MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021487	GCC	2	6	831366	831371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550782
16002	NC_021487	ACC	2	6	831378	831383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550782
16003	NC_021487	CTT	2	6	831404	831409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550782
16004	NC_021487	GAT	2	6	831488	831493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550782
16005	NC_021487	ACC	2	6	831564	831569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550782
16006	NC_021487	CG	3	6	831614	831619	0 %	0 %	50 %	50 %	512550782
16007	NC_021487	CAA	2	6	831659	831664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550782
16008	NC_021487	CTA	2	6	831692	831697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550782
16009	NC_021487	ACT	2	6	831739	831744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550782
16010	NC_021487	GTGG	2	8	831812	831819	0 %	25 %	75 %	0 %	512550782
16011	NC_021487	CCG	2	6	831832	831837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550782
16012	NC_021487	CAT	2	6	831849	831854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550782
16013	NC_021487	GCA	2	6	831869	831874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550782
16014	NC_021487	GTGGC	2	10	831902	831911	0 %	20 %	60 %	20 %	512550782
16015	NC_021487	GGA	2	6	831921	831926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550782
16016	NC_021487	TCG	2	6	831949	831954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550782
16017	NC_021487	GT	3	6	831997	832002	0 %	50 %	50 %	0 %	512550782
16018	NC_021487	TGTGGC	2	12	832050	832061	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512550783
16019	NC_021487	TG	3	6	832131	832136	0 %	50 %	50 %	0 %	512550783
16020	NC_021487	C	6	6	832169	832174	0 %	0 %	0 %	100 %	512550783
16021	NC_021487	CGT	2	6	832199	832204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550783
16022	NC_021487	GTA	2	6	832385	832390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550783
16023	NC_021487	TCG	2	6	832458	832463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550783
16024	NC_021487	AG	3	6	832544	832549	50 %	0 %	50 %	0 %	512550783
16025	NC_021487	AG	4	8	832648	832655	50 %	0 %	50 %	0 %	512550783
16026	NC_021487	CCG	2	6	833023	833028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550783
16027	NC_021487	AG	3	6	833069	833074	50 %	0 %	50 %	0 %	512550783
16028	NC_021487	GTA	2	6	833085	833090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550783
16029	NC_021487	CCA	2	6	833149	833154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550783
16030	NC_021487	TGG	2	6	833296	833301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550783
16031	NC_021487	ACG	2	6	833327	833332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550783
16032	NC_021487	TGT	2	6	833369	833374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550783
16033	NC_021487	AGA	2	6	833391	833396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550783
16034	NC_021487	GAA	2	6	833494	833499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550783
16035	NC_021487	CTG	2	6	833563	833568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550783
16036	NC_021487	ACC	2	6	833697	833702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550783
16037	NC_021487	AG	3	6	833732	833737	50 %	0 %	50 %	0 %	512550783
16038	NC_021487	CAA	2	6	833764	833769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550783
16039	NC_021487	GGTC	2	8	833773	833780	0 %	25 %	50 %	25 %	512550783
16040	NC_021487	GCAG	2	8	833814	833821	25 %	0 %	50 %	25 %	512550783
16041	NC_021487	GA	3	6	833853	833858	50 %	0 %	50 %	0 %	512550783
16042	NC_021487	TGG	2	6	833867	833872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550783
16043	NC_021487	CTA	2	6	833902	833907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550783
16044	NC_021487	GCA	2	6	833934	833939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550783
16045	NC_021487	ACA	2	6	833940	833945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550783
16046	NC_021487	T	6	6	834049	834054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_021487	CAT	2	6	834081	834086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_021487	GCG	2	6	834112	834117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550784
16049	NC_021487	GGT	2	6	834185	834190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550784
16050	NC_021487	CCT	2	6	834272	834277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550784
16051	NC_021487	CAA	2	6	834278	834283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550784
16052	NC_021487	CAG	2	6	834371	834376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550784
16053	NC_021487	GTTC	2	8	834461	834468	0 %	50 %	25 %	25 %	512550784
16054	NC_021487	C	6	6	834499	834504	0 %	0 %	0 %	100 %	512550784
16055	NC_021487	TAGC	2	8	834508	834515	25 %	25 %	25 %	25 %	512550784
16056	NC_021487	GCC	2	6	834553	834558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550784
16057	NC_021487	CGG	2	6	834626	834631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550784
16058	NC_021487	TCA	2	6	834685	834690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550784
16059	NC_021487	GGA	2	6	834717	834722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550784
16060	NC_021487	CTG	2	6	834798	834803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550784
16061	NC_021487	TCT	2	6	834894	834899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550784
16062	NC_021487	GAAGA	2	10	834900	834909	60 %	0 %	40 %	0 %	512550784
16063	NC_021487	TGA	2	6	834992	834997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550784
16064	NC_021487	CTT	2	6	835004	835009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550784
16065	NC_021487	TTC	2	6	835107	835112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550784
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16068	NC_021487	GCC	2	6	835297	835302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550784
16069	NC_021487	AGC	2	6	835306	835311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550784
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16072	NC_021487	CCAAC	2	10	835476	835485	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16073	NC_021487	TTA	2	6	835498	835503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_021487	AGGCG	2	10	835512	835521	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16075	NC_021487	TCG	2	6	835579	835584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550785
