MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_021487	TGT	2	6	2631855	2631860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552229
51002	NC_021487	TGT	3	9	2631927	2631935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552229
51003	NC_021487	GGA	2	6	2631983	2631988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552229
51004	NC_021487	GT	3	6	2632035	2632040	0 %	50 %	50 %	0 %	512552229
51005	NC_021487	GCA	2	6	2632065	2632070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552229
51006	NC_021487	GAT	2	6	2632102	2632107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552229
51007	NC_021487	ATG	2	6	2632157	2632162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552229
51008	NC_021487	TGT	2	6	2632189	2632194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552230
51009	NC_021487	ATC	2	6	2632290	2632295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552230
51010	NC_021487	TAA	2	6	2632325	2632330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552230
51011	NC_021487	AAT	2	6	2632340	2632345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552230
51012	NC_021487	ACG	2	6	2632362	2632367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552230
51013	NC_021487	ACC	2	6	2632394	2632399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552230
51014	NC_021487	AGCA	2	8	2632430	2632437	50 %	0 %	25 %	25 %	512552230
51015	NC_021487	AAG	2	6	2632521	2632526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552230
51016	NC_021487	T	6	6	2632545	2632550	0 %	100 %	0 %	0 %	512552230
51017	NC_021487	GAT	2	6	2632583	2632588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552230
51018	NC_021487	CCA	2	6	2632594	2632599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552230
51019	NC_021487	GAG	2	6	2632850	2632855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552231
51020	NC_021487	GGGT	2	8	2632864	2632871	0 %	25 %	75 %	0 %	512552231
51021	NC_021487	CTG	2	6	2632914	2632919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552231
51022	NC_021487	GCGAT	2	10	2632967	2632976	20 %	20 %	40 %	20 %	512552231
51023	NC_021487	TCC	2	6	2633042	2633047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552231
51024	NC_021487	CTT	2	6	2633157	2633162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552231
51025	NC_021487	AG	3	6	2633284	2633289	50 %	0 %	50 %	0 %	512552231
51026	NC_021487	GCCG	2	8	2633423	2633430	0 %	0 %	50 %	50 %	512552231
51027	NC_021487	GGC	2	6	2633603	2633608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552232
51028	NC_021487	GC	3	6	2633636	2633641	0 %	0 %	50 %	50 %	512552232
51029	NC_021487	TC	3	6	2633659	2633664	0 %	50 %	0 %	50 %	512552232
51030	NC_021487	GTT	2	6	2633895	2633900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552232
51031	NC_021487	TCGA	2	8	2633906	2633913	25 %	25 %	25 %	25 %	512552232
51032	NC_021487	CGT	2	6	2633938	2633943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552232
51033	NC_021487	TGCA	2	8	2634035	2634042	25 %	25 %	25 %	25 %	512552232
51034	NC_021487	CAC	2	6	2634080	2634085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552232
51035	NC_021487	GATA	2	8	2634091	2634098	50 %	25 %	25 %	0 %	512552232
51036	NC_021487	CGA	2	6	2634112	2634117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552232
51037	NC_021487	CTT	2	6	2634229	2634234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552232
51038	NC_021487	GGAT	2	8	2634252	2634259	25 %	25 %	50 %	0 %	512552232
51039	NC_021487	TGG	2	6	2634272	2634277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552232
51040	NC_021487	G	7	7	2634276	2634282	0 %	0 %	100 %	0 %	512552232
51041	NC_021487	GTG	2	6	2634378	2634383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552232
51042	NC_021487	GAA	2	6	2634418	2634423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552232
51043	NC_021487	TTG	2	6	2634542	2634547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552232
51044	NC_021487	CT	3	6	2634586	2634591	0 %	50 %	0 %	50 %	512552233
51045	NC_021487	CTG	2	6	2634670	2634675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552233
51046	NC_021487	CCT	2	6	2634693	2634698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552233
51047	NC_021487	TTG	2	6	2634787	2634792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552233
51048	NC_021487	G	7	7	2634818	2634824	0 %	0 %	100 %	0 %	512552233
51049	NC_021487	AGG	2	6	2634871	2634876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552233
51050	NC_021487	GCC	2	6	2634920	2634925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552233
51051	NC_021487	GGT	2	6	2634978	2634983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552233
51052	NC_021487	CTG	2	6	2635036	2635041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552233
51053	NC_021487	CAA	2	6	2635053	2635058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552233
51054	NC_021487	GA	4	8	2635113	2635120	50 %	0 %	50 %	0 %	512552233
51055	NC_021487	TTG	2	6	2635309	2635314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552233
51056	NC_021487	T	6	6	2635318	2635323	0 %	100 %	0 %	0 %	512552233
51057	NC_021487	GGC	2	6	2635345	2635350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552233
51058	NC_021487	GCA	2	6	2635388	2635393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552233
51059	NC_021487	GCT	2	6	2635404	2635409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552233
51060	NC_021487	GTC	2	6	2635410	2635415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552233
51061	NC_021487	AGG	2	6	2635441	2635446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552233
51062	NC_021487	G	6	6	2635445	2635450	0 %	0 %	100 %	0 %	512552233
51063	NC_021487	G	7	7	2635466	2635472	0 %	0 %	100 %	0 %	512552233
