MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021487	AG	3	6	780364	780369	50 %	0 %	50 %	0 %	512550744
15002	NC_021487	AAT	2	6	780384	780389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550744
15003	NC_021487	CG	3	6	780439	780444	0 %	0 %	50 %	50 %	512550744
15004	NC_021487	TGA	2	6	780454	780459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550744
15005	NC_021487	CTA	2	6	780476	780481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550744
15006	NC_021487	TCA	2	6	780577	780582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550744
15007	NC_021487	AG	3	6	780608	780613	50 %	0 %	50 %	0 %	512550744
15008	NC_021487	GGTA	2	8	780626	780633	25 %	25 %	50 %	0 %	512550744
15009	NC_021487	GAA	2	6	780699	780704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550744
15010	NC_021487	TCT	2	6	780799	780804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550744
15011	NC_021487	TCC	2	6	780823	780828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550744
15012	NC_021487	AGC	2	6	780835	780840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550744
15013	NC_021487	AAC	2	6	780846	780851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550744
15014	NC_021487	GTAG	2	8	781025	781032	25 %	25 %	50 %	0 %	512550744
15015	NC_021487	CTCC	2	8	781115	781122	0 %	25 %	0 %	75 %	512550744
15016	NC_021487	CGC	3	9	781155	781163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550744
15017	NC_021487	TCT	2	6	781223	781228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550744
15018	NC_021487	TC	3	6	781258	781263	0 %	50 %	0 %	50 %	512550744
15019	NC_021487	CTC	2	6	781269	781274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550744
15020	NC_021487	CCG	2	6	781383	781388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550744
15021	NC_021487	CGG	2	6	781424	781429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550744
15022	NC_021487	ATC	2	6	781509	781514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550744
15023	NC_021487	GTC	2	6	781516	781521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550744
15024	NC_021487	CG	3	6	781541	781546	0 %	0 %	50 %	50 %	512550744
15025	NC_021487	CTC	2	6	781606	781611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15026	NC_021487	A	6	6	781612	781617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_021487	GAT	2	6	781683	781688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550745
15028	NC_021487	AGC	2	6	781711	781716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550745
15029	NC_021487	GGA	2	6	781736	781741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550745
15030	NC_021487	ACG	2	6	781869	781874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550745
15031	NC_021487	CCT	2	6	781916	781921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550745
15032	NC_021487	CGC	2	6	781974	781979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550745
15033	NC_021487	TCC	2	6	782018	782023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550745
15034	NC_021487	GAC	2	6	782025	782030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550745
15035	NC_021487	CAC	2	6	782034	782039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550745
15036	NC_021487	ACG	2	6	782140	782145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550745
15037	NC_021487	CA	3	6	782151	782156	50 %	0 %	0 %	50 %	512550745
15038	NC_021487	ACC	2	6	782171	782176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550745
15039	NC_021487	ATGG	2	8	782177	782184	25 %	25 %	50 %	0 %	512550745
15040	NC_021487	CCTG	2	8	782341	782348	0 %	25 %	25 %	50 %	512550745
15041	NC_021487	TGGG	2	8	782399	782406	0 %	25 %	75 %	0 %	512550745
15042	NC_021487	GAA	2	6	782433	782438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550745
15043	NC_021487	CTA	2	6	782483	782488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550745
15044	NC_021487	GAA	2	6	782585	782590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550745
15045	NC_021487	CT	4	8	782632	782639	0 %	50 %	0 %	50 %	512550745
15046	NC_021487	CAA	2	6	782649	782654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550745
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15048	NC_021487	TCAGCG	2	12	782795	782806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512550745
15049	NC_021487	ATC	2	6	782879	782884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15050	NC_021487	A	6	6	782886	782891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_021487	GCG	2	6	782911	782916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_021487	A	6	6	782921	782926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_021487	GAA	3	9	782949	782957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_021487	TA	3	6	782985	782990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_021487	TCG	2	6	783031	783036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_021487	GACT	2	8	783040	783047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15057	NC_021487	GTC	2	6	783152	783157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550746
