MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021050	TGA	2	6	593080	593085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545605
13003	NC_021050	AGGAG	2	10	593119	593128	40 %	0 %	60 %	0 %	482545605
13004	NC_021050	GCT	2	6	593219	593224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545605
13005	NC_021050	TGGAAT	2	12	593230	593241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545605
13006	NC_021050	AGC	2	6	593245	593250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545605
13007	NC_021050	ATT	2	6	593270	593275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545605
13008	NC_021050	TC	3	6	593295	593300	0 %	50 %	0 %	50 %	482545605
13009	NC_021050	TGC	2	6	593305	593310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545605
13010	NC_021050	GCA	2	6	593330	593335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545605
13011	NC_021050	TAT	2	6	593342	593347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545605
13012	NC_021050	GCT	2	6	593399	593404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545605
13013	NC_021050	CTT	2	6	593507	593512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545605
13014	NC_021050	AAC	2	6	593531	593536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545605
13015	NC_021050	AGA	2	6	593593	593598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545605
13016	NC_021050	AAG	2	6	593634	593639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545605
13017	NC_021050	GCT	2	6	593693	593698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545605
13018	NC_021050	AAC	2	6	593709	593714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545605
13019	NC_021050	CT	3	6	593723	593728	0 %	50 %	0 %	50 %	482545605
13020	NC_021050	ACGA	2	8	593746	593753	50 %	0 %	25 %	25 %	482545605
13021	NC_021050	CTC	2	6	593777	593782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545605
13022	NC_021050	A	7	7	593792	593798	100 %	0 %	0 %	0 %	482545605
13023	NC_021050	TTGTC	2	10	593806	593815	0 %	60 %	20 %	20 %	482545605
13024	NC_021050	GAA	2	6	593819	593824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545605
13025	NC_021050	ATT	2	6	593829	593834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545605
13026	NC_021050	ACG	2	6	593861	593866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545605
13027	NC_021050	ATC	2	6	593895	593900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545605
13028	NC_021050	CTC	2	6	593901	593906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545605
13029	NC_021050	ATA	2	6	593940	593945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545605
13030	NC_021050	A	6	6	594000	594005	100 %	0 %	0 %	0 %	482545605
13031	NC_021050	A	6	6	594090	594095	100 %	0 %	0 %	0 %	482545606
13032	NC_021050	TGGT	2	8	594179	594186	0 %	50 %	50 %	0 %	482545606
13033	NC_021050	AAG	2	6	594205	594210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545606
13034	NC_021050	GAA	2	6	594297	594302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545606
13035	NC_021050	TGT	2	6	594305	594310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545606
13036	NC_021050	ATG	2	6	594390	594395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545606
13037	NC_021050	TCCG	2	8	594400	594407	0 %	25 %	25 %	50 %	482545606
13038	NC_021050	ACC	2	6	594410	594415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545606
13039	NC_021050	CTC	2	6	594424	594429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545606
13040	NC_021050	A	7	7	594476	594482	100 %	0 %	0 %	0 %	482545606
13041	NC_021050	CT	3	6	594507	594512	0 %	50 %	0 %	50 %	482545606
13042	NC_021050	GGA	2	6	594534	594539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545606
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13044	NC_021050	CTC	2	6	594568	594573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545606
13045	NC_021050	TA	3	6	594630	594635	50 %	50 %	0 %	0 %	482545606
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13050	NC_021050	CT	3	6	594783	594788	0 %	50 %	0 %	50 %	482545606
13051	NC_021050	ATTGT	2	10	594796	594805	20 %	60 %	20 %	0 %	482545606
13052	NC_021050	AATT	2	8	594842	594849	50 %	50 %	0 %	0 %	482545606
13053	NC_021050	ATT	2	6	594876	594881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545606
13054	NC_021050	A	6	6	594962	594967	100 %	0 %	0 %	0 %	482545606
13055	NC_021050	CAG	2	6	595017	595022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545606
13056	NC_021050	AGA	3	9	595031	595039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545606
13057	NC_021050	AGG	2	6	595046	595051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545606
13058	NC_021050	TTCT	2	8	595052	595059	0 %	75 %	0 %	25 %	482545606
13059	NC_021050	TCC	2	6	595112	595117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545606
13060	NC_021050	GCT	2	6	595122	595127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545606
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13062	NC_021050	AGCT	2	8	595177	595184	25 %	25 %	25 %	25 %	482545606
13063	NC_021050	TGAT	2	8	595228	595235	25 %	50 %	25 %	0 %	482545606
13064	NC_021050	CTC	2	6	595275	595280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545606
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13066	NC_021050	CTT	2	6	595327	595332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_021050	TCT	2	6	595333	595338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545607
13068	NC_021050	AAG	2	6	595339	595344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545607
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13070	NC_021050	CTT	2	6	595436	595441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545607
13071	NC_021050	TA	3	6	595493	595498	50 %	50 %	0 %	0 %	482545607
13072	NC_021050	TCT	2	6	595578	595583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545607
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13075	NC_021050	CCAT	2	8	595755	595762	25 %	25 %	0 %	50 %	482545607
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13088	NC_021050	CTTC	2	8	596529	596536	0 %	50 %	0 %	50 %	482545607
13089	NC_021050	ATA	2	6	596541	596546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545607
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13093	NC_021050	TC	3	6	596675	596680	0 %	50 %	0 %	50 %	482545607
13094	NC_021050	GAA	2	6	596692	596697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545607
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13100	NC_021050	ATGCT	2	10	597195	597204	20 %	40 %	20 %	20 %	482545607
