MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021487	TGA	2	6	415210	415215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550438
8002	NC_021487	CCG	2	6	415255	415260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550438
8003	NC_021487	AGG	2	6	415487	415492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550438
8004	NC_021487	GTA	2	6	415533	415538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550438
8005	NC_021487	GAT	2	6	415607	415612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550438
8006	NC_021487	CAT	2	6	415688	415693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550438
8007	NC_021487	TGG	2	6	415792	415797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550438
8008	NC_021487	TCT	2	6	415839	415844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550438
8009	NC_021487	GCG	2	6	415878	415883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550438
8010	NC_021487	AGG	2	6	415942	415947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550438
8011	NC_021487	GGGGAA	2	12	416110	416121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021487	CTC	2	6	416403	416408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550439
8013	NC_021487	TGC	2	6	416470	416475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550439
8014	NC_021487	GCG	2	6	416577	416582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550439
8015	NC_021487	CG	3	6	416665	416670	0 %	0 %	50 %	50 %	512550439
8016	NC_021487	CG	3	6	416673	416678	0 %	0 %	50 %	50 %	512550439
8017	NC_021487	CAG	2	6	416733	416738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550439
8018	NC_021487	AAG	2	6	416805	416810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550439
8019	NC_021487	TGG	2	6	416884	416889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550439
8020	NC_021487	CTG	2	6	416892	416897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550439
8021	NC_021487	GT	3	6	416937	416942	0 %	50 %	50 %	0 %	512550439
8022	NC_021487	CGT	2	6	417053	417058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550439
8023	NC_021487	GGCGTA	2	12	417109	417120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512550439
8024	NC_021487	ATT	2	6	417187	417192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550439
8025	NC_021487	CCTT	2	8	417479	417486	0 %	50 %	0 %	50 %	512550440
8026	NC_021487	TGC	2	6	417494	417499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550440
8027	NC_021487	GT	3	6	417604	417609	0 %	50 %	50 %	0 %	512550440
8028	NC_021487	TAA	2	6	417634	417639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550440
8029	NC_021487	CTC	2	6	417760	417765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550440
8030	NC_021487	T	6	6	417835	417840	0 %	100 %	0 %	0 %	512550440
8031	NC_021487	GTT	2	6	417866	417871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550440
8032	NC_021487	AGGT	2	8	418049	418056	25 %	25 %	50 %	0 %	512550440
8033	NC_021487	CTC	2	6	418293	418298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_021487	GTT	2	6	418321	418326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_021487	AGG	2	6	418387	418392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_021487	AAG	2	6	418398	418403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_021487	TGT	2	6	418439	418444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_021487	TTG	2	6	418492	418497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550441
8039	NC_021487	AT	3	6	418690	418695	50 %	50 %	0 %	0 %	512550441
8040	NC_021487	AGG	3	9	418891	418899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550441
8041	NC_021487	TAGC	2	8	419290	419297	25 %	25 %	25 %	25 %	512550441
8042	NC_021487	CAGAC	2	10	419311	419320	40 %	0 %	20 %	40 %	512550441
8043	NC_021487	CT	3	6	419345	419350	0 %	50 %	0 %	50 %	512550441
8044	NC_021487	GAGG	2	8	419394	419401	25 %	0 %	75 %	0 %	512550441
8045	NC_021487	ATGT	2	8	419478	419485	25 %	50 %	25 %	0 %	512550441
8046	NC_021487	GGA	2	6	419504	419509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550441
8047	NC_021487	CGAG	2	8	419523	419530	25 %	0 %	50 %	25 %	512550441
8048	NC_021487	AG	3	6	419545	419550	50 %	0 %	50 %	0 %	512550441
8049	NC_021487	AAG	2	6	419555	419560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_021487	A	6	6	419571	419576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_021487	CGA	2	6	419672	419677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550442
8052	NC_021487	CG	3	6	419755	419760	0 %	0 %	50 %	50 %	512550442
8053	NC_021487	GTG	2	6	419799	419804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550442
8054	NC_021487	AAG	2	6	419848	419853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550442
8055	NC_021487	GCTTC	2	10	419868	419877	0 %	40 %	20 %	40 %	512550442
8056	NC_021487	GTT	2	6	419917	419922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550442
8057	NC_021487	CTT	2	6	419925	419930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550442
8058	NC_021487	A	6	6	419931	419936	100 %	0 %	0 %	0 %	512550442
8059	NC_021487	ACG	2	6	419975	419980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550442
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8061	NC_021487	TTA	2	6	420121	420126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550442
8062	NC_021487	GAG	2	6	420132	420137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550442
8063	NC_021487	AAG	2	6	420148	420153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550442
8064	NC_021487	GT	3	6	420238	420243	0 %	50 %	50 %	0 %	512550443
8065	NC_021487	TA	3	6	420328	420333	50 %	50 %	0 %	0 %	512550443
8066	NC_021487	GGC	2	6	420369	420374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550443
