MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_021487	G	6	6	3021445	3021450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58502	NC_021487	A	6	6	3021465	3021470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58503	NC_021487	ACGT	2	8	3021507	3021514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58504	NC_021487	TAAAA	2	10	3021552	3021561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58505	NC_021487	GCC	2	6	3021564	3021569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58506	NC_021487	CTTT	2	8	3021640	3021647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58507	NC_021487	TGA	2	6	3021826	3021831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552546
58508	NC_021487	TCGAG	2	10	3021853	3021862	20 %	20 %	40 %	20 %	512552546
58509	NC_021487	CCG	2	6	3021914	3021919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552546
58510	NC_021487	GGC	2	6	3021929	3021934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552546
58511	NC_021487	GGCCTC	2	12	3022022	3022033	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512552546
58512	NC_021487	AGA	2	6	3022072	3022077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552546
58513	NC_021487	GCG	2	6	3022107	3022112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552546
58514	NC_021487	CG	3	6	3022123	3022128	0 %	0 %	50 %	50 %	512552546
58515	NC_021487	CCT	2	6	3022129	3022134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552546
58516	NC_021487	GC	3	6	3022185	3022190	0 %	0 %	50 %	50 %	512552546
58517	NC_021487	GAT	2	6	3022202	3022207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552546
58518	NC_021487	GC	3	6	3022263	3022268	0 %	0 %	50 %	50 %	512552546
58519	NC_021487	TCT	2	6	3022312	3022317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58520	NC_021487	A	6	6	3022328	3022333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58521	NC_021487	GCC	2	6	3022364	3022369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552547
58522	NC_021487	ACA	2	6	3022436	3022441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552547
58523	NC_021487	G	6	6	3022451	3022456	0 %	0 %	100 %	0 %	512552547
58524	NC_021487	GCT	2	6	3022535	3022540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552547
58525	NC_021487	GAG	2	6	3022548	3022553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552547
58526	NC_021487	GCT	2	6	3022559	3022564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552547
58527	NC_021487	A	6	6	3022631	3022636	100 %	0 %	0 %	0 %	512552547
58528	NC_021487	AGC	2	6	3022720	3022725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552547
58529	NC_021487	GCG	2	6	3022732	3022737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552547
58530	NC_021487	GGC	2	6	3022933	3022938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552547
58531	NC_021487	AG	3	6	3022977	3022982	50 %	0 %	50 %	0 %	512552547
58532	NC_021487	TTC	2	6	3023049	3023054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552547
58533	NC_021487	CCT	2	6	3023063	3023068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552547
58534	NC_021487	CTG	2	6	3023117	3023122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552547
58535	NC_021487	GGT	2	6	3023158	3023163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552547
58536	NC_021487	C	6	6	3023176	3023181	0 %	0 %	0 %	100 %	512552547
58537	NC_021487	CG	3	6	3023200	3023205	0 %	0 %	50 %	50 %	512552547
58538	NC_021487	AGG	2	6	3023209	3023214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552547
58539	NC_021487	TGG	2	6	3023239	3023244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552547
58540	NC_021487	AC	3	6	3023281	3023286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58541	NC_021487	AAG	2	6	3023306	3023311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58542	NC_021487	GAATGG	2	12	3023359	3023370	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58543	NC_021487	GA	3	6	3023396	3023401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58544	NC_021487	GCA	2	6	3023491	3023496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552548
58545	NC_021487	TGG	2	6	3023511	3023516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552548
58546	NC_021487	TC	3	6	3023598	3023603	0 %	50 %	0 %	50 %	512552548
58547	NC_021487	AAC	2	6	3023666	3023671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552548
58548	NC_021487	GAG	3	9	3023711	3023719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552548
58549	NC_021487	TGC	2	6	3023787	3023792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552548
58550	NC_021487	CAT	2	6	3023809	3023814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552548
58551	NC_021487	TGG	2	6	3023838	3023843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552548
58552	NC_021487	AAG	2	6	3023924	3023929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552548
58553	NC_021487	GC	3	6	3024041	3024046	0 %	0 %	50 %	50 %	512552548
58554	NC_021487	TCTA	2	8	3024096	3024103	25 %	50 %	0 %	25 %	512552548
58555	NC_021487	CGA	2	6	3024109	3024114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552548
58556	NC_021487	CGG	2	6	3024162	3024167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552548
58557	NC_021487	ACC	2	6	3024189	3024194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58558	NC_021487	GA	3	6	3024259	3024264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58559	NC_021487	GCA	2	6	3024294	3024299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552549
58560	NC_021487	CTG	2	6	3024354	3024359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552549
