MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021487	AAGCC	2	10	647700	647709	40 %	0 %	20 %	40 %	512550639
12502	NC_021487	CCT	2	6	647742	647747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550639
12503	NC_021487	TACC	2	8	647774	647781	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12504	NC_021487	CAAG	2	8	647845	647852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12505	NC_021487	TGT	3	9	647854	647862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_021487	AGT	2	6	647863	647868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_021487	GTT	2	6	647894	647899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550640
12508	NC_021487	AC	3	6	647928	647933	50 %	0 %	0 %	50 %	512550640
12509	NC_021487	GAAGA	2	10	647957	647966	60 %	0 %	40 %	0 %	512550640
12510	NC_021487	GAG	2	6	647969	647974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550640
12511	NC_021487	CAAGCC	2	12	648011	648022	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512550640
12512	NC_021487	A	6	6	648028	648033	100 %	0 %	0 %	0 %	512550640
12513	NC_021487	GAA	2	6	648038	648043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550640
12514	NC_021487	CCG	3	9	648045	648053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550640
12515	NC_021487	CGC	2	6	648142	648147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550640
12516	NC_021487	T	6	6	648155	648160	0 %	100 %	0 %	0 %	512550640
12517	NC_021487	CTG	2	6	648347	648352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550640
12518	NC_021487	TCG	2	6	648403	648408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550640
12519	NC_021487	AGCG	2	8	648410	648417	25 %	0 %	50 %	25 %	512550640
12520	NC_021487	GCC	2	6	648500	648505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550640
12521	NC_021487	CT	3	6	648523	648528	0 %	50 %	0 %	50 %	512550640
12522	NC_021487	ATCC	2	8	648563	648570	25 %	25 %	0 %	50 %	512550640
12523	NC_021487	GC	3	6	648602	648607	0 %	0 %	50 %	50 %	512550640
12524	NC_021487	GAC	2	6	648710	648715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550640
12525	NC_021487	AAGC	2	8	648761	648768	50 %	0 %	25 %	25 %	512550640
12526	NC_021487	CCG	2	6	648814	648819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550640
12527	NC_021487	CGG	2	6	648865	648870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550640
12528	NC_021487	CT	3	6	648969	648974	0 %	50 %	0 %	50 %	512550640
12529	NC_021487	TGC	2	6	649030	649035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550640
12530	NC_021487	CCT	2	6	649045	649050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550640
12531	NC_021487	GAG	2	6	649118	649123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550640
12532	NC_021487	ATT	2	6	649190	649195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550640
12533	NC_021487	CT	4	8	649243	649250	0 %	50 %	0 %	50 %	512550640
12534	NC_021487	AGA	2	6	649270	649275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550640
12535	NC_021487	ACA	2	6	649315	649320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550640
12536	NC_021487	GCA	2	6	649363	649368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550640
12537	NC_021487	TCC	2	6	649374	649379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550640
12538	NC_021487	GCCG	2	8	649396	649403	0 %	0 %	50 %	50 %	512550640
12539	NC_021487	AT	3	6	649506	649511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_021487	CAT	2	6	649519	649524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_021487	GGCC	2	8	649609	649616	0 %	0 %	50 %	50 %	512550641
12542	NC_021487	ATT	2	6	649640	649645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550641
12543	NC_021487	GGC	2	6	649694	649699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550641
12544	NC_021487	ATGG	2	8	649718	649725	25 %	25 %	50 %	0 %	512550641
12545	NC_021487	TTC	2	6	649818	649823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550641
12546	NC_021487	TCAT	2	8	649833	649840	25 %	50 %	0 %	25 %	512550641
12547	NC_021487	A	6	6	649967	649972	100 %	0 %	0 %	0 %	512550641
12548	NC_021487	TCA	2	6	650052	650057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550641
12549	NC_021487	T	7	7	650088	650094	0 %	100 %	0 %	0 %	512550641
12550	NC_021487	CAG	2	6	650209	650214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550641
12551	NC_021487	TGC	2	6	650251	650256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550641
12552	NC_021487	GGT	2	6	650326	650331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550641
12553	NC_021487	CCA	2	6	650347	650352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550641
