MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021487	GAT	2	6	335307	335312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550371
6502	NC_021487	TGG	2	6	335349	335354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550371
6503	NC_021487	CCT	2	6	335361	335366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550371
6504	NC_021487	TGC	2	6	335369	335374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550371
6505	NC_021487	AGA	2	6	335423	335428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550371
6506	NC_021487	AGT	2	6	335511	335516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550371
6507	NC_021487	TCA	2	6	335618	335623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550371
6508	NC_021487	AGG	2	6	335666	335671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550371
6509	NC_021487	GAT	2	6	335750	335755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550371
6510	NC_021487	GGT	2	6	335778	335783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550371
6511	NC_021487	GTC	2	6	336027	336032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550371
6512	NC_021487	GCA	2	6	336143	336148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550371
6513	NC_021487	CCGA	2	8	336216	336223	25 %	0 %	25 %	50 %	512550371
6514	NC_021487	GTCGC	2	10	336225	336234	0 %	20 %	40 %	40 %	512550371
6515	NC_021487	CAG	2	6	336274	336279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550371
6516	NC_021487	CGC	2	6	336361	336366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550371
6517	NC_021487	GAA	2	6	336577	336582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550372
6518	NC_021487	ACC	2	6	336692	336697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550372
6519	NC_021487	TCTGC	2	10	336732	336741	0 %	40 %	20 %	40 %	512550372
6520	NC_021487	TTGT	2	8	336894	336901	0 %	75 %	25 %	0 %	512550372
6521	NC_021487	GTTT	2	8	337061	337068	0 %	75 %	25 %	0 %	512550372
6522	NC_021487	GTC	2	6	337075	337080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550372
6523	NC_021487	GGT	2	6	337222	337227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550372
6524	NC_021487	CAG	2	6	337281	337286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550372
6525	NC_021487	GAA	2	6	337288	337293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550372
6526	NC_021487	AGC	2	6	337296	337301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550372
6527	NC_021487	GA	3	6	337308	337313	50 %	0 %	50 %	0 %	512550372
6528	NC_021487	CAT	3	9	337468	337476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550372
6529	NC_021487	TGC	2	6	337642	337647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550372
6530	NC_021487	GCAAG	2	10	337680	337689	40 %	0 %	40 %	20 %	512550372
6531	NC_021487	ATG	2	6	337700	337705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550372
6532	NC_021487	T	7	7	337752	337758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_021487	GA	3	6	337818	337823	50 %	0 %	50 %	0 %	512550373
6534	NC_021487	CCT	2	6	338019	338024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550373
6535	NC_021487	GCA	2	6	338037	338042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550373
6536	NC_021487	CCT	2	6	338070	338075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550373
6537	NC_021487	ACA	2	6	338084	338089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550373
6538	NC_021487	GCA	2	6	338126	338131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550373
6539	NC_021487	GCA	2	6	338172	338177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550373
6540	NC_021487	CAG	2	6	338206	338211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550373
6541	NC_021487	CCT	2	6	338232	338237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550373
6542	NC_021487	GAA	3	9	338271	338279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550373
6543	NC_021487	AGC	2	6	338315	338320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550373
6544	NC_021487	GGC	2	6	338341	338346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550373
6545	NC_021487	CCA	2	6	338358	338363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550373
6546	NC_021487	CATC	2	8	338409	338416	25 %	25 %	0 %	50 %	512550373
6547	NC_021487	GCA	2	6	338427	338432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550373
6548	NC_021487	AG	3	6	338445	338450	50 %	0 %	50 %	0 %	512550373
6549	NC_021487	CTG	2	6	338526	338531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550373
6550	NC_021487	CCAG	2	8	338582	338589	25 %	0 %	25 %	50 %	512550373
6551	NC_021487	CAG	2	6	338737	338742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550373
6552	NC_021487	ACGAGG	2	12	338804	338815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512550373
6553	NC_021487	AAG	2	6	338822	338827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550373
6554	NC_021487	GTGAA	2	10	338828	338837	40 %	20 %	40 %	0 %	512550373
6555	NC_021487	AAAG	2	8	338868	338875	75 %	0 %	25 %	0 %	512550373
6556	NC_021487	TGG	2	6	338932	338937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550373
6557	NC_021487	TGG	2	6	338941	338946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550373
6558	NC_021487	CTTT	2	8	338975	338982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6559	NC_021487	GATA	2	8	339003	339010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_021487	TTA	2	6	339017	339022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_021487	TA	3	6	339050	339055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_021487	GGT	2	6	339097	339102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_021487	GAA	2	6	339127	339132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_021487	TGA	2	6	339166	339171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_021487	GA	3	6	339199	339204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_021487	AT	3	6	339354	339359	50 %	50 %	0 %	0 %	512550374