8067	NC_021487	AGCG	2	8	420379	420386	25 %	0 %	50 %	25 %	512550443
8068	NC_021487	GGAAGA	2	12	420408	420419	50 %	0 %	50 %	0 %	512550443
8069	NC_021487	TGG	2	6	420437	420442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550443
8070	NC_021487	TAG	2	6	420444	420449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550443
8071	NC_021487	AGC	3	9	420501	420509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550443
8072	NC_021487	CTTT	2	8	420617	420624	0 %	75 %	0 %	25 %	512550443
8073	NC_021487	GCA	2	6	420633	420638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550443
8074	NC_021487	CTT	2	6	420732	420737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550443
8075	NC_021487	CGA	2	6	420816	420821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550443
8076	NC_021487	ATT	2	6	420853	420858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550443
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8078	NC_021487	GTT	2	6	421047	421052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550443
8079	NC_021487	GA	3	6	421070	421075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_021487	AAAAT	2	10	421120	421129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_021487	TAGG	2	8	421242	421249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_021487	ACG	2	6	421317	421322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550444
8083	NC_021487	CTC	2	6	421342	421347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550444
8084	NC_021487	TGA	2	6	421352	421357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550444
8085	NC_021487	ATCT	2	8	421507	421514	25 %	50 %	0 %	25 %	512550444
8086	NC_021487	GAG	2	6	421524	421529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550444
8087	NC_021487	TTG	2	6	421588	421593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550444
8088	NC_021487	TGC	2	6	421630	421635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550444
8089	NC_021487	GGA	2	6	421664	421669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550444
8090	NC_021487	GCT	2	6	421701	421706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550444
8091	NC_021487	CGA	2	6	421821	421826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550444
8092	NC_021487	GGGC	2	8	421829	421836	0 %	0 %	75 %	25 %	512550444
8093	NC_021487	GGTAGC	2	12	421903	421914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8094	NC_021487	GTA	2	6	421935	421940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_021487	GAC	2	6	421973	421978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_021487	TGG	2	6	421999	422004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_021487	AGG	2	6	422057	422062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_021487	TGT	2	6	422085	422090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550445
8099	NC_021487	GGAGCA	2	12	422119	422130	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512550445
8100	NC_021487	TC	3	6	422165	422170	0 %	50 %	0 %	50 %	512550445
8101	NC_021487	TCC	2	6	422173	422178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550445
8102	NC_021487	GGTG	2	8	422285	422292	0 %	25 %	75 %	0 %	512550445
8103	NC_021487	TCTA	2	8	422324	422331	25 %	50 %	0 %	25 %	512550445
8104	NC_021487	ATA	2	6	422426	422431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550445
8105	NC_021487	GA	3	6	422457	422462	50 %	0 %	50 %	0 %	512550445
8106	NC_021487	GC	3	6	422550	422555	0 %	0 %	50 %	50 %	512550445
8107	NC_021487	TTGG	2	8	422642	422649	0 %	50 %	50 %	0 %	512550445
8108	NC_021487	ACT	2	6	422697	422702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550445
8109	NC_021487	GTA	2	6	422770	422775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550445
8110	NC_021487	GCA	2	6	422805	422810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550445
8111	NC_021487	TGG	2	6	422944	422949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550445
8112	NC_021487	TGA	2	6	422964	422969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550445
8113	NC_021487	TTGC	2	8	423035	423042	0 %	50 %	25 %	25 %	512550445
8114	NC_021487	GTG	2	6	423290	423295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550445
8115	NC_021487	TG	3	6	423326	423331	0 %	50 %	50 %	0 %	512550445
8116	NC_021487	CTA	2	6	423378	423383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550445
8117	NC_021487	CT	3	6	423459	423464	0 %	50 %	0 %	50 %	512550445
8118	NC_021487	TGTGG	2	10	423470	423479	0 %	40 %	60 %	0 %	512550445
8119	NC_021487	CAG	2	6	423493	423498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550445
8120	NC_021487	CAT	2	6	423502	423507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550445
8121	NC_021487	GGA	3	9	423591	423599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550445
8122	NC_021487	CTGGC	2	10	423615	423624	0 %	20 %	40 %	40 %	512550445
8123	NC_021487	G	7	7	423634	423640	0 %	0 %	100 %	0 %	512550445
8124	NC_021487	CTT	3	9	423758	423766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550445
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8242	NC_021487	CTA	2	6	429869	429874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8243	NC_021487	AGATT	2	10	429919	429928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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8246	NC_021487	GCG	2	6	430148	430153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550452
8247	NC_021487	GCG	2	6	430163	430168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550452
8248	NC_021487	TAT	2	6	430190	430195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550452
8249	NC_021487	GAC	2	6	430220	430225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550452
