MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_021487	GCCCG	2	10	2786226	2786235	0 %	0 %	40 %	60 %	512552367
54003	NC_021487	TAG	2	6	2786242	2786247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552367
54004	NC_021487	TC	4	8	2786260	2786267	0 %	50 %	0 %	50 %	512552367
54005	NC_021487	AG	3	6	2786293	2786298	50 %	0 %	50 %	0 %	512552367
54006	NC_021487	CGG	2	6	2786363	2786368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552367
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54008	NC_021487	TCG	2	6	2786422	2786427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552367
54009	NC_021487	GCG	2	6	2786430	2786435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552367
54010	NC_021487	AG	3	6	2786540	2786545	50 %	0 %	50 %	0 %	512552368
54011	NC_021487	GA	3	6	2786609	2786614	50 %	0 %	50 %	0 %	512552368
54012	NC_021487	AACGC	2	10	2786635	2786644	40 %	0 %	20 %	40 %	512552368
54013	NC_021487	CTG	2	6	2786666	2786671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552368
54014	NC_021487	GCA	2	6	2786729	2786734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552368
54015	NC_021487	AAAG	2	8	2786742	2786749	75 %	0 %	25 %	0 %	512552368
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54017	NC_021487	TGC	2	6	2786881	2786886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552368
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54020	NC_021487	CTG	2	6	2786996	2787001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552368
54021	NC_021487	GA	3	6	2787005	2787010	50 %	0 %	50 %	0 %	512552368
54022	NC_021487	CTCGAT	2	12	2787015	2787026	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512552368
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54034	NC_021487	CGG	2	6	2787953	2787958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552369
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54039	NC_021487	AG	3	6	2788208	2788213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54040	NC_021487	A	7	7	2788317	2788323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54041	NC_021487	AT	3	6	2788329	2788334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54042	NC_021487	AGA	2	6	2788342	2788347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54043	NC_021487	CTG	2	6	2788381	2788386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54045	NC_021487	TCA	3	9	2788439	2788447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552370
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54058	NC_021487	CATAG	2	10	2789122	2789131	40 %	20 %	20 %	20 %	512552371
54059	NC_021487	GAATGG	2	12	2789173	2789184	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512552371
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54071	NC_021487	CTTT	2	8	2789825	2789832	0 %	75 %	0 %	25 %	512552372
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54102	NC_021487	CGG	2	6	2791532	2791537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552372
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54118	NC_021487	CAC	2	6	2792308	2792313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552373
54119	NC_021487	CTT	2	6	2792366	2792371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552373
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54153	NC_021487	G	6	6	2794266	2794271	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54154	NC_021487	AT	3	6	2794364	2794369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54201	NC_021487	GGAA	2	8	2797393	2797400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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54220	NC_021487	GAA	2	6	2798366	2798371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552379
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54222	NC_021487	A	6	6	2798386	2798391	100 %	0 %	0 %	0 %	512552379
54223	NC_021487	ATG	2	6	2798457	2798462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54224	NC_021487	GA	3	6	2798485	2798490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54225	NC_021487	T	6	6	2798542	2798547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54226	NC_021487	AAAAAG	2	12	2798593	2798604	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54227	NC_021487	AAG	2	6	2798696	2798701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552380
54228	NC_021487	TGGTT	2	10	2798749	2798758	0 %	60 %	40 %	0 %	512552380
54229	NC_021487	TGG	2	6	2798931	2798936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552380
54230	NC_021487	GAT	2	6	2798938	2798943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552380
54231	NC_021487	G	7	7	2798981	2798987	0 %	0 %	100 %	0 %	512552380
54232	NC_021487	ACC	2	6	2799044	2799049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552380
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54234	NC_021487	CCA	2	6	2799146	2799151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552380
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54346	NC_021487	GAA	2	6	2805451	2805456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54352	NC_021487	GGC	2	6	2805662	2805667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552387
54353	NC_021487	CGG	2	6	2805673	2805678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552387
54354	NC_021487	ACG	2	6	2805733	2805738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552387
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54357	NC_021487	TC	3	6	2805833	2805838	0 %	50 %	0 %	50 %	512552387
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54380	NC_021487	CGT	2	6	2807027	2807032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54382	NC_021487	TGC	2	6	2807099	2807104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54384	NC_021487	CGT	2	6	2807157	2807162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54388	NC_021487	CCTC	2	8	2807288	2807295	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54389	NC_021487	CGCCTC	2	12	2807313	2807324	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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54392	NC_021487	GAG	2	6	2807414	2807419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54393	NC_021487	T	6	6	2807425	2807430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54408	NC_021487	TCT	3	9	2808335	2808343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552389
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54435	NC_021487	TA	3	6	2809622	2809627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54443	NC_021487	GCC	2	6	2810054	2810059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54444	NC_021487	GAGC	2	8	2810127	2810134	25 %	0 %	50 %	25 %	512552391
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54457	NC_021487	CGTAG	2	10	2810874	2810883	20 %	20 %	40 %	20 %	512552391
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54462	NC_021487	TGC	2	6	2811077	2811082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552391
54463	NC_021487	GCG	2	6	2811156	2811161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552391
54464	NC_021487	TGC	2	6	2811168	2811173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552391
54465	NC_021487	TTGC	2	8	2811189	2811196	0 %	50 %	25 %	25 %	512552391
54466	NC_021487	GGGC	2	8	2811252	2811259	0 %	0 %	75 %	25 %	512552391
54467	NC_021487	ACA	2	6	2811288	2811293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552391
54468	NC_021487	GGCC	2	8	2811294	2811301	0 %	0 %	50 %	50 %	512552391
54469	NC_021487	TC	4	8	2811333	2811340	0 %	50 %	0 %	50 %	512552391
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