MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021487	CGA	2	6	543514	543519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550546
10502	NC_021487	AG	3	6	543528	543533	50 %	0 %	50 %	0 %	512550546
10503	NC_021487	CGT	2	6	543567	543572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550546
10504	NC_021487	CTG	2	6	543659	543664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550546
10505	NC_021487	AG	3	6	543758	543763	50 %	0 %	50 %	0 %	512550546
10506	NC_021487	ACC	2	6	543789	543794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550546
10507	NC_021487	GCA	2	6	543849	543854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550546
10508	NC_021487	GCAC	2	8	543875	543882	25 %	0 %	25 %	50 %	512550546
10509	NC_021487	ATAG	2	8	543886	543893	50 %	25 %	25 %	0 %	512550546
10510	NC_021487	GTT	2	6	543928	543933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550546
10511	NC_021487	AACC	2	8	543938	543945	50 %	0 %	0 %	50 %	512550546
10512	NC_021487	CCT	2	6	544021	544026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550546
10513	NC_021487	CAAG	2	8	544123	544130	50 %	0 %	25 %	25 %	512550546
10514	NC_021487	GCG	2	6	544190	544195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550546
10515	NC_021487	GA	4	8	544198	544205	50 %	0 %	50 %	0 %	512550546
10516	NC_021487	GGC	2	6	544214	544219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550546
10517	NC_021487	TCT	2	6	544266	544271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550547
10518	NC_021487	T	6	6	544352	544357	0 %	100 %	0 %	0 %	512550547
10519	NC_021487	ATC	2	6	544411	544416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550547
10520	NC_021487	TGT	2	6	544481	544486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550547
10521	NC_021487	TGG	2	6	544509	544514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550547
10522	NC_021487	CTG	2	6	544615	544620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550547
10523	NC_021487	CTC	2	6	544669	544674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550547
10524	NC_021487	CGC	2	6	544694	544699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550547
10525	NC_021487	TCC	2	6	544867	544872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550547
10526	NC_021487	CGC	2	6	544873	544878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550547
10527	NC_021487	CT	3	6	544932	544937	0 %	50 %	0 %	50 %	512550547
10528	NC_021487	TCC	2	6	544939	544944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10529	NC_021487	TTCCC	2	10	545224	545233	0 %	40 %	0 %	60 %	512550548
10530	NC_021487	GGAT	2	8	545256	545263	25 %	25 %	50 %	0 %	512550548
10531	NC_021487	AGG	2	6	545313	545318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550548
10532	NC_021487	GCG	2	6	545351	545356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550548
10533	NC_021487	CTT	3	9	545386	545394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550548
10534	NC_021487	T	6	6	545406	545411	0 %	100 %	0 %	0 %	512550548
10535	NC_021487	CG	3	6	545443	545448	0 %	0 %	50 %	50 %	512550548
10536	NC_021487	GCT	2	6	545512	545517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550548
10537	NC_021487	AGC	2	6	545532	545537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550548
10538	NC_021487	TGC	2	6	545548	545553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550548
10539	NC_021487	C	6	6	545629	545634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10540	NC_021487	AGA	2	6	545704	545709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_021487	ATGAA	2	10	545741	545750	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_021487	TAA	2	6	545759	545764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_021487	GAG	2	6	545814	545819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_021487	GAT	2	6	545832	545837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550549
10545	NC_021487	CAC	3	9	545862	545870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550549
10546	NC_021487	ACC	2	6	545929	545934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550549
10547	NC_021487	AG	3	6	545949	545954	50 %	0 %	50 %	0 %	512550549
10548	NC_021487	C	7	7	545983	545989	0 %	0 %	0 %	100 %	512550549
10549	NC_021487	AAG	2	6	545992	545997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550549
10550	NC_021487	CCA	2	6	546037	546042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550549
10551	NC_021487	TGG	2	6	546069	546074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550549
10552	NC_021487	C	6	6	546087	546092	0 %	0 %	0 %	100 %	512550549
10553	NC_021487	CTC	2	6	546104	546109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550549
10554	NC_021487	CGC	2	6	546115	546120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550549
10555	NC_021487	CCTC	2	8	546125	546132	0 %	25 %	0 %	75 %	512550549
10556	NC_021487	ACA	2	6	546164	546169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550549
10557	NC_021487	CGCC	2	8	546170	546177	0 %	0 %	25 %	75 %	512550549
10558	NC_021487	C	6	6	546284	546289	0 %	0 %	0 %	100 %	512550549
10559	NC_021487	CCA	2	6	546313	546318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550549
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10563	NC_021487	GCG	2	6	546430	546435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550549
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10565	NC_021487	GCC	2	6	546490	546495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550549
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10567	NC_021487	TGC	2	6	546566	546571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550549
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10569	NC_021487	GTG	2	6	546613	546618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550549
10570	NC_021487	TCT	3	9	546668	546676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550549
10571	NC_021487	TCG	2	6	546761	546766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550549
10572	NC_021487	TCG	2	6	546908	546913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550549
10573	NC_021487	CGG	2	6	546974	546979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_021487	GGA	2	6	547098	547103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_021487	GAA	2	6	547159	547164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_021487	CAA	2	6	547193	547198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10577	NC_021487	GC	3	6	547276	547281	0 %	0 %	50 %	50 %	512550550
10578	NC_021487	GCT	2	6	547304	547309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550550
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10582	NC_021487	GTC	2	6	547476	547481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550550
