MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021487	C	6	6	621570	621575	0 %	0 %	0 %	100 %	512550621
12002	NC_021487	TGG	2	6	621596	621601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550621
12003	NC_021487	GC	3	6	621610	621615	0 %	0 %	50 %	50 %	512550621
12004	NC_021487	CCG	2	6	621652	621657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550621
12005	NC_021487	GCT	2	6	621704	621709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550621
12006	NC_021487	GCC	2	6	621719	621724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550621
12007	NC_021487	GGT	2	6	621731	621736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550621
12008	NC_021487	CT	3	6	621815	621820	0 %	50 %	0 %	50 %	512550621
12009	NC_021487	CAAC	2	8	621928	621935	50 %	0 %	0 %	50 %	512550622
12010	NC_021487	CAC	2	6	621956	621961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12011	NC_021487	CCT	2	6	622101	622106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550622
12012	NC_021487	TGGG	2	8	622134	622141	0 %	25 %	75 %	0 %	512550622
12013	NC_021487	ATC	2	6	622391	622396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12014	NC_021487	CAT	2	6	622415	622420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12015	NC_021487	CCA	2	6	622483	622488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12016	NC_021487	CAT	2	6	622588	622593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12017	NC_021487	AGG	2	6	622595	622600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550622
12018	NC_021487	GGT	2	6	622664	622669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550622
12019	NC_021487	ATAC	2	8	622681	622688	50 %	25 %	0 %	25 %	512550622
12020	NC_021487	GTA	2	6	622703	622708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550622
12021	NC_021487	TTC	3	9	622734	622742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550622
12022	NC_021487	CGT	2	6	622756	622761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550622
12023	NC_021487	TCA	2	6	622762	622767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12024	NC_021487	TAGA	2	8	622822	622829	50 %	25 %	25 %	0 %	512550622
12025	NC_021487	TCA	2	6	622978	622983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12026	NC_021487	CCT	2	6	623095	623100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550622
12027	NC_021487	CAT	2	6	623161	623166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12028	NC_021487	ATT	2	6	623208	623213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550622
12029	NC_021487	T	6	6	623505	623510	0 %	100 %	0 %	0 %	512550622
12030	NC_021487	CCA	2	6	623698	623703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12031	NC_021487	TCT	2	6	623715	623720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550622
12032	NC_021487	AGGG	2	8	623721	623728	25 %	0 %	75 %	0 %	512550622
12033	NC_021487	CCA	2	6	623767	623772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12034	NC_021487	TCAC	2	8	623874	623881	25 %	25 %	0 %	50 %	512550622
12035	NC_021487	CCCT	2	8	623924	623931	0 %	25 %	0 %	75 %	512550622
12036	NC_021487	CTC	2	6	624035	624040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550622
12037	NC_021487	CCG	2	6	624047	624052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550622
12038	NC_021487	CCA	3	9	624129	624137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12039	NC_021487	TA	3	6	624208	624213	50 %	50 %	0 %	0 %	512550622
12040	NC_021487	CAA	2	6	624262	624267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550622
12041	NC_021487	CCA	3	9	624307	624315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12042	NC_021487	TGC	2	6	624398	624403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550622
12043	NC_021487	CTG	2	6	624410	624415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550622
12044	NC_021487	GAT	2	6	624469	624474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550622
12045	NC_021487	CAT	2	6	624493	624498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12046	NC_021487	CAC	2	6	624503	624508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12047	NC_021487	AGG	2	6	624515	624520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550622
12048	NC_021487	AAC	2	6	624602	624607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550622
12049	NC_021487	AAG	2	6	624622	624627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550622
12050	NC_021487	AAT	2	6	624635	624640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550622
12051	NC_021487	TGT	2	6	624684	624689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550622
12052	NC_021487	GT	3	6	624688	624693	0 %	50 %	50 %	0 %	512550622
12053	NC_021487	ACT	2	6	624699	624704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12054	NC_021487	TC	3	6	624718	624723	0 %	50 %	0 %	50 %	512550622
12055	NC_021487	GGC	2	6	624791	624796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550622