51064	NC_021487	GCA	2	6	2635493	2635498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552233
51065	NC_021487	G	6	6	2635516	2635521	0 %	0 %	100 %	0 %	512552233
51066	NC_021487	GAT	2	6	2635529	2635534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552233
51067	NC_021487	CAA	2	6	2635645	2635650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552233
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51069	NC_021487	TCG	2	6	2635757	2635762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552234
51070	NC_021487	CTG	2	6	2635912	2635917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552234
51071	NC_021487	GC	3	6	2635933	2635938	0 %	0 %	50 %	50 %	512552234
51072	NC_021487	GTC	2	6	2636026	2636031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552234
51073	NC_021487	T	6	6	2636038	2636043	0 %	100 %	0 %	0 %	512552234
51074	NC_021487	TGT	2	6	2636060	2636065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552234
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51076	NC_021487	CCGG	2	8	2636093	2636100	0 %	0 %	50 %	50 %	512552234
51077	NC_021487	T	6	6	2636133	2636138	0 %	100 %	0 %	0 %	512552234
51078	NC_021487	AG	3	6	2636149	2636154	50 %	0 %	50 %	0 %	512552234
51079	NC_021487	TCA	2	6	2636169	2636174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552234
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51082	NC_021487	CTG	2	6	2636227	2636232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552234
51083	NC_021487	TTC	2	6	2636406	2636411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51084	NC_021487	TGT	2	6	2636467	2636472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51085	NC_021487	CAAG	2	8	2636489	2636496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51086	NC_021487	AAG	2	6	2636498	2636503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51087	NC_021487	CAT	2	6	2636559	2636564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51088	NC_021487	CTC	2	6	2636593	2636598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51089	NC_021487	CCTC	2	8	2636641	2636648	0 %	25 %	0 %	75 %	512552235
51090	NC_021487	GGCCC	2	10	2636702	2636711	0 %	0 %	40 %	60 %	512552235
51091	NC_021487	GCCC	2	8	2636774	2636781	0 %	0 %	25 %	75 %	512552235
51092	NC_021487	GTC	2	6	2636883	2636888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552235
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51095	NC_021487	GC	4	8	2636969	2636976	0 %	0 %	50 %	50 %	512552235
51096	NC_021487	GAAG	2	8	2637065	2637072	50 %	0 %	50 %	0 %	512552235
51097	NC_021487	TGC	2	6	2637077	2637082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552235
51098	NC_021487	GT	3	6	2637203	2637208	0 %	50 %	50 %	0 %	512552235
51099	NC_021487	TGA	2	6	2637215	2637220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552235
51100	NC_021487	ATG	2	6	2637253	2637258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552235
51101	NC_021487	G	7	7	2637269	2637275	0 %	0 %	100 %	0 %	512552235
51102	NC_021487	CCA	2	6	2637367	2637372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552235
51103	NC_021487	GC	3	6	2637373	2637378	0 %	0 %	50 %	50 %	512552235
51104	NC_021487	TAG	2	6	2637388	2637393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552235
51105	NC_021487	GCC	2	6	2637513	2637518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552235
51106	NC_021487	GTT	2	6	2637615	2637620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552235
51107	NC_021487	CAA	2	6	2637632	2637637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552235
51108	NC_021487	TCG	2	6	2637763	2637768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552235
51109	NC_021487	ATA	2	6	2637856	2637861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552235
51110	NC_021487	GAT	2	6	2637918	2637923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552235
51111	NC_021487	TGC	2	6	2637985	2637990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552235
51112	NC_021487	ATC	2	6	2638132	2638137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552235
51113	NC_021487	AAT	2	6	2638155	2638160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552235
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51115	NC_021487	TTG	2	6	2638392	2638397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552235
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51237	NC_021487	CG	3	6	2645137	2645142	0 %	0 %	50 %	50 %	512552238
51238	NC_021487	ATG	2	6	2645144	2645149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552238
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51353	NC_021487	CTT	3	9	2650467	2650475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552243
51354	NC_021487	GA	3	6	2650478	2650483	50 %	0 %	50 %	0 %	512552243
51355	NC_021487	GCG	2	6	2650622	2650627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552243
51356	NC_021487	GA	3	6	2650663	2650668	50 %	0 %	50 %	0 %	512552243
51357	NC_021487	GC	3	6	2650687	2650692	0 %	0 %	50 %	50 %	512552243
51358	NC_021487	GCC	2	6	2650722	2650727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552243
51359	NC_021487	GTT	2	6	2650741	2650746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552243
51360	NC_021487	TCTA	2	8	2650849	2650856	25 %	50 %	0 %	25 %	512552243
51361	NC_021487	GAG	2	6	2650994	2650999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552243
51362	NC_021487	TC	3	6	2651236	2651241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51363	NC_021487	T	6	6	2651298	2651303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51364	NC_021487	A	7	7	2651356	2651362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51365	NC_021487	T	6	6	2651363	2651368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51366	NC_021487	CTC	2	6	2651374	2651379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51367	NC_021487	CTTG	2	8	2651413	2651420	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51368	NC_021487	CGAT	2	8	2651523	2651530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51369	NC_021487	AGA	2	6	2651626	2651631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552244
