MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_021487	GTA	2	6	2865296	2865301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552434
55502	NC_021487	CCA	2	6	2865350	2865355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552434
55503	NC_021487	GGC	2	6	2865357	2865362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552434
55504	NC_021487	AGC	2	6	2865385	2865390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552434
55505	NC_021487	GCA	2	6	2865395	2865400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552434
55506	NC_021487	CTT	3	9	2865447	2865455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552434
55507	NC_021487	AACC	2	8	2865463	2865470	50 %	0 %	0 %	50 %	512552434
55508	NC_021487	AGG	2	6	2865515	2865520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552434
55509	NC_021487	GCT	2	6	2865563	2865568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552434
55510	NC_021487	GCC	2	6	2865637	2865642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552434
55511	NC_021487	ATC	2	6	2865646	2865651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552434
55512	NC_021487	T	6	6	2865778	2865783	0 %	100 %	0 %	0 %	512552434
55513	NC_021487	CGT	2	6	2865821	2865826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552434
55514	NC_021487	CTT	2	6	2865828	2865833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552434
55515	NC_021487	GAT	2	6	2865876	2865881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552434
55516	NC_021487	TGC	2	6	2865932	2865937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552434
55517	NC_021487	TCT	2	6	2865962	2865967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552434
55518	NC_021487	T	6	6	2865967	2865972	0 %	100 %	0 %	0 %	512552434
55519	NC_021487	CAC	2	6	2866022	2866027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55520	NC_021487	AGA	2	6	2866091	2866096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55521	NC_021487	G	6	6	2866190	2866195	0 %	0 %	100 %	0 %	512552435
55522	NC_021487	GTC	2	6	2866202	2866207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552435
55523	NC_021487	ATC	2	6	2866209	2866214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552435
55524	NC_021487	GGC	2	6	2866241	2866246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552435
55525	NC_021487	GC	3	6	2866245	2866250	0 %	0 %	50 %	50 %	512552435
55526	NC_021487	CATG	2	8	2866255	2866262	25 %	25 %	25 %	25 %	512552435
55527	NC_021487	CAG	2	6	2866289	2866294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552435
55528	NC_021487	GAT	2	6	2866310	2866315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552435
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55530	NC_021487	AT	3	6	2866347	2866352	50 %	50 %	0 %	0 %	512552435
55531	NC_021487	AGCA	2	8	2866467	2866474	50 %	0 %	25 %	25 %	512552435
55532	NC_021487	ACG	2	6	2866496	2866501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552435
55533	NC_021487	CCCG	2	8	2866561	2866568	0 %	0 %	25 %	75 %	512552435
55534	NC_021487	AGG	2	6	2866613	2866618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552435
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55537	NC_021487	G	6	6	2866888	2866893	0 %	0 %	100 %	0 %	512552435
55538	NC_021487	TAC	2	6	2866895	2866900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552435
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55541	NC_021487	CCT	2	6	2867008	2867013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552435
55542	NC_021487	CCT	2	6	2867056	2867061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552435
55543	NC_021487	CG	3	6	2867067	2867072	0 %	0 %	50 %	50 %	512552435
55544	NC_021487	CG	3	6	2867095	2867100	0 %	0 %	50 %	50 %	512552435
55545	NC_021487	TGA	2	6	2867128	2867133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552435
55546	NC_021487	CTT	2	6	2867327	2867332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552435
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55548	NC_021487	GCC	2	6	2867418	2867423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552435
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55551	NC_021487	GAT	2	6	2867519	2867524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552435
55552	NC_021487	GAT	2	6	2867603	2867608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552435
55553	NC_021487	TGCC	2	8	2867663	2867670	0 %	25 %	25 %	50 %	512552435
55554	NC_021487	CGT	2	6	2867734	2867739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55555	NC_021487	CTT	2	6	2867794	2867799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55556	NC_021487	ACC	2	6	2867899	2867904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552436
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55570	NC_021487	GC	3	6	2868568	2868573	0 %	0 %	50 %	50 %	512552436
55571	NC_021487	TGA	2	6	2868776	2868781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552436
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55578	NC_021487	CTA	2	6	2868985	2868990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55585	NC_021487	GTG	2	6	2869352	2869357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552437
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55591	NC_021487	TTG	2	6	2869993	2869998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552437
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55593	NC_021487	AG	3	6	2870105	2870110	50 %	0 %	50 %	0 %	512552437
55594	NC_021487	TC	3	6	2870169	2870174	0 %	50 %	0 %	50 %	512552437
55595	NC_021487	GGAT	2	8	2870247	2870254	25 %	25 %	50 %	0 %	512552437
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55604	NC_021487	CCA	2	6	2870821	2870826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55605	NC_021487	CT	3	6	2870833	2870838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55606	NC_021487	GCA	2	6	2870844	2870849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552438
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55618	NC_021487	TCG	2	6	2871692	2871697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552438