8250	NC_021487	TG	3	6	430240	430245	0 %	50 %	50 %	0 %	512550452
8251	NC_021487	GCT	2	6	430280	430285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550452
8252	NC_021487	CG	3	6	430422	430427	0 %	0 %	50 %	50 %	512550452
8253	NC_021487	AT	3	6	430466	430471	50 %	50 %	0 %	0 %	512550452
8254	NC_021487	AGA	2	6	430496	430501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550452
8255	NC_021487	GATG	2	8	430669	430676	25 %	25 %	50 %	0 %	512550452
8256	NC_021487	CGA	2	6	430682	430687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550452
8257	NC_021487	GGT	2	6	430823	430828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550452
8258	NC_021487	CAG	2	6	430958	430963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550452
8259	NC_021487	GCT	2	6	430973	430978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550452
8260	NC_021487	TATC	2	8	431047	431054	25 %	50 %	0 %	25 %	512550452
8261	NC_021487	CGG	2	6	431082	431087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550452
8262	NC_021487	GAG	2	6	431169	431174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550453
8263	NC_021487	TAG	2	6	431193	431198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550453
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8266	NC_021487	AAG	2	6	431275	431280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550453
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8274	NC_021487	CAG	2	6	431749	431754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550453
8275	NC_021487	ACA	2	6	431755	431760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550453
8276	NC_021487	TGA	2	6	431815	431820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550453
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8279	NC_021487	TAAAA	2	10	431979	431988	80 %	20 %	0 %	0 %	512550453
8280	NC_021487	GAT	2	6	432060	432065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550453
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8282	NC_021487	AAAG	2	8	432167	432174	75 %	0 %	25 %	0 %	512550453
8283	NC_021487	ATCG	2	8	432224	432231	25 %	25 %	25 %	25 %	512550453
8284	NC_021487	AAG	2	6	432277	432282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550453
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8287	NC_021487	AGT	2	6	432456	432461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550453
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8291	NC_021487	CCGC	2	8	432655	432662	0 %	0 %	25 %	75 %	512550454
8292	NC_021487	CAA	2	6	432674	432679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550454
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8317	NC_021487	ACTT	2	8	434261	434268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8318	NC_021487	ACA	2	6	434284	434289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8323	NC_021487	T	6	6	434760	434765	0 %	100 %	0 %	0 %	512550456
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8342	NC_021487	CAGA	2	8	435759	435766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8343	NC_021487	GGC	2	6	435857	435862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8344	NC_021487	TG	3	6	435917	435922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8345	NC_021487	TGAG	2	8	435977	435984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8346	NC_021487	ATC	2	6	436008	436013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8348	NC_021487	AGG	2	6	436069	436074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8349	NC_021487	T	6	6	436090	436095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8350	NC_021487	ACC	2	6	436294	436299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550457
8351	NC_021487	GGGT	2	8	436325	436332	0 %	25 %	75 %	0 %	512550457
8352	NC_021487	TGC	2	6	436350	436355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550457
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8354	NC_021487	TGT	2	6	436453	436458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550457
8355	NC_021487	TGC	2	6	436506	436511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550457
8356	NC_021487	TGC	2	6	436534	436539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550457
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8359	NC_021487	TCT	2	6	436801	436806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550457
8360	NC_021487	AG	3	6	436886	436891	50 %	0 %	50 %	0 %	512550458
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8363	NC_021487	ATT	2	6	436969	436974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550458
8364	NC_021487	ATG	2	6	436983	436988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550458
8365	NC_021487	CA	3	6	437069	437074	50 %	0 %	0 %	50 %	512550458
8366	NC_021487	TGA	2	6	437092	437097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550458
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8492	NC_021487	CAT	3	9	443822	443830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550463
8493	NC_021487	TGA	2	6	443837	443842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550463
8494	NC_021487	GGTG	2	8	443955	443962	0 %	25 %	75 %	0 %	512550463
8495	NC_021487	CGG	2	6	444065	444070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550463
8496	NC_021487	GAA	2	6	444084	444089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550463
8497	NC_021487	T	6	6	444128	444133	0 %	100 %	0 %	0 %	512550463
8498	NC_021487	ACGCA	2	10	444236	444245	40 %	0 %	20 %	40 %	512550463
8499	NC_021487	TA	3	6	444369	444374	50 %	50 %	0 %	0 %	512550463
8500	NC_021487	ATC	2	6	444442	444447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550463

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