MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_021487	TTG	2	6	2812960	2812965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54502	NC_021487	GGA	2	6	2812986	2812991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54503	NC_021487	TGGTG	2	10	2813010	2813019	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
54504	NC_021487	AGG	2	6	2813033	2813038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54505	NC_021487	ACTC	2	8	2813060	2813067	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54506	NC_021487	G	6	6	2813076	2813081	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54507	NC_021487	CTG	2	6	2813099	2813104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552392
54508	NC_021487	CGG	2	6	2813139	2813144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552392
54509	NC_021487	GGC	2	6	2813203	2813208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552392
54510	NC_021487	GTG	2	6	2813312	2813317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552392
54511	NC_021487	TGA	2	6	2813352	2813357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552392
54512	NC_021487	GCC	2	6	2813450	2813455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552392
54513	NC_021487	CCT	2	6	2813478	2813483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552392
54514	NC_021487	AAC	2	6	2813547	2813552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552392
54515	NC_021487	CG	3	6	2813595	2813600	0 %	0 %	50 %	50 %	512552392
54516	NC_021487	AG	3	6	2813650	2813655	50 %	0 %	50 %	0 %	512552392
54517	NC_021487	TGA	2	6	2813679	2813684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552392
54518	NC_021487	GCT	2	6	2813721	2813726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552392
54519	NC_021487	CAA	2	6	2813730	2813735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552392
54520	NC_021487	GGA	2	6	2813736	2813741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552392
54521	NC_021487	CGCT	2	8	2813837	2813844	0 %	25 %	25 %	50 %	512552392
54522	NC_021487	GCG	2	6	2813848	2813853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552392
54523	NC_021487	TGC	2	6	2813863	2813868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552392
54524	NC_021487	GGA	2	6	2813969	2813974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54525	NC_021487	GAAA	2	8	2813994	2814001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54526	NC_021487	GCT	2	6	2814026	2814031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54527	NC_021487	GC	3	6	2814140	2814145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54528	NC_021487	ACT	2	6	2814168	2814173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54529	NC_021487	GGA	2	6	2814185	2814190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54530	NC_021487	GAT	2	6	2814290	2814295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54531	NC_021487	GCC	2	6	2814340	2814345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54532	NC_021487	GGC	2	6	2814382	2814387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54533	NC_021487	GCCGTT	2	12	2814410	2814421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54534	NC_021487	CTG	2	6	2814473	2814478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54535	NC_021487	GCA	2	6	2814544	2814549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54536	NC_021487	TC	3	6	2814591	2814596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54537	NC_021487	AGA	2	6	2814603	2814608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54538	NC_021487	GA	3	6	2814607	2814612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54539	NC_021487	GAA	2	6	2814628	2814633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54540	NC_021487	AAGA	2	8	2814659	2814666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54541	NC_021487	CT	3	6	2814879	2814884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54542	NC_021487	ACG	2	6	2814937	2814942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54543	NC_021487	GCT	2	6	2815003	2815008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54544	NC_021487	GGAA	2	8	2815057	2815064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54545	NC_021487	TGA	2	6	2815071	2815076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54546	NC_021487	GGC	2	6	2815103	2815108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54547	NC_021487	AG	3	6	2815225	2815230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54548	NC_021487	CTT	2	6	2815231	2815236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54549	NC_021487	AGG	2	6	2815311	2815316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54550	NC_021487	TGG	2	6	2815338	2815343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54551	NC_021487	AGG	2	6	2815368	2815373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54552	NC_021487	CTT	2	6	2815408	2815413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54553	NC_021487	GAG	2	6	2815433	2815438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54554	NC_021487	TGGC	2	8	2815478	2815485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54555	NC_021487	AAG	2	6	2815505	2815510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54556	NC_021487	GATA	2	8	2815605	2815612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54557	NC_021487	TGG	2	6	2815807	2815812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54558	NC_021487	CAA	2	6	2815842	2815847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54559	NC_021487	CTC	2	6	2815858	2815863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54560	NC_021487	AGA	2	6	2815865	2815870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54561	NC_021487	CGT	2	6	2815913	2815918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552393
