MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_021487	ATT	2	6	3155029	3155034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61002	NC_021487	CTG	2	6	3155123	3155128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61003	NC_021487	TGG	2	6	3155159	3155164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61004	NC_021487	AGG	2	6	3155213	3155218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61005	NC_021487	CGG	2	6	3155270	3155275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552656
61006	NC_021487	GC	3	6	3155367	3155372	0 %	0 %	50 %	50 %	512552656
61007	NC_021487	CG	3	6	3155398	3155403	0 %	0 %	50 %	50 %	512552656
61008	NC_021487	GAC	2	6	3155519	3155524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61009	NC_021487	GGAT	2	8	3155621	3155628	25 %	25 %	50 %	0 %	512552656
61010	NC_021487	ACGGT	2	10	3155637	3155646	20 %	20 %	40 %	20 %	512552656
61011	NC_021487	ATCT	2	8	3155664	3155671	25 %	50 %	0 %	25 %	512552656
61012	NC_021487	CAC	2	6	3155672	3155677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552656
61013	NC_021487	ATC	2	6	3155706	3155711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552656
61014	NC_021487	AGG	2	6	3155812	3155817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552656
61015	NC_021487	GTAC	2	8	3155925	3155932	25 %	25 %	25 %	25 %	512552656
61016	NC_021487	CTA	2	6	3155993	3155998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552656
61017	NC_021487	GGT	2	6	3156011	3156016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552656
61018	NC_021487	CCT	2	6	3156034	3156039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552656
61019	NC_021487	CTT	2	6	3156041	3156046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552656
61020	NC_021487	CAG	2	6	3156247	3156252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61021	NC_021487	AGG	2	6	3156262	3156267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552656
61022	NC_021487	AGCC	2	8	3156291	3156298	25 %	0 %	25 %	50 %	512552656
61023	NC_021487	GCT	2	6	3156332	3156337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61024	NC_021487	CTG	2	6	3156615	3156620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61025	NC_021487	A	6	6	3156682	3156687	100 %	0 %	0 %	0 %	512552656
61026	NC_021487	TGC	2	6	3156709	3156714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61027	NC_021487	ACC	2	6	3156718	3156723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552656
61028	NC_021487	TGC	2	6	3156874	3156879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61029	NC_021487	AGG	2	6	3156916	3156921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552656
61030	NC_021487	AGG	2	6	3156970	3156975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552656
61031	NC_021487	CTA	2	6	3157071	3157076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552656
61032	NC_021487	AAC	2	6	3157078	3157083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552656
61033	NC_021487	AGC	2	6	3157126	3157131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61034	NC_021487	GCGG	2	8	3157172	3157179	0 %	0 %	75 %	25 %	512552656
61035	NC_021487	GCT	2	6	3157184	3157189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61036	NC_021487	TGC	2	6	3157193	3157198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61037	NC_021487	CCAA	2	8	3157273	3157280	50 %	0 %	0 %	50 %	512552656
61038	NC_021487	GAA	2	6	3157317	3157322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552656
61039	NC_021487	AATT	2	8	3157333	3157340	50 %	50 %	0 %	0 %	512552656
61040	NC_021487	TCGC	2	8	3157368	3157375	0 %	25 %	25 %	50 %	512552656
61041	NC_021487	TGG	2	6	3157453	3157458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552656
61042	NC_021487	AGG	2	6	3157477	3157482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552656
61043	NC_021487	AGAT	2	8	3157513	3157520	50 %	25 %	25 %	0 %	512552656
61044	NC_021487	GGGA	2	8	3157528	3157535	25 %	0 %	75 %	0 %	512552656
61045	NC_021487	AAG	2	6	3157787	3157792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552656
61046	NC_021487	CT	3	6	3157807	3157812	0 %	50 %	0 %	50 %	512552656
61047	NC_021487	CAC	2	6	3157883	3157888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552656
61048	NC_021487	GTA	2	6	3158151	3158156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552656
61049	NC_021487	GTG	2	6	3158202	3158207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552656
61050	NC_021487	CGA	2	6	3158238	3158243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61051	NC_021487	GCC	2	6	3158330	3158335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552656
61052	NC_021487	GCT	2	6	3158417	3158422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61053	NC_021487	CCT	2	6	3158452	3158457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552656
61054	NC_021487	ACC	2	6	3158460	3158465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552656
61055	NC_021487	TATCT	2	10	3158485	3158494	20 %	60 %	0 %	20 %	512552656
61056	NC_021487	CTG	2	6	3158518	3158523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61057	NC_021487	CGAGC	2	10	3158532	3158541	20 %	0 %	40 %	40 %	512552656
61058	NC_021487	CA	3	6	3158708	3158713	50 %	0 %	0 %	50 %	512552656
61059	NC_021487	AAC	2	6	3158731	3158736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552656
61060	NC_021487	GCTG	2	8	3158749	3158756	0 %	25 %	50 %	25 %	512552656
61061	NC_021487	GAA	2	6	3158757	3158762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552656
61062	NC_021487	CAC	2	6	3158813	3158818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552656
61063	NC_021487	CGA	2	6	3158903	3158908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61064	NC_021487	GAC	2	6	3158913	3158918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61065	NC_021487	CTG	2	6	3158946	3158951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61066	NC_021487	CAC	2	6	3159017	3159022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552656
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61068	NC_021487	ACC	2	6	3159150	3159155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552656
61069	NC_021487	CAA	2	6	3159177	3159182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552656
61070	NC_021487	GAC	2	6	3159206	3159211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61071	NC_021487	GTG	2	6	3159224	3159229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552656
61072	NC_021487	GC	3	6	3159233	3159238	0 %	0 %	50 %	50 %	512552656
61073	NC_021487	TCT	2	6	3159239	3159244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552656
