MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52119	NC_021487	ATC	2	6	2690944	2690949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552276
52120	NC_021487	CGTG	2	8	2690969	2690976	0 %	25 %	50 %	25 %	512552276
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52153	NC_021487	GCTCC	2	10	2692419	2692428	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52154	NC_021487	TC	3	6	2692429	2692434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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52222	NC_021487	GGC	2	6	2695653	2695658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552282
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52231	NC_021487	GAC	2	6	2696154	2696159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552282
52232	NC_021487	TGGT	2	8	2696179	2696186	0 %	50 %	50 %	0 %	512552282
52233	NC_021487	G	6	6	2696190	2696195	0 %	0 %	100 %	0 %	512552282
52234	NC_021487	CAG	2	6	2696298	2696303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552282
52235	NC_021487	GAT	2	6	2696306	2696311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552282
52236	NC_021487	ACC	2	6	2696334	2696339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552282
52237	NC_021487	GC	3	6	2696434	2696439	0 %	0 %	50 %	50 %	512552282
52238	NC_021487	GGC	2	6	2696447	2696452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552282
52239	NC_021487	CAA	2	6	2696585	2696590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552282
52240	NC_021487	TAT	2	6	2696595	2696600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552282
52241	NC_021487	TGC	2	6	2696648	2696653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552282
52242	NC_021487	GCTTG	2	10	2696826	2696835	0 %	40 %	40 %	20 %	512552282
52243	NC_021487	CTG	3	9	2697105	2697113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552282
52244	NC_021487	CAAC	2	8	2697133	2697140	50 %	0 %	0 %	50 %	512552282
52245	NC_021487	AAC	2	6	2697196	2697201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52246	NC_021487	GTAGA	2	10	2697339	2697348	40 %	20 %	40 %	0 %	512552283
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52249	NC_021487	TGAG	2	8	2697507	2697514	25 %	25 %	50 %	0 %	512552283
52250	NC_021487	ACT	2	6	2697609	2697614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552283
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52252	NC_021487	TGGG	2	8	2697808	2697815	0 %	25 %	75 %	0 %	512552283
52253	NC_021487	TAG	2	6	2697826	2697831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552283
52254	NC_021487	CTG	2	6	2697839	2697844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552283
52255	NC_021487	ACC	2	6	2697923	2697928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552283
52256	NC_021487	ATC	2	6	2697930	2697935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552283
52257	NC_021487	TCA	2	6	2697943	2697948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552283
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52259	NC_021487	GC	3	6	2697985	2697990	0 %	0 %	50 %	50 %	512552283
52260	NC_021487	TCC	2	6	2697996	2698001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552283
52261	NC_021487	CAC	2	6	2698010	2698015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552283
52262	NC_021487	TGC	2	6	2698088	2698093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552283
52263	NC_021487	CT	3	6	2698171	2698176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52264	NC_021487	GCA	2	6	2698311	2698316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552284
52265	NC_021487	CG	3	6	2698526	2698531	0 %	0 %	50 %	50 %	512552284
52266	NC_021487	TGT	2	6	2698630	2698635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552284
52267	NC_021487	GAT	2	6	2698637	2698642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552284
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52270	NC_021487	GGC	2	6	2698877	2698882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552284
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52273	NC_021487	TGG	2	6	2699197	2699202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552284
52274	NC_021487	TGC	2	6	2699203	2699208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552284
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52293	NC_021487	CAT	2	6	2699910	2699915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552285
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52298	NC_021487	TG	3	6	2700514	2700519	0 %	50 %	50 %	0 %	512552285
52299	NC_021487	CGGT	2	8	2700551	2700558	0 %	25 %	50 %	25 %	512552285
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52302	NC_021487	CCTT	2	8	2700666	2700673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52303	NC_021487	TCT	2	6	2700702	2700707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52307	NC_021487	AAC	2	6	2700876	2700881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52310	NC_021487	AAG	2	6	2701013	2701018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52311	NC_021487	AGC	3	9	2701050	2701058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52329	NC_021487	CG	4	8	2702280	2702287	0 %	0 %	50 %	50 %	512552286
52330	NC_021487	ATC	2	6	2702317	2702322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552286
52331	NC_021487	GGC	2	6	2702378	2702383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552286
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52336	NC_021487	TCCAT	2	10	2702641	2702650	20 %	40 %	0 %	40 %	512552286
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52340	NC_021487	CGA	2	6	2703018	2703023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552286
