MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021487	T	6	6	595011	595016	0 %	100 %	0 %	0 %	512550597
11502	NC_021487	CTT	3	9	595019	595027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550597
11503	NC_021487	GA	3	6	595077	595082	50 %	0 %	50 %	0 %	512550597
11504	NC_021487	GAG	2	6	595185	595190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550597
11505	NC_021487	TC	3	6	595202	595207	0 %	50 %	0 %	50 %	512550597
11506	NC_021487	GTG	2	6	595291	595296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_021487	TC	4	8	595297	595304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_021487	CAT	2	6	595347	595352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_021487	TAG	2	6	595429	595434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_021487	AGG	2	6	595456	595461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_021487	TAA	2	6	595545	595550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550598
11512	NC_021487	AGG	2	6	595558	595563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550598
11513	NC_021487	ACA	2	6	595591	595596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550598
11514	NC_021487	CCT	2	6	595855	595860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_021487	AGG	2	6	595907	595912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550599
11516	NC_021487	ATTG	2	8	595921	595928	25 %	50 %	25 %	0 %	512550599
11517	NC_021487	TCC	2	6	595954	595959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550599
11518	NC_021487	TCGT	2	8	596046	596053	0 %	50 %	25 %	25 %	512550599
11519	NC_021487	CAA	2	6	596058	596063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550599
11520	NC_021487	AC	4	8	596146	596153	50 %	0 %	0 %	50 %	512550599
11521	NC_021487	CAT	2	6	596169	596174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550599
11522	NC_021487	GCA	2	6	596254	596259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550599
11523	NC_021487	TGA	2	6	596311	596316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550599
11524	NC_021487	ATA	2	6	596329	596334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550599
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11526	NC_021487	TC	3	6	596376	596381	0 %	50 %	0 %	50 %	512550599
11527	NC_021487	GCCG	2	8	596401	596408	0 %	0 %	50 %	50 %	512550599
11528	NC_021487	CGT	2	6	596465	596470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550599
11529	NC_021487	CGA	2	6	596476	596481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550599
11530	NC_021487	GC	3	6	596536	596541	0 %	0 %	50 %	50 %	512550599
11531	NC_021487	TCGC	2	8	596553	596560	0 %	25 %	25 %	50 %	512550599
11532	NC_021487	TTGA	2	8	596574	596581	25 %	50 %	25 %	0 %	512550599
11533	NC_021487	AGC	2	6	596592	596597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550599
11534	NC_021487	CCTAC	2	10	596605	596614	20 %	20 %	0 %	60 %	512550599
11535	NC_021487	TCT	2	6	596633	596638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550599
11536	NC_021487	CTT	2	6	596714	596719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550599
11537	NC_021487	CCT	2	6	596758	596763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550599
11538	NC_021487	TC	3	6	596781	596786	0 %	50 %	0 %	50 %	512550599
11539	NC_021487	CAC	2	6	596889	596894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550599
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11541	NC_021487	TCCA	2	8	596991	596998	25 %	25 %	0 %	50 %	512550599
11542	NC_021487	GCG	2	6	597017	597022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550599
11543	NC_021487	GAA	2	6	597125	597130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550599
11544	NC_021487	TCCG	2	8	597134	597141	0 %	25 %	25 %	50 %	512550599
11545	NC_021487	CAG	2	6	597149	597154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550599
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11547	NC_021487	GAT	2	6	597322	597327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550600
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11552	NC_021487	CTC	2	6	597550	597555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550600
11553	NC_021487	TAG	2	6	597576	597581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550600
11554	NC_021487	ACG	2	6	597613	597618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550600
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11557	NC_021487	AC	3	6	597747	597752	50 %	0 %	0 %	50 %	512550600
11558	NC_021487	AGG	4	12	597790	597801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550600
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11564	NC_021487	CGT	2	6	598092	598097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550600
11565	NC_021487	GGTT	2	8	598125	598132	0 %	50 %	50 %	0 %	512550600
11566	NC_021487	GCG	2	6	598181	598186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550600
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11588	NC_021487	ACG	2	6	599492	599497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550602
11589	NC_021487	GGCC	2	8	599530	599537	0 %	0 %	50 %	50 %	512550602
11590	NC_021487	CTG	2	6	599564	599569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550602
11591	NC_021487	TTA	2	6	599619	599624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550602
11592	NC_021487	GCTGC	2	10	599653	599662	0 %	20 %	40 %	40 %	512550602
11593	NC_021487	CG	3	6	599671	599676	0 %	0 %	50 %	50 %	512550602
11594	NC_021487	AG	3	6	599699	599704	50 %	0 %	50 %	0 %	512550602
11595	NC_021487	GTA	2	6	599743	599748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550602
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11597	NC_021487	CG	3	6	599980	599985	0 %	0 %	50 %	50 %	512550602
11598	NC_021487	TTC	2	6	599988	599993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550602
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11600	NC_021487	GT	3	6	600022	600027	0 %	50 %	50 %	0 %	512550602
11601	NC_021487	AGT	2	6	600132	600137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550602
11602	NC_021487	TCC	2	6	600230	600235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550602
11603	NC_021487	AAG	2	6	600266	600271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550602
11604	NC_021487	TGG	2	6	600282	600287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550602
11605	NC_021487	TTC	2	6	600411	600416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550603
11606	NC_021487	TTGG	2	8	600503	600510	0 %	50 %	50 %	0 %	512550603