15058	NC_021487	CCT	2	6	783295	783300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550746
15059	NC_021487	GAA	2	6	783449	783454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550746
15060	NC_021487	CTTC	2	8	783488	783495	0 %	50 %	0 %	50 %	512550746
15061	NC_021487	CTTT	2	8	783498	783505	0 %	75 %	0 %	25 %	512550746
15062	NC_021487	CG	3	6	783608	783613	0 %	0 %	50 %	50 %	512550746
15063	NC_021487	CAA	3	9	783635	783643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550746
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15069	NC_021487	TCA	2	6	784156	784161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550747
15070	NC_021487	CTGC	2	8	784164	784171	0 %	25 %	25 %	50 %	512550747
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15083	NC_021487	CT	3	6	785196	785201	0 %	50 %	0 %	50 %	512550747
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15085	NC_021487	GACC	2	8	785338	785345	25 %	0 %	25 %	50 %	512550748
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15089	NC_021487	CTTC	2	8	785475	785482	0 %	50 %	0 %	50 %	512550748
15090	NC_021487	GTG	2	6	785489	785494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550748
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15093	NC_021487	CTT	2	6	785574	785579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550748
15094	NC_021487	TAA	2	6	785580	785585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550748
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15101	NC_021487	TCC	2	6	785789	785794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550748
15102	NC_021487	ACC	2	6	785818	785823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550748
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15104	NC_021487	CTTGCG	2	12	785884	785895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550748
15105	NC_021487	TTG	2	6	785927	785932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550748
15106	NC_021487	CT	3	6	785960	785965	0 %	50 %	0 %	50 %	512550748
15107	NC_021487	CTA	2	6	785991	785996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550748
15108	NC_021487	GAAA	2	8	786049	786056	75 %	0 %	25 %	0 %	512550748
15109	NC_021487	AGC	2	6	786088	786093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550748
15110	NC_021487	GTG	2	6	786140	786145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550748
15111	NC_021487	CAG	2	6	786247	786252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550748
15112	NC_021487	AGC	2	6	786368	786373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550748
15113	NC_021487	TGT	2	6	786381	786386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550748
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15121	NC_021487	CCA	2	6	786760	786765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550748
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15364	NC_021487	TGC	2	6	798081	798086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550756
15365	NC_021487	CTGG	2	8	798132	798139	0 %	25 %	50 %	25 %	512550756
15366	NC_021487	GCT	2	6	798234	798239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550756
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15368	NC_021487	TCCC	3	12	798292	798303	0 %	25 %	0 %	75 %	512550756
15369	NC_021487	CAGA	2	8	798305	798312	50 %	0 %	25 %	25 %	512550756
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15374	NC_021487	AGC	2	6	798513	798518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550756
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15382	NC_021487	TCT	2	6	799034	799039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550756
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15385	NC_021487	CAC	2	6	799175	799180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550756
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15389	NC_021487	GCC	2	6	799488	799493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550757
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15391	NC_021487	CGG	2	6	799594	799599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550757
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15393	NC_021487	GTG	2	6	799635	799640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550757
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15396	NC_021487	CCA	2	6	799678	799683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550757
15397	NC_021487	CGA	2	6	799762	799767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550757
15398	NC_021487	TC	3	6	799777	799782	0 %	50 %	0 %	50 %	512550757
15399	NC_021487	CAA	2	6	799793	799798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550757
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15401	NC_021487	C	6	6	800037	800042	0 %	0 %	0 %	100 %	512550757