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52342	NC_021487	TCT	2	6	2703050	2703055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552286
52343	NC_021487	TGG	2	6	2703057	2703062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552286
52344	NC_021487	GTAAG	2	10	2703080	2703089	40 %	20 %	40 %	0 %	512552286
52345	NC_021487	TG	3	6	2703125	2703130	0 %	50 %	50 %	0 %	512552286
52346	NC_021487	CCG	2	6	2703161	2703166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552286
52347	NC_021487	TTA	2	6	2703167	2703172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552286
52348	NC_021487	GCA	2	6	2703207	2703212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552286
52349	NC_021487	G	6	6	2703219	2703224	0 %	0 %	100 %	0 %	512552286
52350	NC_021487	GGT	2	6	2703235	2703240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552286
52351	NC_021487	G	6	6	2703243	2703248	0 %	0 %	100 %	0 %	512552286
52352	NC_021487	CT	3	6	2703266	2703271	0 %	50 %	0 %	50 %	512552286
52353	NC_021487	GTC	2	6	2703302	2703307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552286
52354	NC_021487	AAG	2	6	2703455	2703460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552286
52355	NC_021487	ATC	2	6	2703481	2703486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552286
52356	NC_021487	TTG	2	6	2703563	2703568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552286
52357	NC_021487	GAT	2	6	2703604	2703609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552286
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52383	NC_021487	T	7	7	2704889	2704895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52384	NC_021487	GCC	2	6	2704916	2704921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52385	NC_021487	GAG	2	6	2705055	2705060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52386	NC_021487	AG	3	6	2705072	2705077	50 %	0 %	50 %	0 %	512552287
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52461	NC_021487	AAG	2	6	2708643	2708648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52462	NC_021487	CT	3	6	2708651	2708656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52463	NC_021487	AGG	2	6	2708688	2708693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52465	NC_021487	TAC	2	6	2708804	2708809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52466	NC_021487	GA	3	6	2708835	2708840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52467	NC_021487	GAAA	2	8	2708845	2708852	75 %	0 %	25 %	0 %	512552290
52468	NC_021487	CTT	2	6	2708901	2708906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552290
52469	NC_021487	AGC	2	6	2708935	2708940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552290
52470	NC_021487	ACC	2	6	2708951	2708956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552290
52471	NC_021487	GAT	2	6	2708965	2708970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552290
52472	NC_021487	GGA	2	6	2709087	2709092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552290
52473	NC_021487	GTG	2	6	2709139	2709144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552290
52474	NC_021487	GGC	2	6	2709147	2709152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552290
52475	NC_021487	TCG	2	6	2709320	2709325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552290
52476	NC_021487	AGC	2	6	2709343	2709348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552290
52477	NC_021487	GC	3	6	2709351	2709356	0 %	0 %	50 %	50 %	512552290
52478	NC_021487	TTG	2	6	2709382	2709387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552290
52479	NC_021487	GC	3	6	2709441	2709446	0 %	0 %	50 %	50 %	512552290
52480	NC_021487	TGT	2	6	2709467	2709472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552290
52481	NC_021487	GC	3	6	2709479	2709484	0 %	0 %	50 %	50 %	512552290
52482	NC_021487	AGC	2	6	2709494	2709499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552290
52483	NC_021487	CT	3	6	2709549	2709554	0 %	50 %	0 %	50 %	512552290
52484	NC_021487	GCCC	2	8	2709558	2709565	0 %	0 %	25 %	75 %	512552290
52485	NC_021487	ATC	2	6	2709619	2709624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552290
52486	NC_021487	CGGG	2	8	2709667	2709674	0 %	0 %	75 %	25 %	512552290
52487	NC_021487	GGT	2	6	2709748	2709753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552291
52488	NC_021487	GGT	2	6	2709772	2709777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552291
52489	NC_021487	GCT	2	6	2709823	2709828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552291
52490	NC_021487	GCT	2	6	2709862	2709867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552291
52491	NC_021487	TGG	2	6	2709876	2709881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552291
52492	NC_021487	GCG	2	6	2709960	2709965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552291
52493	NC_021487	TGG	2	6	2710218	2710223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552291
52494	NC_021487	CGC	2	6	2710297	2710302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552291
52495	NC_021487	GCT	2	6	2710306	2710311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552291
52496	NC_021487	GCT	2	6	2710327	2710332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552291
52497	NC_021487	CCA	2	6	2710434	2710439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52498	NC_021487	TC	4	8	2710521	2710528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52499	NC_021487	TGCTTG	2	12	2710538	2710549	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52500	NC_021487	AGG	2	6	2710577	2710582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552292

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