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10586	NC_021487	ACA	2	6	547571	547576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550550
10587	NC_021487	ACG	2	6	547591	547596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550550
10588	NC_021487	GCC	2	6	547629	547634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550550
10589	NC_021487	GTT	2	6	547644	547649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550550
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10591	NC_021487	CGG	2	6	547739	547744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550550
10592	NC_021487	CCTCA	2	10	547766	547775	20 %	20 %	0 %	60 %	512550550
10593	NC_021487	ACA	2	6	547808	547813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550550
10594	NC_021487	CCT	2	6	547818	547823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550550
10595	NC_021487	TCC	2	6	547833	547838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550550
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10598	NC_021487	ACC	2	6	547944	547949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550550
10599	NC_021487	TAT	2	6	547971	547976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550550
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10602	NC_021487	GTTC	2	8	548219	548226	0 %	50 %	25 %	25 %	512550550
10603	NC_021487	C	6	6	548280	548285	0 %	0 %	0 %	100 %	512550550
10604	NC_021487	CT	3	6	548320	548325	0 %	50 %	0 %	50 %	512550551
10605	NC_021487	TCT	2	6	548353	548358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550551
10606	NC_021487	CG	4	8	548415	548422	0 %	0 %	50 %	50 %	512550551
10607	NC_021487	AGA	2	6	548427	548432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550551
10608	NC_021487	CT	3	6	548616	548621	0 %	50 %	0 %	50 %	512550551
10609	NC_021487	GTT	2	6	548636	548641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550551
10610	NC_021487	CG	3	6	548670	548675	0 %	0 %	50 %	50 %	512550551
10611	NC_021487	CGT	2	6	548700	548705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550551
10612	NC_021487	CTG	2	6	548708	548713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550551
10613	NC_021487	GACG	2	8	548722	548729	25 %	0 %	50 %	25 %	512550551
10614	NC_021487	CTG	2	6	548738	548743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550551
10615	NC_021487	TGC	2	6	548771	548776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550551
10616	NC_021487	GGAG	2	8	548780	548787	25 %	0 %	75 %	0 %	512550551
10617	NC_021487	CCG	2	6	548797	548802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550551
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10620	NC_021487	TGT	2	6	548967	548972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550551
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10622	NC_021487	CGC	2	6	549108	549113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550551
10623	NC_021487	ATGGCA	2	12	549117	549128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512550551
10624	NC_021487	AAG	2	6	549182	549187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550551
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10626	NC_021487	CGA	2	6	549244	549249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550551
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10635	NC_021487	GGAAT	2	10	549513	549522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10636	NC_021487	GCT	2	6	549544	549549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550553
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10651	NC_021487	TGC	2	6	550277	550282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550553
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10655	NC_021487	GTT	3	9	550386	550394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10656	NC_021487	GTTC	2	8	550409	550416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10657	NC_021487	GGCGGA	2	12	550426	550437	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512550554
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10735	NC_021487	GCA	2	6	554930	554935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550557
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10743	NC_021487	A	6	6	555215	555220	100 %	0 %	0 %	0 %	512550558
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10866	NC_021487	GAG	2	6	561219	561224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550563
10867	NC_021487	GAT	2	6	561228	561233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550563
10868	NC_021487	CGC	2	6	561251	561256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550563
10869	NC_021487	ATA	2	6	561273	561278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550563
10870	NC_021487	CGG	2	6	561295	561300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550563
10871	NC_021487	CAA	2	6	561382	561387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550563
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10873	NC_021487	TGG	2	6	561514	561519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550563
10874	NC_021487	GGC	2	6	561599	561604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550563
10875	NC_021487	CTT	2	6	561629	561634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550563
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10877	NC_021487	GCT	2	6	561827	561832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550563
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10879	NC_021487	CTG	2	6	562034	562039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550563
10880	NC_021487	TATGA	2	10	562106	562115	40 %	40 %	20 %	0 %	512550563
10881	NC_021487	CCCT	2	8	562140	562147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10882	NC_021487	TAC	2	6	562226	562231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550564
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10886	NC_021487	CGT	2	6	562361	562366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550564
10887	NC_021487	CTG	2	6	562385	562390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550564
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10909	NC_021487	CT	3	6	564251	564256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10910	NC_021487	C	6	6	564266	564271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10932	NC_021487	ATT	2	6	565399	565404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10966	NC_021487	CGCC	2	8	567600	567607	0 %	0 %	25 %	75 %	512550568
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10968	NC_021487	CAAG	2	8	567639	567646	50 %	0 %	25 %	25 %	512550568
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10975	NC_021487	CCG	2	6	568267	568272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550569
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