12554	NC_021487	GGTT	2	8	650475	650482	0 %	50 %	50 %	0 %	512550641
12555	NC_021487	CAC	2	6	650523	650528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550641
12556	NC_021487	CCT	2	6	650539	650544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550641
12557	NC_021487	GGA	2	6	650575	650580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550641
12558	NC_021487	TGC	3	9	650614	650622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550641
12559	NC_021487	CTG	2	6	650714	650719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550641
12560	NC_021487	GA	3	6	650760	650765	50 %	0 %	50 %	0 %	512550641
12561	NC_021487	AGC	2	6	650812	650817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550641
12562	NC_021487	ACC	2	6	650834	650839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550641
12563	NC_021487	CAT	2	6	650856	650861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550642
12564	NC_021487	GCC	2	6	650900	650905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550642
12565	NC_021487	GCC	2	6	650926	650931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550642
12566	NC_021487	CACC	2	8	650957	650964	25 %	0 %	0 %	75 %	512550642
12567	NC_021487	GCT	3	9	651009	651017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550642
12568	NC_021487	CGC	2	6	651018	651023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550642
12569	NC_021487	TC	3	6	651051	651056	0 %	50 %	0 %	50 %	512550642
12570	NC_021487	CCT	3	9	651153	651161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550642
12571	NC_021487	CA	3	6	651230	651235	50 %	0 %	0 %	50 %	512550642
12572	NC_021487	AAGAC	2	10	651236	651245	60 %	0 %	20 %	20 %	512550642
12573	NC_021487	AGC	2	6	651261	651266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550642
12574	NC_021487	CAA	2	6	651313	651318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550642
12575	NC_021487	GAT	2	6	651319	651324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550642
12576	NC_021487	CTTCC	2	10	651431	651440	0 %	40 %	0 %	60 %	512550642
12577	NC_021487	T	8	8	651485	651492	0 %	100 %	0 %	0 %	512550642
12578	NC_021487	CGA	2	6	651558	651563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550642
12579	NC_021487	TA	3	6	651612	651617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_021487	TGC	2	6	651619	651624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_021487	TTG	2	6	651636	651641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_021487	GCA	2	6	651696	651701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_021487	CCT	2	6	651807	651812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12584	NC_021487	CCT	2	6	651822	651827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12585	NC_021487	CTC	2	6	651848	651853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12586	NC_021487	CT	3	6	651935	651940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12587	NC_021487	GTT	2	6	652084	652089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_021487	AAC	2	6	652183	652188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_021487	GAA	2	6	652206	652211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_021487	TC	3	6	652231	652236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12591	NC_021487	ATT	2	6	652434	652439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550643
12592	NC_021487	TGG	2	6	652451	652456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550643
12593	NC_021487	GAA	2	6	652467	652472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550643
12594	NC_021487	AGA	2	6	652523	652528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550643
12595	NC_021487	CCA	2	6	652533	652538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550643
12596	NC_021487	ATC	2	6	652576	652581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550643
12597	NC_021487	AAC	2	6	652585	652590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550643
12598	NC_021487	TGC	2	6	652655	652660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550643
12599	NC_021487	TCT	2	6	652661	652666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550643
12600	NC_021487	TCC	2	6	652692	652697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550643
12601	NC_021487	AG	3	6	652755	652760	50 %	0 %	50 %	0 %	512550643
12602	NC_021487	CTG	2	6	652780	652785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550643
12603	NC_021487	CCG	2	6	652792	652797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550643
12604	NC_021487	TGAA	2	8	652807	652814	50 %	25 %	25 %	0 %	512550643