12056	NC_021487	AAG	2	6	624871	624876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550622
12057	NC_021487	GCT	2	6	625020	625025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550622
12058	NC_021487	TGA	2	6	625093	625098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550622
12059	NC_021487	GC	3	6	625118	625123	0 %	0 %	50 %	50 %	512550622
12060	NC_021487	GCT	2	6	625132	625137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550622
12061	NC_021487	TCC	2	6	625185	625190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550622
12062	NC_021487	CCA	2	6	625239	625244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12063	NC_021487	CCA	2	6	625258	625263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550622
12064	NC_021487	TCA	2	6	625299	625304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550622
12065	NC_021487	CAA	2	6	625438	625443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550622
12066	NC_021487	TGAA	2	8	625528	625535	50 %	25 %	25 %	0 %	512550622
12067	NC_021487	GAT	2	6	625541	625546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550622
12068	NC_021487	TCC	2	6	625585	625590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12069	NC_021487	AAG	2	6	625647	625652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_021487	CTG	2	6	625655	625660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12071	NC_021487	TTCG	2	8	625708	625715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12072	NC_021487	CTTT	2	8	625742	625749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12073	NC_021487	ACCT	2	8	625859	625866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12074	NC_021487	TGGA	2	8	625887	625894	25 %	25 %	50 %	0 %	512550623
12075	NC_021487	CTTT	2	8	625905	625912	0 %	75 %	0 %	25 %	512550623
12076	NC_021487	GTG	2	6	625939	625944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550623
12077	NC_021487	TCC	2	6	626003	626008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550623
12078	NC_021487	ACA	2	6	626099	626104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550623
12079	NC_021487	CAG	2	6	626262	626267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550623
12080	NC_021487	GC	3	6	626294	626299	0 %	0 %	50 %	50 %	512550623
12081	NC_021487	ACT	2	6	626322	626327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550623
12082	NC_021487	AC	3	6	626333	626338	50 %	0 %	0 %	50 %	512550623
12083	NC_021487	GA	3	6	626347	626352	50 %	0 %	50 %	0 %	512550623
12084	NC_021487	GCTC	2	8	626394	626401	0 %	25 %	25 %	50 %	512550623
12085	NC_021487	GA	3	6	626467	626472	50 %	0 %	50 %	0 %	512550623
12086	NC_021487	ACA	2	6	626576	626581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550623
12087	NC_021487	CAC	2	6	626596	626601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550623
12088	NC_021487	CAG	2	6	626721	626726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550623
12089	NC_021487	CTT	2	6	626826	626831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550623
12090	NC_021487	CCT	2	6	626874	626879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550623
12091	NC_021487	GTC	2	6	626880	626885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550623
12092	NC_021487	GCA	2	6	626943	626948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550623
12093	NC_021487	TC	3	6	627122	627127	0 %	50 %	0 %	50 %	512550623
12094	NC_021487	AGA	2	6	627338	627343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550623
12095	NC_021487	CAC	2	6	627347	627352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550623
12096	NC_021487	TC	3	6	627421	627426	0 %	50 %	0 %	50 %	512550623
12097	NC_021487	AGG	2	6	627508	627513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550623
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12099	NC_021487	TGC	2	6	627695	627700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550623
12100	NC_021487	CAT	2	6	627713	627718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550623
12101	NC_021487	AGC	2	6	627751	627756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550623
12102	NC_021487	TC	3	6	627917	627922	0 %	50 %	0 %	50 %	512550623
12103	NC_021487	GCC	2	6	627957	627962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550623
12104	NC_021487	CT	5	10	627994	628003	0 %	50 %	0 %	50 %	512550623
12105	NC_021487	ACG	2	6	628213	628218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550623
12106	NC_021487	CGA	2	6	628219	628224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550623
12107	NC_021487	C	7	7	628297	628303	0 %	0 %	0 %	100 %	512550623
12108	NC_021487	GACC	2	8	628326	628333	25 %	0 %	25 %	50 %	512550623
12109	NC_021487	CT	3	6	628397	628402	0 %	50 %	0 %	50 %	512550623
12110	NC_021487	GCG	2	6	628464	628469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550623