55619	NC_021487	TGCCA	2	10	2871709	2871718	20 %	20 %	20 %	40 %	512552438
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55630	NC_021487	GGTG	2	8	2872048	2872055	0 %	25 %	75 %	0 %	512552438
55631	NC_021487	AGG	2	6	2872123	2872128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552438
55632	NC_021487	CTG	2	6	2872237	2872242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552438
55633	NC_021487	CGG	2	6	2872416	2872421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552438
55634	NC_021487	GTA	2	6	2872450	2872455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552438
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55649	NC_021487	CCT	2	6	2872950	2872955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552438
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55667	NC_021487	TTG	2	6	2874095	2874100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552439
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55672	NC_021487	ATC	2	6	2874502	2874507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552439
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55675	NC_021487	TTG	2	6	2874646	2874651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55677	NC_021487	GTAC	2	8	2874682	2874689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55678	NC_021487	CTAG	2	8	2874791	2874798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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55715	NC_021487	ATCT	2	8	2876938	2876945	25 %	50 %	0 %	25 %	512552440
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55719	NC_021487	AC	3	6	2877276	2877281	50 %	0 %	0 %	50 %	512552441
55720	NC_021487	ACGC	2	8	2877394	2877401	25 %	0 %	25 %	50 %	512552441
55721	NC_021487	TGT	2	6	2877410	2877415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552441
55722	NC_021487	GAG	2	6	2877428	2877433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552441
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55728	NC_021487	G	6	6	2877800	2877805	0 %	0 %	100 %	0 %	512552441
55729	NC_021487	TAT	2	6	2877836	2877841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552441
55730	NC_021487	CT	3	6	2877848	2877853	0 %	50 %	0 %	50 %	512552441
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55732	NC_021487	TGC	2	6	2877909	2877914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552441
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55734	NC_021487	TGC	2	6	2877999	2878004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552441
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55736	NC_021487	CACTT	2	10	2878101	2878110	20 %	40 %	0 %	40 %	512552441
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55755	NC_021487	AG	3	6	2879343	2879348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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55833	NC_021487	ATC	2	6	2883314	2883319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552446
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55969	NC_021487	CAG	2	6	2890334	2890339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55970	NC_021487	TTC	2	6	2890356	2890361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552452
55971	NC_021487	AGC	2	6	2890426	2890431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55972	NC_021487	GCA	2	6	2890483	2890488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55973	NC_021487	GAA	2	6	2890504	2890509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552452
55974	NC_021487	CCTC	2	8	2890536	2890543	0 %	25 %	0 %	75 %	512552452
55975	NC_021487	GACA	2	8	2890577	2890584	50 %	0 %	25 %	25 %	512552452
55976	NC_021487	TGC	2	6	2890588	2890593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55977	NC_021487	TGG	2	6	2890641	2890646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552452
55978	NC_021487	CAG	2	6	2890652	2890657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55979	NC_021487	ACT	2	6	2890665	2890670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552452
55980	NC_021487	AGC	2	6	2890743	2890748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55981	NC_021487	TTCC	2	8	2890755	2890762	0 %	50 %	0 %	50 %	512552452
55982	NC_021487	GGT	2	6	2890792	2890797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552452
55983	NC_021487	GAC	2	6	2890810	2890815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55984	NC_021487	GCA	2	6	2890891	2890896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55985	NC_021487	CAT	2	6	2891089	2891094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552452
55986	NC_021487	GC	3	6	2891097	2891102	0 %	0 %	50 %	50 %	512552452
55987	NC_021487	ACCA	2	8	2891234	2891241	50 %	0 %	0 %	50 %	512552452
55988	NC_021487	CAT	2	6	2891275	2891280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552452
55989	NC_021487	GAC	2	6	2891317	2891322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55990	NC_021487	GGGAGC	2	12	2891365	2891376	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512552452
55991	NC_021487	CTG	2	6	2891441	2891446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55992	NC_021487	CGA	2	6	2891473	2891478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55993	NC_021487	GCG	2	6	2891513	2891518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552452
55994	NC_021487	TCG	2	6	2891539	2891544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552452
55995	NC_021487	AGA	2	6	2891570	2891575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55996	NC_021487	TAT	2	6	2891643	2891648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55997	NC_021487	GTA	2	6	2891652	2891657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55998	NC_021487	AG	3	6	2891659	2891664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55999	NC_021487	GCT	2	6	2891667	2891672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56000	NC_021487	GGC	2	6	2891675	2891680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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