MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/CV204 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020976	TGT	2	6	182025	182030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020976	T	6	6	182129	182134	0 %	100 %	0 %	0 %	478464117
4004	NC_020976	TTGAA	2	10	182155	182164	40 %	40 %	20 %	0 %	478464117
4005	NC_020976	TTTG	2	8	182169	182176	0 %	75 %	25 %	0 %	478464117
4006	NC_020976	ATC	2	6	182266	182271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464117
4007	NC_020976	TGCA	2	8	182287	182294	25 %	25 %	25 %	25 %	478464117
4008	NC_020976	TGT	2	6	182305	182310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464117
4009	NC_020976	AGT	2	6	182324	182329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464117
4010	NC_020976	CT	3	6	182369	182374	0 %	50 %	0 %	50 %	478464117
4011	NC_020976	T	6	6	182374	182379	0 %	100 %	0 %	0 %	478464117
4012	NC_020976	CTC	2	6	182403	182408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464117
4013	NC_020976	GA	3	6	182448	182453	50 %	0 %	50 %	0 %	478464117
4014	NC_020976	GAT	2	6	182503	182508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464117
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4016	NC_020976	CGA	2	6	182837	182842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464117
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4018	NC_020976	ATT	2	6	182903	182908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464117
4019	NC_020976	GTTT	2	8	182959	182966	0 %	75 %	25 %	0 %	478464117
4020	NC_020976	TGAGT	2	10	182969	182978	20 %	40 %	40 %	0 %	478464117
4021	NC_020976	CTT	2	6	183047	183052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464117
4022	NC_020976	AGA	2	6	183127	183132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464117
4023	NC_020976	TG	3	6	183160	183165	0 %	50 %	50 %	0 %	478464117
4024	NC_020976	AGGGG	2	10	183166	183175	20 %	0 %	80 %	0 %	478464117
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4029	NC_020976	AAGA	2	8	183355	183362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020976	T	8	8	183379	183386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020976	AGAAAA	2	12	183397	183408	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020976	A	6	6	183405	183410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020976	TCG	2	6	183445	183450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464118
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4042	NC_020976	TTGAG	2	10	183716	183725	20 %	40 %	40 %	0 %	478464118
4043	NC_020976	ATAGA	2	10	183738	183747	60 %	20 %	20 %	0 %	478464118
4044	NC_020976	CT	3	6	183791	183796	0 %	50 %	0 %	50 %	478464118
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4055	NC_020976	GA	3	6	184037	184042	50 %	0 %	50 %	0 %	478464118
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4059	NC_020976	GCA	2	6	184174	184179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4062	NC_020976	GCA	2	6	184237	184242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_020976	TA	3	6	184272	184277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020976	GAA	2	6	184307	184312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4090	NC_020976	GA	3	6	185161	185166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_020976	GTT	2	6	186444	186449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_020976	TGC	2	6	186577	186582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464122
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4112	NC_020976	AC	3	6	186616	186621	50 %	0 %	0 %	50 %	478464122
4113	NC_020976	AGA	2	6	186715	186720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464122
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4116	NC_020976	T	7	7	186866	186872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020976	T	6	6	186878	186883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020976	T	8	8	186928	186935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020976	A	6	6	186951	186956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020976	T	6	6	186973	186978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020976	T	7	7	187068	187074	0 %	100 %	0 %	0 %	478464123
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4126	NC_020976	TCT	2	6	187282	187287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464123
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4500	NC_020976	A	6	6	204242	204247	100 %	0 %	0 %	0 %	478464140

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