11607	NC_021487	TATGT	2	10	600535	600544	20 %	60 %	20 %	0 %	512550603
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11609	NC_021487	TGC	2	6	600598	600603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550603
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11611	NC_021487	CA	3	6	600608	600613	50 %	0 %	0 %	50 %	512550603
11612	NC_021487	ATT	2	6	600710	600715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550603
11613	NC_021487	CAG	2	6	600747	600752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550603
11614	NC_021487	TGG	2	6	600769	600774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550603
11615	NC_021487	ACA	2	6	600872	600877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550603
11616	NC_021487	TCT	2	6	600895	600900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550603
11617	NC_021487	TGC	2	6	601027	601032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550603
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11619	NC_021487	GCAA	2	8	601120	601127	50 %	0 %	25 %	25 %	512550603
11620	NC_021487	CAAC	2	8	601147	601154	50 %	0 %	0 %	50 %	512550603
11621	NC_021487	TGC	2	6	601163	601168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550603
11622	NC_021487	TC	3	6	601178	601183	0 %	50 %	0 %	50 %	512550603
11623	NC_021487	CGT	2	6	601212	601217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550603
11624	NC_021487	CTT	2	6	601279	601284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550603
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11630	NC_021487	TCT	2	6	601537	601542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550603
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11700	NC_021487	GAT	2	6	605704	605709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11702	NC_021487	TTC	2	6	605736	605741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11723	NC_021487	ATAG	2	8	606666	606673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11724	NC_021487	GA	3	6	606706	606711	50 %	0 %	50 %	0 %	512550608
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11742	NC_021487	TC	3	6	607607	607612	0 %	50 %	0 %	50 %	512550608
11743	NC_021487	TGA	2	6	607696	607701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550608
11744	NC_021487	CATCGG	2	12	607712	607723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512550608
11745	NC_021487	CCT	2	6	607751	607756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550608
11746	NC_021487	TGA	2	6	607786	607791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550608
11747	NC_021487	TTA	2	6	607810	607815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550608
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11750	NC_021487	ATC	2	6	607887	607892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550608
11751	NC_021487	CAC	2	6	607894	607899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550608
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11753	NC_021487	TCA	2	6	608016	608021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550608
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11770	NC_021487	GC	3	6	608997	609002	0 %	0 %	50 %	50 %	512550609
11771	NC_021487	TCC	2	6	609006	609011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550609
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11814	NC_021487	TTC	2	6	611995	612000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550610
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11817	NC_021487	TGTTC	2	10	612036	612045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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11843	NC_021487	AGGG	2	8	613525	613532	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11844	NC_021487	GGC	2	6	613538	613543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11845	NC_021487	GAG	2	6	613570	613575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11846	NC_021487	AG	3	6	613594	613599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11847	NC_021487	CA	3	6	613605	613610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11848	NC_021487	CTT	2	6	613640	613645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11849	NC_021487	TTC	2	6	613656	613661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11850	NC_021487	TGTTCT	2	12	613798	613809	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11851	NC_021487	TAG	2	6	613811	613816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11859	NC_021487	GGC	2	6	614184	614189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550613
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11863	NC_021487	TCA	3	9	614358	614366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550613
11864	NC_021487	GTC	2	6	614419	614424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550613
11865	NC_021487	CCT	2	6	614463	614468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550613
11866	NC_021487	CTT	2	6	614493	614498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550613
11867	NC_021487	GTG	2	6	614501	614506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550613
11868	NC_021487	ACT	2	6	614519	614524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550613
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11876	NC_021487	TCA	2	6	614892	614897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550613
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11984	NC_021487	A	7	7	620667	620673	100 %	0 %	0 %	0 %	512550620
11985	NC_021487	CCT	2	6	620774	620779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550620
11986	NC_021487	AGAGC	2	10	620819	620828	40 %	0 %	40 %	20 %	512550620
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11989	NC_021487	ACC	2	6	621069	621074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11990	NC_021487	TTG	2	6	621214	621219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550621
11991	NC_021487	CGTC	2	8	621242	621249	0 %	25 %	25 %	50 %	512550621
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11993	NC_021487	CGCA	2	8	621263	621270	25 %	0 %	25 %	50 %	512550621
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11997	NC_021487	TCC	2	6	621442	621447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550621
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11999	NC_021487	CAT	2	6	621476	621481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550621
12000	NC_021487	GCG	2	6	621550	621555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550621

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