MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 75227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021009	ATC	2	6	109	114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136968
2	NC_021009	CTC	2	6	190	195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136968
3	NC_021009	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136968
4	NC_021009	AAT	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136968
5	NC_021009	CGC	2	6	237	242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136968
6	NC_021009	T	6	6	287	292	0 %	100 %	0 %	0 %	479136968
7	NC_021009	T	6	6	419	424	0 %	100 %	0 %	0 %	479136968
8	NC_021009	CATT	2	8	434	441	25 %	50 %	0 %	25 %	479136968
9	NC_021009	TGG	2	6	522	527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136968
10	NC_021009	TGAT	2	8	530	537	25 %	50 %	25 %	0 %	479136968
11	NC_021009	TCC	2	6	561	566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021009	A	6	6	624	629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021009	A	6	6	637	642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021009	AGTA	2	8	690	697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021009	TA	3	6	696	701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021009	AGG	2	6	739	744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021009	TTG	2	6	775	780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136969
18	NC_021009	GTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136969
19	NC_021009	GCA	3	9	811	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
20	NC_021009	GCA	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
21	NC_021009	ATC	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136969
22	NC_021009	AGC	2	6	890	895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
23	NC_021009	CAG	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
24	NC_021009	GCC	2	6	1176	1181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136969
25	NC_021009	TAT	2	6	1235	1240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136969
26	NC_021009	GCA	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
27	NC_021009	ATTC	2	8	1381	1388	25 %	50 %	0 %	25 %	479136969
28	NC_021009	TTA	2	6	1447	1452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136969
29	NC_021009	CAG	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
30	NC_021009	TC	3	6	1542	1547	0 %	50 %	0 %	50 %	479136969
31	NC_021009	CTT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136969
32	NC_021009	GAT	2	6	1704	1709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136969
33	NC_021009	CTG	2	6	1720	1725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136969
34	NC_021009	TGAAGT	2	12	1754	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136969
35	NC_021009	TAT	2	6	1830	1835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021009	GAAG	2	8	2070	2077	50 %	0 %	50 %	0 %	479136970
37	NC_021009	CAG	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
38	NC_021009	TTTAAA	2	12	2154	2165	50 %	50 %	0 %	0 %	479136970
39	NC_021009	CAG	2	6	2284	2289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
40	NC_021009	GCT	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136970
41	NC_021009	TGA	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136970
42	NC_021009	ACA	2	6	2374	2379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136970
43	NC_021009	T	6	6	2383	2388	0 %	100 %	0 %	0 %	479136970
44	NC_021009	TAT	4	12	2424	2435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136970
45	NC_021009	CAG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
46	NC_021009	AGA	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
47	NC_021009	TGA	2	6	2621	2626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136970
48	NC_021009	CAT	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136970
49	NC_021009	TCA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136970
50	NC_021009	AGA	3	9	2771	2779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
51	NC_021009	ATT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136970
52	NC_021009	TGGA	2	8	2798	2805	25 %	25 %	50 %	0 %	479136970
53	NC_021009	ATT	2	6	2905	2910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136970
54	NC_021009	AAG	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
55	NC_021009	A	6	6	2985	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	479136970
56	NC_021009	AAAAG	2	10	2994	3003	80 %	0 %	20 %	0 %	479136970
57	NC_021009	GCA	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
58	NC_021009	GTGC	2	8	3019	3026	0 %	25 %	50 %	25 %	479136970
59	NC_021009	GTT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136970
60	NC_021009	GGT	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136970
61	NC_021009	CAG	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
62	NC_021009	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136970
63	NC_021009	GA	3	6	3099	3104	50 %	0 %	50 %	0 %	479136970
64	NC_021009	GACA	2	8	3108	3115	50 %	0 %	25 %	25 %	479136970
65	NC_021009	CAG	2	6	3184	3189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
66	NC_021009	ATCA	2	8	3193	3200	50 %	25 %	0 %	25 %	479136970
67	NC_021009	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
68	NC_021009	CAG	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
