MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_021487	AGT	2	6	2710628	2710633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552292
52502	NC_021487	CTT	2	6	2710679	2710684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552292
52503	NC_021487	GAG	2	6	2710794	2710799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552292
52504	NC_021487	GGA	2	6	2710819	2710824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552292
52505	NC_021487	TG	3	6	2710863	2710868	0 %	50 %	50 %	0 %	512552292
52506	NC_021487	TG	3	6	2710954	2710959	0 %	50 %	50 %	0 %	512552292
52507	NC_021487	T	6	6	2710972	2710977	0 %	100 %	0 %	0 %	512552292
52508	NC_021487	ATG	2	6	2711028	2711033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552292
52509	NC_021487	AGC	2	6	2711039	2711044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552292
52510	NC_021487	TTGGT	2	10	2711082	2711091	0 %	60 %	40 %	0 %	512552292
52511	NC_021487	GC	3	6	2711098	2711103	0 %	0 %	50 %	50 %	512552292
52512	NC_021487	CAT	2	6	2711150	2711155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552292
52513	NC_021487	TGA	2	6	2711273	2711278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552293
52514	NC_021487	A	6	6	2711283	2711288	100 %	0 %	0 %	0 %	512552293
52515	NC_021487	AG	3	6	2711382	2711387	50 %	0 %	50 %	0 %	512552293
52516	NC_021487	CAT	2	6	2711453	2711458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552293
52517	NC_021487	TGT	2	6	2711581	2711586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552293
52518	NC_021487	GA	3	6	2711589	2711594	50 %	0 %	50 %	0 %	512552293
52519	NC_021487	AGGG	2	8	2711621	2711628	25 %	0 %	75 %	0 %	512552293
52520	NC_021487	CAA	2	6	2711648	2711653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552293
52521	NC_021487	A	6	6	2711679	2711684	100 %	0 %	0 %	0 %	512552293
52522	NC_021487	GCAATG	2	12	2711716	2711727	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512552293
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52525	NC_021487	AG	3	6	2711797	2711802	50 %	0 %	50 %	0 %	512552293
52526	NC_021487	CCAA	2	8	2711818	2711825	50 %	0 %	0 %	50 %	512552293
52527	NC_021487	CT	3	6	2711868	2711873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52528	NC_021487	TG	3	6	2711906	2711911	0 %	50 %	50 %	0 %	512552294
52529	NC_021487	TCG	2	6	2711921	2711926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552294
52530	NC_021487	TA	3	6	2711971	2711976	50 %	50 %	0 %	0 %	512552294
52531	NC_021487	GAGG	3	12	2711977	2711988	25 %	0 %	75 %	0 %	512552294
52532	NC_021487	ATG	2	6	2712029	2712034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552294
52533	NC_021487	TGA	2	6	2712068	2712073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552294
52534	NC_021487	AGAGC	2	10	2712207	2712216	40 %	0 %	40 %	20 %	512552294
52535	NC_021487	TAG	2	6	2712323	2712328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552294
52536	NC_021487	CAT	2	6	2712330	2712335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552294
52537	NC_021487	TTG	2	6	2712367	2712372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552294
52538	NC_021487	GCT	2	6	2712404	2712409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552294
52539	NC_021487	TGC	2	6	2712442	2712447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552294
52540	NC_021487	GA	3	6	2712455	2712460	50 %	0 %	50 %	0 %	512552294
52541	NC_021487	GAC	2	6	2712469	2712474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552294
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52543	NC_021487	GTTTG	2	10	2712674	2712683	0 %	60 %	40 %	0 %	512552295
52544	NC_021487	GT	3	6	2712715	2712720	0 %	50 %	50 %	0 %	512552295
52545	NC_021487	AAT	2	6	2712756	2712761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552295
52546	NC_021487	CGG	2	6	2712815	2712820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552295
52547	NC_021487	GT	3	6	2712831	2712836	0 %	50 %	50 %	0 %	512552295
52548	NC_021487	ATATCA	2	12	2712850	2712861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	512552295
52549	NC_021487	GTA	2	6	2712936	2712941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552295
52550	NC_021487	T	7	7	2713021	2713027	0 %	100 %	0 %	0 %	512552295
52551	NC_021487	GAG	2	6	2713043	2713048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552295
52552	NC_021487	GCA	2	6	2713142	2713147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552295
52553	NC_021487	TCC	2	6	2713161	2713166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52554	NC_021487	GTAT	2	8	2713187	2713194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52555	NC_021487	ACA	2	6	2713196	2713201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52556	NC_021487	CGC	2	6	2713340	2713345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52557	NC_021487	CTT	2	6	2713375	2713380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52558	NC_021487	TAT	2	6	2713439	2713444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52559	NC_021487	AGAC	2	8	2713468	2713475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52560	NC_021487	A	7	7	2713480	2713486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52561	NC_021487	CTGAAA	2	12	2713505	2713516	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52562	NC_021487	GA	3	6	2713544	2713549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52563	NC_021487	CGAA	2	8	2713575	2713582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52564	NC_021487	GAC	2	6	2713641	2713646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52565	NC_021487	CGT	2	6	2713666	2713671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52566	NC_021487	GGA	2	6	2713679	2713684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552296