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51372	NC_021487	CTG	2	6	2651775	2651780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552244
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51379	NC_021487	ACG	2	6	2652319	2652324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552244
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51384	NC_021487	TCC	2	6	2652549	2652554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552245
51385	NC_021487	CTC	2	6	2652583	2652588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552245
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51388	NC_021487	GA	3	6	2652821	2652826	50 %	0 %	50 %	0 %	512552246
51389	NC_021487	ATGGG	2	10	2652918	2652927	20 %	20 %	60 %	0 %	512552246
51390	NC_021487	TAT	2	6	2652928	2652933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552246
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51396	NC_021487	A	7	7	2653465	2653471	100 %	0 %	0 %	0 %	512552246
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51400	NC_021487	TGCC	2	8	2653561	2653568	0 %	25 %	25 %	50 %	512552246
51401	NC_021487	CCAA	2	8	2653585	2653592	50 %	0 %	0 %	50 %	512552246
51402	NC_021487	GGA	2	6	2653627	2653632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552246
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51409	NC_021487	TAG	2	6	2653939	2653944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552246
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51419	NC_021487	T	6	6	2654471	2654476	0 %	100 %	0 %	0 %	512552247
51420	NC_021487	GAT	2	6	2654500	2654505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552247
51421	NC_021487	TAG	2	6	2654531	2654536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552247
51422	NC_021487	GTA	2	6	2654710	2654715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552247
51423	NC_021487	GCC	2	6	2654728	2654733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552247
51424	NC_021487	ACAA	2	8	2654885	2654892	75 %	0 %	0 %	25 %	512552247
51425	NC_021487	CCTGG	2	10	2655135	2655144	0 %	20 %	40 %	40 %	512552247
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51429	NC_021487	TTGCC	2	10	2655248	2655257	0 %	40 %	20 %	40 %	512552247
51430	NC_021487	TAG	2	6	2655524	2655529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552247
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51432	NC_021487	GAT	2	6	2655613	2655618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552247
51433	NC_021487	TGT	2	6	2655624	2655629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552247
51434	NC_021487	TCG	2	6	2655647	2655652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552247
51435	NC_021487	GCC	2	6	2655664	2655669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552247
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51440	NC_021487	TGG	2	6	2655870	2655875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552247
51441	NC_021487	CAA	2	6	2655898	2655903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552247
51442	NC_021487	CCTG	2	8	2656000	2656007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51443	NC_021487	AAC	2	6	2656121	2656126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51444	NC_021487	CTGC	2	8	2656221	2656228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51445	NC_021487	CT	3	6	2656253	2656258	0 %	50 %	0 %	50 %	512552248
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51449	NC_021487	GTCG	2	8	2656477	2656484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51450	NC_021487	CGTT	2	8	2656532	2656539	0 %	50 %	25 %	25 %	512552249
51451	NC_021487	CT	3	6	2656556	2656561	0 %	50 %	0 %	50 %	512552249
51452	NC_021487	GC	4	8	2656583	2656590	0 %	0 %	50 %	50 %	512552249
51453	NC_021487	CCT	2	6	2656640	2656645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552249
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51457	NC_021487	CATTC	2	10	2656895	2656904	20 %	40 %	0 %	40 %	512552249
51458	NC_021487	ACG	2	6	2656958	2656963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552249
51459	NC_021487	CT	3	6	2656988	2656993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51460	NC_021487	AGG	2	6	2657038	2657043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51461	NC_021487	AG	3	6	2657048	2657053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51462	NC_021487	CGCT	2	8	2657066	2657073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51463	NC_021487	ACC	2	6	2657087	2657092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51464	NC_021487	AGG	2	6	2657162	2657167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51465	NC_021487	GAG	2	6	2657258	2657263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51466	NC_021487	GGT	2	6	2657269	2657274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552250
51467	NC_021487	TG	3	6	2657302	2657307	0 %	50 %	50 %	0 %	512552250
51468	NC_021487	GCT	2	6	2657322	2657327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552250
51469	NC_021487	GCT	3	9	2657345	2657353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552250
51470	NC_021487	GGC	2	6	2657434	2657439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552250
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51472	NC_021487	TGG	2	6	2657755	2657760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552250
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