58561	NC_021487	CAT	2	6	3024387	3024392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552549
58562	NC_021487	CAT	2	6	3024399	3024404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552549
58563	NC_021487	GGT	2	6	3024408	3024413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552549
58564	NC_021487	ATG	2	6	3024436	3024441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552549
58565	NC_021487	TGG	2	6	3024482	3024487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552549
58566	NC_021487	GTCA	2	8	3024495	3024502	25 %	25 %	25 %	25 %	512552549
58567	NC_021487	GTCC	2	8	3024539	3024546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58568	NC_021487	GGGT	2	8	3024598	3024605	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58569	NC_021487	CTC	2	6	3024633	3024638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58570	NC_021487	GA	3	6	3024693	3024698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58571	NC_021487	TC	3	6	3024776	3024781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58572	NC_021487	AAC	2	6	3024851	3024856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58573	NC_021487	CCA	2	6	3024865	3024870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552550
58574	NC_021487	TGC	2	6	3025103	3025108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552550
58575	NC_021487	CAA	2	6	3025115	3025120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552550
58576	NC_021487	TGCC	2	8	3025151	3025158	0 %	25 %	25 %	50 %	512552550
58577	NC_021487	GAG	2	6	3025164	3025169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552550
58578	NC_021487	T	7	7	3025170	3025176	0 %	100 %	0 %	0 %	512552550
58579	NC_021487	CCA	2	6	3025205	3025210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552550
58580	NC_021487	CGC	3	9	3025275	3025283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552550
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58583	NC_021487	GCC	2	6	3025398	3025403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552550
58584	NC_021487	GAG	2	6	3025430	3025435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552550
58585	NC_021487	GGAG	2	8	3025461	3025468	25 %	0 %	75 %	0 %	512552550
58586	NC_021487	GCC	2	6	3025506	3025511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552550
58587	NC_021487	TTCC	2	8	3025528	3025535	0 %	50 %	0 %	50 %	512552550
58588	NC_021487	TGCT	2	8	3025603	3025610	0 %	50 %	25 %	25 %	512552550
58589	NC_021487	ATC	2	6	3025660	3025665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552550
58590	NC_021487	CAA	2	6	3025698	3025703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552550
58591	NC_021487	GGAT	2	8	3025848	3025855	25 %	25 %	50 %	0 %	512552550
58592	NC_021487	CGA	2	6	3025863	3025868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552550
58593	NC_021487	GGC	2	6	3025887	3025892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552550
58594	NC_021487	GAA	2	6	3025917	3025922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552550
58595	NC_021487	G	7	7	3025927	3025933	0 %	0 %	100 %	0 %	512552550
58596	NC_021487	CCG	2	6	3025936	3025941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552550
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58598	NC_021487	CCT	2	6	3026020	3026025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58599	NC_021487	AGGA	2	8	3026027	3026034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58600	NC_021487	CGG	2	6	3026084	3026089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552551
58601	NC_021487	TGAT	2	8	3026126	3026133	25 %	50 %	25 %	0 %	512552551
58602	NC_021487	GGC	2	6	3026134	3026139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552551
58603	NC_021487	CGG	2	6	3026169	3026174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552551
58604	NC_021487	TGA	2	6	3026180	3026185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552551
58605	NC_021487	CAC	2	6	3026187	3026192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552551
58606	NC_021487	TGA	3	9	3026243	3026251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552551
58607	NC_021487	CCA	2	6	3026303	3026308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552551
58608	NC_021487	TGGCT	2	10	3026404	3026413	0 %	40 %	40 %	20 %	512552551
58609	NC_021487	CGG	2	6	3026448	3026453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552551
58610	NC_021487	TTTC	2	8	3026490	3026497	0 %	75 %	0 %	25 %	512552551
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58614	NC_021487	GCA	2	6	3026625	3026630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552551
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58617	NC_021487	GCG	2	6	3026748	3026753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552551
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58974	NC_021487	GAT	2	6	3045493	3045498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552567
58975	NC_021487	ATC	2	6	3045565	3045570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552567
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58979	NC_021487	GGA	2	6	3045792	3045797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552567
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58982	NC_021487	ACC	2	6	3045922	3045927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552567
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58987	NC_021487	A	7	7	3046111	3046117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58993	NC_021487	GAC	2	6	3046525	3046530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552568
58994	NC_021487	GC	3	6	3046581	3046586	0 %	0 %	50 %	50 %	512552568
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