MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_021487	TGGC	2	8	2891909	2891916	0 %	25 %	50 %	25 %	512552453
56003	NC_021487	TGA	2	6	2892018	2892023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552453
56004	NC_021487	CGT	2	6	2892062	2892067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552453
56005	NC_021487	CTA	2	6	2892070	2892075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552453
56006	NC_021487	CTT	2	6	2892082	2892087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552453
56007	NC_021487	CTA	2	6	2892159	2892164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552453
56008	NC_021487	TGG	2	6	2892224	2892229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552453
56009	NC_021487	CTTT	2	8	2892243	2892250	0 %	75 %	0 %	25 %	512552453
56010	NC_021487	TG	3	6	2892483	2892488	0 %	50 %	50 %	0 %	512552453
56011	NC_021487	A	6	6	2892631	2892636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56012	NC_021487	CGG	2	6	2892680	2892685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56013	NC_021487	GTGC	2	8	2892721	2892728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56014	NC_021487	TTG	2	6	2892810	2892815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56015	NC_021487	GAA	2	6	2892837	2892842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56016	NC_021487	GCG	2	6	2892878	2892883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56017	NC_021487	AGA	2	6	2892886	2892891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56018	NC_021487	GGA	2	6	2893008	2893013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56019	NC_021487	GTC	2	6	2893120	2893125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552454
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56021	NC_021487	CAC	2	6	2893153	2893158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552454
56022	NC_021487	CCT	2	6	2893161	2893166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552454
56023	NC_021487	ATG	2	6	2893202	2893207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552454
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56026	NC_021487	GAG	2	6	2893344	2893349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552454
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56028	NC_021487	GTGTT	2	10	2893428	2893437	0 %	60 %	40 %	0 %	512552454
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56031	NC_021487	TTTC	2	8	2893594	2893601	0 %	75 %	0 %	25 %	512552454
56032	NC_021487	CGG	2	6	2893603	2893608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552454
56033	NC_021487	ATG	2	6	2893613	2893618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552454
56034	NC_021487	CG	3	6	2893630	2893635	0 %	0 %	50 %	50 %	512552454
56035	NC_021487	ATC	2	6	2893685	2893690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552454
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56039	NC_021487	TGC	2	6	2893776	2893781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552454
56040	NC_021487	CGG	2	6	2893804	2893809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552454
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56043	NC_021487	GCA	2	6	2894054	2894059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552454
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56051	NC_021487	TCT	2	6	2894379	2894384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552454
56052	NC_021487	TGC	2	6	2894484	2894489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552454
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56062	NC_021487	GCC	2	6	2895154	2895159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552455
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56079	NC_021487	AT	3	6	2895890	2895895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56082	NC_021487	AC	3	6	2896145	2896150	50 %	0 %	0 %	50 %	512552456
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56088	NC_021487	CTG	2	6	2896516	2896521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552456
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56110	NC_021487	CAA	3	9	2897642	2897650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552457
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56112	NC_021487	CA	3	6	2897707	2897712	50 %	0 %	0 %	50 %	512552457
56113	NC_021487	ACG	2	6	2897719	2897724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552457
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56235	NC_021487	GCC	2	6	2904402	2904407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552459
56236	NC_021487	GGC	2	6	2904423	2904428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552459
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56246	NC_021487	ATC	2	6	2905127	2905132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552459
56247	NC_021487	ATC	2	6	2905219	2905224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552459
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56250	NC_021487	TCCC	2	8	2905389	2905396	0 %	25 %	0 %	75 %	512552459
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56254	NC_021487	ATC	2	6	2905547	2905552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552460
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56286	NC_021487	GC	3	6	2907344	2907349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56287	NC_021487	TAT	2	6	2907355	2907360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56288	NC_021487	GA	3	6	2907369	2907374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56289	NC_021487	T	6	6	2907377	2907382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56293	NC_021487	CAAC	2	8	2907455	2907462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56294	NC_021487	CAA	2	6	2907469	2907474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56295	NC_021487	TAAG	2	8	2907503	2907510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56296	NC_021487	CT	3	6	2907525	2907530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56297	NC_021487	CT	3	6	2907589	2907594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56298	NC_021487	CTC	2	6	2907605	2907610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56322	NC_021487	GCC	2	6	2908719	2908724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552462
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56335	NC_021487	CGA	2	6	2909498	2909503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552462
56336	NC_021487	GCC	2	6	2909511	2909516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552462
56337	NC_021487	TC	3	6	2909546	2909551	0 %	50 %	0 %	50 %	512552462
56338	NC_021487	AGG	2	6	2909564	2909569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552462
