MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_021487	AGC	2	6	3309397	3309402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552770
64003	NC_021487	CAT	2	6	3309625	3309630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552770
64004	NC_021487	CGA	2	6	3309634	3309639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552770
64005	NC_021487	CGT	2	6	3309817	3309822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552771
64006	NC_021487	G	6	6	3309869	3309874	0 %	0 %	100 %	0 %	512552771
64007	NC_021487	CAG	2	6	3309884	3309889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552771
64008	NC_021487	CAA	2	6	3310003	3310008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552771
64009	NC_021487	GGC	2	6	3310010	3310015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552771
64010	NC_021487	GA	4	8	3310030	3310037	50 %	0 %	50 %	0 %	512552771
64011	NC_021487	CGG	2	6	3310102	3310107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552771
64012	NC_021487	AGGC	2	8	3310239	3310246	25 %	0 %	50 %	25 %	512552771
64013	NC_021487	GCAATG	2	12	3310272	3310283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512552771
64014	NC_021487	T	6	6	3310325	3310330	0 %	100 %	0 %	0 %	512552771
64015	NC_021487	GAG	3	9	3310390	3310398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552771
64016	NC_021487	GGA	2	6	3310417	3310422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552771
64017	NC_021487	TGA	2	6	3310553	3310558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64018	NC_021487	AGG	2	6	3310698	3310703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552772
64019	NC_021487	GCA	2	6	3310772	3310777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552772
64020	NC_021487	TCG	2	6	3310820	3310825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552772
64021	NC_021487	G	6	6	3310830	3310835	0 %	0 %	100 %	0 %	512552772
64022	NC_021487	ACG	2	6	3310843	3310848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552772
64023	NC_021487	TCT	2	6	3310892	3310897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552772
64024	NC_021487	CT	3	6	3310963	3310968	0 %	50 %	0 %	50 %	512552772
64025	NC_021487	GTG	2	6	3310985	3310990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552772
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64027	NC_021487	GC	3	6	3311293	3311298	0 %	0 %	50 %	50 %	512552772
64028	NC_021487	CGG	3	9	3311376	3311384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552772
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64030	NC_021487	G	6	6	3311460	3311465	0 %	0 %	100 %	0 %	512552772
64031	NC_021487	CCA	2	6	3311556	3311561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552772
64032	NC_021487	C	6	6	3311566	3311571	0 %	0 %	0 %	100 %	512552772
64033	NC_021487	AGC	2	6	3311603	3311608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552772
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64038	NC_021487	TCG	2	6	3311977	3311982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552773
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64040	NC_021487	CGG	2	6	3312314	3312319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552773
64041	NC_021487	GCA	2	6	3312398	3312403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552773
64042	NC_021487	TGA	2	6	3312467	3312472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552773
64043	NC_021487	GCC	2	6	3312589	3312594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552773
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64045	NC_021487	TAA	2	6	3312801	3312806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64046	NC_021487	A	6	6	3312805	3312810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64047	NC_021487	GTTCG	2	10	3312840	3312849	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64048	NC_021487	T	7	7	3312936	3312942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64049	NC_021487	CG	3	6	3313060	3313065	0 %	0 %	50 %	50 %	512552774
64050	NC_021487	TGA	2	6	3313066	3313071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552774
64051	NC_021487	TCC	2	6	3313075	3313080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552774
64052	NC_021487	TCT	2	6	3313097	3313102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552774
64053	NC_021487	CACC	2	8	3313145	3313152	25 %	0 %	0 %	75 %	512552774
64054	NC_021487	GTG	3	9	3313170	3313178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552774
64055	NC_021487	TGA	2	6	3313250	3313255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552774
64056	NC_021487	TGT	2	6	3313285	3313290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552774
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64060	NC_021487	ACC	2	6	3313395	3313400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552774
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64077	NC_021487	TCGG	2	8	3314146	3314153	0 %	25 %	50 %	25 %	512552774
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64081	NC_021487	ATCC	2	8	3314505	3314512	25 %	25 %	0 %	50 %	512552775
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64098	NC_021487	CT	3	6	3315429	3315434	0 %	50 %	0 %	50 %	512552775