12111	NC_021487	CAT	2	6	628676	628681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12112	NC_021487	CGT	2	6	628683	628688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_021487	T	6	6	628721	628726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12114	NC_021487	CTA	2	6	628767	628772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_021487	GCA	2	6	628831	628836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550624
12116	NC_021487	TTG	2	6	628866	628871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550624
12117	NC_021487	CTC	2	6	628911	628916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550624
12118	NC_021487	ATC	2	6	628917	628922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550624
12119	NC_021487	CGC	2	6	628978	628983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550624
12120	NC_021487	GGCA	2	8	629082	629089	25 %	0 %	50 %	25 %	512550624
12121	NC_021487	TCG	2	6	629119	629124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550624
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12239	NC_021487	GCT	2	6	634909	634914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550629
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12242	NC_021487	CTC	2	6	635063	635068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550629
12243	NC_021487	TCTA	2	8	635070	635077	25 %	50 %	0 %	25 %	512550629
12244	NC_021487	CTG	2	6	635135	635140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550629
12245	NC_021487	TCG	2	6	635191	635196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550629
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12260	NC_021487	GCT	2	6	635906	635911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550630
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12328	NC_021487	GTC	2	6	638565	638570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12331	NC_021487	AG	3	6	638793	638798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12332	NC_021487	GAT	2	6	638879	638884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550632
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12348	NC_021487	TCT	2	6	639592	639597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550632
12349	NC_021487	GGCTT	2	10	639637	639646	0 %	40 %	40 %	20 %	512550632
12350	NC_021487	A	7	7	639737	639743	100 %	0 %	0 %	0 %	512550632
12351	NC_021487	CCG	2	6	639751	639756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550632
12352	NC_021487	GCTT	2	8	639860	639867	0 %	50 %	25 %	25 %	512550633
12353	NC_021487	GCGT	2	8	639884	639891	0 %	25 %	50 %	25 %	512550633
12354	NC_021487	TCTT	2	8	639921	639928	0 %	75 %	0 %	25 %	512550633
12355	NC_021487	CCT	3	9	640092	640100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550633
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12359	NC_021487	CGG	2	6	640262	640267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550633
12360	NC_021487	TGG	2	6	640355	640360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550633
12361	NC_021487	TA	3	6	640400	640405	50 %	50 %	0 %	0 %	512550633
12362	NC_021487	GAG	2	6	640408	640413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550633
12363	NC_021487	CAG	2	6	640456	640461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550633
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12483	NC_021487	CTA	2	6	646868	646873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550638
12484	NC_021487	TCA	2	6	646894	646899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12485	NC_021487	AGC	2	6	646967	646972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550639
12486	NC_021487	TGC	2	6	646973	646978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550639
12487	NC_021487	CTA	2	6	647001	647006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550639
12488	NC_021487	CT	3	6	647009	647014	0 %	50 %	0 %	50 %	512550639
12489	NC_021487	TCA	2	6	647064	647069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550639
12490	NC_021487	CAGT	2	8	647103	647110	25 %	25 %	25 %	25 %	512550639
12491	NC_021487	TCTTA	2	10	647208	647217	20 %	60 %	0 %	20 %	512550639
12492	NC_021487	CTGC	2	8	647245	647252	0 %	25 %	25 %	50 %	512550639
12493	NC_021487	AGC	2	6	647262	647267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550639
12494	NC_021487	AGA	2	6	647370	647375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550639
12495	NC_021487	CCT	2	6	647465	647470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550639
12496	NC_021487	AAT	2	6	647500	647505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550639
12497	NC_021487	CTC	2	6	647587	647592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550639
12498	NC_021487	GAA	2	6	647620	647625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550639
12499	NC_021487	GCCT	2	8	647644	647651	0 %	25 %	25 %	50 %	512550639
12500	NC_021487	CCG	2	6	647684	647689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550639

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