MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021050	CAACA	2	10	839276	839285	60 %	0 %	0 %	40 %	482545820
18502	NC_021050	GA	3	6	839286	839291	50 %	0 %	50 %	0 %	482545820
18503	NC_021050	GA	3	6	839326	839331	50 %	0 %	50 %	0 %	482545820
18504	NC_021050	CTT	2	6	839335	839340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545820
18505	NC_021050	CTCC	2	8	839514	839521	0 %	25 %	0 %	75 %	482545820
18506	NC_021050	T	6	6	839535	839540	0 %	100 %	0 %	0 %	482545820
18507	NC_021050	CTT	2	6	839554	839559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545820
18508	NC_021050	TTG	2	6	839588	839593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545820
18509	NC_021050	CT	3	6	839750	839755	0 %	50 %	0 %	50 %	482545820
18510	NC_021050	AAG	2	6	839797	839802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545820
18511	NC_021050	GAG	2	6	839935	839940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545820
18512	NC_021050	CTT	2	6	840012	840017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545820
18513	NC_021050	AGA	2	6	840077	840082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545820
18514	NC_021050	CTG	2	6	840088	840093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545820
18515	NC_021050	TCA	2	6	840180	840185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545820
18516	NC_021050	TAA	2	6	840215	840220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545820
18517	NC_021050	CCT	2	6	840261	840266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545820
18518	NC_021050	TCT	2	6	840448	840453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545820
18519	NC_021050	TAC	2	6	840464	840469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545820
18520	NC_021050	TGT	2	6	840654	840659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545820
18521	NC_021050	AGC	2	6	840665	840670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545820
18522	NC_021050	TTC	2	6	840671	840676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545820
18523	NC_021050	GCC	2	6	840948	840953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482545820
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18525	NC_021050	AGC	2	6	841091	841096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545820
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18528	NC_021050	CAA	2	6	841180	841185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545820
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18536	NC_021050	AAG	2	6	841585	841590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545820
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18539	NC_021050	ACA	2	6	841647	841652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545820
18540	NC_021050	AATA	2	8	841706	841713	75 %	25 %	0 %	0 %	482545820
18541	NC_021050	TCT	2	6	841722	841727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545820
18542	NC_021050	TGC	2	6	841770	841775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545820
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18544	NC_021050	AAT	3	9	841973	841981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545820
18545	NC_021050	GAAG	2	8	842078	842085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_021050	AT	3	6	842104	842109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18547	NC_021050	AAAG	2	8	842117	842124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_021050	T	6	6	842165	842170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_021050	TTGGA	2	10	842188	842197	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_021050	T	6	6	842211	842216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_021050	ACA	2	6	842219	842224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18552	NC_021050	AACC	2	8	842252	842259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18553	NC_021050	A	7	7	842323	842329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18554	NC_021050	T	6	6	842345	842350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_021050	A	7	7	842396	842402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_021050	AGA	2	6	842449	842454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545821
18557	NC_021050	AAAG	2	8	842462	842469	75 %	0 %	25 %	0 %	482545821
18558	NC_021050	CAA	2	6	842518	842523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545821
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18560	NC_021050	TTG	2	6	842706	842711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545821
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18562	NC_021050	A	7	7	842789	842795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_021050	CTAA	2	8	842810	842817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18564	NC_021050	AAT	2	6	842834	842839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_021050	ACTT	2	8	842844	842851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18566	NC_021050	GCT	2	6	842935	842940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18567	NC_021050	CAAAA	2	10	842954	842963	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18568	NC_021050	AGA	2	6	843012	843017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18569	NC_021050	ATA	2	6	843046	843051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_021050	CTA	2	6	843120	843125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18571	NC_021050	TCCC	2	8	843282	843289	0 %	25 %	0 %	75 %	482545822
18572	NC_021050	CAT	3	9	843302	843310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545822
18573	NC_021050	TCG	2	6	843320	843325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545822
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18578	NC_021050	ACA	2	6	843613	843618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545822
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18580	NC_021050	ATTA	2	8	843675	843682	50 %	50 %	0 %	0 %	482545822
18581	NC_021050	A	7	7	843741	843747	100 %	0 %	0 %	0 %	482545822
18582	NC_021050	CAA	2	6	843957	843962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545822
18583	NC_021050	TAAA	2	8	843980	843987	75 %	25 %	0 %	0 %	482545822
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18590	NC_021050	TTCT	2	8	844307	844314	0 %	75 %	0 %	25 %	482545824
18591	NC_021050	CTT	2	6	844315	844320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545824
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18596	NC_021050	CTT	2	6	844537	844542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545824
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18604	NC_021050	TCC	2	6	844872	844877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545824
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18606	NC_021050	CAGGAA	2	12	844931	844942	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482545825
18607	NC_021050	AAG	2	6	845048	845053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545825
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18610	NC_021050	TTTC	2	8	845087	845094	0 %	75 %	0 %	25 %	482545825
18611	NC_021050	AAG	2	6	845165	845170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545825
18612	NC_021050	TCT	2	6	845318	845323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545825
18613	NC_021050	ACG	2	6	845352	845357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545825
18614	NC_021050	CCTC	2	8	845367	845374	0 %	25 %	0 %	75 %	482545825
18615	NC_021050	CAA	2	6	845434	845439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545825
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18617	NC_021050	AGA	2	6	845607	845612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545826
18618	NC_021050	AAGC	2	8	845629	845636	50 %	0 %	25 %	25 %	482545826
18619	NC_021050	TAT	2	6	845657	845662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545826
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18622	NC_021050	ATTC	2	8	845758	845765	25 %	50 %	0 %	25 %	482545826
18623	NC_021050	TGC	2	6	845822	845827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545826
18624	NC_021050	GCT	2	6	845838	845843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545826
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18991	NC_021050	GTT	2	6	861120	861125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545840
18992	NC_021050	TAC	2	6	861143	861148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545840
18993	NC_021050	TTA	2	6	861238	861243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545841
18994	NC_021050	GAT	2	6	861249	861254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545841
18995	NC_021050	CTT	2	6	861270	861275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545841
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