12605	NC_021487	GC	3	6	652848	652853	0 %	0 %	50 %	50 %	512550643
12606	NC_021487	TCT	2	6	652913	652918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550643
12607	NC_021487	AAC	2	6	653142	653147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550644
12608	NC_021487	CTC	2	6	653154	653159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550644
12609	NC_021487	GGA	2	6	653166	653171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550644
12610	NC_021487	CT	3	6	653234	653239	0 %	50 %	0 %	50 %	512550644
12611	NC_021487	TCG	2	6	653281	653286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550644
12612	NC_021487	CCT	3	9	653332	653340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550644
12613	NC_021487	GCT	2	6	653372	653377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550644
12614	NC_021487	GGCT	2	8	653423	653430	0 %	25 %	50 %	25 %	512550644
12615	NC_021487	ACC	2	6	653535	653540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550644
12616	NC_021487	AAC	2	6	653629	653634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550644
12617	NC_021487	CG	3	6	653651	653656	0 %	0 %	50 %	50 %	512550644
12618	NC_021487	CGG	2	6	653714	653719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550644
12619	NC_021487	CGC	2	6	653759	653764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550644
12620	NC_021487	T	6	6	654026	654031	0 %	100 %	0 %	0 %	512550645
12621	NC_021487	TCT	2	6	654244	654249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550645
12622	NC_021487	CTT	2	6	654316	654321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550645
12623	NC_021487	CTA	2	6	654340	654345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550645
12624	NC_021487	TGG	2	6	654346	654351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550645
12625	NC_021487	CTC	4	12	654488	654499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550645
12626	NC_021487	GCC	2	6	654542	654547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550645
12627	NC_021487	TGG	2	6	654644	654649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550645
12628	NC_021487	TCA	2	6	654669	654674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550645
12629	NC_021487	CGC	2	6	654679	654684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550645
12630	NC_021487	GAC	2	6	654696	654701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550645
12631	NC_021487	CT	3	6	654723	654728	0 %	50 %	0 %	50 %	512550645
12632	NC_021487	TCC	3	9	654732	654740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550645
12633	NC_021487	ACCT	2	8	654839	654846	25 %	25 %	0 %	50 %	512550645
12634	NC_021487	GCCCA	2	10	654894	654903	20 %	0 %	20 %	60 %	512550645
12635	NC_021487	GGTA	2	8	654907	654914	25 %	25 %	50 %	0 %	512550645
12636	NC_021487	ACA	2	6	654952	654957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550645
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12638	NC_021487	TGA	2	6	655000	655005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550645
12639	NC_021487	CATG	2	8	655034	655041	25 %	25 %	25 %	25 %	512550645
12640	NC_021487	TG	3	6	655040	655045	0 %	50 %	50 %	0 %	512550645
12641	NC_021487	GGCA	2	8	655132	655139	25 %	0 %	50 %	25 %	512550645
12642	NC_021487	TGC	2	6	655143	655148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550645
12643	NC_021487	TGGG	2	8	655265	655272	0 %	25 %	75 %	0 %	512550645
12644	NC_021487	GCC	2	6	655337	655342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550645
12645	NC_021487	CTGC	2	8	655485	655492	0 %	25 %	25 %	50 %	512550645
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12648	NC_021487	GGTGA	2	10	655667	655676	20 %	20 %	60 %	0 %	512550645
12649	NC_021487	CTG	2	6	655691	655696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550645
12650	NC_021487	CTCA	2	8	655703	655710	25 %	25 %	0 %	50 %	512550645
12651	NC_021487	CAC	2	6	655733	655738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550645
12652	NC_021487	TGC	2	6	655754	655759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550645
12653	NC_021487	GGA	3	9	655766	655774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550645
12654	NC_021487	TGGA	2	8	655781	655788	25 %	25 %	50 %	0 %	512550645
12655	NC_021487	CT	3	6	656027	656032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12656	NC_021487	AGA	2	6	656137	656142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550646
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12658	NC_021487	CAT	2	6	656155	656160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550646
