MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_021487	AGG	2	6	389539	389544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550417
7503	NC_021487	TTG	2	6	389580	389585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550417
7504	NC_021487	GGA	2	6	389664	389669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550417
7505	NC_021487	GAG	2	6	389732	389737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550417
7506	NC_021487	GA	3	6	389752	389757	50 %	0 %	50 %	0 %	512550417
7507	NC_021487	CTG	2	6	389803	389808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550418
7508	NC_021487	GCA	2	6	389867	389872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550418
7509	NC_021487	GAT	2	6	389887	389892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550418
7510	NC_021487	TGT	2	6	389894	389899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550418
7511	NC_021487	TTG	2	6	390088	390093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550418
7512	NC_021487	GCC	2	6	390098	390103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550418
7513	NC_021487	CG	3	6	390106	390111	0 %	0 %	50 %	50 %	512550418
7514	NC_021487	AGA	2	6	390144	390149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550418
7515	NC_021487	GT	3	6	390185	390190	0 %	50 %	50 %	0 %	512550418
7516	NC_021487	GGT	2	6	390247	390252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550418
7517	NC_021487	CAA	2	6	390262	390267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550418
7518	NC_021487	TCCA	2	8	390283	390290	25 %	25 %	0 %	50 %	512550418
7519	NC_021487	ATT	2	6	390319	390324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550418
7520	NC_021487	CGG	2	6	390435	390440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550418
7521	NC_021487	CAA	2	6	390513	390518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550418
7522	NC_021487	CTG	2	6	390558	390563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550418
7523	NC_021487	ACC	2	6	390581	390586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550418
7524	NC_021487	CGT	2	6	390591	390596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550418
7525	NC_021487	ATT	2	6	390697	390702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550418
7526	NC_021487	TTG	3	9	390725	390733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550418
7527	NC_021487	TG	3	6	390812	390817	0 %	50 %	50 %	0 %	512550418
7528	NC_021487	CGA	2	6	390843	390848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550418
7529	NC_021487	GCCC	2	8	390897	390904	0 %	0 %	25 %	75 %	512550418
7530	NC_021487	TTGA	2	8	391129	391136	25 %	50 %	25 %	0 %	512550418
7531	NC_021487	TGT	2	6	391149	391154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550418
7532	NC_021487	TTA	2	6	391202	391207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550418
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7534	NC_021487	GCA	2	6	391299	391304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550418
7535	NC_021487	TTA	2	6	391341	391346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550419
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7538	NC_021487	GAT	2	6	391413	391418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550419
7539	NC_021487	GA	4	8	391422	391429	50 %	0 %	50 %	0 %	512550419
7540	NC_021487	CGT	2	6	391691	391696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550419
7541	NC_021487	CAA	2	6	391834	391839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550419
7542	NC_021487	GTA	2	6	391867	391872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550419
7543	NC_021487	GAT	2	6	391924	391929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550419
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7547	NC_021487	GAA	2	6	392253	392258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550419
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7549	NC_021487	AGA	2	6	392390	392395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550419
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7551	NC_021487	GGCAGA	2	12	392517	392528	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512550420
7552	NC_021487	AAG	2	6	392616	392621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550420
7553	NC_021487	TTG	2	6	392667	392672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550420
7554	NC_021487	AAG	2	6	392684	392689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550420
7555	NC_021487	AG	3	6	392688	392693	50 %	0 %	50 %	0 %	512550420
7556	NC_021487	ATT	2	6	392731	392736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550420
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7559	NC_021487	TTCG	2	8	392891	392898	0 %	50 %	25 %	25 %	512550421
7560	NC_021487	GCA	2	6	392979	392984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550421
7561	NC_021487	TCGC	2	8	392987	392994	0 %	25 %	25 %	50 %	512550421
7562	NC_021487	AG	3	6	393024	393029	50 %	0 %	50 %	0 %	512550421
7563	NC_021487	CAT	2	6	393127	393132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550421
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7567	NC_021487	TAG	2	6	393300	393305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550421
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7569	NC_021487	GTC	2	6	393346	393351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550421
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7572	NC_021487	TCT	2	6	393495	393500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550422
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7580	NC_021487	TTGA	2	8	393868	393875	25 %	50 %	25 %	0 %	512550422
7581	NC_021487	AGGT	2	8	393899	393906	25 %	25 %	50 %	0 %	512550422
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7585	NC_021487	TCGGA	2	10	394294	394303	20 %	20 %	40 %	20 %	512550422
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7588	NC_021487	CGTA	2	8	394377	394384	25 %	25 %	25 %	25 %	512550422
7589	NC_021487	CAA	2	6	394460	394465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_021487	CA	3	6	394481	394486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7591	NC_021487	GTC	2	6	394537	394542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7592	NC_021487	CCT	2	6	394564	394569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7593	NC_021487	TGA	2	6	394570	394575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7601	NC_021487	GCT	2	6	395108	395113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550423
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7603	NC_021487	GCT	2	6	395198	395203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550423
7604	NC_021487	GTA	2	6	395224	395229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550423
7605	NC_021487	GCG	2	6	395239	395244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550423
7606	NC_021487	GCA	2	6	395292	395297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550423
7607	NC_021487	ATA	2	6	395303	395308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550423
7608	NC_021487	TTGC	2	8	395320	395327	0 %	50 %	25 %	25 %	512550423
7609	NC_021487	AGGTG	2	10	395348	395357	20 %	20 %	60 %	0 %	512550423
7610	NC_021487	AG	3	6	395371	395376	50 %	0 %	50 %	0 %	512550423
7611	NC_021487	TGT	2	6	395407	395412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550423
7612	NC_021487	CTC	2	6	395422	395427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550423
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7617	NC_021487	GGTG	2	8	395529	395536	0 %	25 %	75 %	0 %	512550423
7618	NC_021487	AGC	2	6	395712	395717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550423
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7620	NC_021487	AG	3	6	395818	395823	50 %	0 %	50 %	0 %	512550423
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7622	NC_021487	AG	3	6	395858	395863	50 %	0 %	50 %	0 %	512550423
7623	NC_021487	AG	3	6	395898	395903	50 %	0 %	50 %	0 %	512550423
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7746	NC_021487	TGC	2	6	402341	402346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550426
7747	NC_021487	GC	3	6	402345	402350	0 %	0 %	50 %	50 %	512550426
7748	NC_021487	GCA	2	6	402400	402405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550426
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7861	NC_021487	CT	3	6	407787	407792	0 %	50 %	0 %	50 %	512550431
7862	NC_021487	TG	4	8	407796	407803	0 %	50 %	50 %	0 %	512550431
7863	NC_021487	GAAA	2	8	407809	407816	75 %	0 %	25 %	0 %	512550431
7864	NC_021487	TCG	2	6	407855	407860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550431
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7992	NC_021487	CAT	2	6	414778	414783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550438
7993	NC_021487	CTT	2	6	414802	414807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550438
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