MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_021487	GC	3	6	2736592	2736597	0 %	0 %	50 %	50 %	512552316
53002	NC_021487	GCA	2	6	2736627	2736632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552316
53003	NC_021487	TG	3	6	2736638	2736643	0 %	50 %	50 %	0 %	512552316
53004	NC_021487	GCT	2	6	2736679	2736684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552316
53005	NC_021487	CACG	2	8	2736883	2736890	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53006	NC_021487	GACC	2	8	2736949	2736956	25 %	0 %	25 %	50 %	512552317
53007	NC_021487	AGG	2	6	2737122	2737127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552317
53008	NC_021487	AG	3	6	2737130	2737135	50 %	0 %	50 %	0 %	512552317
53009	NC_021487	CT	3	6	2737151	2737156	0 %	50 %	0 %	50 %	512552317
53010	NC_021487	GCG	2	6	2737196	2737201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552317
53011	NC_021487	GCG	3	9	2737322	2737330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552317
53012	NC_021487	CAT	2	6	2737382	2737387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552317
53013	NC_021487	TGA	2	6	2737423	2737428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552317
53014	NC_021487	TG	3	6	2737457	2737462	0 %	50 %	50 %	0 %	512552317
53015	NC_021487	GCC	2	6	2737496	2737501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552317
53016	NC_021487	ACGC	2	8	2737507	2737514	25 %	0 %	25 %	50 %	512552317
53017	NC_021487	GGA	2	6	2737541	2737546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552317
53018	NC_021487	GCG	2	6	2737573	2737578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552317
53019	NC_021487	CTC	2	6	2737581	2737586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552317
53020	NC_021487	GTT	2	6	2737624	2737629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552317
53021	NC_021487	AAC	2	6	2737631	2737636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552317
53022	NC_021487	TGC	3	9	2737656	2737664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552317
53023	NC_021487	GCA	2	6	2737705	2737710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552317
53024	NC_021487	GAAC	2	8	2737750	2737757	50 %	0 %	25 %	25 %	512552318
53025	NC_021487	TAG	2	6	2737783	2737788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552318
53026	NC_021487	CGT	2	6	2737815	2737820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552318
53027	NC_021487	ATC	2	6	2737824	2737829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552318
53028	NC_021487	CT	3	6	2737830	2737835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53029	NC_021487	ACA	2	6	2737892	2737897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53030	NC_021487	A	6	6	2737927	2737932	100 %	0 %	0 %	0 %	512552319
53031	NC_021487	TGA	2	6	2738004	2738009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552319
53032	NC_021487	CGA	2	6	2738094	2738099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552319
53033	NC_021487	CGA	2	6	2738121	2738126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552319
53034	NC_021487	GCAC	2	8	2738147	2738154	25 %	0 %	25 %	50 %	512552319
53035	NC_021487	AGG	2	6	2738240	2738245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552319
53036	NC_021487	TGG	2	6	2738255	2738260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552319
53037	NC_021487	GC	3	6	2738266	2738271	0 %	0 %	50 %	50 %	512552319
53038	NC_021487	CTA	2	6	2738370	2738375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552319
53039	NC_021487	TGCGCG	2	12	2738393	2738404	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512552319
53040	NC_021487	GATC	2	8	2738481	2738488	25 %	25 %	25 %	25 %	512552319
53041	NC_021487	GGA	2	6	2738610	2738615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552319
53042	NC_021487	CGC	2	6	2738676	2738681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552319
53043	NC_021487	ACGG	2	8	2738722	2738729	25 %	0 %	50 %	25 %	512552319
53044	NC_021487	CCA	2	6	2738750	2738755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552319
53045	NC_021487	CAG	2	6	2738815	2738820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552319
53046	NC_021487	AAG	2	6	2738957	2738962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552319
53047	NC_021487	TTC	2	6	2739019	2739024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53048	NC_021487	CTT	2	6	2739052	2739057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53049	NC_021487	ATT	2	6	2739099	2739104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53050	NC_021487	AG	3	6	2739167	2739172	50 %	0 %	50 %	0 %	512552320
53051	NC_021487	GCT	2	6	2739236	2739241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552320
53052	NC_021487	ACC	2	6	2739285	2739290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552320
53053	NC_021487	ATC	2	6	2739340	2739345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552320
53054	NC_021487	TGG	2	6	2739346	2739351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552320
53055	NC_021487	CT	3	6	2739363	2739368	0 %	50 %	0 %	50 %	512552320
53056	NC_021487	CGAT	2	8	2739416	2739423	25 %	25 %	25 %	25 %	512552320
53057	NC_021487	ATG	2	6	2739438	2739443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552320
53058	NC_021487	TC	3	6	2739458	2739463	0 %	50 %	0 %	50 %	512552320
53059	NC_021487	ACGGCC	2	12	2739465	2739476	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512552320