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52572	NC_021487	CG	3	6	2713896	2713901	0 %	0 %	50 %	50 %	512552296
52573	NC_021487	TTTCG	2	10	2713903	2713912	0 %	60 %	20 %	20 %	512552296
52574	NC_021487	TCGT	2	8	2713948	2713955	0 %	50 %	25 %	25 %	512552296
52575	NC_021487	CTG	2	6	2713989	2713994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552296
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52583	NC_021487	GCC	2	6	2714515	2714520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552297
52584	NC_021487	CAAC	2	8	2714562	2714569	50 %	0 %	0 %	50 %	512552297
52585	NC_021487	ACG	2	6	2714584	2714589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552297
52586	NC_021487	AGG	2	6	2714592	2714597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52587	NC_021487	GTAT	2	8	2714727	2714734	25 %	50 %	25 %	0 %	512552298
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52589	NC_021487	ATC	3	9	2714810	2714818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552298
52590	NC_021487	GAG	2	6	2714819	2714824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552298
52591	NC_021487	GAG	2	6	2714843	2714848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552298
52592	NC_021487	GAG	2	6	2714915	2714920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552298
52593	NC_021487	AAAGG	2	10	2714933	2714942	60 %	0 %	40 %	0 %	512552298
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52601	NC_021487	CTAT	2	8	2715267	2715274	25 %	50 %	0 %	25 %	512552298
52602	NC_021487	CCA	2	6	2715282	2715287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552298
52603	NC_021487	CCT	2	6	2715322	2715327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552298
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52605	NC_021487	GA	3	6	2715417	2715422	50 %	0 %	50 %	0 %	512552298
52606	NC_021487	GC	3	6	2715444	2715449	0 %	0 %	50 %	50 %	512552298
52607	NC_021487	CGGGCA	2	12	2715455	2715466	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512552298
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52611	NC_021487	CAC	2	6	2715668	2715673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52612	NC_021487	CTTCC	2	10	2715697	2715706	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52613	NC_021487	GCAG	3	12	2715725	2715736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52614	NC_021487	TTC	2	6	2715795	2715800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52615	NC_021487	AGC	2	6	2715812	2715817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52616	NC_021487	GGC	2	6	2715859	2715864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552299
52617	NC_021487	GC	3	6	2715863	2715868	0 %	0 %	50 %	50 %	512552299
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52619	NC_021487	CA	3	6	2715897	2715902	50 %	0 %	0 %	50 %	512552299
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52738	NC_021487	T	6	6	2722932	2722937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52739	NC_021487	TCA	2	6	2723035	2723040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52740	NC_021487	TCT	2	6	2723049	2723054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52810	NC_021487	TAT	2	6	2726164	2726169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52845	NC_021487	ATT	2	6	2728029	2728034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52847	NC_021487	GAA	2	6	2728197	2728202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52852	NC_021487	CT	3	6	2728318	2728323	0 %	50 %	0 %	50 %	512552311
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52854	NC_021487	AAG	2	6	2728334	2728339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552311
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52912	NC_021487	GTG	2	6	2731638	2731643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52941	NC_021487	GAGTA	2	10	2733336	2733345	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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52952	NC_021487	G	6	6	2733995	2734000	0 %	0 %	100 %	0 %	512552314
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52965	NC_021487	T	7	7	2734740	2734746	0 %	100 %	0 %	0 %	512552314
52966	NC_021487	ACAAG	2	10	2734784	2734793	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52967	NC_021487	CTT	2	6	2734797	2734802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52968	NC_021487	GTT	2	6	2734885	2734890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52969	NC_021487	GGC	2	6	2734896	2734901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552315
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52971	NC_021487	GGC	2	6	2734928	2734933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552315
52972	NC_021487	GCA	2	6	2734948	2734953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552315
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52974	NC_021487	ATC	2	6	2735121	2735126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552315
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