_021487	TGT	2	6	861933	861938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550806
16566	NC_021487	CGTC	2	8	861999	862006	0 %	25 %	25 %	50 %	512550806
16567	NC_021487	CGC	2	6	862058	862063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550806
16568	NC_021487	TTA	2	6	862071	862076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550806
16569	NC_021487	CGG	2	6	862294	862299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550806
16570	NC_021487	GGC	2	6	862488	862493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550806
16571	NC_021487	CA	3	6	862496	862501	50 %	0 %	0 %	50 %	512550806
16572	NC_021487	GTT	2	6	862537	862542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550806
16573	NC_021487	CTT	2	6	862543	862548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550806
16574	NC_021487	ACG	2	6	862555	862560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550806
16575	NC_021487	TAT	2	6	862586	862591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16576	NC_021487	A	6	6	862600	862605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16577	NC_021487	CACCG	2	10	862635	862644	20 %	0 %	20 %	60 %	512550807
16578	NC_021487	T	6	6	862726	862731	0 %	100 %	0 %	0 %	512550807
16579	NC_021487	GCA	2	6	862768	862773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550807
16580	NC_021487	TCT	2	6	862796	862801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550807
16581	NC_021487	ATC	2	6	862851	862856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550807
16582	NC_021487	ATCC	2	8	862926	862933	25 %	25 %	0 %	50 %	512550807
16583	NC_021487	CTG	3	9	862937	862945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550807
16584	NC_021487	TGTC	2	8	863033	863040	0 %	50 %	25 %	25 %	512550807
16585	NC_021487	CAG	2	6	863117	863122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550807
16586	NC_021487	ACC	2	6	863140	863145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550807
16587	NC_021487	CGT	2	6	863170	863175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550807
16588	NC_021487	AAC	2	6	863220	863225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550807
16589	NC_021487	ACC	2	6	863323	863328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550807
16590	NC_021487	GC	3	6	863342	863347	0 %	0 %	50 %	50 %	512550807
16591	NC_021487	GCT	2	6	863407	863412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550807
16592	NC_021487	GAT	2	6	863442	863447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550807
16593	NC_021487	GCC	2	6	863547	863552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550808
16594	NC_021487	AAG	2	6	863667	863672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550808
16595	NC_021487	ATA	2	6	863676	863681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550808
16596	NC_021487	ACC	2	6	863737	863742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550808
16597	NC_021487	ATCG	2	8	863808	863815	25 %	25 %	25 %	25 %	512550808
16598	NC_021487	CTG	2	6	863856	863861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550808
16599	NC_021487	GAG	2	6	863920	863925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550808
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16601	NC_021487	AGA	2	6	864008	864013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550808
16602	NC_021487	CCA	2	6	864067	864072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550808
16603	NC_021487	CTG	2	6	864141	864146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550808
16604	NC_021487	A	6	6	864231	864236	100 %	0 %	0 %	0 %	512550808
16605	NC_021487	CCAG	2	8	864239	864246	25 %	0 %	25 %	50 %	512550808
16606	NC_021487	TGA	2	6	864254	864259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550808
16607	NC_021487	CCA	2	6	864302	864307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550808
16608	NC_021487	AGA	2	6	864308	864313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550808
16609	NC_021487	TGC	2	6	864406	864411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550808
16610	NC_021487	CT	4	8	864429	864436	0 %	50 %	0 %	50 %	512550808
16611	NC_021487	ACCGCC	2	12	864478	864489	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	512550808
16612	NC_021487	TGG	2	6	864581	864586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550808
16613	NC_021487	GAT	2	6	864639	864644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550808
16614	NC_021487	GAA	2	6	864740	864745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550808
16615	NC_021487	TGG	2	6	864758	864763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550808
16616	NC_021487	GAA	2	6	864771	864776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550808
16617	NC_021487	GCA	2	6	864785	864790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550808
16618	NC_021487	CCA	2	6	864863	864868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550808
16619	NC_021487	GCGCCA	2	12	864888	864899	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512550808
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16988	NC_021487	AG	3	6	885266	885271	50 %	0 %	50 %	0 %	512550819
16989	NC_021487	A	7	7	885322	885328	100 %	0 %	0 %	0 %	512550819
16990	NC_021487	GAG	2	6	885360	885365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550819
16991	NC_021487	CAA	2	6	885383	885388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550819
16992	NC_021487	ACT	3	9	885427	885435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550819
16993	NC_021487	GAG	2	6	885463	885468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550819
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16995	NC_021487	CTA	2	6	885599	885604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550819
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16998	NC_021487	TG	3	6	885864	885869	0 %	50 %	50 %	0 %	512550819
16999	NC_021487	CTG	2	6	885926	885931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550819
17000	NC_021487	GCGA	2	8	885964	885971	25 %	0 %	50 %	25 %	512550819

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