MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65501	NC_021487	AGC	2	6	3387441	3387446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552845
65502	NC_021487	ACG	2	6	3387482	3387487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65503	NC_021487	ATT	2	6	3387542	3387547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552846
65504	NC_021487	CCT	2	6	3387560	3387565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552846
65505	NC_021487	GGGAA	2	10	3387572	3387581	40 %	0 %	60 %	0 %	512552846
65506	NC_021487	CGC	2	6	3387666	3387671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552846
65507	NC_021487	CG	3	6	3387737	3387742	0 %	0 %	50 %	50 %	512552846
65508	NC_021487	CA	3	6	3387757	3387762	50 %	0 %	0 %	50 %	512552846
65509	NC_021487	GTA	2	6	3387771	3387776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552846
65510	NC_021487	CTC	2	6	3387836	3387841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552846
65511	NC_021487	AACAGC	2	12	3387843	3387854	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512552846
65512	NC_021487	GGC	2	6	3387855	3387860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552846
65513	NC_021487	CGG	2	6	3387864	3387869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552846
65514	NC_021487	GCT	2	6	3387895	3387900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552846
65515	NC_021487	CGT	2	6	3387905	3387910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552846
65516	NC_021487	GAT	2	6	3388025	3388030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552846
65517	NC_021487	ACT	2	6	3388092	3388097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552846
65518	NC_021487	GATGCC	2	12	3388127	3388138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512552846
65519	NC_021487	TGT	2	6	3388147	3388152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552846
65520	NC_021487	CGC	2	6	3388229	3388234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552847
65521	NC_021487	TGC	2	6	3388254	3388259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552847
65522	NC_021487	TGAT	2	8	3388280	3388287	25 %	50 %	25 %	0 %	512552847
65523	NC_021487	ACC	2	6	3388318	3388323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552847
65524	NC_021487	G	7	7	3388365	3388371	0 %	0 %	100 %	0 %	512552847
65525	NC_021487	CCG	2	6	3388396	3388401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552847
65526	NC_021487	GAG	2	6	3388444	3388449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552847
65527	NC_021487	CTG	2	6	3388509	3388514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552847
65528	NC_021487	GA	3	6	3388585	3388590	50 %	0 %	50 %	0 %	512552847
65529	NC_021487	AGG	2	6	3388607	3388612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552847
65530	NC_021487	TTG	2	6	3388685	3388690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552847
65531	NC_021487	GGT	2	6	3388887	3388892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552847
65532	NC_021487	AC	3	6	3388926	3388931	50 %	0 %	0 %	50 %	512552847
65533	NC_021487	CA	3	6	3388965	3388970	50 %	0 %	0 %	50 %	512552847
65534	NC_021487	TGCA	2	8	3388997	3389004	25 %	25 %	25 %	25 %	512552848
65535	NC_021487	A	6	6	3389015	3389020	100 %	0 %	0 %	0 %	512552848
65536	NC_021487	G	6	6	3389041	3389046	0 %	0 %	100 %	0 %	512552848
65537	NC_021487	TGG	2	6	3389062	3389067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552848
65538	NC_021487	CGT	2	6	3389073	3389078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552848
65539	NC_021487	AGG	2	6	3389080	3389085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552848
65540	NC_021487	GAC	2	6	3389107	3389112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552848
65541	NC_021487	AGG	2	6	3389425	3389430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65542	NC_021487	CG	3	6	3389447	3389452	0 %	0 %	50 %	50 %	512552849
65543	NC_021487	TCA	2	6	3389484	3389489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552849
65544	NC_021487	GTT	2	6	3389501	3389506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552849
65545	NC_021487	AGGGAT	2	12	3389544	3389555	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512552849
65546	NC_021487	CGAT	2	8	3389567	3389574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65547	NC_021487	GAG	3	9	3389577	3389585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65548	NC_021487	CGAAT	2	10	3389629	3389638	40 %	20 %	20 %	20 %	512552850
65549	NC_021487	GAA	2	6	3389679	3389684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552850
65550	NC_021487	ATC	2	6	3389764	3389769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552850
65551	NC_021487	GAA	2	6	3389958	3389963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552850
65552	NC_021487	TAA	2	6	3390075	3390080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552851
