MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_021487	CTT	2	6	2918688	2918693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56502	NC_021487	CT	3	6	2918741	2918746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56503	NC_021487	GCT	3	9	2918808	2918816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56504	NC_021487	GCTT	2	8	2918880	2918887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56505	NC_021487	CCT	2	6	2918933	2918938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56506	NC_021487	CCT	2	6	2918972	2918977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56507	NC_021487	CTG	2	6	2919094	2919099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56508	NC_021487	CGGG	2	8	2919109	2919116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56509	NC_021487	AGAT	2	8	2919157	2919164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56510	NC_021487	TG	3	6	2919216	2919221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56511	NC_021487	AGG	2	6	2919229	2919234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56512	NC_021487	CTG	2	6	2919255	2919260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56513	NC_021487	CCA	2	6	2919328	2919333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56514	NC_021487	CACTG	2	10	2919353	2919362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56515	NC_021487	CACG	2	8	2919386	2919393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56516	NC_021487	CTGGC	2	10	2919405	2919414	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56517	NC_021487	GC	3	6	2919413	2919418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56518	NC_021487	CTG	2	6	2919422	2919427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56519	NC_021487	GGT	2	6	2919449	2919454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56520	NC_021487	CTTCC	2	10	2919478	2919487	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56521	NC_021487	CG	3	6	2919495	2919500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56522	NC_021487	GCA	2	6	2919521	2919526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56523	NC_021487	CGC	2	6	2919606	2919611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56524	NC_021487	GCC	2	6	2919662	2919667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56525	NC_021487	TGC	2	6	2920060	2920065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552471
56526	NC_021487	CAA	2	6	2920140	2920145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552471
56527	NC_021487	AAG	2	6	2920190	2920195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552471
56528	NC_021487	ACC	2	6	2920274	2920279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552471
56529	NC_021487	GGC	2	6	2920387	2920392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552471
56530	NC_021487	CGG	2	6	2920400	2920405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552471
56531	NC_021487	GC	3	6	2920620	2920625	0 %	0 %	50 %	50 %	512552471
56532	NC_021487	CAA	2	6	2920639	2920644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56533	NC_021487	TCA	2	6	2920665	2920670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56534	NC_021487	AACCC	2	10	2920707	2920716	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
56535	NC_021487	CCT	2	6	2920730	2920735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56536	NC_021487	TCG	2	6	2920767	2920772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56537	NC_021487	CTG	2	6	2920778	2920783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56538	NC_021487	GCT	2	6	2920788	2920793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56539	NC_021487	A	6	6	2920799	2920804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56540	NC_021487	CTC	2	6	2920846	2920851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552472
56541	NC_021487	GC	3	6	2920861	2920866	0 %	0 %	50 %	50 %	512552472
56542	NC_021487	CTA	2	6	2920957	2920962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552472
56543	NC_021487	CCG	2	6	2920971	2920976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552472
56544	NC_021487	CAA	2	6	2921164	2921169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552472
56545	NC_021487	GT	3	6	2921181	2921186	0 %	50 %	50 %	0 %	512552472
56546	NC_021487	GAA	2	6	2921188	2921193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552472
56547	NC_021487	GCA	2	6	2921194	2921199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552472
56548	NC_021487	TGGCG	2	10	2921233	2921242	0 %	20 %	60 %	20 %	512552472
56549	NC_021487	CGC	2	6	2921346	2921351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552472
56550	NC_021487	TCA	2	6	2921463	2921468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552472
56551	NC_021487	CGG	2	6	2921476	2921481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552472
56552	NC_021487	GT	4	8	2921510	2921517	0 %	50 %	50 %	0 %	512552472
56553	NC_021487	GCC	2	6	2921662	2921667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552472
56554	NC_021487	GCA	2	6	2921775	2921780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552472
56555	NC_021487	GTG	2	6	2921888	2921893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552472
56556	NC_021487	TG	3	6	2921939	2921944	0 %	50 %	50 %	0 %	512552472
56557	NC_021487	GC	3	6	2921991	2921996	0 %	0 %	50 %	50 %	512552472
56558	NC_021487	CCG	2	6	2922050	2922055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552472
56559	NC_021487	CACGCT	2	12	2922070	2922081	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512552472
56560	NC_021487	CCT	2	6	2922109	2922114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552472
56561	NC_021487	ACG	2	6	2922120	2922125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552472
56562	NC_021487	TTC	2	6	2922138	2922143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552472
56563	NC_021487	TCGT	2	8	2922158	2922165	0 %	50 %	25 %	25 %	512552472
