MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_021487	GCC	2	6	2998248	2998253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552526
58003	NC_021487	GCA	2	6	2998272	2998277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552526
58004	NC_021487	AG	3	6	2998284	2998289	50 %	0 %	50 %	0 %	512552526
58005	NC_021487	AGG	2	6	2998298	2998303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552526
58006	NC_021487	AAC	2	6	2998354	2998359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552526
58007	NC_021487	TGCGC	2	10	2998365	2998374	0 %	20 %	40 %	40 %	512552526
58008	NC_021487	ACC	2	6	2998507	2998512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552526
58009	NC_021487	AG	3	6	2998552	2998557	50 %	0 %	50 %	0 %	512552526
58010	NC_021487	TTC	2	6	2998639	2998644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552526
58011	NC_021487	G	6	6	2998884	2998889	0 %	0 %	100 %	0 %	512552526
58012	NC_021487	GAGG	2	8	2998894	2998901	25 %	0 %	75 %	0 %	512552526
58013	NC_021487	ACT	2	6	2998913	2998918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552526
58014	NC_021487	GGC	2	6	2998968	2998973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552526
58015	NC_021487	CGCTA	2	10	2999074	2999083	20 %	20 %	20 %	40 %	512552526
58016	NC_021487	CTT	2	6	2999136	2999141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552526
58017	NC_021487	TC	3	6	2999220	2999225	0 %	50 %	0 %	50 %	512552526
58018	NC_021487	CCCTCA	2	12	2999288	2999299	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	512552526
58019	NC_021487	TAA	2	6	2999373	2999378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552526
58020	NC_021487	GAT	2	6	2999422	2999427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552526
58021	NC_021487	AAC	2	6	2999440	2999445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552526
58022	NC_021487	GCA	2	6	2999456	2999461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552526
58023	NC_021487	TGG	2	6	2999494	2999499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552526
58024	NC_021487	CAT	2	6	2999518	2999523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552526
58025	NC_021487	CAA	2	6	2999535	2999540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552526
58026	NC_021487	AG	3	6	2999676	2999681	50 %	0 %	50 %	0 %	512552526
58027	NC_021487	AAC	2	6	2999734	2999739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552526
58028	NC_021487	GCA	3	9	2999754	2999762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552526
58029	NC_021487	CCA	2	6	2999891	2999896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552526
58030	NC_021487	GA	3	6	2999951	2999956	50 %	0 %	50 %	0 %	512552526
58031	NC_021487	TGG	2	6	2999960	2999965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58032	NC_021487	G	6	6	3000003	3000008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58033	NC_021487	GC	3	6	3000195	3000200	0 %	0 %	50 %	50 %	512552527
58034	NC_021487	CCGATA	2	12	3000287	3000298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512552527
58035	NC_021487	GCTCT	2	10	3000319	3000328	0 %	40 %	20 %	40 %	512552527
58036	NC_021487	GGA	2	6	3000405	3000410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552527
58037	NC_021487	CTA	2	6	3000417	3000422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552527
58038	NC_021487	GGT	2	6	3000432	3000437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552527
58039	NC_021487	GT	3	6	3000482	3000487	0 %	50 %	50 %	0 %	512552527
58040	NC_021487	TCG	2	6	3000501	3000506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552527
58041	NC_021487	TGA	2	6	3000507	3000512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552527
58042	NC_021487	GCC	2	6	3000523	3000528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552527
58043	NC_021487	GCG	2	6	3000532	3000537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552527
58044	NC_021487	GCC	2	6	3000577	3000582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552527
58045	NC_021487	CT	3	6	3000593	3000598	0 %	50 %	0 %	50 %	512552527
58046	NC_021487	CCG	2	6	3000603	3000608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552527
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58048	NC_021487	GC	3	6	3000644	3000649	0 %	0 %	50 %	50 %	512552527
58049	NC_021487	AGC	2	6	3000719	3000724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552527
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58052	NC_021487	CG	4	8	3000807	3000814	0 %	0 %	50 %	50 %	512552527
58053	NC_021487	GCCG	2	8	3000855	3000862	0 %	0 %	50 %	50 %	512552527
58054	NC_021487	ATGT	2	8	3000874	3000881	25 %	50 %	25 %	0 %	512552527
58055	NC_021487	GA	3	6	3000884	3000889	50 %	0 %	50 %	0 %	512552527