15402	NC_021487	CCA	2	6	800059	800064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550757
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15409	NC_021487	CG	3	6	800371	800376	0 %	0 %	50 %	50 %	512550757
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15413	NC_021487	CGT	2	6	800547	800552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550757
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15415	NC_021487	TC	4	8	800581	800588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15416	NC_021487	TAC	2	6	800595	800600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15418	NC_021487	TC	3	6	800691	800696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15419	NC_021487	GAG	2	6	800833	800838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15420	NC_021487	TGC	2	6	800874	800879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550758
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15422	NC_021487	GTT	2	6	800903	800908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550758
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15425	NC_021487	A	7	7	800995	801001	100 %	0 %	0 %	0 %	512550758
15426	NC_021487	GGCATG	2	12	801008	801019	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512550758
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15430	NC_021487	CATC	2	8	801202	801209	25 %	25 %	0 %	50 %	512550758
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15434	NC_021487	CACG	2	8	801464	801471	25 %	0 %	25 %	50 %	512550758
15435	NC_021487	ATC	2	6	801476	801481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550758
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15446	NC_021487	CT	3	6	802033	802038	0 %	50 %	0 %	50 %	512550759
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15453	NC_021487	T	6	6	802494	802499	0 %	100 %	0 %	0 %	512550759
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15462	NC_021487	TCGT	2	8	802822	802829	0 %	50 %	25 %	25 %	512550759
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15464	NC_021487	A	7	7	803076	803082	100 %	0 %	0 %	0 %	512550759
15465	NC_021487	GGTATT	2	12	803126	803137	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15466	NC_021487	TGCTA	2	10	803239	803248	20 %	40 %	20 %	20 %	512550760
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15468	NC_021487	CATT	2	8	803350	803357	25 %	50 %	0 %	25 %	512550760
15469	NC_021487	ACGAT	2	10	803358	803367	40 %	20 %	20 %	20 %	512550760
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15471	NC_021487	T	7	7	803418	803424	0 %	100 %	0 %	0 %	512550760
15472	NC_021487	GAG	2	6	803427	803432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550760
15473	NC_021487	CTTC	2	8	803467	803474	0 %	50 %	0 %	50 %	512550760
15474	NC_021487	AGAC	2	8	803578	803585	50 %	0 %	25 %	25 %	512550760
15475	NC_021487	CAC	2	6	803644	803649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550760
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15478	NC_021487	A	7	7	803787	803793	100 %	0 %	0 %	0 %	512550760
15479	NC_021487	TCC	2	6	803838	803843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550760
15480	NC_021487	CGA	2	6	803854	803859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550760
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15482	NC_021487	TGA	2	6	803940	803945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550760
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15484	NC_021487	GCT	2	6	804014	804019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550760
15485	NC_021487	TCGG	2	8	804191	804198	0 %	25 %	50 %	25 %	512550760
15486	NC_021487	CGC	2	6	804274	804279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550760
15487	NC_021487	AAGC	2	8	804294	804301	50 %	0 %	25 %	25 %	512550760
15488	NC_021487	ATC	2	6	804355	804360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550761
15489	NC_021487	ATC	2	6	804369	804374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550761
15490	NC_021487	GCCGT	2	10	804442	804451	0 %	20 %	40 %	40 %	512550761
15491	NC_021487	AT	3	6	804557	804562	50 %	50 %	0 %	0 %	512550761
15492	NC_021487	TGT	2	6	804584	804589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550761
15493	NC_021487	ACCC	2	8	804613	804620	25 %	0 %	0 %	75 %	512550761
15494	NC_021487	GAT	2	6	804669	804674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550761
15495	NC_021487	TGC	2	6	804689	804694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550761
15496	NC_021487	GCT	2	6	804702	804707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550761
15497	NC_021487	CGC	2	6	804730	804735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550761
15498	NC_021487	GAG	2	6	804771	804776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550761
15499	NC_021487	TGCA	2	8	804789	804796	25 %	25 %	25 %	25 %	512550761
15500	NC_021487	CT	3	6	804829	804834	0 %	50 %	0 %	50 %	512550761

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