54562	NC_021487	GCCC	2	8	2815974	2815981	0 %	0 %	25 %	75 %	512552393
54563	NC_021487	GGC	2	6	2816030	2816035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552393
54564	NC_021487	AAG	2	6	2816044	2816049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552393
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54570	NC_021487	GAG	2	6	2816310	2816315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552393
54571	NC_021487	CGG	2	6	2816397	2816402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552393
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54573	NC_021487	GTG	2	6	2816551	2816556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552393
54574	NC_021487	CCA	2	6	2816571	2816576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552393
54575	NC_021487	G	6	6	2816644	2816649	0 %	0 %	100 %	0 %	512552393
54576	NC_021487	GGC	2	6	2816684	2816689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552393
54577	NC_021487	TCGT	2	8	2816781	2816788	0 %	50 %	25 %	25 %	512552393
54578	NC_021487	CT	3	6	2816814	2816819	0 %	50 %	0 %	50 %	512552393
54579	NC_021487	TATC	2	8	2816930	2816937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54580	NC_021487	CAT	2	6	2816973	2816978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54581	NC_021487	GGT	2	6	2817029	2817034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54582	NC_021487	CTGA	2	8	2817071	2817078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54583	NC_021487	GGC	2	6	2817109	2817114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54584	NC_021487	AGG	2	6	2817164	2817169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54585	NC_021487	TCC	2	6	2817179	2817184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54586	NC_021487	GAC	2	6	2817219	2817224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54587	NC_021487	GAT	3	9	2817261	2817269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552394
54588	NC_021487	CT	3	6	2817272	2817277	0 %	50 %	0 %	50 %	512552394
54589	NC_021487	CGA	2	6	2817312	2817317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552394
54590	NC_021487	CAC	2	6	2817363	2817368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552394
54591	NC_021487	G	6	6	2817448	2817453	0 %	0 %	100 %	0 %	512552394
54592	NC_021487	GGGC	2	8	2817473	2817480	0 %	0 %	75 %	25 %	512552394
54593	NC_021487	GGA	2	6	2817484	2817489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552394
54594	NC_021487	GCC	2	6	2817553	2817558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552394
54595	NC_021487	TTG	2	6	2817599	2817604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552394
54596	NC_021487	CT	3	6	2817614	2817619	0 %	50 %	0 %	50 %	512552394
54597	NC_021487	CGA	2	6	2817698	2817703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552394
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54599	NC_021487	TTG	2	6	2817758	2817763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552394
54600	NC_021487	GC	3	6	2817992	2817997	0 %	0 %	50 %	50 %	512552394
54601	NC_021487	GGC	2	6	2818003	2818008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552394
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54603	NC_021487	GAC	2	6	2818083	2818088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552394
54604	NC_021487	ACT	2	6	2818124	2818129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552394
54605	NC_021487	GT	3	6	2818137	2818142	0 %	50 %	50 %	0 %	512552394
54606	NC_021487	TGG	2	6	2818187	2818192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552394
54607	NC_021487	AACG	2	8	2818194	2818201	50 %	0 %	25 %	25 %	512552394
54608	NC_021487	CGCCC	2	10	2818266	2818275	0 %	0 %	20 %	80 %	512552394
54609	NC_021487	AAC	2	6	2818396	2818401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552394
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54612	NC_021487	TCC	2	6	2818560	2818565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552394
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54615	NC_021487	GCAA	2	8	2818645	2818652	50 %	0 %	25 %	25 %	512552394
54616	NC_021487	GCA	2	6	2818701	2818706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552394
54617	NC_021487	GGGC	2	8	2818824	2818831	0 %	0 %	75 %	25 %	512552394
54618	NC_021487	AGG	2	6	2818843	2818848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54619	NC_021487	GGA	2	6	2818849	2818854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54620	NC_021487	CAG	2	6	2818902	2818907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552395
54621	NC_021487	GCG	2	6	2818915	2818920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552395
54622	NC_021487	ACG	2	6	2818975	2818980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552395
54623	NC_021487	TGC	2	6	2819049	2819054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552395
54624	NC_021487	GGCT	2	8	2819144	2819151	0 %	25 %	50 %	25 %	512552395
54625	NC_021487	GCCG	2	8	2819223	2819230	0 %	0 %	50 %	50 %	512552395
54626	NC_021487	AG	3	6	2819253	2819258	50 %	0 %	50 %	0 %	512552395
54627	NC_021487	GT	3	6	2819297	2819302	0 %	50 %	50 %	0 %	512552395
54628	NC_021487	GCG	2	6	2819335	2819340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552395
54629	NC_021487	ATG	2	6	2819463	2819468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54630	NC_021487	AG	3	6	2819615	2819620	50 %	0 %	50 %	0 %	512552396
54631	NC_021487	TGG	2	6	2819668	2819673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552397
54632	NC_021487	TCT	2	6	2819821	2819826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552397
54633	NC_021487	CA	3	6	2819828	2819833	50 %	0 %	0 %	50 %	512552397
54634	NC_021487	CGG	2	6	2820065	2820070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552397
