MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021487	TCCC	2	8	702311	702318	0 %	25 %	0 %	75 %	512550689
13503	NC_021487	AGG	2	6	702326	702331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550689
13504	NC_021487	C	6	6	702337	702342	0 %	0 %	0 %	100 %	512550689
13505	NC_021487	CTG	2	6	702358	702363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550689
13506	NC_021487	AGA	2	6	702380	702385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550689
13507	NC_021487	ATC	2	6	702394	702399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550689
13508	NC_021487	GCA	2	6	702449	702454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550689
13509	NC_021487	CTCTT	2	10	702493	702502	0 %	60 %	0 %	40 %	512550690
13510	NC_021487	TCG	2	6	702510	702515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550690
13511	NC_021487	GAG	2	6	702611	702616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550690
13512	NC_021487	ACC	2	6	702650	702655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550690
13513	NC_021487	CACC	2	8	702733	702740	25 %	0 %	0 %	75 %	512550690
13514	NC_021487	CA	3	6	702781	702786	50 %	0 %	0 %	50 %	512550690
13515	NC_021487	GCC	2	6	702851	702856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550690
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13519	NC_021487	TGA	2	6	703108	703113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550690
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13521	NC_021487	AGC	2	6	703138	703143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550690
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13523	NC_021487	TGC	2	6	703185	703190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550690
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13530	NC_021487	TGG	2	6	703497	703502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550691
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13533	NC_021487	TC	3	6	703667	703672	0 %	50 %	0 %	50 %	512550691
13534	NC_021487	CGT	2	6	703675	703680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550691
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13544	NC_021487	CCA	2	6	704156	704161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550691
13545	NC_021487	CAC	2	6	704178	704183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550691
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13547	NC_021487	GTC	2	6	704323	704328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550691
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13555	NC_021487	GCA	2	6	704915	704920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550691
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13622	NC_021487	CAA	2	6	708084	708089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550693
13623	NC_021487	CG	3	6	708116	708121	0 %	0 %	50 %	50 %	512550693
13624	NC_021487	TGGC	2	8	708206	708213	0 %	25 %	50 %	25 %	512550694
13625	NC_021487	G	6	6	708288	708293	0 %	0 %	100 %	0 %	512550694
13626	NC_021487	TCA	2	6	708312	708317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550694
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13632	NC_021487	CTTA	2	8	708693	708700	25 %	50 %	0 %	25 %	512550694
13633	NC_021487	CTTC	2	8	708701	708708	0 %	50 %	0 %	50 %	512550694
13634	NC_021487	TGG	2	6	708728	708733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550694
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13648	NC_021487	AGC	2	6	709274	709279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550694
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13651	NC_021487	CTT	2	6	709446	709451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13652	NC_021487	AAC	2	6	709504	709509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550695
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13702	NC_021487	CTC	2	6	712458	712463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13703	NC_021487	A	6	6	712492	712497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13704	NC_021487	TAAGG	2	10	712515	712524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13705	NC_021487	GTT	2	6	712547	712552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550696
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13719	NC_021487	GCC	2	6	713310	713315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550696
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13731	NC_021487	GCCTT	2	10	713975	713984	0 %	40 %	20 %	40 %	512550697
13732	NC_021487	CGTG	2	8	713994	714001	0 %	25 %	50 %	25 %	512550697
13733	NC_021487	CG	3	6	714004	714009	0 %	0 %	50 %	50 %	512550697
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13737	NC_021487	CT	3	6	714202	714207	0 %	50 %	0 %	50 %	512550697
13738	NC_021487	CAT	2	6	714243	714248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550697
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13864	NC_021487	TTGC	2	8	720108	720115	0 %	50 %	25 %	25 %	512550701
13865	NC_021487	AC	3	6	720147	720152	50 %	0 %	0 %	50 %	512550701
13866	NC_021487	CGA	2	6	720160	720165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550701
13867	NC_021487	CGA	2	6	720184	720189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550701
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13869	NC_021487	GAC	2	6	720293	720298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550701
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13872	NC_021487	TCG	2	6	720466	720471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550701
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13894	NC_021487	T	7	7	721491	721497	0 %	100 %	0 %	0 %	512550702
13895	NC_021487	CAA	2	6	721499	721504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550702
13896	NC_021487	TA	3	6	721569	721574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13897	NC_021487	GC	3	6	721638	721643	0 %	0 %	50 %	50 %	512550703
13898	NC_021487	T	6	6	721678	721683	0 %	100 %	0 %	0 %	512550703
13899	NC_021487	CTAT	2	8	721695	721702	25 %	50 %	0 %	25 %	512550703
13900	NC_021487	TCT	2	6	721778	721783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550703
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13913	NC_021487	CCTG	2	8	722210	722217	0 %	25 %	25 %	50 %	512550703
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13915	NC_021487	CCCG	2	8	722300	722307	0 %	0 %	25 %	75 %	512550703
13916	NC_021487	CTG	2	6	722353	722358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550703
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13930	NC_021487	CAA	2	6	723252	723257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550703
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13983	NC_021487	CCT	2	6	725324	725329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550703
13984	NC_021487	CT	3	6	725357	725362	0 %	50 %	0 %	50 %	512550703
13985	NC_021487	CG	3	6	725368	725373	0 %	0 %	50 %	50 %	512550703
13986	NC_021487	TAC	2	6	725442	725447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550703
13987	NC_021487	A	6	6	725463	725468	100 %	0 %	0 %	0 %	512550703
13988	NC_021487	TC	4	8	725513	725520	0 %	50 %	0 %	50 %	512550704
13989	NC_021487	AAC	2	6	725524	725529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550704
13990	NC_021487	CAA	2	6	725549	725554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550704
13991	NC_021487	GC	3	6	725591	725596	0 %	0 %	50 %	50 %	512550704
13992	NC_021487	CCT	2	6	725728	725733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550704
13993	NC_021487	TC	3	6	725740	725745	0 %	50 %	0 %	50 %	512550704
13994	NC_021487	ACAGAT	2	12	725815	725826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512550704
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13996	NC_021487	GCTC	2	8	725905	725912	0 %	25 %	25 %	50 %	512550704
13997	NC_021487	CAAAAC	2	12	725993	726004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550704
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13999	NC_021487	CT	3	6	726062	726067	0 %	50 %	0 %	50 %	512550704
14000	NC_021487	CCG	2	6	726160	726165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550704

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