MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_021487	TCA	2	6	3362100	3362105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552813
65002	NC_021487	ACG	3	9	3362146	3362154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65003	NC_021487	GCA	3	9	3362172	3362180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65004	NC_021487	CTG	2	6	3362260	3362265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65005	NC_021487	GACC	2	8	3362274	3362281	25 %	0 %	25 %	50 %	512552813
65006	NC_021487	AGC	2	6	3362314	3362319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65007	NC_021487	CAA	3	9	3362349	3362357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552813
65008	NC_021487	GACC	2	8	3362403	3362410	25 %	0 %	25 %	50 %	512552813
65009	NC_021487	GCA	2	6	3362520	3362525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65010	NC_021487	AGC	2	6	3362659	3362664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65011	NC_021487	ACG	2	6	3362693	3362698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65012	NC_021487	GAC	2	6	3362736	3362741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65013	NC_021487	ATG	2	6	3362753	3362758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552813
65014	NC_021487	CGGGT	2	10	3362792	3362801	0 %	20 %	60 %	20 %	512552813
65015	NC_021487	GCG	2	6	3362821	3362826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552813
65016	NC_021487	ATC	2	6	3362828	3362833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552813
65017	NC_021487	CGG	2	6	3362885	3362890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552813
65018	NC_021487	GCG	2	6	3362950	3362955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552813
65019	NC_021487	TGG	2	6	3363005	3363010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552813
65020	NC_021487	GGT	2	6	3363051	3363056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552813
65021	NC_021487	AGC	2	6	3363059	3363064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65022	NC_021487	ACG	2	6	3363092	3363097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65023	NC_021487	CTG	2	6	3363109	3363114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65024	NC_021487	AGC	2	6	3363119	3363124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65025	NC_021487	GGT	3	9	3363192	3363200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552813
65026	NC_021487	ACG	2	6	3363236	3363241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65027	NC_021487	GGT	2	6	3363261	3363266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552813
65028	NC_021487	CGA	2	6	3363275	3363280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65029	NC_021487	ACG	2	6	3363283	3363288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65030	NC_021487	CG	3	6	3363347	3363352	0 %	0 %	50 %	50 %	512552813
65031	NC_021487	CGT	2	6	3363442	3363447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65032	NC_021487	AAC	2	6	3363466	3363471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552813
65033	NC_021487	TGG	2	6	3363518	3363523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552813
65034	NC_021487	AGG	2	6	3363524	3363529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552813
65035	NC_021487	GGC	3	9	3363583	3363591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552813
65036	NC_021487	GCA	2	6	3363593	3363598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65037	NC_021487	TCG	2	6	3363609	3363614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65038	NC_021487	CAG	2	6	3363758	3363763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65039	NC_021487	CCTGC	2	10	3363812	3363821	0 %	20 %	20 %	60 %	512552813
65040	NC_021487	TAC	2	6	3363842	3363847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552813
65041	NC_021487	GAA	2	6	3363863	3363868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552813
65042	NC_021487	GCC	2	6	3363879	3363884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552813
65043	NC_021487	CACCCA	2	12	3363910	3363921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552813
65044	NC_021487	CAC	2	6	3363929	3363934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552813
65045	NC_021487	CCAAA	2	10	3363947	3363956	60 %	0 %	0 %	40 %	512552813
65046	NC_021487	GCTT	2	8	3364009	3364016	0 %	50 %	25 %	25 %	512552813
65047	NC_021487	GT	3	6	3364042	3364047	0 %	50 %	50 %	0 %	512552813
65048	NC_021487	TAA	2	6	3364085	3364090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552813
65049	NC_021487	CCT	2	6	3364113	3364118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552813
65050	NC_021487	GAC	2	6	3364153	3364158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65051	NC_021487	CAG	2	6	3364174	3364179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552813
65052	NC_021487	TG	3	6	3364180	3364185	0 %	50 %	50 %	0 %	512552813
65053	NC_021487	GGA	2	6	3364214	3364219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65054	NC_021487	AGG	2	6	3364222	3364227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65055	NC_021487	CTC	2	6	3364257	3364262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65056	NC_021487	AGG	2	6	3364274	3364279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65057	NC_021487	CAA	2	6	3364300	3364305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552814
65058	NC_021487	CAAG	2	8	3364391	3364398	50 %	0 %	25 %	25 %	512552814
65059	NC_021487	ATCT	2	8	3364477	3364484	25 %	50 %	0 %	25 %	512552814
65060	NC_021487	CATC	2	8	3364516	3364523	25 %	25 %	0 %	50 %	512552814
65061	NC_021487	CTT	2	6	3364570	3364575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552814
65062	NC_021487	CTA	2	6	3364672	3364677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552814
65063	NC_021487	TGG	2	6	3364715	3364720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552814
65064	NC_021487	GGA	2	6	3364800	3364805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552814
65065	NC_021487	GCA	2	6	3364809	3364814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552814
65066	NC_021487	CCT	2	6	3364827	3364832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552814