53060	NC_021487	CTG	2	6	2739516	2739521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552320
53061	NC_021487	GCG	2	6	2739543	2739548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552320
53062	NC_021487	CCG	2	6	2739607	2739612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552320
53063	NC_021487	CTTAT	2	10	2739634	2739643	20 %	60 %	0 %	20 %	512552320
53064	NC_021487	GCA	2	6	2739651	2739656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552320
53065	NC_021487	TGC	2	6	2739790	2739795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552320
53066	NC_021487	ACC	2	6	2739802	2739807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552320
53067	NC_021487	CCA	2	6	2739829	2739834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552320
53068	NC_021487	ATG	2	6	2739864	2739869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552320
53069	NC_021487	TCA	2	6	2739901	2739906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552320
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53071	NC_021487	TC	3	6	2740025	2740030	0 %	50 %	0 %	50 %	512552320
53072	NC_021487	GCACC	2	10	2740133	2740142	20 %	0 %	20 %	60 %	512552320
53073	NC_021487	GCT	2	6	2740163	2740168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552320
53074	NC_021487	GGCTT	2	10	2740171	2740180	0 %	40 %	40 %	20 %	512552320
53075	NC_021487	GCCA	2	8	2740230	2740237	25 %	0 %	25 %	50 %	512552320
53076	NC_021487	ATGG	2	8	2740363	2740370	25 %	25 %	50 %	0 %	512552320
53077	NC_021487	TGC	2	6	2740393	2740398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552320
53078	NC_021487	GA	3	6	2740434	2740439	50 %	0 %	50 %	0 %	512552320
53079	NC_021487	AGT	2	6	2740465	2740470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552320
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53081	NC_021487	CGA	2	6	2740599	2740604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552321
53082	NC_021487	TCT	2	6	2740712	2740717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552321
53083	NC_021487	AGGCG	2	10	2740794	2740803	20 %	0 %	60 %	20 %	512552321
53084	NC_021487	GCT	2	6	2740850	2740855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552321
53085	NC_021487	T	6	6	2740888	2740893	0 %	100 %	0 %	0 %	512552321
53086	NC_021487	GT	3	6	2740920	2740925	0 %	50 %	50 %	0 %	512552321
53087	NC_021487	TGA	2	6	2741006	2741011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552321
53088	NC_021487	GAC	2	6	2741035	2741040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552321
53089	NC_021487	AGAA	2	8	2741053	2741060	75 %	0 %	25 %	0 %	512552321
53090	NC_021487	TCCT	2	8	2741067	2741074	0 %	50 %	0 %	50 %	512552321
53091	NC_021487	CTG	3	9	2741100	2741108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53092	NC_021487	GGC	2	6	2741139	2741144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552322
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53094	NC_021487	GGC	2	6	2741186	2741191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552322
53095	NC_021487	GAG	2	6	2741264	2741269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552322
53096	NC_021487	CCGCT	2	10	2741275	2741284	0 %	20 %	20 %	60 %	512552322
53097	NC_021487	GCG	2	6	2741307	2741312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552322
53098	NC_021487	GTT	2	6	2741375	2741380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552322
53099	NC_021487	ACG	2	6	2741405	2741410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552322
53100	NC_021487	TG	3	6	2741427	2741432	0 %	50 %	50 %	0 %	512552322
53101	NC_021487	GCAGA	2	10	2741486	2741495	40 %	0 %	40 %	20 %	512552322
53102	NC_021487	CGG	2	6	2741506	2741511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552322
53103	NC_021487	TCC	2	6	2741534	2741539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552322
53104	NC_021487	TC	3	6	2741572	2741577	0 %	50 %	0 %	50 %	512552322
53105	NC_021487	AGG	2	6	2741672	2741677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552322
53106	NC_021487	CGGG	2	8	2741707	2741714	0 %	0 %	75 %	25 %	512552322
53107	NC_021487	CTC	2	6	2741741	2741746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552322
53108	NC_021487	AAACG	2	10	2741770	2741779	60 %	0 %	20 %	20 %	512552322
53109	NC_021487	ACC	2	6	2741805	2741810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552322
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53111	NC_021487	GC	3	6	2741883	2741888	0 %	0 %	50 %	50 %	512552322
53112	NC_021487	GCG	2	6	2741906	2741911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552322
53113	NC_021487	CGC	2	6	2741929	2741934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552322
53114	NC_021487	ATG	2	6	2742020	2742025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552322
53115	NC_021487	GGT	2	6	2742041	2742046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552322
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53117	NC_021487	GCC	2	6	2742110	2742115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552322
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53236	NC_021487	CTT	2	6	2748216	2748221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53237	NC_021487	TAAG	2	8	2748244	2748251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53238	NC_021487	A	6	6	2748315	2748320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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