56339	NC_021487	CGT	2	6	2909593	2909598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552462
56340	NC_021487	AAG	3	9	2909608	2909616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552462
56341	NC_021487	AGC	2	6	2909632	2909637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552462
56342	NC_021487	CTGCC	2	10	2909639	2909648	0 %	20 %	20 %	60 %	512552462
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56344	NC_021487	GAG	2	6	2909676	2909681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56345	NC_021487	AG	4	8	2909711	2909718	50 %	0 %	50 %	0 %	512552463
56346	NC_021487	TTG	2	6	2909734	2909739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552463
56347	NC_021487	AG	3	6	2909851	2909856	50 %	0 %	50 %	0 %	512552463
56348	NC_021487	ACG	2	6	2909903	2909908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552463
56349	NC_021487	CTG	2	6	2909909	2909914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552463
56350	NC_021487	TGATCG	2	12	2910002	2910013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512552463
56351	NC_021487	AAG	2	6	2910017	2910022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552463
56352	NC_021487	AGGCG	2	10	2910055	2910064	20 %	0 %	60 %	20 %	512552463
56353	NC_021487	CTC	2	6	2910147	2910152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552463
56354	NC_021487	GGA	2	6	2910169	2910174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552463
56355	NC_021487	GTA	2	6	2910241	2910246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552463
56356	NC_021487	TGC	2	6	2910339	2910344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552463
56357	NC_021487	GCG	2	6	2910354	2910359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552463
56358	NC_021487	ACC	2	6	2910384	2910389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552463
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56360	NC_021487	TGG	2	6	2910609	2910614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552463
56361	NC_021487	TGGC	2	8	2910767	2910774	0 %	25 %	50 %	25 %	512552463
56362	NC_021487	T	6	6	2910842	2910847	0 %	100 %	0 %	0 %	512552463
56363	NC_021487	GTG	2	6	2910880	2910885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552463
56364	NC_021487	TGG	2	6	2910952	2910957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552463
56365	NC_021487	TGGT	2	8	2910962	2910969	0 %	50 %	50 %	0 %	512552463
56366	NC_021487	AGC	2	6	2911007	2911012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552463
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56368	NC_021487	GAAGCC	2	12	2911192	2911203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552463
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56373	NC_021487	GGGT	2	8	2911579	2911586	0 %	25 %	75 %	0 %	512552463
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56377	NC_021487	GA	3	6	2911652	2911657	50 %	0 %	50 %	0 %	512552463
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56379	NC_021487	TGG	2	6	2911824	2911829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552463
56380	NC_021487	GGC	2	6	2911845	2911850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552463
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56383	NC_021487	CTG	2	6	2911978	2911983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552463
56384	NC_021487	GAC	2	6	2911997	2912002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552463
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56386	NC_021487	CT	3	6	2912097	2912102	0 %	50 %	0 %	50 %	512552463
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56403	NC_021487	AATT	2	8	2912947	2912954	50 %	50 %	0 %	0 %	512552464
56404	NC_021487	ATA	2	6	2913026	2913031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552464
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56407	NC_021487	CTC	2	6	2913085	2913090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552465
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56418	NC_021487	AGT	2	6	2913599	2913604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552466
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56433	NC_021487	GTTC	2	8	2914193	2914200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56434	NC_021487	AG	3	6	2914264	2914269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56435	NC_021487	AACGA	2	10	2914273	2914282	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56436	NC_021487	AGA	2	6	2914287	2914292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56450	NC_021487	C	6	6	2915334	2915339	0 %	0 %	0 %	100 %	512552468
56451	NC_021487	CT	3	6	2915384	2915389	0 %	50 %	0 %	50 %	512552468
56452	NC_021487	TCG	2	6	2915411	2915416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552468
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56457	NC_021487	GCC	3	9	2916062	2916070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56458	NC_021487	AAG	2	6	2916074	2916079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56460	NC_021487	CT	4	8	2916159	2916166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56461	NC_021487	CGC	2	6	2916172	2916177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56462	NC_021487	TC	3	6	2916264	2916269	0 %	50 %	0 %	50 %	512552469
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56466	NC_021487	GGC	2	6	2916496	2916501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552469
56467	NC_021487	GTCG	2	8	2916597	2916604	0 %	25 %	50 %	25 %	512552469
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56469	NC_021487	GCAC	2	8	2916683	2916690	25 %	0 %	25 %	50 %	512552469
56470	NC_021487	CTG	2	6	2916692	2916697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552469
56471	NC_021487	ATCC	2	8	2916713	2916720	25 %	25 %	0 %	50 %	512552469
56472	NC_021487	TAC	2	6	2916740	2916745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552469
56473	NC_021487	AAGC	2	8	2916756	2916763	50 %	0 %	25 %	25 %	512552469
56474	NC_021487	TC	3	6	2916927	2916932	0 %	50 %	0 %	50 %	512552469
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56480	NC_021487	CTC	2	6	2917325	2917330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552469
56481	NC_021487	GTAC	2	8	2917424	2917431	25 %	25 %	25 %	25 %	512552469
56482	NC_021487	GC	3	6	2917508	2917513	0 %	0 %	50 %	50 %	512552469
56483	NC_021487	GCA	2	6	2917519	2917524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552469
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56495	NC_021487	CTC	2	6	2918505	2918510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56500	NC_021487	GTGG	2	8	2918658	2918665	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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