65553	NC_021487	GCC	2	6	3390178	3390183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552851
65554	NC_021487	GCA	2	6	3390190	3390195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552851
65555	NC_021487	GGC	2	6	3390297	3390302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552851
65556	NC_021487	TTAA	2	8	3390319	3390326	50 %	50 %	0 %	0 %	512552851
65557	NC_021487	TCC	2	6	3390360	3390365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552851
65558	NC_021487	CGA	2	6	3390370	3390375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552851
65559	NC_021487	AAT	2	6	3390421	3390426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552852
65560	NC_021487	GTC	2	6	3390440	3390445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552852
65561	NC_021487	CGC	2	6	3390451	3390456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552852
65562	NC_021487	A	6	6	3390512	3390517	100 %	0 %	0 %	0 %	512552852
65563	NC_021487	TGGG	2	8	3390558	3390565	0 %	25 %	75 %	0 %	512552852
65564	NC_021487	GT	3	6	3390713	3390718	0 %	50 %	50 %	0 %	512552852
65565	NC_021487	GCT	2	6	3390738	3390743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552852
65566	NC_021487	CTT	2	6	3390825	3390830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552852
65567	NC_021487	AAAGC	2	10	3390902	3390911	60 %	0 %	20 %	20 %	512552852
65568	NC_021487	GTG	2	6	3391051	3391056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552852
65569	NC_021487	ATC	2	6	3391069	3391074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552852
65570	NC_021487	GCC	2	6	3391093	3391098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65571	NC_021487	GAG	2	6	3391104	3391109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65572	NC_021487	AG	3	6	3391108	3391113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65573	NC_021487	GTC	2	6	3391180	3391185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552853
65574	NC_021487	GCG	2	6	3391230	3391235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552853
65575	NC_021487	TGC	2	6	3391292	3391297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552853
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65578	NC_021487	GTA	2	6	3391489	3391494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552853
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65580	NC_021487	GAACG	2	10	3391737	3391746	40 %	0 %	40 %	20 %	512552853
65581	NC_021487	GCC	2	6	3391759	3391764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552853
65582	NC_021487	GCC	2	6	3391774	3391779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552853
65583	NC_021487	CT	3	6	3391837	3391842	0 %	50 %	0 %	50 %	512552853
65584	NC_021487	GAA	2	6	3391846	3391851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552853
65585	NC_021487	GTAC	2	8	3391912	3391919	25 %	25 %	25 %	25 %	512552853
65586	NC_021487	A	6	6	3391933	3391938	100 %	0 %	0 %	0 %	512552853
65587	NC_021487	GAA	2	6	3391981	3391986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552853
65588	NC_021487	GAG	2	6	3392128	3392133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552853
65589	NC_021487	GAG	2	6	3392146	3392151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552853
65590	NC_021487	AGA	2	6	3392213	3392218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552854
65591	NC_021487	CTTA	2	8	3392274	3392281	25 %	50 %	0 %	25 %	512552854
65592	NC_021487	TGC	2	6	3392303	3392308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552854
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65596	NC_021487	G	6	6	3392502	3392507	0 %	0 %	100 %	0 %	512552854
65597	NC_021487	CTA	2	6	3392529	3392534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552854
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65601	NC_021487	CTT	2	6	3392725	3392730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552854
65602	NC_021487	ACG	2	6	3392805	3392810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552855
65603	NC_021487	CAGCGC	2	12	3392831	3392842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512552855
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65607	NC_021487	TGC	2	6	3393021	3393026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552855
65608	NC_021487	TG	3	6	3393038	3393043	0 %	50 %	50 %	0 %	512552855
65609	NC_021487	CGT	2	6	3393090	3393095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552855
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65613	NC_021487	AG	3	6	3393278	3393283	50 %	0 %	50 %	0 %	512552855
65614	NC_021487	CTT	2	6	3393346	3393351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552855
65615	NC_021487	GGA	2	6	3393415	3393420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552855
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