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16085	NC_021487	GGC	2	6	836158	836163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550785
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16087	NC_021487	CAT	2	6	836221	836226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550785
16088	NC_021487	T	6	6	836287	836292	0 %	100 %	0 %	0 %	512550785
16089	NC_021487	CGT	2	6	836322	836327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550785
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16091	NC_021487	GCT	2	6	836379	836384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550786
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16094	NC_021487	AGG	2	6	836427	836432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550786
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16099	NC_021487	ACA	2	6	836505	836510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550786
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16102	NC_021487	AGC	2	6	836629	836634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550786
16103	NC_021487	TCC	2	6	836654	836659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550786
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16105	NC_021487	CCG	2	6	836703	836708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550786
16106	NC_021487	GCATC	2	10	836727	836736	20 %	20 %	20 %	40 %	512550786
16107	NC_021487	CTC	2	6	836773	836778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550786
16108	NC_021487	CAT	2	6	836803	836808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550786
16109	NC_021487	A	6	6	836914	836919	100 %	0 %	0 %	0 %	512550786
16110	NC_021487	CTC	2	6	836926	836931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550786
16111	NC_021487	CCA	2	6	836958	836963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550786
16112	NC_021487	CCT	2	6	836967	836972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550786
16113	NC_021487	CAT	2	6	836980	836985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550786
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16116	NC_021487	C	6	6	837175	837180	0 %	0 %	0 %	100 %	512550786
16117	NC_021487	CAA	2	6	837195	837200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550786
16118	NC_021487	GAAC	2	8	837234	837241	50 %	0 %	25 %	25 %	512550786
16119	NC_021487	TGGA	2	8	837321	837328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_021487	TGCT	2	8	837468	837475	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16121	NC_021487	GAG	2	6	837499	837504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_021487	AGA	2	6	837551	837556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_021487	CTC	2	6	837567	837572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16124	NC_021487	AGGAA	2	10	837618	837627	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_021487	GCG	2	6	837754	837759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550787
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16165	NC_021487	GTT	2	6	839984	839989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16180	NC_021487	CTCAT	2	10	840510	840519	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16181	NC_021487	TCA	2	6	840654	840659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16230	NC_021487	CATA	2	8	843453	843460	50 %	25 %	0 %	25 %	512550792
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16233	NC_021487	CT	3	6	843530	843535	0 %	50 %	0 %	50 %	512550792
16234	NC_021487	TC	3	6	843547	843552	0 %	50 %	0 %	50 %	512550792
16235	NC_021487	GAT	2	6	843642	843647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550792
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16239	NC_021487	AGC	2	6	843971	843976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550792
16240	NC_021487	GGAT	2	8	844085	844092	25 %	25 %	50 %	0 %	512550792
16241	NC_021487	GCAT	2	8	844112	844119	25 %	25 %	25 %	25 %	512550792
16242	NC_021487	GCC	2	6	844136	844141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550792
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16367	NC_021487	CCG	2	6	851491	851496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550799
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16397	NC_021487	GCG	2	6	852919	852924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16398	NC_021487	GCA	2	6	852974	852979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550800
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16402	NC_021487	CTA	2	6	853268	853273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550800
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16405	NC_021487	TC	3	6	853307	853312	0 %	50 %	0 %	50 %	512550800
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16460	NC_021487	AGT	2	6	856384	856389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550801
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16462	NC_021487	AATG	2	8	856471	856478	50 %	25 %	25 %	0 %	512550801
16463	NC_021487	ATA	2	6	856569	856574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550801
16464	NC_021487	TTTCG	3	15	856617	856631	0 %	60 %	20 %	20 %	512550801
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16467	NC_021487	TCCT	2	8	856727	856734	0 %	50 %	0 %	50 %	512550801
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16472	NC_021487	CGGCAT	2	12	856939	856950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512550801
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16475	NC_021487	CAA	2	6	857094	857099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550801
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16477	NC_021487	CTC	2	6	857135	857140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550801
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16479	NC_021487	TCA	2	6	857327	857332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16480	NC_021487	AGT	2	6	857466	857471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550802
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16482	NC_021487	TGT	2	6	857591	857596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550802
16483	NC_021487	TAGG	2	8	857650	857657	25 %	25 %	50 %	0 %	512550802
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