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64101	NC_021487	CG	3	6	3315487	3315492	0 %	0 %	50 %	50 %	512552775
64102	NC_021487	GGT	2	6	3315540	3315545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552775
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64105	NC_021487	GCT	2	6	3315619	3315624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552775
64106	NC_021487	TCG	2	6	3315677	3315682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552775
64107	NC_021487	AATAA	2	10	3315719	3315728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64108	NC_021487	GCA	2	6	3315797	3315802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64109	NC_021487	AGA	2	6	3315835	3315840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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64111	NC_021487	TGG	2	6	3315884	3315889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552776
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64113	NC_021487	CGCC	2	8	3316058	3316065	0 %	0 %	25 %	75 %	512552776
64114	NC_021487	TGT	2	6	3316068	3316073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552776
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64117	NC_021487	GGGT	2	8	3316300	3316307	0 %	25 %	75 %	0 %	512552776
64118	NC_021487	AGA	2	6	3316494	3316499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552776
64119	NC_021487	TGG	2	6	3316517	3316522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552776
64120	NC_021487	AGGAG	2	10	3316524	3316533	40 %	0 %	60 %	0 %	512552776
64121	NC_021487	ATC	3	9	3316546	3316554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552776
64122	NC_021487	CAT	2	6	3316555	3316560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552776
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64124	NC_021487	GC	3	6	3316648	3316653	0 %	0 %	50 %	50 %	512552776
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64129	NC_021487	TGC	2	6	3316871	3316876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552776
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64144	NC_021487	TCA	2	6	3318176	3318181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552776
64145	NC_021487	TGA	2	6	3318191	3318196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552776
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64148	NC_021487	AGG	2	6	3318336	3318341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64149	NC_021487	AGT	3	9	3318367	3318375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64150	NC_021487	GA	3	6	3318384	3318389	50 %	0 %	50 %	0 %	512552777
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64152	NC_021487	TC	3	6	3318505	3318510	0 %	50 %	0 %	50 %	512552777
64153	NC_021487	AG	3	6	3318537	3318542	50 %	0 %	50 %	0 %	512552777
64154	NC_021487	CGC	2	6	3318565	3318570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552777
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64157	NC_021487	AG	3	6	3318657	3318662	50 %	0 %	50 %	0 %	512552777
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64171	NC_021487	TTA	2	6	3319437	3319442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552778
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64187	NC_021487	TAC	2	6	3320159	3320164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552778
64188	NC_021487	GCCAT	2	10	3320199	3320208	20 %	20 %	20 %	40 %	512552778
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64193	NC_021487	C	6	6	3320687	3320692	0 %	0 %	0 %	100 %	512552779
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64206	NC_021487	CT	3	6	3321485	3321490	0 %	50 %	0 %	50 %	512552779
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64218	NC_021487	GTG	2	6	3322219	3322224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552780
64219	NC_021487	AAG	2	6	3322226	3322231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552780
64220	NC_021487	TTCGC	2	10	3322261	3322270	0 %	40 %	20 %	40 %	512552780
64221	NC_021487	AAC	2	6	3322272	3322277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552780
64222	NC_021487	AC	3	6	3322337	3322342	50 %	0 %	0 %	50 %	512552780
64223	NC_021487	CGCC	2	8	3322403	3322410	0 %	0 %	25 %	75 %	512552780
64224	NC_021487	GCT	2	6	3322416	3322421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552780
64225	NC_021487	GGCGA	2	10	3322439	3322448	20 %	0 %	60 %	20 %	512552780
64226	NC_021487	CAA	2	6	3322497	3322502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552780
64227	NC_021487	CAAGC	2	10	3322513	3322522	40 %	0 %	20 %	40 %	512552780
64228	NC_021487	TGCAGC	2	12	3322650	3322661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512552780
64229	NC_021487	TC	3	6	3322770	3322775	0 %	50 %	0 %	50 %	512552780
64230	NC_021487	TGC	2	6	3322781	3322786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552780
64231	NC_021487	GAC	2	6	3322799	3322804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552780
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64355	NC_021487	CGTA	2	8	3329354	3329361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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