MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021050	TGA	2	6	637608	637613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545645
14002	NC_021050	TGC	2	6	637623	637628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545645
14003	NC_021050	CT	3	6	637636	637641	0 %	50 %	0 %	50 %	482545645
14004	NC_021050	TTC	2	6	637664	637669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545645
14005	NC_021050	A	6	6	637769	637774	100 %	0 %	0 %	0 %	482545645
14006	NC_021050	GCT	2	6	637822	637827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545645
14007	NC_021050	TGA	2	6	637836	637841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545645
14008	NC_021050	AGA	2	6	637844	637849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545645
14009	NC_021050	ACA	2	6	637878	637883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545645
14010	NC_021050	GAA	2	6	637900	637905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545645
14011	NC_021050	TGA	2	6	637920	637925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545645
14012	NC_021050	AGT	2	6	637941	637946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545645
14013	NC_021050	AAAG	2	8	638028	638035	75 %	0 %	25 %	0 %	482545645
14014	NC_021050	CGT	2	6	638080	638085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545645
14015	NC_021050	TCCT	2	8	638125	638132	0 %	50 %	0 %	50 %	482545645
14016	NC_021050	GCA	2	6	638172	638177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545645
14017	NC_021050	GGA	2	6	638197	638202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545645
14018	NC_021050	GAT	2	6	638262	638267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545645
14019	NC_021050	TCC	2	6	638274	638279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545645
14020	NC_021050	CGC	2	6	638329	638334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482545645
14021	NC_021050	TGTGT	2	10	638341	638350	0 %	60 %	40 %	0 %	482545645
14022	NC_021050	TGA	2	6	638355	638360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545645
14023	NC_021050	CAT	3	9	638463	638471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545645
14024	NC_021050	GTG	2	6	638510	638515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545645
14025	NC_021050	TGC	2	6	638574	638579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545645
14026	NC_021050	AAG	2	6	638584	638589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545645
14027	NC_021050	AAG	2	6	638651	638656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545645
14028	NC_021050	TAA	2	6	638685	638690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545645
14029	NC_021050	GGA	2	6	638823	638828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545645
14030	NC_021050	AAG	2	6	638867	638872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545645
14031	NC_021050	CG	4	8	638884	638891	0 %	0 %	50 %	50 %	482545645
14032	NC_021050	AGA	2	6	638898	638903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545645
14033	NC_021050	GTT	2	6	638908	638913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545645
14034	NC_021050	AGA	3	9	638922	638930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545645
14035	NC_021050	TGA	2	6	638982	638987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545645
14036	NC_021050	CTC	3	9	639007	639015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545646
14037	NC_021050	TAAAG	2	10	639228	639237	60 %	20 %	20 %	0 %	482545646
14038	NC_021050	GAT	2	6	639238	639243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545646
14039	NC_021050	TCC	2	6	639314	639319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545646
14040	NC_021050	TAA	2	6	639351	639356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545646
14041	NC_021050	TGT	2	6	639384	639389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545646
14042	NC_021050	AAT	2	6	639401	639406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545646
14043	NC_021050	T	7	7	639488	639494	0 %	100 %	0 %	0 %	482545646
14044	NC_021050	CTT	2	6	639514	639519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545646
14045	NC_021050	CTC	2	6	639664	639669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545646
14046	NC_021050	AAT	2	6	639673	639678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545646
14047	NC_021050	A	6	6	639690	639695	100 %	0 %	0 %	0 %	482545646
14048	NC_021050	CTT	2	6	639716	639721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545646
14049	NC_021050	TAA	2	6	639725	639730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545646
14050	NC_021050	ATGGA	2	10	639853	639862	40 %	20 %	40 %	0 %	482545646
14051	NC_021050	CAA	2	6	639958	639963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545646
14052	NC_021050	CTT	2	6	639980	639985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545646
14053	NC_021050	CAA	2	6	639997	640002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545646
14054	NC_021050	CTC	2	6	640015	640020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545646
14055	NC_021050	CAA	2	6	640030	640035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545646
14056	NC_021050	CAT	2	6	640104	640109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_021050	A	7	7	640116	640122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_021050	A	7	7	640130	640136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_021050	GCC	2	6	640149	640154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14060	NC_021050	AATT	2	8	640183	640190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_021050	A	6	6	640200	640205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_021050	TTG	2	6	640221	640226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_021050	A	7	7	640228	640234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_021050	ATA	2	6	640251	640256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_021050	TCA	2	6	640300	640305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545647
14066	NC_021050	GAG	2	6	640461	640466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545647
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14068	NC_021050	TGC	2	6	640498	640503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545647
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14071	NC_021050	AAAACA	2	12	640567	640578	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	482545647
14072	NC_021050	A	8	8	640722	640729	100 %	0 %	0 %	0 %	482545647
14073	NC_021050	AAG	2	6	640737	640742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545647
14074	NC_021050	CT	4	8	640811	640818	0 %	50 %	0 %	50 %	482545647
14075	NC_021050	GAG	2	6	640845	640850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545647
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14079	NC_021050	TA	3	6	641001	641006	50 %	50 %	0 %	0 %	482545647
14080	NC_021050	GTC	2	6	641060	641065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545647
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14085	NC_021050	CTT	2	6	641326	641331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545647