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13102	NC_021050	CAT	2	6	597439	597444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545607
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13108	NC_021050	ACC	2	6	597622	597627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545607
13109	NC_021050	CCAT	2	8	597634	597641	25 %	25 %	0 %	50 %	482545607
13110	NC_021050	GAG	2	6	597694	597699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545607
13111	NC_021050	GCTT	2	8	597735	597742	0 %	50 %	25 %	25 %	482545607
13112	NC_021050	GTTT	2	8	597802	597809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_021050	ATATTA	2	12	597825	597836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_021050	AAAG	2	8	597837	597844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_021050	A	6	6	597892	597897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021050	T	6	6	597916	597921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_021050	AGG	2	6	597927	597932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_021050	GCA	2	6	598011	598016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545608
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13120	NC_021050	TCT	2	6	598039	598044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545608
13121	NC_021050	GCA	2	6	598069	598074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545608
13122	NC_021050	TTA	2	6	598184	598189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545608
13123	NC_021050	ACG	2	6	598250	598255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545608
13124	NC_021050	GTA	2	6	598284	598289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545608
13125	NC_021050	AGG	2	6	598310	598315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_021050	TGCC	2	8	598325	598332	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_021050	TCT	2	6	598345	598350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545609
13128	NC_021050	TGA	2	6	598374	598379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545609
13129	NC_021050	CT	3	6	598422	598427	0 %	50 %	0 %	50 %	482545609
13130	NC_021050	ATC	2	6	598428	598433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545609
13131	NC_021050	TTC	2	6	598434	598439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545609
13132	NC_021050	GAA	2	6	598465	598470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545609
13133	NC_021050	GA	3	6	598490	598495	50 %	0 %	50 %	0 %	482545609
13134	NC_021050	AAAG	2	8	598522	598529	75 %	0 %	25 %	0 %	482545609
13135	NC_021050	ATA	2	6	598620	598625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545609
13136	NC_021050	CAT	2	6	598688	598693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545609
13137	NC_021050	TAA	2	6	598695	598700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545609
13138	NC_021050	GTT	2	6	598768	598773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545609
13139	NC_021050	GAT	2	6	598801	598806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545609
13140	NC_021050	TTC	2	6	598865	598870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545609
13141	NC_021050	A	6	6	598876	598881	100 %	0 %	0 %	0 %	482545609
13142	NC_021050	TAAT	2	8	598943	598950	50 %	50 %	0 %	0 %	482545609
13143	NC_021050	TTC	2	6	598953	598958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545609
13144	NC_021050	AGA	2	6	598989	598994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545609
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13146	NC_021050	GAA	2	6	599040	599045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545609
13147	NC_021050	CTT	2	6	599048	599053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545609
13148	NC_021050	TCC	2	6	599223	599228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545609
13149	NC_021050	CAG	2	6	599231	599236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545609
13150	NC_021050	GAA	2	6	599336	599341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545609
13151	NC_021050	CACGCG	2	12	599490	599501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482545609
13152	NC_021050	ATT	3	9	599514	599522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545609
13153	NC_021050	TTTCTT	2	12	599669	599680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	482545609
13154	NC_021050	A	6	6	599755	599760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13155	NC_021050	TAC	2	6	599764	599769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13156	NC_021050	TCT	2	6	599793	599798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545610
13157	NC_021050	TGC	2	6	599816	599821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545610
13158	NC_021050	TGT	2	6	599825	599830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545610
13159	NC_021050	TGTT	2	8	599844	599851	0 %	75 %	25 %	0 %	482545610
13160	NC_021050	TTG	2	6	599857	599862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545610
13161	NC_021050	AGA	2	6	599881	599886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545610
13162	NC_021050	AAC	2	6	599939	599944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545610
13163	NC_021050	CAT	2	6	599947	599952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545610
13164	NC_021050	CTT	2	6	599964	599969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545610
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13166	NC_021050	CAG	2	6	600009	600014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545610
13167	NC_021050	CTG	2	6	600022	600027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545610
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13169	NC_021050	TATC	2	8	600132	600139	25 %	50 %	0 %	25 %	482545610
13170	NC_021050	AGCT	2	8	600153	600160	25 %	25 %	25 %	25 %	482545610
13171	NC_021050	CTG	2	6	600319	600324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545610
13172	NC_021050	ACG	2	6	600358	600363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545610
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13175	NC_021050	ATA	2	6	600483	600488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545610
13176	NC_021050	TGC	2	6	600490	600495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545610
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13178	NC_021050	AGA	2	6	600766	600771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545610
13179	NC_021050	GAG	2	6	600846	600851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545610
