MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50502	NC_021487	TG	3	6	2603556	2603561	0 %	50 %	50 %	0 %	512552207
50503	NC_021487	GTC	2	6	2603564	2603569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552207
50504	NC_021487	CGTCA	2	10	2603600	2603609	20 %	20 %	20 %	40 %	512552207
50505	NC_021487	AGT	2	6	2603677	2603682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552207
50506	NC_021487	GCA	2	6	2603688	2603693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552207
50507	NC_021487	T	6	6	2603733	2603738	0 %	100 %	0 %	0 %	512552207
50508	NC_021487	GTT	2	6	2603777	2603782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552207
50509	NC_021487	GCA	2	6	2603830	2603835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552207
50510	NC_021487	GGC	2	6	2603885	2603890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552207
50511	NC_021487	AGT	2	6	2603908	2603913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552207
50512	NC_021487	TTC	2	6	2604012	2604017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552207
50513	NC_021487	CGC	2	6	2604067	2604072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552207
50514	NC_021487	TGG	2	6	2604099	2604104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552207
50515	NC_021487	GAT	2	6	2604122	2604127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552207
50516	NC_021487	CCT	2	6	2604136	2604141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552207
50517	NC_021487	TGA	2	6	2604214	2604219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552207
50518	NC_021487	CATATC	2	12	2604341	2604352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552207
50519	NC_021487	GAA	2	6	2604422	2604427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552207
50520	NC_021487	GTT	2	6	2604437	2604442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552207
50521	NC_021487	TCC	2	6	2604465	2604470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552207
50522	NC_021487	AGA	2	6	2604583	2604588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552207
50523	NC_021487	TGC	2	6	2604696	2604701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552207
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50525	NC_021487	CAG	2	6	2604731	2604736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552207
50526	NC_021487	CGG	2	6	2604751	2604756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552207
50527	NC_021487	CGG	2	6	2604793	2604798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552207
50528	NC_021487	TGT	2	6	2604832	2604837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552207
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50530	NC_021487	CGC	2	6	2604965	2604970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50531	NC_021487	AGG	2	6	2604991	2604996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50532	NC_021487	TAT	2	6	2604997	2605002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50533	NC_021487	T	7	7	2605013	2605019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50534	NC_021487	GTAGCC	2	12	2605071	2605082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512552208
50535	NC_021487	AGCC	2	8	2605125	2605132	25 %	0 %	25 %	50 %	512552208
50536	NC_021487	TC	3	6	2605134	2605139	0 %	50 %	0 %	50 %	512552208
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50538	NC_021487	CGT	2	6	2605197	2605202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552208
50539	NC_021487	TGC	2	6	2605234	2605239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552208
50540	NC_021487	GCA	2	6	2605259	2605264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552208
50541	NC_021487	GC	3	6	2605266	2605271	0 %	0 %	50 %	50 %	512552208
50542	NC_021487	GAG	2	6	2605278	2605283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552208
50543	NC_021487	CAG	2	6	2605296	2605301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552208
50544	NC_021487	CTG	2	6	2605356	2605361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552208
50545	NC_021487	GAG	2	6	2605373	2605378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552208
50546	NC_021487	CGG	2	6	2605489	2605494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552208
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50549	NC_021487	CTG	3	9	2605806	2605814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552208
50550	NC_021487	GAG	2	6	2605818	2605823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552208
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50555	NC_021487	GCA	2	6	2606063	2606068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552209
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50588	NC_021487	GGA	2	6	2608144	2608149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50589	NC_021487	TGT	2	6	2608217	2608222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50590	NC_021487	ATCT	2	8	2608337	2608344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50591	NC_021487	CA	3	6	2608369	2608374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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50593	NC_021487	CT	3	6	2608542	2608547	0 %	50 %	0 %	50 %	512552211
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50612	NC_021487	CGAC	2	8	2609840	2609847	25 %	0 %	25 %	50 %	512552212
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50616	NC_021487	TTG	2	6	2610062	2610067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552212
50617	NC_021487	AAG	2	6	2610106	2610111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552212
50618	NC_021487	TCC	2	6	2610313	2610318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552212
50619	NC_021487	CGT	2	6	2610324	2610329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50620	NC_021487	AAG	2	6	2610416	2610421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50621	NC_021487	AG	3	6	2610496	2610501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50622	NC_021487	GCG	2	6	2610518	2610523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50624	NC_021487	GAG	2	6	2610549	2610554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50625	NC_021487	ACG	2	6	2610604	2610609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552213
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50643	NC_021487	GA	3	6	2611633	2611638	50 %	0 %	50 %	0 %	512552213
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50683	NC_021487	GCC	2	6	2613699	2613704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552214
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50705	NC_021487	A	6	6	2614760	2614765	100 %	0 %	0 %	0 %	512552216
50706	NC_021487	TGA	2	6	2614776	2614781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552216
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50710	NC_021487	GAG	3	9	2614916	2614924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552216
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50714	NC_021487	AC	3	6	2615008	2615013	50 %	0 %	0 %	50 %	512552217
50715	NC_021487	CGT	2	6	2615043	2615048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552217
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50720	NC_021487	CCCTA	2	10	2615306	2615315	20 %	20 %	0 %	60 %	512552217
50721	NC_021487	CT	3	6	2615362	2615367	0 %	50 %	0 %	50 %	512552217
50722	NC_021487	AG	3	6	2615540	2615545	50 %	0 %	50 %	0 %	512552217
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50727	NC_021487	GGC	2	6	2615708	2615713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552217
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50733	NC_021487	CG	3	6	2616470	2616475	0 %	0 %	50 %	50 %	512552218
50734	NC_021487	ATC	2	6	2616493	2616498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552218
50735	NC_021487	CTA	2	6	2616516	2616521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552218
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50749	NC_021487	GGGC	2	8	2617307	2617314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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50834	NC_021487	GTT	2	6	2622086	2622091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552224
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50848	NC_021487	CG	3	6	2623026	2623031	0 %	0 %	50 %	50 %	512552224
50849	NC_021487	ATG	2	6	2623063	2623068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552224
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50851	NC_021487	TGG	2	6	2623115	2623120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552224
50852	NC_021487	TGCT	2	8	2623163	2623170	0 %	50 %	25 %	25 %	512552224
50853	NC_021487	AGC	2	6	2623201	2623206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552224
50854	NC_021487	G	6	6	2623252	2623257	0 %	0 %	100 %	0 %	512552224
50855	NC_021487	AGG	2	6	2623501	2623506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50864	NC_021487	GTA	2	6	2624249	2624254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552225
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50871	NC_021487	GCCAA	2	10	2624529	2624538	40 %	0 %	20 %	40 %	512552225
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