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14089	NC_021050	CTTA	2	8	641457	641464	25 %	50 %	0 %	25 %	482545647
14090	NC_021050	TAA	2	6	641476	641481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545647
14091	NC_021050	CGA	2	6	641482	641487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545647
14092	NC_021050	TAAA	2	8	641559	641566	75 %	25 %	0 %	0 %	482545647
14093	NC_021050	ACG	2	6	641587	641592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545647
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14102	NC_021050	CT	3	6	641930	641935	0 %	50 %	0 %	50 %	482545647
14103	NC_021050	ACA	2	6	641941	641946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545647
14104	NC_021050	TTC	2	6	641981	641986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_021050	AAAAAG	2	12	641996	642007	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_021050	CCT	4	12	642080	642091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545648
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14109	NC_021050	TACA	2	8	642180	642187	50 %	25 %	0 %	25 %	482545648
14110	NC_021050	AAG	2	6	642222	642227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545648
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14113	NC_021050	TAT	2	6	642297	642302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545648
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14115	NC_021050	TCA	2	6	642389	642394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545648
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14121	NC_021050	TTC	2	6	642694	642699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545648
14122	NC_021050	CTTT	2	8	642742	642749	0 %	75 %	0 %	25 %	482545648
14123	NC_021050	ATC	2	6	642751	642756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545648
14124	NC_021050	TTCT	2	8	642787	642794	0 %	75 %	0 %	25 %	482545648
14125	NC_021050	GTT	2	6	642803	642808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545648
14126	NC_021050	T	6	6	642814	642819	0 %	100 %	0 %	0 %	482545648
14127	NC_021050	ACT	2	6	642833	642838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545648
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14129	NC_021050	GCT	2	6	642885	642890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545648
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14132	NC_021050	T	7	7	642984	642990	0 %	100 %	0 %	0 %	482545648
14133	NC_021050	T	6	6	642997	643002	0 %	100 %	0 %	0 %	482545648
14134	NC_021050	ATA	2	6	643061	643066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545648
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14136	NC_021050	T	7	7	643251	643257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14137	NC_021050	AAGA	2	8	643333	643340	75 %	0 %	25 %	0 %	482545649
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14146	NC_021050	CCCCT	2	10	643695	643704	0 %	20 %	0 %	80 %	482545649
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14166	NC_021050	GCTA	2	8	644659	644666	25 %	25 %	25 %	25 %	482545651
14167	NC_021050	GAAC	2	8	644678	644685	50 %	0 %	25 %	25 %	482545651
14168	NC_021050	CT	3	6	644739	644744	0 %	50 %	0 %	50 %	482545651
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14245	NC_021050	AGG	2	6	647950	647955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545654
14246	NC_021050	AAAT	2	8	648043	648050	75 %	25 %	0 %	0 %	482545654
14247	NC_021050	TCT	2	6	648144	648149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545654
14248	NC_021050	CT	3	6	648289	648294	0 %	50 %	0 %	50 %	482545654
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14251	NC_021050	TTAG	2	8	648581	648588	25 %	50 %	25 %	0 %	482545655
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14259	NC_021050	ATC	2	6	648843	648848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545655
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14261	NC_021050	CCT	2	6	648919	648924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545655
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14263	NC_021050	A	6	6	649146	649151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14264	NC_021050	GCA	2	6	649159	649164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545656
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14282	NC_021050	TGC	2	6	649810	649815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545656
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14332	NC_021050	T	6	6	651977	651982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14333	NC_021050	CTG	2	6	652031	652036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14334	NC_021050	TAC	2	6	652071	652076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14335	NC_021050	TAA	2	6	652117	652122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14336	NC_021050	CTC	2	6	652123	652128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14337	NC_021050	GCAAC	2	10	652137	652146	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14338	NC_021050	GAA	2	6	652172	652177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14339	NC_021050	CTTGT	2	10	652197	652206	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14340	NC_021050	C	6	6	652244	652249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14341	NC_021050	CAGT	2	8	652259	652266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14342	NC_021050	TCA	2	6	652316	652321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545659
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14346	NC_021050	A	6	6	652374	652379	100 %	0 %	0 %	0 %	482545659
14347	NC_021050	TGG	2	6	652381	652386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545659
14348	NC_021050	TTGT	2	8	652400	652407	0 %	75 %	25 %	0 %	482545659
14349	NC_021050	CTG	2	6	652415	652420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545659
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14353	NC_021050	GTT	2	6	652544	652549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545659
14354	NC_021050	CTG	2	6	652612	652617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545659
14355	NC_021050	TCA	2	6	652627	652632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545659
14356	NC_021050	CCTTT	2	10	652656	652665	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14357	NC_021050	T	7	7	652693	652699	0 %	100 %	0 %	0 %	482545660
14358	NC_021050	A	7	7	652704	652710	100 %	0 %	0 %	0 %	482545660
14359	NC_021050	GAA	3	9	652778	652786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545660
14360	NC_021050	TCT	2	6	652811	652816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545660
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14362	NC_021050	AAT	2	6	652838	652843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545660
14363	NC_021050	AT	3	6	652847	652852	50 %	50 %	0 %	0 %	482545660
14364	NC_021050	CA	3	6	652860	652865	50 %	0 %	0 %	50 %	482545660
14365	NC_021050	GCTC	2	8	653035	653042	0 %	25 %	25 %	50 %	482545660
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14367	NC_021050	CTC	2	6	653097	653102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545660
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