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54642	NC_021487	CTT	2	6	2820789	2820794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552398
54643	NC_021487	GA	3	6	2820824	2820829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54644	NC_021487	GT	3	6	2820838	2820843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54645	NC_021487	GCA	2	6	2820918	2820923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552399
54646	NC_021487	AGCTG	2	10	2821067	2821076	20 %	20 %	40 %	20 %	512552399
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54649	NC_021487	AGC	2	6	2821171	2821176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552399
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54653	NC_021487	CA	3	6	2821414	2821419	50 %	0 %	0 %	50 %	512552399
54654	NC_021487	TGGAT	2	10	2821513	2821522	20 %	40 %	40 %	0 %	512552399
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54668	NC_021487	AGTAG	2	10	2821880	2821889	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54669	NC_021487	TTC	2	6	2821994	2821999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552400
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54674	NC_021487	GCGG	2	8	2822209	2822216	0 %	0 %	75 %	25 %	512552400
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54678	NC_021487	GA	3	6	2822399	2822404	50 %	0 %	50 %	0 %	512552400
54679	NC_021487	GCG	2	6	2822431	2822436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552400
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54681	NC_021487	CCT	2	6	2822561	2822566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54682	NC_021487	GAG	2	6	2822601	2822606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54683	NC_021487	CCG	2	6	2822672	2822677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552401
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54698	NC_021487	CTCCC	2	10	2823651	2823660	0 %	20 %	0 %	80 %	512552401
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54702	NC_021487	TTGG	2	8	2823831	2823838	0 %	50 %	50 %	0 %	512552401
54703	NC_021487	CT	4	8	2823851	2823858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54704	NC_021487	AAG	2	6	2823927	2823932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552402
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54707	NC_021487	GCT	2	6	2824044	2824049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552402
54708	NC_021487	GCT	2	6	2824067	2824072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552402
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54712	NC_021487	C	6	6	2824182	2824187	0 %	0 %	0 %	100 %	512552402
54713	NC_021487	AAG	2	6	2824198	2824203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552402
54714	NC_021487	AG	3	6	2824226	2824231	50 %	0 %	50 %	0 %	512552402
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54718	NC_021487	AG	3	6	2824398	2824403	50 %	0 %	50 %	0 %	512552402
54719	NC_021487	ATG	2	6	2824483	2824488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552402
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54721	NC_021487	GAT	2	6	2824509	2824514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552402
54722	NC_021487	TCA	2	6	2824531	2824536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552402
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54725	NC_021487	TGG	2	6	2824661	2824666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552403
54726	NC_021487	G	6	6	2824686	2824691	0 %	0 %	100 %	0 %	512552403
54727	NC_021487	GCG	2	6	2824730	2824735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552403
54728	NC_021487	GC	3	6	2824741	2824746	0 %	0 %	50 %	50 %	512552403
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54730	NC_021487	GAG	2	6	2824802	2824807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552403
54731	NC_021487	TCT	2	6	2824859	2824864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552404
54732	NC_021487	CGT	2	6	2824882	2824887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552404
54733	NC_021487	GAGG	2	8	2824911	2824918	25 %	0 %	75 %	0 %	512552404
54734	NC_021487	GCA	2	6	2824925	2824930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552404
54735	NC_021487	TCGT	2	8	2824933	2824940	0 %	50 %	25 %	25 %	512552404
54736	NC_021487	GAG	2	6	2824951	2824956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552404
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54738	NC_021487	TGC	2	6	2825005	2825010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552404
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54856	NC_021487	TG	3	6	2831343	2831348	0 %	50 %	50 %	0 %	512552408
54857	NC_021487	AGG	2	6	2831363	2831368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552408
54858	NC_021487	AGA	2	6	2831413	2831418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552408
54859	NC_021487	TG	3	6	2831444	2831449	0 %	50 %	50 %	0 %	512552408
54860	NC_021487	TGTT	2	8	2831482	2831489	0 %	75 %	25 %	0 %	512552408
54861	NC_021487	GAT	2	6	2831491	2831496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552408
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54974	NC_021487	TGC	2	6	2837854	2837859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552414
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54976	NC_021487	CTA	2	6	2837909	2837914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552414
54977	NC_021487	CG	3	6	2837920	2837925	0 %	0 %	50 %	50 %	512552414
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54991	NC_021487	GAAAG	2	10	2838833	2838842	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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55000	NC_021487	ATG	3	9	2839115	2839123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552415

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