65067	NC_021487	TCT	2	6	3364923	3364928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552814
65068	NC_021487	GTC	2	6	3364938	3364943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552814
65069	NC_021487	CAT	2	6	3364956	3364961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552814
65070	NC_021487	CAA	2	6	3364962	3364967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552814
65071	NC_021487	ATTT	2	8	3365017	3365024	25 %	75 %	0 %	0 %	512552814
65072	NC_021487	CTCG	2	8	3365133	3365140	0 %	25 %	25 %	50 %	512552814
65073	NC_021487	CTG	2	6	3365221	3365226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552814
65074	NC_021487	GCC	2	6	3365260	3365265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552814
65075	NC_021487	CGA	2	6	3365274	3365279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552814
65076	NC_021487	A	6	6	3365297	3365302	100 %	0 %	0 %	0 %	512552814
65077	NC_021487	GCT	2	6	3365322	3365327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552814
65078	NC_021487	CTG	2	6	3365590	3365595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552814
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65081	NC_021487	GCA	2	6	3365689	3365694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552814
65082	NC_021487	AGG	2	6	3365747	3365752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65083	NC_021487	GCC	2	6	3365767	3365772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65084	NC_021487	CAAA	2	8	3365839	3365846	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65085	NC_021487	CTGT	2	8	3365890	3365897	0 %	50 %	25 %	25 %	512552815
65086	NC_021487	AAC	2	6	3365987	3365992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552815
65087	NC_021487	TGC	3	9	3366052	3366060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552815
65088	NC_021487	CGTT	2	8	3366077	3366084	0 %	50 %	25 %	25 %	512552815
65089	NC_021487	AG	3	6	3366097	3366102	50 %	0 %	50 %	0 %	512552815
65090	NC_021487	GAC	2	6	3366328	3366333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552816
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65092	NC_021487	GTT	2	6	3366523	3366528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65093	NC_021487	TGA	2	6	3366553	3366558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65094	NC_021487	GTC	2	6	3366605	3366610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65095	NC_021487	GAG	2	6	3366623	3366628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65096	NC_021487	CAG	2	6	3366643	3366648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552817
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65098	NC_021487	TGG	2	6	3366749	3366754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552817
65099	NC_021487	CAA	2	6	3366761	3366766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552817
65100	NC_021487	AGA	2	6	3366815	3366820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552817
65101	NC_021487	GCA	2	6	3366852	3366857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552817
65102	NC_021487	GTT	2	6	3366865	3366870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552817
65103	NC_021487	GA	3	6	3366883	3366888	50 %	0 %	50 %	0 %	512552817
65104	NC_021487	GCGA	2	8	3366905	3366912	25 %	0 %	50 %	25 %	512552817
65105	NC_021487	ACG	2	6	3366943	3366948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552817
65106	NC_021487	AG	3	6	3366972	3366977	50 %	0 %	50 %	0 %	512552817
65107	NC_021487	GCTG	2	8	3367062	3367069	0 %	25 %	50 %	25 %	512552817
65108	NC_021487	GCGG	2	8	3367116	3367123	0 %	0 %	75 %	25 %	512552817
65109	NC_021487	GGC	2	6	3367125	3367130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552817
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65111	NC_021487	TGA	2	6	3367245	3367250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552817
65112	NC_021487	GGA	2	6	3367278	3367283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552817
65113	NC_021487	TGG	2	6	3367286	3367291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552817
65114	NC_021487	CAGCCA	2	12	3367357	3367368	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512552817
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65116	NC_021487	CGC	2	6	3367534	3367539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552818
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65119	NC_021487	GCA	2	6	3367783	3367788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552818
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65140	NC_021487	GAG	2	6	3369111	3369116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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65154	NC_021487	AG	4	8	3369540	3369547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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65165	NC_021487	GTG	2	6	3370150	3370155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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65221	NC_021487	GAAG	2	8	3373386	3373393	50 %	0 %	50 %	0 %	512552822
65222	NC_021487	G	6	6	3373395	3373400	0 %	0 %	100 %	0 %	512552822
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65232	NC_021487	GGT	2	6	3373993	3373998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552824
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65353	NC_021487	CAT	2	6	3379884	3379889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552835
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65462	NC_021487	GGA	3	9	3385411	3385419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552842
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65467	NC_021487	CAG	2	6	3385671	3385676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552844
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65469	NC_021487	A	7	7	3386002	3386008	100 %	0 %	0 %	0 %	512552844
65470	NC_021487	AGCG	2	8	3386033	3386040	25 %	0 %	50 %	25 %	512552844
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65472	NC_021487	CGT	2	6	3386088	3386093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552844
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65474	NC_021487	AG	3	6	3386125	3386130	50 %	0 %	50 %	0 %	512552845
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