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13183	NC_021050	AGT	2	6	601021	601026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545610
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13193	NC_021050	GTA	2	6	601480	601485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545610
13194	NC_021050	AC	3	6	601559	601564	50 %	0 %	0 %	50 %	482545610
13195	NC_021050	TCT	2	6	601565	601570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545610
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13198	NC_021050	CTA	2	6	601722	601727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545610
13199	NC_021050	CTT	2	6	601785	601790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545610
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13203	NC_021050	TAC	2	6	601981	601986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545610
13204	NC_021050	GCT	2	6	602031	602036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545610
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13206	NC_021050	ATA	2	6	602124	602129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545610
13207	NC_021050	CGTT	2	8	602131	602138	0 %	50 %	25 %	25 %	482545610
13208	NC_021050	ATTC	2	8	602140	602147	25 %	50 %	0 %	25 %	482545610
13209	NC_021050	GGGA	2	8	602173	602180	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13210	NC_021050	A	7	7	602219	602225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13211	NC_021050	C	6	6	602380	602385	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13212	NC_021050	AT	4	8	602439	602446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13213	NC_021050	CAT	2	6	602459	602464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545611
13214	NC_021050	T	9	9	602464	602472	0 %	100 %	0 %	0 %	482545611
13215	NC_021050	TTC	2	6	602548	602553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545611
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13217	NC_021050	CTG	2	6	602628	602633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545611
13218	NC_021050	CCA	2	6	602753	602758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545611
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13220	NC_021050	CAC	2	6	602944	602949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545611
13221	NC_021050	CCT	2	6	602978	602983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545611
13222	NC_021050	CTCC	2	8	603026	603033	0 %	25 %	0 %	75 %	482545611
13223	NC_021050	AAGC	2	8	603048	603055	50 %	0 %	25 %	25 %	482545611
13224	NC_021050	ATG	2	6	603065	603070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545611
13225	NC_021050	T	6	6	603121	603126	0 %	100 %	0 %	0 %	482545611
13226	NC_021050	CTC	2	6	603127	603132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545611
13227	NC_021050	GAT	2	6	603176	603181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545611
13228	NC_021050	A	7	7	603182	603188	100 %	0 %	0 %	0 %	482545611
13229	NC_021050	AG	3	6	603249	603254	50 %	0 %	50 %	0 %	482545611
13230	NC_021050	CT	3	6	603291	603296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13231	NC_021050	TAAA	2	8	603315	603322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13232	NC_021050	A	6	6	603320	603325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_021050	T	6	6	603340	603345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13234	NC_021050	A	6	6	603360	603365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13235	NC_021050	TC	4	8	603382	603389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13236	NC_021050	T	6	6	603510	603515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13237	NC_021050	CTT	2	6	603552	603557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545612
13238	NC_021050	ACT	2	6	603581	603586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545612
13239	NC_021050	GCTGT	2	10	603594	603603	0 %	40 %	40 %	20 %	482545612
13240	NC_021050	GTC	2	6	603662	603667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545612
13241	NC_021050	T	6	6	603681	603686	0 %	100 %	0 %	0 %	482545612
13242	NC_021050	ACT	2	6	603709	603714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545612
13243	NC_021050	ACT	2	6	603778	603783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545612
13244	NC_021050	TGC	2	6	603814	603819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545612
13245	NC_021050	T	7	7	603824	603830	0 %	100 %	0 %	0 %	482545612
13246	NC_021050	CTCCTA	2	12	603831	603842	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	482545612
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13249	NC_021050	ATC	2	6	604056	604061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545612
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13273	NC_021050	TTTA	2	8	604862	604869	25 %	75 %	0 %	0 %	482545613
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13280	NC_021050	TC	3	6	605130	605135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13281	NC_021050	TTA	2	6	605156	605161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545614
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13283	NC_021050	TTC	2	6	605198	605203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545614
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13488	NC_021050	AAG	2	6	614397	614402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545624
13489	NC_021050	AGC	2	6	614419	614424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545624
13490	NC_021050	AATT	2	8	614438	614445	50 %	50 %	0 %	0 %	482545624
13491	NC_021050	A	6	6	614462	614467	100 %	0 %	0 %	0 %	482545624
13492	NC_021050	GTT	2	6	614472	614477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545624
13493	NC_021050	CAA	2	6	614491	614496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545624
13494	NC_021050	CTA	2	6	614497	614502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545624
13495	NC_021050	AG	3	6	614546	614551	50 %	0 %	50 %	0 %	482545624
13496	NC_021050	CCT	2	6	614586	614591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545624
13497	NC_021050	CAA	2	6	614647	614652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545624
13498	NC_021050	TAT	2	6	614653	614658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545624
13499	NC_021050	AAG	2	6	614669	614674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545624
13500	NC_021050	CTCC	2	8	614713	614720	0 %	25 %	0 %	75 %	482545624

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