MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020977	AACT	2	8	519429	519436	50 %	25 %	0 %	25 %	478465311
11502	NC_020977	AGC	2	6	519447	519452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465311
11503	NC_020977	AAC	2	6	519475	519480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465311
11504	NC_020977	GA	3	6	519518	519523	50 %	0 %	50 %	0 %	478465311
11505	NC_020977	CAA	2	6	519536	519541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465311
11506	NC_020977	AAG	2	6	519602	519607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465311
11507	NC_020977	CTC	2	6	519618	519623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465311
11508	NC_020977	CTTC	2	8	519629	519636	0 %	50 %	0 %	50 %	478465311
11509	NC_020977	TGT	2	6	519646	519651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465311
11510	NC_020977	ATAA	2	8	519850	519857	75 %	25 %	0 %	0 %	478465311
11511	NC_020977	TTG	2	6	519860	519865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465311
11512	NC_020977	AAAG	2	8	519919	519926	75 %	0 %	25 %	0 %	478465311
11513	NC_020977	AAG	2	6	519941	519946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465311
11514	NC_020977	AAC	2	6	519969	519974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465311
11515	NC_020977	TC	3	6	519977	519982	0 %	50 %	0 %	50 %	478465311
11516	NC_020977	ACA	2	6	520003	520008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465311
11517	NC_020977	AATA	2	8	520062	520069	75 %	25 %	0 %	0 %	478465311
11518	NC_020977	TCT	2	6	520078	520083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465311
11519	NC_020977	TGC	2	6	520126	520131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465311
11520	NC_020977	CAAAGC	2	12	520308	520319	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478465311
11521	NC_020977	AAT	3	9	520329	520337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465311
11522	NC_020977	GAAG	2	8	520434	520441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_020977	AT	3	6	520460	520465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_020977	AAAG	2	8	520473	520480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_020977	T	6	6	520521	520526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_020977	TTGGA	2	10	520544	520553	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_020977	T	6	6	520567	520572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_020977	ACA	2	6	520575	520580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_020977	AACC	2	8	520608	520615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11530	NC_020977	A	7	7	520679	520685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020977	T	6	6	520701	520706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_020977	A	7	7	520752	520758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_020977	AGA	2	6	520805	520810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465312
11534	NC_020977	AAAG	2	8	520818	520825	75 %	0 %	25 %	0 %	478465312
11535	NC_020977	CAA	2	6	520874	520879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465312
11536	NC_020977	GAACT	2	10	521031	521040	40 %	20 %	20 %	20 %	478465312
11537	NC_020977	TTG	2	6	521062	521067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465312
11538	NC_020977	TCA	2	6	521135	521140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_020977	A	7	7	521145	521151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_020977	CTAA	2	8	521166	521173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11541	NC_020977	AAT	2	6	521190	521195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_020977	ACTT	2	8	521200	521207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11543	NC_020977	GCT	2	6	521291	521296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_020977	CAAAA	2	10	521310	521319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11545	NC_020977	AGA	2	6	521368	521373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_020977	ATA	2	6	521402	521407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_020977	CTA	2	6	521476	521481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_020977	TCCC	2	8	521638	521645	0 %	25 %	0 %	75 %	478465313
11549	NC_020977	CAT	3	9	521658	521666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465313
11550	NC_020977	TCG	2	6	521676	521681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465313
11551	NC_020977	TTG	2	6	521762	521767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465313
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11553	NC_020977	GCA	2	6	521885	521890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465313
11554	NC_020977	CT	3	6	521893	521898	0 %	50 %	0 %	50 %	478465313
11555	NC_020977	ACA	2	6	521969	521974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465313
11556	NC_020977	CCT	2	6	521984	521989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465313
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11558	NC_020977	A	7	7	522097	522103	100 %	0 %	0 %	0 %	478465313
11559	NC_020977	CAA	2	6	522313	522318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465313
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11561	NC_020977	GTC	2	6	522402	522407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465314
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11563	NC_020977	TTC	2	6	522436	522441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465314
11564	NC_020977	CTT	2	6	522483	522488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465314
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11567	NC_020977	TTCT	2	8	522663	522670	0 %	75 %	0 %	25 %	478465314
11568	NC_020977	CTT	2	6	522671	522676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465314
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11591	NC_020977	CCTC	2	8	523723	523730	0 %	25 %	0 %	75 %	478465315
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11599	NC_020977	ATTC	2	8	524114	524121	25 %	50 %	0 %	25 %	478465316
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11602	NC_020977	GGAG	2	8	524218	524225	25 %	0 %	75 %	0 %	478465316
11603	NC_020977	TCA	2	6	524228	524233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465316
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11605	NC_020977	ACT	2	6	524401	524406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465316
11606	NC_020977	A	6	6	524461	524466	100 %	0 %	0 %	0 %	478465316
11607	NC_020977	CAA	2	6	524530	524535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465316
11608	NC_020977	ACA	2	6	524577	524582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465317
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11613	NC_020977	TCC	2	6	524777	524782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465317
11614	NC_020977	CTAG	2	8	524850	524857	25 %	25 %	25 %	25 %	478465317
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11621	NC_020977	TA	3	6	525145	525150	50 %	50 %	0 %	0 %	478465317
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11990	NC_020977	GCTC	2	8	540563	540570	0 %	25 %	25 %	50 %	478465331
11991	NC_020977	CCTT	2	8	540635	540642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11992	NC_020977	GGT	2	6	540687	540692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_020977	CTT	2	6	540731	540736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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