61074	NC_021487	CAG	2	6	3159251	3159256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61075	NC_021487	GTTA	2	8	3159281	3159288	25 %	50 %	25 %	0 %	512552656
61076	NC_021487	GCA	2	6	3159353	3159358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552656
61077	NC_021487	GA	3	6	3159388	3159393	50 %	0 %	50 %	0 %	512552656
61078	NC_021487	CTA	2	6	3159452	3159457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552656
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61080	NC_021487	AAC	2	6	3159582	3159587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552656
61081	NC_021487	GCC	2	6	3159629	3159634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552656
61082	NC_021487	GACG	2	8	3159650	3159657	25 %	0 %	50 %	25 %	512552656
61083	NC_021487	GGA	2	6	3159662	3159667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552656
61084	NC_021487	GGC	2	6	3159704	3159709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552656
61085	NC_021487	ATC	2	6	3159717	3159722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552656
61086	NC_021487	ACCAA	2	10	3159743	3159752	60 %	0 %	0 %	40 %	512552656
61087	NC_021487	GC	4	8	3159776	3159783	0 %	0 %	50 %	50 %	512552656
61088	NC_021487	CGC	2	6	3159805	3159810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552656
61089	NC_021487	CTA	2	6	3159827	3159832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552656
61090	NC_021487	GTTG	2	8	3159899	3159906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61091	NC_021487	GCGG	2	8	3159976	3159983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61092	NC_021487	TGTT	2	8	3160054	3160061	0 %	75 %	25 %	0 %	512552657
61093	NC_021487	TCT	2	6	3160073	3160078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552657
61094	NC_021487	CAAC	2	8	3160101	3160108	50 %	0 %	0 %	50 %	512552657
61095	NC_021487	CAT	2	6	3160176	3160181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552657
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61097	NC_021487	CTT	2	6	3160266	3160271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552657
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61100	NC_021487	CAA	2	6	3160326	3160331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552657
61101	NC_021487	CGGC	2	8	3160360	3160367	0 %	0 %	50 %	50 %	512552657
61102	NC_021487	TGC	2	6	3160459	3160464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552657
61103	NC_021487	CT	3	6	3160469	3160474	0 %	50 %	0 %	50 %	512552657
61104	NC_021487	GCG	2	6	3160503	3160508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552657
61105	NC_021487	GTT	2	6	3160553	3160558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552657
61106	NC_021487	TAG	2	6	3160669	3160674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552657
61107	NC_021487	CT	3	6	3160685	3160690	0 %	50 %	0 %	50 %	512552657
61108	NC_021487	TG	3	6	3160692	3160697	0 %	50 %	50 %	0 %	512552657
61109	NC_021487	TGC	2	6	3160724	3160729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552657
61110	NC_021487	ACAA	2	8	3160733	3160740	75 %	0 %	0 %	25 %	512552657
61111	NC_021487	GA	3	6	3160773	3160778	50 %	0 %	50 %	0 %	512552657
61112	NC_021487	TGC	2	6	3160868	3160873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552657
61113	NC_021487	GGC	2	6	3160880	3160885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552657
61114	NC_021487	ACG	2	6	3160965	3160970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552657
61115	NC_021487	CGA	2	6	3161008	3161013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552657
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61117	NC_021487	TGG	2	6	3161164	3161169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552657
61118	NC_021487	GTT	2	6	3161291	3161296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552657
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61222	NC_021487	GGCC	2	8	3166775	3166782	0 %	0 %	50 %	50 %	512552662
61223	NC_021487	CGC	2	6	3166932	3166937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552662
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61227	NC_021487	GGC	2	6	3167268	3167273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61228	NC_021487	GTG	2	6	3167312	3167317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552663
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61230	NC_021487	G	6	6	3167463	3167468	0 %	0 %	100 %	0 %	512552663
61231	NC_021487	CTG	2	6	3167491	3167496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552663
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61236	NC_021487	TTC	2	6	3167719	3167724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552663
61237	NC_021487	CCT	2	6	3167749	3167754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61238	NC_021487	CT	3	6	3167786	3167791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61239	NC_021487	CGTT	2	8	3167809	3167816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61240	NC_021487	TAAGA	2	10	3167823	3167832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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61243	NC_021487	T	6	6	3167955	3167960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61244	NC_021487	TG	3	6	3168016	3168021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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61472	NC_021487	GCA	2	6	3180270	3180275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552674
61473	NC_021487	GAT	2	6	3180305	3180310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552674
61474	NC_021487	GGC	2	6	3180317	3180322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552674
61475	NC_021487	G	6	6	3180444	3180449	0 %	0 %	100 %	0 %	512552674
61476	NC_021487	AGG	2	6	3180498	3180503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552674
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61478	NC_021487	GC	3	6	3180569	3180574	0 %	0 %	50 %	50 %	512552674
61479	NC_021487	CT	3	6	3180617	3180622	0 %	50 %	0 %	50 %	512552674
61480	NC_021487	TGC	2	6	3180650	3180655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552674
61481	NC_021487	AAG	2	6	3180725	3180730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552674
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61487	NC_021487	TGGTG	2	10	3180950	3180959	0 %	40 %	60 %	0 %	512552675
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61499	NC_021487	ATG	2	6	3181462	3181467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552675
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