58056	NC_021487	CG	3	6	3000925	3000930	0 %	0 %	50 %	50 %	512552527
58057	NC_021487	CCCG	2	8	3000933	3000940	0 %	0 %	25 %	75 %	512552527
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58070	NC_021487	TGT	2	6	3001469	3001474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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58118	NC_021487	GA	3	6	3003526	3003531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58119	NC_021487	GT	3	6	3003642	3003647	0 %	50 %	50 %	0 %	512552530
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58186	NC_021487	CTGC	2	8	3007100	3007107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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58231	NC_021487	CA	3	6	3008569	3008574	50 %	0 %	0 %	50 %	512552534
58232	NC_021487	T	6	6	3008600	3008605	0 %	100 %	0 %	0 %	512552534
58233	NC_021487	ATG	2	6	3008628	3008633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552534
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58343	NC_021487	A	6	6	3013524	3013529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58344	NC_021487	GATCTC	2	12	3013569	3013580	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512552538
58345	NC_021487	AG	3	6	3013595	3013600	50 %	0 %	50 %	0 %	512552538
58346	NC_021487	CAC	2	6	3013602	3013607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552538
58347	NC_021487	G	7	7	3013663	3013669	0 %	0 %	100 %	0 %	512552538
58348	NC_021487	GAG	2	6	3013698	3013703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552538
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58351	NC_021487	TGA	2	6	3013871	3013876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552538
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58353	NC_021487	GCC	2	6	3013969	3013974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552538
58354	NC_021487	AT	3	6	3013990	3013995	50 %	50 %	0 %	0 %	512552538
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58403	NC_021487	T	6	6	3016770	3016775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58471	NC_021487	GGGCGA	2	12	3019929	3019940	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512552545
58472	NC_021487	GC	3	6	3019943	3019948	0 %	0 %	50 %	50 %	512552545
58473	NC_021487	GC	3	6	3020044	3020049	0 %	0 %	50 %	50 %	512552545
58474	NC_021487	CGT	2	6	3020064	3020069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552545
58475	NC_021487	TTG	2	6	3020077	3020082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552545
58476	NC_021487	GGC	2	6	3020083	3020088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552545
58477	NC_021487	GGAGC	2	10	3020134	3020143	20 %	0 %	60 %	20 %	512552545
58478	NC_021487	GCA	2	6	3020201	3020206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552545
58479	NC_021487	TAGG	2	8	3020242	3020249	25 %	25 %	50 %	0 %	512552545
58480	NC_021487	GCT	2	6	3020357	3020362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552545
58481	NC_021487	AGA	2	6	3020367	3020372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552545
58482	NC_021487	CTTC	2	8	3020460	3020467	0 %	50 %	0 %	50 %	512552545
58483	NC_021487	GTT	2	6	3020538	3020543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552545
58484	NC_021487	CGTTG	2	10	3020610	3020619	0 %	40 %	40 %	20 %	512552545
58485	NC_021487	GGC	2	6	3020637	3020642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552545
58486	NC_021487	GC	3	6	3020647	3020652	0 %	0 %	50 %	50 %	512552545
58487	NC_021487	CCT	2	6	3020697	3020702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552545
58488	NC_021487	AGGG	2	8	3020785	3020792	25 %	0 %	75 %	0 %	512552545
58489	NC_021487	GC	3	6	3020817	3020822	0 %	0 %	50 %	50 %	512552545
58490	NC_021487	CCT	2	6	3020826	3020831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552545
58491	NC_021487	CGG	2	6	3020940	3020945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552545
58492	NC_021487	AAG	2	6	3020968	3020973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552545
58493	NC_021487	GC	3	6	3020996	3021001	0 %	0 %	50 %	50 %	512552545
58494	NC_021487	GCT	2	6	3021008	3021013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552545
58495	NC_021487	CTTCT	2	10	3021169	3021178	0 %	60 %	0 %	40 %	512552545
58496	NC_021487	CTG	2	6	3021238	3021243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552545
58497	NC_021487	GC	4	8	3021294	3021301	0 %	0 %	50 %	50 %	512552545
58498	NC_021487	AAC	2	6	3021303	3021308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552545
58499	NC_021487	CTC	2	6	3021325	3021330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552545
58500	NC_021487	CTG	2	6	3021358	3021363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552545

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