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12662	NC_021487	GCA	2	6	656275	656280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550646
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12671	NC_021487	AATG	2	8	656726	656733	50 %	25 %	25 %	0 %	512550646
12672	NC_021487	CGTAA	2	10	656754	656763	40 %	20 %	20 %	20 %	512550646
12673	NC_021487	GAAGA	2	10	656786	656795	60 %	0 %	40 %	0 %	512550646
12674	NC_021487	TCC	2	6	656842	656847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12675	NC_021487	GCCGC	2	10	656910	656919	0 %	0 %	40 %	60 %	512550647
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12677	NC_021487	CCACG	2	10	657018	657027	20 %	0 %	20 %	60 %	512550647
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12679	NC_021487	T	6	6	657171	657176	0 %	100 %	0 %	0 %	512550647
12680	NC_021487	T	6	6	657217	657222	0 %	100 %	0 %	0 %	512550647
12681	NC_021487	TAGA	2	8	657238	657245	50 %	25 %	25 %	0 %	512550647
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12685	NC_021487	TAGC	2	8	657387	657394	25 %	25 %	25 %	25 %	512550647
12686	NC_021487	TCA	2	6	657434	657439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550647
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12688	NC_021487	GGC	2	6	657487	657492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550647
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12715	NC_021487	GAC	2	6	659180	659185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550649
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12718	NC_021487	AACC	2	8	659365	659372	50 %	0 %	0 %	50 %	512550649
12719	NC_021487	AG	3	6	659453	659458	50 %	0 %	50 %	0 %	512550649
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12723	NC_021487	CTT	2	6	659673	659678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550649
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12726	NC_021487	CA	3	6	659958	659963	50 %	0 %	0 %	50 %	512550649
12727	NC_021487	GAA	2	6	659969	659974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550649
12728	NC_021487	GA	3	6	659997	660002	50 %	0 %	50 %	0 %	512550649
12729	NC_021487	GCA	2	6	660004	660009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550649
12730	NC_021487	ATAAGC	2	12	660111	660122	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512550649
12731	NC_021487	GCT	2	6	660131	660136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550649
12732	NC_021487	TC	3	6	660219	660224	0 %	50 %	0 %	50 %	512550649
12733	NC_021487	CTT	2	6	660303	660308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12734	NC_021487	ATCG	2	8	660318	660325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12735	NC_021487	CGA	2	6	660416	660421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550650
12736	NC_021487	CTTC	2	8	660442	660449	0 %	50 %	0 %	50 %	512550650
12737	NC_021487	CT	3	6	660567	660572	0 %	50 %	0 %	50 %	512550650
12738	NC_021487	GCA	2	6	660624	660629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550650
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12740	NC_021487	AGC	2	6	660720	660725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550650
12741	NC_021487	G	6	6	660873	660878	0 %	0 %	100 %	0 %	512550650
12742	NC_021487	TAG	2	6	660927	660932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550650
12743	NC_021487	T	6	6	660972	660977	0 %	100 %	0 %	0 %	512550650
12744	NC_021487	GCA	2	6	661174	661179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550650
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12748	NC_021487	GCG	2	6	661434	661439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550650
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12850	NC_021487	CTT	2	6	666767	666772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12863	NC_021487	TA	3	6	667644	667649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12864	NC_021487	ACA	2	6	667732	667737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12991	NC_021487	AAT	2	6	674332	674337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550668
12992	NC_021487	TGC	2	6	674339	674344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550668
12993	NC_021487	TAAA	2	8	674353	674360	75 %	25 %	0 %	0 %	512550668
12994	NC_021487	TCC	2	6	674428	674433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550668
12995	NC_021487	AGC	2	6	674554	674559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550668
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12999	NC_021487	TCG	2	6	674765	674770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550668
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