6567	NC_021487	AGG	2	6	339389	339394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550374
6568	NC_021487	AC	3	6	339455	339460	50 %	0 %	0 %	50 %	512550374
6569	NC_021487	CGA	2	6	339496	339501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550374
6570	NC_021487	TCT	2	6	339552	339557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550374
6571	NC_021487	GAG	2	6	339602	339607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550374
6572	NC_021487	TGA	2	6	339670	339675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550374
6573	NC_021487	CT	3	6	339765	339770	0 %	50 %	0 %	50 %	512550374
6574	NC_021487	CGA	2	6	339795	339800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550374
6575	NC_021487	GCT	2	6	339874	339879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550374
6576	NC_021487	TGA	2	6	339894	339899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550374
6577	NC_021487	GA	3	6	339916	339921	50 %	0 %	50 %	0 %	512550374
6578	NC_021487	CGC	2	6	339942	339947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550374
6579	NC_021487	CTCGC	2	10	339977	339986	0 %	20 %	20 %	60 %	512550374
6580	NC_021487	CTG	2	6	340080	340085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550374
6581	NC_021487	TGC	2	6	340092	340097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550374
6582	NC_021487	GA	3	6	340236	340241	50 %	0 %	50 %	0 %	512550374
6583	NC_021487	TC	3	6	340249	340254	0 %	50 %	0 %	50 %	512550374
6584	NC_021487	GCTTGA	2	12	340257	340268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512550374
6585	NC_021487	T	6	6	340280	340285	0 %	100 %	0 %	0 %	512550374
6586	NC_021487	ATG	2	6	340347	340352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550374
6587	NC_021487	TGGA	2	8	340367	340374	25 %	25 %	50 %	0 %	512550374
6588	NC_021487	GTC	2	6	340418	340423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550374
6589	NC_021487	GA	3	6	340536	340541	50 %	0 %	50 %	0 %	512550374
6590	NC_021487	CGT	2	6	340600	340605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550374
6591	NC_021487	GGTC	2	8	340668	340675	0 %	25 %	50 %	25 %	512550374
6592	NC_021487	GAG	2	6	340772	340777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550374
6593	NC_021487	TCA	2	6	340798	340803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550374
6594	NC_021487	CCA	2	6	340818	340823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550374
6595	NC_021487	TGA	2	6	340855	340860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550374
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6597	NC_021487	CT	3	6	340913	340918	0 %	50 %	0 %	50 %	512550374
6598	NC_021487	GCA	2	6	340987	340992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550374
6599	NC_021487	GAT	2	6	341033	341038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550374
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6601	NC_021487	AGAA	2	8	341142	341149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_021487	AGCGA	2	10	341169	341178	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6603	NC_021487	A	6	6	341183	341188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_021487	GAG	2	6	341195	341200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_021487	AGA	2	6	341224	341229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_021487	ACT	2	6	341231	341236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_021487	GAG	2	6	341252	341257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_021487	GA	3	6	341263	341268	50 %	0 %	50 %	0 %	512550375
6609	NC_021487	GGT	2	6	341405	341410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550375
6610	NC_021487	ATC	2	6	341430	341435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550375
6611	NC_021487	GC	3	6	341503	341508	0 %	0 %	50 %	50 %	512550375
6612	NC_021487	TGG	2	6	341612	341617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550375
6613	NC_021487	TTG	2	6	341826	341831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550375
6614	NC_021487	ACTT	2	8	341845	341852	25 %	50 %	0 %	25 %	512550375
6615	NC_021487	CTG	2	6	341871	341876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550375
6616	NC_021487	GA	3	6	341932	341937	50 %	0 %	50 %	0 %	512550375
6617	NC_021487	AG	3	6	342018	342023	50 %	0 %	50 %	0 %	512550375
6618	NC_021487	GC	3	6	342095	342100	0 %	0 %	50 %	50 %	512550375
6619	NC_021487	TGA	2	6	342166	342171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550375
6620	NC_021487	GCAG	2	8	342179	342186	25 %	0 %	50 %	25 %	512550375
6621	NC_021487	GGA	2	6	342284	342289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550375
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6992	NC_021487	GAC	2	6	360406	360411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550392
6993	NC_021487	GCT	2	6	360456	360461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550392
6994	NC_021487	TCA	2	6	360462	360467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550392
6995	NC_021487	ATC	2	6	360484	360489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550392
6996	NC_021487	ATG	2	6	360497	360502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550392
6997	NC_021487	GA	3	6	360619	360624	50 %	0 %	50 %	0 %	512550392
6998	NC_021487	CCT	2	6	360635	360640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550392
6999	NC_021487	GCA	2	6	360706	360711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550393
7000	NC_021487	TCT	2	6	360717	360722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550393

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