69	NC_021009	AGA	2	6	3315	3320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
70	NC_021009	AGG	2	6	3365	3370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136970
71	NC_021009	AAT	2	6	3377	3382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136970
72	NC_021009	A	7	7	3391	3397	100 %	0 %	0 %	0 %	479136971
73	NC_021009	ATC	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136971
74	NC_021009	TGT	2	6	3596	3601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136971
75	NC_021009	CTT	2	6	3614	3619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136971
76	NC_021009	GGC	2	6	3725	3730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136971
77	NC_021009	GGT	2	6	3744	3749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136971
78	NC_021009	GCA	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136971
79	NC_021009	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136971
80	NC_021009	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136971
81	NC_021009	TGA	2	6	3908	3913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136971
82	NC_021009	GCT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136971
83	NC_021009	GT	3	6	3980	3985	0 %	50 %	50 %	0 %	479136971
84	NC_021009	TCG	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136971
85	NC_021009	AG	3	6	4054	4059	50 %	0 %	50 %	0 %	479136971
86	NC_021009	CAG	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136971
87	NC_021009	GCT	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136971
88	NC_021009	ATC	2	6	4237	4242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136971
89	NC_021009	CAT	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136971
90	NC_021009	GTT	3	9	4353	4361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136971
91	NC_021009	ATT	2	6	4382	4387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136971
92	NC_021009	AGG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136971
93	NC_021009	CAGT	2	8	4455	4462	25 %	25 %	25 %	25 %	479136972
94	NC_021009	ATT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136972
95	NC_021009	CTTT	2	8	4593	4600	0 %	75 %	0 %	25 %	479136972
96	NC_021009	TGGT	2	8	4635	4642	0 %	50 %	50 %	0 %	479136972
97	NC_021009	TA	3	6	4773	4778	50 %	50 %	0 %	0 %	479136972
98	NC_021009	CAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136972
99	NC_021009	ATC	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136972
100	NC_021009	AT	3	6	4897	4902	50 %	50 %	0 %	0 %	479136972
101	NC_021009	TA	3	6	4905	4910	50 %	50 %	0 %	0 %	479136972
102	NC_021009	AGC	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136972
103	NC_021009	TCAA	2	8	5016	5023	50 %	25 %	0 %	25 %	479136972
104	NC_021009	CGG	2	6	5059	5064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136972
105	NC_021009	CGG	2	6	5068	5073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136972
106	NC_021009	GCA	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136972
107	NC_021009	GCA	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136972
108	NC_021009	T	6	6	5263	5268	0 %	100 %	0 %	0 %	479136972
109	NC_021009	GTT	2	6	5378	5383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021009	GAT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021009	ATT	2	6	5504	5509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021009	GT	3	6	5522	5527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021009	GA	3	6	5661	5666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021009	GCC	2	6	5704	5709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_021009	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021009	GAG	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021009	GCG	2	6	5844	5849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021009	AT	3	6	5878	5883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021009	TTTCTA	2	12	5895	5906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021009	CGA	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021009	T	6	6	5918	5923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021009	CTT	2	6	5953	5958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021009	GAT	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021009	ACG	2	6	5980	5985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021009	CAGT	2	8	6090	6097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021009	GAT	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021009	ATT	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021009	TTG	2	6	6143	6148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021009	AGA	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021009	AAG	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021009	A	6	6	6234	6239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021009	AG	3	6	6249	6254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021009	GCTG	2	8	6324	6331	0 %	25 %	50 %	25 %	479136973
134	NC_021009	TTG	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136973
135	NC_021009	TGG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136973
136	NC_021009	GGCA	2	8	6372	6379	25 %	0 %	50 %	25 %	479136973
137	NC_021009	TGCATG	2	12	6464	6475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479136973
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