56564	NC_021487	ACT	2	6	2922215	2922220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56565	NC_021487	TAC	2	6	2922326	2922331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56566	NC_021487	AT	3	6	2922341	2922346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56567	NC_021487	TAT	2	6	2922357	2922362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56568	NC_021487	CTAT	2	8	2922391	2922398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56569	NC_021487	TCC	2	6	2922418	2922423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552473
56570	NC_021487	GGC	2	6	2922444	2922449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552473
56571	NC_021487	CACG	2	8	2922475	2922482	25 %	0 %	25 %	50 %	512552473
56572	NC_021487	ACA	2	6	2922499	2922504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552473
56573	NC_021487	ATCT	2	8	2922521	2922528	25 %	50 %	0 %	25 %	512552473
56574	NC_021487	ATC	2	6	2922545	2922550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552473
56575	NC_021487	CAT	2	6	2922637	2922642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552473
56576	NC_021487	CCA	2	6	2922655	2922660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552473
56577	NC_021487	GCA	2	6	2922685	2922690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56578	NC_021487	TGG	2	6	2922742	2922747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56579	NC_021487	TG	3	6	2922768	2922773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56580	NC_021487	AAAAGA	2	12	2922835	2922846	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56581	NC_021487	GGC	2	6	2922921	2922926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552474
56582	NC_021487	GTG	2	6	2922942	2922947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552474
56583	NC_021487	GAA	2	6	2922989	2922994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552474
56584	NC_021487	CATC	2	8	2923050	2923057	25 %	25 %	0 %	50 %	512552474
56585	NC_021487	CGC	2	6	2923078	2923083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552474
56586	NC_021487	TCA	2	6	2923090	2923095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552474
56587	NC_021487	CAT	2	6	2923133	2923138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552474
56588	NC_021487	GTA	2	6	2923283	2923288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552474
56589	NC_021487	TGTT	2	8	2923314	2923321	0 %	75 %	25 %	0 %	512552474
56590	NC_021487	TCA	2	6	2923348	2923353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552474
56591	NC_021487	GCC	2	6	2923400	2923405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552474
56592	NC_021487	CGT	2	6	2923528	2923533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552474
56593	NC_021487	AAC	2	6	2923694	2923699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552474
56594	NC_021487	AGC	2	6	2923701	2923706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552474
56595	NC_021487	GTT	2	6	2923865	2923870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552475
56596	NC_021487	GGT	2	6	2923941	2923946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552475
56597	NC_021487	GGT	2	6	2923953	2923958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552475
56598	NC_021487	ACG	2	6	2924022	2924027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552475
56599	NC_021487	ATG	2	6	2924028	2924033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552475
56600	NC_021487	CCT	2	6	2924079	2924084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56601	NC_021487	CTG	2	6	2924120	2924125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552476
56602	NC_021487	CGC	2	6	2924152	2924157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552476
56603	NC_021487	GCA	2	6	2924192	2924197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552476
56604	NC_021487	TCA	2	6	2924228	2924233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552476
56605	NC_021487	GCCT	2	8	2924262	2924269	0 %	25 %	25 %	50 %	512552476
56606	NC_021487	GTT	2	6	2924287	2924292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552476
56607	NC_021487	CGGG	2	8	2924314	2924321	0 %	0 %	75 %	25 %	512552476
56608	NC_021487	GGC	2	6	2924403	2924408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552476
56609	NC_021487	AGC	2	6	2924455	2924460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552476
56610	NC_021487	CTC	2	6	2924580	2924585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552476
56611	NC_021487	ATG	2	6	2924638	2924643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552476
56612	NC_021487	GGCC	2	8	2924657	2924664	0 %	0 %	50 %	50 %	512552476
56613	NC_021487	GTG	3	9	2924674	2924682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552476
56614	NC_021487	CGT	2	6	2924684	2924689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552476
56615	NC_021487	CG	3	6	2924717	2924722	0 %	0 %	50 %	50 %	512552476
56616	NC_021487	CCA	2	6	2924750	2924755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552476
56617	NC_021487	TCT	2	6	2924794	2924799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552476
56618	NC_021487	CGC	2	6	2924935	2924940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552476
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56620	NC_021487	GAG	2	6	2925017	2925022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552476
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56633	NC_021487	CTT	3	9	2925738	2925746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56634	NC_021487	GCA	2	6	2925787	2925792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552477
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56999	NC_021487	A	6	6	2944652	2944657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57000	NC_021487	GCTTA	2	10	2944760	2944769	20 %	40 %	20 %	20 %	512552487

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